Cmc04g0107321 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTACACATACACTTCTATTTCTATTTCTATATTTTTAATAGTTAATCTCTTTTTTCCTAAACCTATTTTGTCGTTTCGGACAGTTAAAAACCCCTGCCGCCGCCGTCCCGTTCCTTCCGGACGGCCTCTCAGCTCCTGCTCTCTCACGCCGCTCTCCCTGCCTTCCGACGAAATCGCTGCCCTCACCCCCTCCGAGCAATCAGAGTTACTTATCTACTTCCTTCTTCTCAGAAACGCAGTGGTTCAGCCCCTAAACCCTAGGTGAGATCGCTCTGCCGCCACTCATGTTTTACAACCCTAAGATTTGATCATTTGTGGTTTTTTGTTAGTTTATGTTTGTTTATTCTGTTCATCTACGGAGAAGAAAATCGATAAATTTTTTTCTTTTGTTGATTTCTTGTTCTACTAATGTTCAAGCAGTATATCCAAATCAATAAATGAAGGGAAGAAAAAAGTTTAAAACATGAACTAAGAAAGACACTTACTTTGGTTGGTTGTAAAAAAGAGTAAGAAAACCTGTATTTGAAGGGATTGATATGATAGTTTTTAGTTTAGAAAAACAATAAGATACAATGACTAGTTATTTTCCAACTAATTCAATATAATTTACACATATAACTAATATCCACGCTGTTTGTCGTCCAAGTCGGTCCCTCTCATCGCCAAGCAACGTCATCGTCGATTGCCGCTTCTCCTCAGATGAAGCTGCGGGCAGTCGTGCTGTCAAATCCCCTCCCGAACTACTTGCTAGATTAGCCCGAAAGAAGGTGTGAAGCCGACTGATATCGCTCTCCTCTAACGATACCTGTCGACTCTGTTGAACTCTTTAACCTGATAATCATGCTAATATTGTATATAAACTATTTTACATGCAACACAACACAACAAAACACAGCGAAACCTAGACTAATCATAGACATACATGAAGTGTATGAAATAACTAATTTAGCAAGTAAACCTGAAGGAGACATCATAACCAAAAACATATCTAACAAAGGTTAACACAACTGCAACACCTAGAGCTTACACAAACTGTAGAGTATCTATATCCTACAAAGACATCAACATAACAAAATAGACTCTATATACAACTCCAACCATGTACTGGCAATCGATCTGAGAGTTTTTAACAGACTAAGGCAGTCTATCAAGTACTGGGAGCTTAATCTCTACCTGAAAATGGAAAAAATATTTTGGAAGGGTAAGCTATAAAGCTCAGTGAGTTACTCAGTTTAAAACTGTAAATATAGAGATTAGAGCATGTGAAAACTTTACATATATAAATCTGTTTAATCAAGCCGTAAATGTAGACGTACATTAATAATAACAGCTTTCTCAAATACTCAGCATGCATGTCGTTAAAATCTAGCAACACATATCAAGTATATCGAAACATTTTAACTAACATGCAATTTATTTGAACTTAGAGCTAGGGGTAGCCCAAACTGTGTTTTATGATTTTACTATTCTAAACCTTTATTTAACAAAAATGTTTTATTTATTTTAATTGATTTTGTAAGAATTATATTTTCAAGCCTATGCATGCGTGTAGTAGCGTCCTTGATAGTGTCAGAAAGTCAGGCCATTACACAGTTCCCTTTCAAATTAGATCAAAGTTCTTTAGACATGTCTCTAATGCTTGGAAATATTTTTTTTTTAGCTACGGAGTAGTTGTCAATTTACTTCAACACCTTTCAGCAAGAACCTTGAGGCTGTTTCGATGAGTTTTATACATTAGGACACTATTTAGACCCTTTCAGATTAAGTCTAAGTGTCGTATATTAGTCAATTACTATTGGGTTACTCTCTATTCGTAGTTTATACCTTTTTGAAGTGTTTGGACTGATGTTTAAGGTCCCCTTAGTTAAAGTCATTCATTTCGAAAATTGTTAAGGCTCTAAATAAGGTTTTGATCTAAGTTCGTAATTTTGGAATCATGTTTTACCATTTCAGGAGCCTTTAGATTCAATTTTTTCTGAAAAGGAAACAATGTGGTTGGACCCAATTTCTTGGGCAAGATTCAAGGAATTATTATTTGATCAATATCTTCTTGATACTATGGAAGATAAGGAAGGAGTGCTTTTACTACTCATTCAAAGATGCATGTTAGTGGCACAACAGAAGGTTTTTTGAGTTGTCTCACTTCACCCCTGATCAGATCGATACGGAGCAAAGAAAGGTGAGGAAGTTCATTAAGGGCCTTTGTAAAGTGAAAAAGGAATAGTAGCCCTTGTATGATTAACTATTTATGTCGGGGCTTTTTCAATCACCATGACTTTGGATAGGGACATTCCAAGAGTGGAACAATGTAGGGAATTGGGCACCTCATATGGGGTTAAGTCTAATATTCCAGAAAGCTCAAGGAGTCCTTTAGTGAGTGTGCATCTACATGTTGAGAGTGGACCTACTTCTAGAACCAAGAGAAAATCTCCTGAAGTGAAAAGGGAATAGTAGCACTTGTATGACCAACTACTTATGTCGAGGTTTTTTCAATCACAATGATTTTGGACGGGGACATTCCAAGAGTGGAACAACGTAGGGAATTAGGCACCTCATATAGGGTTAAGTCTAATATTCTAGAAAGCTCAGGGAGTCCCTAGTGAGTGTGCATTTACATGTTGAGAGTGGACCTACTTCTGGAACCAAGAGAAAATCTCCTCTCTTGTCTACTCTATCATAGGAGGCGTTACAAAATAAGGACTTTTCTCATCCCTTGTGTTCCTTGTGCCAAAAATATCCTCTAGAGGCATGCTAGATTGTTTCAATTGTCGTAAGAATGGACACTATGTATGTCGGTATTCAACAAGAGGCGATCAAAACTCGAAGAAGTCGACTTCGGAAGTCATCTCAACTTCAACACATGTAGGTAAACAAAAAACGCTCGTCTCTGAGCTCACAAAGGAAGCAGTGCAAGATGTTGAGGTAGTTGCTAAATGTACACTACCCTAGACATGTTTCTTCTACCTGCATCTCAATTTTTTTGAGTAGGAGTTCCCCCAAAAGAGAAACCCCTCCAAAGTAGGCATATGCCGCTTTGAGTGGCAAACACACGATATTCTTTAGTAAAGGGCGAAAAAATAGTTCGCTCTGTGCTCACCGCACAACTTTGTGACACTTGCATCTCATTTACCATTTCTATGTTTCTAAGTTGTTGCTTTAGTGATGTCACGGTTCTTAGTGCTTGTGTTTTGTTTGGTTTGCTCATGGTTGAGTCCTTTCTTCTTCCTTGACCCACACATGTCAAGAGAACTTAGAGCTTAGCCATTACATTACCTTGTGTGCTTGCACCTTCATGGGCCAAAGGTTCAAGTTGAGAGTGACTTGGATAAGAAAAGATTAAGTCAAGGCTAGCGTTCAGTGTTATTAGGCACAACATTCAAATAGAAGGTAAAGTAATGTATATAGAAGTCTCTGGAATATCTTGGACTTTTCTCTTGGCTATTGGTAAAATGTTGTTGTTTGTTAAAATTTCATTTTGTGGTACGTCACTGATTGTTGATTCTTCATGCTTATAGACAAATTTCTCAAATAATAAGAGAGTAGTAGTACTACAGTAATAATATATGTATATTTTGCAAGATATGAGTTGGGGTTGGTGGTAGTAGTTGTGTATTTTAAACAATAAACTGAATCCAACAGCACAACACGTAACACATGTAAAGAGCAAGAGTATAACGGTAACTGAAGCTAGCCCTAGCTGCCTCGTTCAATATTTTTCCCACTGCCGTTCTCCATGTTCGCTGCTGCACAGTTTCAAAGTCAACTTTTGTTCATGGTACTCTGTTGTTGGACCTTGCCCACAGCTGTCTATTACCCTTTGCGACACACCTATTGAGTCTTGGACAGTTAGATGAGATTCTTAGTTGGTTTATCTACTCTCCCTCTTCCCCTTTTTTATTTTTTTTCTCTTTGAGTTATGTTCCTTAGCTTGTTAAGTTTTAGTATTTGAGTTGATTAAAGCATTAGTTTGTTTATTCTTTTCTAGGAATTCAAAATCACAAGCATACAGTATGAGCAAAATTATTTATATCCCAGATAAGCTGCCAACTCCACCGGATCAACAACCCACTGGTTACATTTTGTTTTCTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGCTTTTGTTTTTGTTTATATTTTTTACACTCTCTCAGAGATTGTCGTCTGTTGTAATTGGCAGTTAATGTCTTTGCTGCTGTGGTTGAACCCAAGATAATCAATAATCTTGTGAGGTTTGCTTTGTGCTATTTTCTCCAGATTATAATCCGTTCTTCTGAGGTTTCTCATTTACTCAATGAAATAAGTTGAAGTATTCTAAATGATGTCAATTTGAAGTGAACGCATTCTTTTTCCTTGAAATAAGTTTTGTAATGTGATTGTTGTTGGCTGGCTTTATGTAAGTTTTACTTTCTTAGAATATGTCTGGAAGGAAGGGTCAAAATCAAAAATAGATTCTATTTCATGAAATCTATGGGGGAGTCGATGTATAATTTTCTCATTGATTCGTTATTTCTTGGATTACAATTGTTTCCTTATTTTGTAAAGTTCTTAGCTTGTCTTTGTAGGCGACTAAATCAGATAGCGCCATTGGAAAATCTTCGCCATGTGAAGAGAGTTCAGAAGAAGCACCTTGAAGATGGTATGCATCTAGATTTATTGCAAACTTGCCTTTCTTTTTTACCCTTACCTCTTCGAATAATTCCTATGATGTCATTTTGGGCTGTTTTTGTCTTCTTTTCAAATGCTTGCTTGAGTTTTTGGTATACTGAGAGAAATAATTGTAAAAAAGGAAAAGAGTTAGTTGTAAAGGGCAGTTACGAGTATTATACTAATTTTCCTACATCTTGTAGTTACTTCCCTCTATAACTGAAGACCTCTCCCCACTTTTTGAGGAAGAGAATCATTTTCATAAATATTCAGATCTTGGTTTACATCAAATTTGGTATAAAGAGCACTCCAAGTTTCGGGTAGTTTTTAGTCTTTGGTGGCTGGTGTGGCGG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ATGAGCAAAATTATTTATATCCCAGATAAGCTGCCAACTCCACCGGATCAACAACCCACTGTTAATGTCTTTGCTGCTGTGGTTGAACCCAAGATAATCAATAATCTTGTGAGGCGACTAAATCAGATAGCGCCATTGGAAAATCTTCGCCATGTGAAGAGAGTTCAGAAGAAGCACCTTGAAGATGGAAAGACTCAAATAGCATTGATCCTATGTGTTGCAAGTGAAAACAATTGCGATTTGGATGTTTTGTCTCCTTGTGTGCAAGAGCTTGTGACGTCATACAAGTTGAGTGCCTTTATCACAAAGGTTTGTAAGGAAGCAGCAACGACAAAAGAAGAATGGGAAGAGCAGTGCAAGCTTTGGCCAACATCATATCATCCACCCACATACAATATTGATGGTATCACTGGCTTTAATGAAGTGGATACACAATCAATTTTTGGCTTCATGCGATTAGCAATAGAATTAGCACAGTCTTCTAGTAAATCGGTAGTAAATGCTGCGGTGATTGTTGATCCGTCAGTTACACAAGTAATTGCAAGTGCCTGTGATCATCATATTTCCTTCGAGAATGCTTCCACAAGCAATGTCAACGGAGAAACAAGCTTTGAAAAATCCCCAAAATCTCTTTGTTCTCATTTTGGCTCCGATGGATCCATTATCCATGGAACTTTTCCCTCAAGTTCCTCGTTGGAAAAACTGAAACAATCATGTGCAGATGTTTCCTGTTTGTACCCCTTGCGATGGGTTGACCAACCATTACCACATTCCTCAAATTCTTGTTGTTGGCACCCTCTAAGGCATGCTGCTATTGCAGCTATTGAATCTTCTGCTGCCCGAGATCGTCGTCTGTTCCCAACTCTTGAAACCACGGGTGATAAGTCAGTTGAAATGGAGCATATGGGCCCTCTGACAAAACTAGCAAAAAGACAGAAGATTGACCTTGACAATGCCAACAGCAAGGAGAAAAAAGTAGGTACTGACGGTGAAGGCACATATTCTAAACTAGGCAGACCTTATCTGTGCACTGATTATGACATTTATCTTGTGTGGGAGCCATGTATTATGTGTGCAATGGCACTGGTTCATCAACGAGTTAGGCGCGTGTTTTATGCGTTCCCAAATCCTAGCCATGGGGCATTGGGCAGTGCTCACAGACTACAGGGTGAAAAAAGTTTAAACCACCATTACGCTGTTTTTAGAGTTTTGCTTCATGAAGATGTACTTTAG MSKIIYIPDKLPTPPDQQPTVNVFAAVVEPKIINNLVRRLNQIAPLENLRHVKRVQKKHLEDGKTQIALILCVASENNCDLDVLSPCVQELVTSYKLSAFITKVCKEAATTKEEWEEQCKLWPTSYHPPTYNIDGITGFNEVDTQSIFGFMRLAIELAQSSSKSVVNAAVIVDPSVTQVIASACDHHISFENASTSNVNGETSFEKSPKSLCSHFGSDGSIIHGTFPSSSSLEKLKQSCADVSCLYPLRWVDQPLPHSSNSCCWHPLRHAAIAAIESSAARDRRLFPTLETTGDKSVEMEHMGPLTKLAKRQKIDLDNANSKEKKVGTDGEGTYSKLGRPYLCTDYDIYLVWEPCIMCAMALVHQRVRRVFYAFPNPSHGALGSAHRLQGEKSLNHHYAVFRVLLHEDVL Homology
BLAST of Cmc04g0107321 vs. NCBI nr
Match: XP_008466785.1 (PREDICTED: probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016903628.1 PREDICTED: probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016903629.1 PREDICTED: probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 4.1e-236 Identity = 409/410 (99.76%), Postives = 410/410 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. NCBI nr
Match: XP_016903627.1 (PREDICTED: probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 4.1e-236 Identity = 409/410 (99.76%), Postives = 410/410 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. NCBI nr
Match: XP_004142032.1 (tRNA-specific adenosine deaminase TAD3 [Cucumis sativus] >KGN48447.1 hypothetical protein Csa_002907 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 3.9e-218 Identity = 383/410 (93.41%), Postives = 388/410 (94.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. NCBI nr
Match: XP_038891476.1 (tRNA-specific adenosine deaminase TAD3 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891477.1 tRNA-specific adenosine deaminase TAD3 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 737.6 bits (1903), Expect = 5.6e-209 Identity = 365/410 (89.02%), Postives = 381/410 (92.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. NCBI nr
Match: XP_016903630.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504115 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 1.4e-207 Identity = 370/410 (90.24%), Postives = 374/410 (91.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KH86 (tRNA-specific adenosine deaminase TAD3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TAD3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 375.9 bits (964), Expect = 5.7e-103 Identity = 218/417 (52.28%), Postives = 279/417 (66.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8JFW4 (Probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 OS=Danio rerio OX=7955 GN=adat3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 2.7e-20 Identity = 99/394 (25.13%), Postives = 156/394 (39.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96EY9 (Probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ADAT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 4.0e-16 Identity = 40/70 (57.14%), Postives = 48/70 (68.57%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PAT0 (Probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Adat3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 1.2e-15 Identity = 37/68 (54.41%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q561R2 (Probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Adat3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 1.2e-15 Identity = 37/68 (54.41%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5X7 (probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 2.0e-236 Identity = 409/410 (99.76%), Postives = 410/410 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5Y1 (probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 2.0e-236 Identity = 409/410 (99.76%), Postives = 410/410 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KJ95 (CMP/dCMP-type deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G487680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 1.9e-218 Identity = 383/410 (93.41%), Postives = 388/410 (94.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E6M2 (uncharacterized protein LOC103504115 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 6.7e-208 Identity = 370/410 (90.24%), Postives = 374/410 (91.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5W3 (probable inactive tRNA-specific adenosine deaminase-like protein 3 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 718.8 bits (1854), Expect = 1.3e-203 Identity = 356/357 (99.72%), Postives = 357/357 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. TAIR 10
Match: AT5G24670.1 (Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein ) HSP 1 Score: 375.9 bits (964), Expect = 4.0e-104 Identity = 218/417 (52.28%), Postives = 279/417 (66.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0107321 vs. TAIR 10
Match: AT5G24670.2 (Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein ) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 1.2e-103 Identity = 218/421 (51.78%), Postives = 279/421 (66.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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