
Cmc05g0135851 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCAAACCTCTCCAAAGCCCTAGTCCGACCGGCTGTTCCTCCCTACACTCATAAATCCCTCAAACTCTCTACTTTCATATCTTTCTTTCAGCCTCCCCATTGTCACTCATTTCCTACTCACTCTTCAACGATGAGTTTCGCCGCTTATAGAATGATGCACTGGCCTACGGGCATCGAGAATTGTGATTCAGCCTTCATCACCCATTCTCGCGCCGACTTCGTCCCCGCCGTCACATCTCACTCTGACGACCTCGACTCCGACTGGCACCCCCGCCGAGATATTGGTCCAGTTCCCAATCTTGTAGTCACCGCCGGCAATGTCCTCGAGGTTTATGTTGTTAGGGTTCTAGAGGAAGGTGGGAGAGAATCAAGAAGCTCAGGAGAAGTCAGACGCGGTGGCATTATGGATGGTGTCTCTGGGGCCTCACTCGAGCTTGTTTGCCACTACAGGTATGTTCCATGTTTTGTGAATGTATACCCAATCATTTCAATCATATTTCTAGCTTGTTAGAACATACATGCATCATGGAACAGCTTTTTGCTAGCTTCTCAATTTGGGTCTTTTTGTTGCGTCTCGTTTTTACTTCTCATTTATGAGCGATAACTTTGCTTATAATAGAATACAAAAGTTACCGTATACTGGGTAAGCACTTGTTCTTTTTGTTTAGTGATAATTTACTATTCTTCCGTTTTGTTGCAGGTTGCATGGTAATGTCGAGTCCATGGCAATTTTGTCCAGTAGAGGAGGTGATGGTTCCAAGAAGAGAGATTCGATCATATTAGTCTTTCAAGAAGCAAAAATTTCTGTGCTGGAGTTTGATGATTCTATCCATAGTCTCCGTACAAGGTGGGTGGAGGAAAGGAACGAGATATTTATTTTTCCTTTTTTGATTGTTCTCTACAATCATTTATTCATTCACACGTGCAGGTGTTTGAACTTTCAAACTAAGATAATTTGATTATAAAAAATAATTAAATTACATGGGATGTATAAATTTTAAGCTTTTGGTATTTCCTTTTGGCTAAAACTTTTTCTCATTGTCTGATCTCTGATTAACATAATTGGGGACGAAGTCCCTGATTGTTGAATTCATATTTTTCAGAATTCCTGTGATTTTTTCCCTTTATTTTCTTGGGAGAAAAACACAATTGGTGCAAGTTGAAAATCGTTCATTCCAGATTTGATATCAGTGACGAGTTTTATTTCTTATTTTTTGGAAGATAGATACGAAGGTAATACAAGTGTTGTTGGCGTTGGATGTATATTGGTTGAGCCCTTTTGTTTTATGAAGATTCCTATTAGAATCCATGAAAGCTTAGATCTAGTATGGAATATGGTTCTCTAATCTAATATGCCATCTTCTAGCAAAGTTAACATAAACAAGGCTCTAGGAAGTTACTAAAATTGTTTTATATATTTAAAATCTGATAACTCAAAGTGTAAACCATTCCAAATGCAGATGGTTCAAGTCTTTCTCCACTTCCTCAATTGTTGTTGATTTTCGTTTTCTACGGTTGACCAAAAATGCTTCTTGGGCTCTAATTTTATTATGTGACTTAAATATCAAGACAACATACTTGTTTGTTATGCATGTAATAATCCTGCCTCTCCAAATAACTTCCTGATTGTTTTCTTCCTTCCTCCACCAGATAGATGTGCAAAGGTACCATCTTGGAAAGAACTTGTGGAAGATGATACTCTGGTTATTTATTATTTTAATTGTCTAAATTTTTTTGGCATTTGACAATTATTATTGAGTGGAAATTTTCGTTTGTAGCTCAATGCATTGCTTTGAGGGCCCTCAATGGCTTCATTTGAAAAGAGGTCGAGAATCATTTGCAAGAGGTCCAGTGGTAAAGGTTGACCCTCAAGGCAGGTGTGGAGGAGTTCTTGTTTATGGTTTGCAAATGATAATACTTAAGGCTTCTCAGGTGCCTTTTGCCTTTCAAACTTTTCTATTTGGTTGTGCATGACAATATAATGCATGCTTTGTTAGTACATTAAAGATGCTAAACTTGACTTGCCATTCCAATGTTTGCACATTGAGTAAGATGAGATATGACTAGCATGTTTTGGTAATGCACTAGAACGGGAAGTAGTAATTTTTAGTTGTGATTATTGCAGTTAAACTCAAACTAAATGAGGTGACAAATATGAAGAAAATGTGTAGAAGACTTGTTTGACTATACTTTTTATTTTTTTCCCCGTAAACCTTAAATGGGCATTTTGATTGTCACATTATAATTTAAGTTGATGTTTGGGAATAAAAATAAATATATTGTATTTTTCTCGAACTTCTAAAGCAAAGACAGTCCTCTTATTCAAAAGACAGACCATCAACCAATAAGGAAAAGGAATCATCGACAAATGAATTTTTTTCTTAATCAATCTAACTTTGTAAGAGTTGGTAGACAAAAGGAGAAAGCTGAATCTGTTCCCTCTTGATAAACCCTTATTGACATGGAAGGCAGCATCGGACAAAACGATAGTCCTATATTCTAACTAATAAAGGATGGTGTACCATCAGTAACTTTATCCATAAGTTTGAAAGGTGAGATCAACCATCAATGAATAAATTTCAATCATTCTTTCATATGGATTAAAAATTGGAACATGTTTGTGTTTTTAGGCTCCTTGCTTTGAACTTTTTCTTTTTTGCCCTAAATGAGAGTTTGGTTTCTCATGATTTGTTTGTTAGGCTGGTTCCGGTTTGGTTGTGGACGATGAAGCTTTTGGTAACACAGGTGCAATTTCTGCTCGAGTTGAATCGTCATACCTAATTAACCTAAGGGATTTGGATGTGAAGCATGTAAAGGATTTTGTATTTGTACATGGTGAGTGTGTACTTATCTTGCTTTATTCTTACTCCTTACGTCTTATTTATTTATTTTTTTAGCTATTATTAAATTGTCTCGATTCTTTGTGTCTTATAGCATTTTAATTATGGCGACAATTAGGAGAGTTTTAATAATTTTGATGACGTTGATCATTCTTCATTTGTATGCATAGTCATAAAGTTTCTCTTTGAAAGAGTATACAGTTTATTTAGGATAAATGGTGTGTATGCATAGTCATAAAGTTTCTCTTTGAAAGAGTATACAGTTTATTTAGGATAAATGGTGTATCAAGAGGCTCTAGAACCAACATCGGTTAGCCTAGTGGTAAAAAAAGAGACAGTCTCAATAACTAACTAAGAGGTCGCAGGTTCAATCAATGGTGGTCACCTACCTATGAATTAATTTCCTACAAGTTTTCATGACACCCAAATGTTGTAGGGTTATATGGGTTGTCTCATGAGATTAGTTGAGGTGCACTTAAACTGATCTAGATACTCACGGATATAGAAAACAAAGAGGCCCTAGTTTTGCATTATGCTCATGGCCTACCTTTTCTAATTAATAAGGGAACTTTAGAATTACTTTTCACACCCAGAGTTGTCTCAATAAAAGCAGGGAGCATAGGAGATCAAATGGTTAGAAGAAGCAATCAAAAGATCATCAAAAGCACAAGGGATGTTGATTTTAATGTTGTTACCAAGAGATTGCTGCGATTACTCCCTTTAAGGGAAAGAATGAACTTCCCATTCTCCTCTACTACATACACTAGTTATTACCTTTTTCCACGAAGGGCCTTCTTCATTCATGTTTCTCCAAAGCTATGTATACAAAAGGCATTATTCCGTTGTTTAAAGGATCTTGTATTCCCAAACCCCACTATACATTAGGGAGGGAAGTGTTATGAGTGCAAACAAAGTCCCATCAAGATTGAGGAAGAGAAGGATCATGGGTATATATGTATGGACAATTATCTCCATTGGTATGAGGTCTTTTGGGTGGTTTCAAAAGTAAAGTCATAAGAGTTTATACCCACAGTAGACAATGTCATAACATTGAGGAGGTTTGTGGAGGGTTGTTGTCACTATCAATTGGTATCAGAGCCTTGATCTAGACCTAATTGTGCGTGTGAAATCCTCAAATTCCTAACAAAGAAATTTAATGAGCCTTGTTCGTGCTCGGTTTAGGTAGCCTTGTGGTTTCCCCTACCTTGATAAGAGCAAGTGTAATGCATGCTTGTGCTTGTGTGCTCTATTTGGATTTTGACTTAAGATGAACAGGATGTGCCTTAAGATAAAGAGCAAGTTGACTCGGGATGAAAAGGATGTGCCTCGAGGTGAAGAGCAAGTGGTCCAAGTAGAACTGGAGGTGCCTTGGGATTTAGAGCGAACTCTCGTAGTTGGGTATGGATGGATATGTTCAAAGGGAGACCTCAAAGTGGTACTTTGTTTGAGGGGAGGATTGTTTGGAGGTTAAACAATGTCGCATGTTGGTTAGGGAAGAGAATGGTCATGGATATATAAGTGTGGACAATTATCTTCATTGGTATGATGCCTCTTAGGTGGTTGCAAAAGCAAAGCCATGAGATTTTATACTTAAATTGGACAATATCATACCATTGTGGAGATAGGTGGTGGTCTTGGTCAGTTCTTCTTATTAGGAAGTCCACACCCAATTAACAAGATGAGCATATCTTTAAAAATTGCCACCATATATGAAAATGTCTCTAACGGAATGGTCAATCTCTTCCACGTCCAAACACATATTTATTACCTTGGATACAAACATTTAATATCTCAAACATATTGTCACAAACCAATTCTTGGAGAGTTCTAGTAAATGATACTTCATTACAATTGTTAGGTGTAGGAGCCCTCTTCAGTCCATGAAAGCCTAATCGAAGAATTGAGCCTCCAGACCCTCATGCCCCTTCTCCCATGTCAAGTGACCTTCAAAGCAAAGCAGAGAAGCCACATTAGTCACCTTCCTATTGGAAAGGAGGCAATGAAACCCAAATGAAGAAAAACGAGCTCCCTGACCATATAAGGAAATCAACAACAAAAATGAAATAGTTTAGGATATAAAGCACAAAGATGTCTCTCACCCACCCAGTGGTCCTCTTGATGTAAGAAGAATAAGGATTAATTGTGTAATTAGTTA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ATGAGTTTCGCCGCTTATAGAATGATGCACTGGCCTACGGGCATCGAGAATTGTGATTCAGCCTTCATCACCCATTCTCGCGCCGACTTCGTCCCCGCCGTCACATCTCACTCTGACGACCTCGACTCCGACTGGCACCCCCGCCGAGATATTGGTCCAGTTCCCAATCTTGTAGTCACCGCCGGCAATGTCCTCGAGGTTTATGTTGTTAGGGTTCTAGAGGAAGGTGGGAGAGAATCAAGAAGCTCAGGAGAAGTCAGACGCGGTGGCATTATGGATGGTGTCTCTGGGGCCTCACTCGAGCTTGTTTGCCACTACAGGTTGCATGGTAATGTCGAGTCCATGGCAATTTTGTCCAGTAGAGGAGGTGATGGTTCCAAGAAGAGAGATTCGATCATATTAGTCTTTCAAGAAGCAAAAATTTCTGTGCTGGAGTTTGATGATTCTATCCATAGTCTCCGTACAAGCTCAATGCATTGCTTTGAGGGCCCTCAATGGCTTCATTTGAAAAGAGGTCGAGAATCATTTGCAAGAGGTCCAGTGGTAAAGGTTGACCCTCAAGGCAGGTGTGGAGGAGTTCTTGTTTATGGTTTGCAAATGATAATACTTAAGGCTTCTCAGGCTGGTTCCGGTTTGGTTGTGGACGATGAAGCTTTTGGTAACACAGGTGCAATTTCTGCTCGAGTTGAATCGTCATACCTAATTAACCTAAGGGATTTGGATGTGAAGCATGTAAAGGATTTTGTATTTGTACATGGTTATATTGAACCTGTGATGGTGATCCTTCATGAACAGGAACTTACCTGGGCTGGTCGTGTTTCTTGGAAGCATCACACGTGTATGATTTCTGCACTAAGTATTAGCACAACATTGAAGCAACATCCTCTAATATGGTCCGCCAATAACCTCCCTCATGATGCTTACAAGCTGCTTGCGGTGCCATCGCCAATCGGTGGTGTACTTGTCATCAGTGCAAATAGTATACATTATAACAGTCAGTCAGCTTCATGCATGTTGGCTTTGAACAATTATGCTGTTTCTGCCGATAGCAGTCAAGATATGCCTAGATCAAATTTCAATGTGGAATTGGACGCTGCCAATGCTACGTGGTTGGTAAATGATGTGGCCTTGCTGTCAACCAAGACTGGGGAGCTATTATTGCTGGCACTTGTTTATGATGGACGGGTTGTGCAAAGACTTGATCTTTCAAAGTCTAAAGCTTCAGTACTTGCATCGGGTATCGCATCAATTGGAAATTCATTATTTTTTCTGGGCAGTCGATTGGGAGATAGTTTACTTGTGCAGTTTAGTTGTGGAGTGGGATCCTCAGGATTGGCATCCAATTTAAAGGACGAGGGTGGAGATATTGAAGTTGATGCTCATACAGCCAAGCGGATGCGTAGGTCATCTTCTGATGCTCTACAAGATATGGTTGGAGGAGATGAGCTATCGTTGTATGGTTCGGCTGCAAATAATACAGAGTCTGCTCAGAAAAATTTTTCTTTTGCTGTTAGAGATTCATTGATCAATATTGGACCTCTGAAGGATTTCTCCTACGGTCTAAGAATTAACGCAGATCCCAATGCTACTGGAATAGCCAAACAAAGCAATTATGAACTCGTTTGTTGTTCGGGTCATGGTAAGAATGGGGCATTATGCATTCTTCGCCAGTCAATTCGCCCTGAAATGATTACTGAGGTTGAACTGCCAGGTTGTAAAGGCATTTGGACTGTTTACCACAAAAATACTCGTGGTAGTATTGCTGATTCTTCTAGAATGGTTCCTGATGACGATGAATATCATGCATATTTGATAATAAGCCTTGAGGCTCGCACAATGGTACTTGAAACTGGAGATCTCCTAACTGAAGTCACTGAGACTGTTGACTACTTTGTGCATGGGAGAACAATTGCTGCAGGCAACTTGTTTGGAAGGCGTCGAGTTATCCAGGTTTATGAAAGTGGTGCACGGATTTTGGATGGATCTTTTATGACTCAAGATTTGAACTTGGTAGTCAATGGCAATGAATCTGGAAATGCCTCTGAAGGCTGTACCGTGTTATCTGCATCTATTAGTGATCCATATGTTTTGCTGACTATGACGGATGGGAGTATTCGGTTACTTGTTGGAGATTCTTCTTCTTGCTCAGTTTCTGTATCTGCACCAGCTGCCTTTGGGAGTTCAAAAAAATGTGTATCTTCTTGTACTCTTTATCATGATAAGGGCGTTGAGCCGTGGCTACGAATGACAAGTACAGACGCATGGCTCTCCACGGGAGTTGGTGAGACAATTGATGGTACCGATGGCTCACTCCAAGATCAGGGGGACATATATTGTGTTGCCTGTTATGATAATGGAGACCTTGAAATATTTGACGTACCAAATTTCATTAGCGTTTTCTATGTGGATAAATTTGTTTCTGGAAAATCGCATTTAGTTGATCATCAAATATCAGACTTGCAGAAACCTTCTGAGGTCGATCAAAATTCTCAGGAATTGATAAGCCATGGGAGGAATGAAAGTTCACAAAATATGAAGGTCATTGAGGTAGCCATGCAGAGGTGGTCAGGGCAGCATAGCCGCCCATTTCTTTTTGGAATATTGACAGACGGCACAATCCTTTGTTACCATGCTTATTTATTTGAGAATACAGACAGTGCTTCTAAAATTGATGATTCGGTTTCCATTGACAATTCTGTTAGCTCAAGCAATATGAGTTCTTCTAGATTAAGAAATTTGAGATTTCTTCGTGTCCCTTTGGACATACAAGGAAGGGATGATATGCCAAATGGAACCTTGTCTCGTAGATTATCTATTTTCAAAAATATTTCCGGTTATCAGGGGCTATTTCTCTGTGGGTCAAGACCTGCTTGGTTTATGGTGTTCAGAGAACGGCTTCGAGTTCACCCACAGCTATGCGATGGACCCATTGTTGCCTTTACCGTGCTACATAATGTAAACTGTAACCATGGACTTATATATGTCACGTCACAGGGTGTTTTGAAGATTTGTCAACTTCCATCTACATCGAACTATGATAATTATTGGCCGGTACATAAAGTTCCACTGAAAGGAACTCCACACCAGGTGACCTACTTCCACGAAAAGAATCTGTACCCTGTTATAATTTCAGCGCCCGTTCAGAAGCCATTGAATCAAGTGCTGTCATCAATGGTTGATCAAGATGTTGGTCACGTTGAGAATCATAACTTGAGTGCTGATGAGCTGCAGCAAACTTACTCTGTGGAAGAGTTCGAAATTCGGATTTTGGAACCAGAAAAATCTGGTGGCCCTTGGCAAACTAGGGCTACAATTGCTATGCACAGTTCTGAAAATGCCCTTACCATTCGAGTTGTTACACTGTTGAACGCAACTACAAAAGAGAATGAAACACTTTTAGCTGTTGGAACTGCATATGTGCAAGGGGAGGATGTTGCTGCAAGAGGAAGAGTACTTTTATTTTCTGTTGGAAAAGATGCTGATAATTCACAGACCTTGGTTTCAGAGGTTTATTCGAAAGAATTGAAGGGTGCTATTTCTGCTTTGGCCTCTCTGCAAGGTCATCTATTGATAGCGTCTGGTCCTAAAATAATCTTACACAAATGGACTGGTGCAGAGTTGAATGGCATTGCATTTTATGATGTTCCACCCTTATATGTTGTGAGCTTGAACATTGTCAAGAATTTCATACTTCTTGGTGATATACACAAGAGCATTTACTTTTTGAGTTGGAAAGAACAGGGAGCTCAACTGAGCTTGTTGGCGAAGGATTTTGGTTCTCTAGACTGCTATGCAACAGAATTTCTGATTGATGGAAGCACTCTTAGCCTTACTGTTTCTGATGATCAGAAGAATATTCAGATATTTTATTATGCACCTAAGTCAACCGAAAGTTGGAAAGGGCAGAAGCTTCTATCAAGAGCTGAATTTCATGTCGGTGCTCATGTGACGAAGTTTCTACGGCTACAGATGTTGTCTACCAGTTCAGACAAAGCATGCAGTACAGTTTCTGACAAGACCAACCGCTTTGCTTTGTTATTCGGCACCCTTGATGGAAGTATTGGTTGTATTGCGCCTCTTGATGAACTCACATTTCGAAGACTGCAGTCATTACAAAAGAAGCTTGGTGATGCCGTTCCCCATGTTGGTGGTTTAAACCCAAGGTCTTTTCGCCAGTTTCATTCAAATGGAAAGGTTCATCGACGTGGGCCAGATAGTATAGTTGATTGTGAATTACTGTGCCACTATGAGATGCTACCGTTGGAGGAGCAGCTTGAAATTGCTCACCAAATCGGGACAACTCGTTCGCAGATTCTCTCAAACTTGAATGACCTCTCTCTGGGAACAAGTTTCTTATAA MSFAAYRMMHWPTGIENCDSAFITHSRADFVPAVTSHSDDLDSDWHPRRDIGPVPNLVVTAGNVLEVYVVRVLEEGGRESRSSGEVRRGGIMDGVSGASLELVCHYRLHGNVESMAILSSRGGDGSKKRDSIILVFQEAKISVLEFDDSIHSLRTSSMHCFEGPQWLHLKRGRESFARGPVVKVDPQGRCGGVLVYGLQMIILKASQAGSGLVVDDEAFGNTGAISARVESSYLINLRDLDVKHVKDFVFVHGYIEPVMVILHEQELTWAGRVSWKHHTCMISALSISTTLKQHPLIWSANNLPHDAYKLLAVPSPIGGVLVISANSIHYNSQSASCMLALNNYAVSADSSQDMPRSNFNVELDAANATWLVNDVALLSTKTGELLLLALVYDGRVVQRLDLSKSKASVLASGIASIGNSLFFLGSRLGDSLLVQFSCGVGSSGLASNLKDEGGDIEVDAHTAKRMRRSSSDALQDMVGGDELSLYGSAANNTESAQKNFSFAVRDSLINIGPLKDFSYGLRINADPNATGIAKQSNYELVCCSGHGKNGALCILRQSIRPEMITEVELPGCKGIWTVYHKNTRGSIADSSRMVPDDDEYHAYLIISLEARTMVLETGDLLTEVTETVDYFVHGRTIAAGNLFGRRRVIQVYESGARILDGSFMTQDLNLVVNGNESGNASEGCTVLSASISDPYVLLTMTDGSIRLLVGDSSSCSVSVSAPAAFGSSKKCVSSCTLYHDKGVEPWLRMTSTDAWLSTGVGETIDGTDGSLQDQGDIYCVACYDNGDLEIFDVPNFISVFYVDKFVSGKSHLVDHQISDLQKPSEVDQNSQELISHGRNESSQNMKVIEVAMQRWSGQHSRPFLFGILTDGTILCYHAYLFENTDSASKIDDSVSIDNSVSSSNMSSSRLRNLRFLRVPLDIQGRDDMPNGTLSRRLSIFKNISGYQGLFLCGSRPAWFMVFRERLRVHPQLCDGPIVAFTVLHNVNCNHGLIYVTSQGVLKICQLPSTSNYDNYWPVHKVPLKGTPHQVTYFHEKNLYPVIISAPVQKPLNQVLSSMVDQDVGHVENHNLSADELQQTYSVEEFEIRILEPEKSGGPWQTRATIAMHSSENALTIRVVTLLNATTKENETLLAVGTAYVQGEDVAARGRVLLFSVGKDADNSQTLVSEVYSKELKGAISALASLQGHLLIASGPKIILHKWTGAELNGIAFYDVPPLYVVSLNIVKNFILLGDIHKSIYFLSWKEQGAQLSLLAKDFGSLDCYATEFLIDGSTLSLTVSDDQKNIQIFYYAPKSTESWKGQKLLSRAEFHVGAHVTKFLRLQMLSTSSDKACSTVSDKTNRFALLFGTLDGSIGCIAPLDELTFRRLQSLQKKLGDAVPHVGGLNPRSFRQFHSNGKVHRRGPDSIVDCELLCHYEMLPLEEQLEIAHQIGTTRSQILSNLNDLSLGTSFL Homology
BLAST of Cmc05g0135851 vs. NCBI nr
Match: XP_008441850.1 (PREDICTED: cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2887.1 bits (7483), Expect = 0.0e+00 Identity = 1451/1452 (99.93%), Postives = 1451/1452 (99.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. NCBI nr
Match: XP_011648998.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61267.1 hypothetical protein Csa_006291 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2848.9 bits (7384), Expect = 0.0e+00 Identity = 1430/1452 (98.48%), Postives = 1441/1452 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. NCBI nr
Match: XP_038887722.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2793.1 bits (7239), Expect = 0.0e+00 Identity = 1404/1454 (96.56%), Postives = 1427/1454 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. NCBI nr
Match: XP_022973592.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022973593.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2732.6 bits (7082), Expect = 0.0e+00 Identity = 1377/1453 (94.77%), Postives = 1411/1453 (97.11%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. NCBI nr
Match: XP_023520837.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023520838.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023520839.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2726.0 bits (7065), Expect = 0.0e+00 Identity = 1375/1453 (94.63%), Postives = 1410/1453 (97.04%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGR0 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CPSF160 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 2167.1 bits (5614), Expect = 0.0e+00 Identity = 1069/1458 (73.32%), Postives = 1251/1458 (85.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XWP1 (Probable cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os04g0252200 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 1875.5 bits (4857), Expect = 0.0e+00 Identity = 972/1468 (66.21%), Postives = 1147/1468 (78.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10570 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CPSF1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 650.2 bits (1676), Expect = 5.5e-185 Identity = 479/1487 (32.21%), Postives = 729/1487 (49.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9EPU4 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cpsf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 648.3 bits (1671), Expect = 2.1e-184 Identity = 481/1537 (31.29%), Postives = 744/1537 (48.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A0R4IC37 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 OS=Danio rerio OX=7955 GN=cpsf1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 645.6 bits (1664), Expect = 1.4e-183 Identity = 470/1485 (31.65%), Postives = 752/1485 (50.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4E8 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485885 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2887.1 bits (7483), Expect = 0.0e+00 Identity = 1451/1452 (99.93%), Postives = 1451/1452 (99.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKI9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G074280 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2848.9 bits (7384), Expect = 0.0e+00 Identity = 1430/1452 (98.48%), Postives = 1441/1452 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7X9 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472174 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2732.6 bits (7082), Expect = 0.0e+00 Identity = 1377/1453 (94.77%), Postives = 1411/1453 (97.11%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY93 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439584 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2717.6 bits (7043), Expect = 0.0e+00 Identity = 1371/1453 (94.36%), Postives = 1407/1453 (96.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DU39 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485885 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2573.5 bits (6669), Expect = 0.0e+00 Identity = 1294/1295 (99.92%), Postives = 1294/1295 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. TAIR 10
Match: AT5G51660.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 160 ) HSP 1 Score: 2167.1 bits (5614), Expect = 0.0e+00 Identity = 1069/1458 (73.32%), Postives = 1251/1458 (85.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05420.1 (damaged DNA binding protein 1A ) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.8e-18 Identity = 86/329 (26.14%), Postives = 152/329 (46.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05420.2 (damaged DNA binding protein 1A ) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.8e-18 Identity = 86/329 (26.14%), Postives = 152/329 (46.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. TAIR 10
Match: AT4G21100.1 (damaged DNA binding protein 1B ) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 1.2e-17 Identity = 135/627 (21.53%), Postives = 239/627 (38.12%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135851 vs. TAIR 10
Match: AT3G55220.1 (Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) A subunit protein ) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 4.0e-05 Identity = 84/365 (23.01%), Postives = 139/365 (38.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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