Cmc10g0280271 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTAGCGGTATTGGTAGGTCACACATGACACAAAATTTTGGAATGGGCCGAGAGGAAGCCCCAAGGCCCAGGTTCCGAATCATTCTCGTTTAAGCTCTTCTCTTTACGGGACAATTTCGCGCCAAATCAATGGCAACTCCAACTCCAAGCAAATTGAAAACCAACTCCTGGACCTCAACCTAAATCAATGGCGCTGCTGTGTTTTTTGCTTGATCTCAGAACCTTTCCTCCTCCCATCCTCACCGCCTTAACCGATGTGAGAACAGAACAGTTCTGAATCAGATTCCTACAACTCTCATTTTCCTTCTCTCTCCTCCTCACCAATCTCACAGTTTTTTTTTTCATTTCGTCTTCATCTGTTTAGTCTTTGTTGCAGCTCGCCAATCTCTATGCAATTTCATCATCATCATCCGCTTCTAGAATCGGCTTGTGCTATGTGAAGAATGCCTCCTTTGTTCCTCATGATGTTCTTGTATGAATATGCAAAAACTTTCACTCACATACGCACACACAAAGATAGACACACGATATTAGATCGAAGGCGTTTGAAAATTTTGTTTTCTCGTATCTGAATTGTTTGAATAGCTGAATGAAACAGTTGGAGGTTGCGTATAGTCCTATTAGATGCTTTAGTCTCTGTCAATTTCATCGTGCTGTGAGGAATTTGCCAACGGATGCCTTTATTCCTGAAATCGATGGCTATGAAACTCTTCGTTGTCTTGGTATCTCCCTTTATAATTTCTTTTTACTTGCATTTCTGTTGGATGTTTATTGAATTGAATTTGGTTGTTGCCTGAAGATGTGAAATTATCGGCTGTTTTAAGCGATCAAGTTCTATACTCGTGGGAATGTGAAGATGTAAAGAGGAAAGTGATTGTATTAAGCGCATCTTCACATTATGATTTGGATTCAAACTTGGAAAGAACACTTGAGGTTGGCCATTTATTTAGCTGAACTGCTAAGATTTTGGTTCACCTTCAATTGGTATGATAACTCCAATAAGGGTTTTTTTTTTCTTTTTTGGATTGCGTTCTTAAATTCCTTAGGAGGCGGCTAGTATGCGTGTTTTAGTTGAGTTTGTGATCTTTGAGCAGAAGTCAAGTCATCTCAACGTCATTGAAGAGGATCCTAATGGGCTAATGAAACGCATTTCTGACTTTGATGGCTGCTCTCTTAAATTATACCTTCCAGGTAGACACAGAACAATGGTTTACTCTCCTACACATATCATGTGAAAAGAAATTAAGTTCTGAGAGTTCATGACGTGTTATAGCTCTGTGGCTGTTGATTACTGTGGTGATCTTTCACGTGATCACTTTTAATTAATAAGAAACAACAGTTCCAGAAATTTTTACTAGTTGGTGCATATGTATTCATTTACAAGTGGAAAATTCCGACCATTTCTGATCCAATGTAAAAATGGACGTCGTAGAGCAATCTTGATGATGGAAAAAATTGTATAAAGGATATTACTTCATTGACTATTGGGGGTGACTAATGCATATCAGCATCAATCTTTTGGTCTATTAGTGATTCTCACTAAAAAATCATCGTTCCTCAATGTATATTAATCTATTTAACCATGATTTTTTACCATAGTTATGAATTCGTTTTTTCACCTGGTTAGGCACCTTCACCTCACAAACTATAATCCTCTGATGTTTCTACGTAGTGCATCGTAGCTTTCTATTGGCAGTGGAATGAGCTGAAATAAGAAGTTAATGTTTAAATATTTAACAAATTCGCAGATGTCAGAATATTTCAAAGCCTTGTGAGACGTTGGTTGCAAGACCTCAAGGATGATATGAAGGAACCATTATTAGCATGTTTTGATTTTAAAGAAAACCTCATTTATTCCACGAACCAGATAACTTGCAACTTGTATACGACTGTCACGCAGATGATTGATGGTTTCTCCACTTGTCAGGTATATTCTGTCAATCAGATTATAGATTCTTTGTGCAAAACTTCTACTGTCATGAAACCTACTTCTATAATTAATTTGGCATATCCAAATGAAAAAATAAATTAGACTTAAAAAATATTTTTGGGCCTGATACTTTGATTGAACCAATGATTTATTTGAATTATTTTTTTTTCAAATTTGTAACAACTTAGTTCACGAAATTTAGTAAATTACTATTTAGATTTTTGGGGCAATTCCATAAATAATGTTGTCGGACAAACATATTAAAAAATAGGCTATATAACAAATTTAGAGTAAAGAATGAAAGTATTATCACAAAAAGGTATAAGGCTCGTGGATCAAGTCCATGAGTTCAACAAGCCAAACATAAATACCCTGTCAGCATACCATATCAGCCAATAGTCGTGGACGAGGTCCACAGTTTTATCCTAACTCGGTGGACCAGGTCCACGCTTTTATCCATACTCGTGGACCAGAGTTGTTTTAAATTGTACTCGTAGATCAGGTCTACGAGTGCAATACTTTTTTTTCCTTAAAAAGAAGAGGAATACACTTAAGTAAATAGTCCATTATGAATTTTTGTAACACTTGTCAACTGAAAATCACGTTTATAAAGTCAGACACCGAACTACACAATGTTTTTTTGTTCTGATTCCTAACTGTTCAGTGTTTTCTTGTTCAATTTTTTTTCCAGAGGCAAATTTTGATATGGGGCGGCTATTTGGAGTATTATATTAGGCGATTAAGGGTATAGTGGTAATTAGAAAAAGAGTTGTTAGCGGATTTGTTAAAGATTGAGGTAGTGAGGAATGAAAGGTAGACTTTATTATGGTGAATGAATCAGGGTGTGGGAGAATTCTCAAGAGAGAAGGATCCAAATATGTTGGAAGACTTGGTTTATCTTGTAGTTTTTTATTTTTTATATTTCAGTATCATTTTAGCTCTTTGTGGATTCGGTCAGATATGTAGTCAAAAGAAATAGATCAAATTTAAACCATGTTTATTTGCAAATGTTGCAAAATGTAAAGCTAAAACAATGTCCATAGCTTGGAGTTCAACTAGACTTCATATTCTCCTAAGTAGGAACAGAGCAAAATACCAAATGCCGAATGTAATGCTTTCGTAGCTTTATTCTGTATTCTTAGGCCTTGGGTAAGAATTTTAACTGTTACTGAAAATGTTGTAGACATGCAGATGCCATGGTATGCCATTAGAAGTCTATAGAAGCGAAGGGATAAAGGAATCTTCCTGTGCAATTAGCGGGGATTTTCTGGATACCTCTGGCATAATGAAAAACTCGATGAAAGTTGGAGAGAAAACAATCCTGTTCCTGCCATCAGCTCAGTGCCTTGATAAGTCTCAACAAAATGCTTCACAAATTAAATTTGACGTCGTACAACGAACCAACTTGGGAACCTTATGCGAAAGTAAGTTGGTTCTGAAACTAAACTTTTGTCAATTGCCCTCACTGCCTTCCCTGTTGGTATGTTTACTACATCTGAATTTTCCTTGAGATAGGAGAATGTATACGAAATTAGCATTTGTCTGATACTTTCCCCCTTCTGTTGCTCCATTATCCAAGTCGCGGAAGAAGGTGTTTTTTTTATCTCAATTTACTACTCTTACTCTTTTGACTGCCTATTTTGCATCGTACATCTATAATTCTTTCAAAATAGTTTTTCAAACGAAGATTACACACTGTTACTTCTAACCGTTATGTAAAGTATCACCAATAATTGGTTTTCTTACCTACTCTTATTTTATTCTGTAAAAAACCCTTTTCCCGCTTCCCTTTAAGTTGACTTGAAGGTTATGGGTTGGTGACCTTTCTGACCAACCCAGAACATGACATAAATAATAATGTATTATATATTAATGCTTGCACGTTCACTAAAGACCGGTGGTCATCTTTGATTTTTTATGCCAAACTTTAACTTCTGTCATCAGATGAGTTAAAAAGTAGTCAACTGTTTATGGTATCTCTTTTTCTAAGTTTTGACAATTCGATGTAGGTATTATTATGGGAGCCGCCTATGTTGTAGTTCCATCATCTTTACGTGAGCTAGAATCTGCTTCAGCAGACAATGATCCGTTTGCGGTTAATGCTTTAGGTGCATAGGACTACCTCTACTTATTTGTTTCGTTGTGCTTTTCGTCAAGTGCTTTATTATTTATTCATTTCTTTATTTGGTAGCTTTTCAAGGACTTTGTGGTGCTCTCCACTCACTAGATCAGGGTTTGATTTGCCTTTCAAAATGGAATATGGAGACCTTGAATGAATCAACATTTCCTTGCTATTATATTCTACAACCGTCACAAAATGGATCAATGTTTCTTAGGGTAATAATCGAATCTTTCCCATGACATATGAATTTTCTTTTCTTATTTAATGATAATTGTCCTTACCTAGAATTCTCTGTCTTATCGTTTTGGTTTAGAATCTATTCCCCATGATCAACTATAACGAGTGCAAAACACAAATTGGTTTAGCTTTCTTGTCAGTTTACCTCTGAATTATTAAGGAAAAATTGCAGCGTCTTGCTGCCTCCGAGGAAGTTCACTATGTACCGGATATCAAGTCTTTGATTACCACTCATGTTAGCAAGGAGATCCAGAGTTCCATTCTAGTCTCATTGGAGAAGGTTGAATTTGTCTTTAAACTTTTGTAGGTGCATTATTATATAAACTGAGGAAGAAATAAGATGCCGTTATGCTATTCTTTTTAATTATTTCATCGTGGGGTTCATCTTCAGGTTGAACTAAAAGACTACAACCCGTTGATGCATGAAAGAGGCCTCCACCAAAAACTTAATGTTCTCGTGAAAGAAAGTTTGGAGTTCCGGTAGTAATCCTCTTCCATCCTATCATATATTATAGCTTTTTTCACATTAGCCAAGGTGGTAATGAATTAATTAATCACTTATAAATTTTCCTTTTTAACTAAACTATTTGTAACTTTGTTTTCTTTATTTAATTTTCTACCGATCAAAAGCAATTTGGTCAAATAATTTTTTAGTACAACAATAAGGGAAGAAATTTGATTCTCTCGTCATTGAAGACAGATGGC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BLAST of Cmc10g0280271 vs. NCBI nr
Match: XP_008454789.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495109 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0065969.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold62G00460 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1267.7 bits (3279), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/639 (100.00%), Postives = 639/639 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. NCBI nr
Match: XP_008454790.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495109 isoform X2 [Cucumis melo] >TYK30260.1 uncharacterized protein E5676_scaffold344G00120 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1255.7 bits (3248), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/639 (99.37%), Postives = 635/639 (99.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. NCBI nr
Match: XP_008454792.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495109 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1159.4 bits (2998), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/580 (100.00%), Postives = 580/580 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. NCBI nr
Match: KAE8648121.1 (hypothetical protein Csa_004725 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1097.8 bits (2838), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/707 (82.46%), Postives = 600/707 (84.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. NCBI nr
Match: XP_038892979.1 (uncharacterized protein LOC120081876 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1062.0 bits (2745), Expect = 2.0e-306 Identity = 556/669 (83.11%), Postives = 584/669 (87.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VKX8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold62G00460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1267.7 bits (3279), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/639 (100.00%), Postives = 639/639 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZH9 (uncharacterized protein LOC103495109 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495109 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1267.7 bits (3279), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/639 (100.00%), Postives = 639/639 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E3Y1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold344G00120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1255.7 bits (3248), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/639 (99.37%), Postives = 635/639 (99.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZE2 (uncharacterized protein LOC103495109 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495109 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1255.7 bits (3248), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/639 (99.37%), Postives = 635/639 (99.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C060 (uncharacterized protein LOC103495109 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495109 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1159.4 bits (2998), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/580 (100.00%), Postives = 580/580 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. TAIR 10
Match: AT5G07380.3 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: egg cell; Has 84 Blast hits to 81 proteins in 31 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 42; Fungi - 0; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 4.8e-128 Identity = 265/654 (40.52%), Postives = 378/654 (57.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. TAIR 10
Match: AT5G07380.1 (unknown protein; Has 84 Blast hits to 81 proteins in 31 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 42; Fungi - 0; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 6.9e-127 Identity = 265/654 (40.52%), Postives = 378/654 (57.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc10g0280271 vs. TAIR 10
Match: AT5G07380.2 (unknown protein; Has 84 Blast hits to 81 proteins in 31 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 42; Fungi - 0; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 6.9e-127 Identity = 265/654 (40.52%), Postives = 378/654 (57.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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