Cmc04g0097011 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc04g0097011
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionATPase 7, plasma membrane-type-like isoform X4
LocationCMiso1.1chr04: 11692770 .. 11710712 (+)
RNA-Seq ExpressionCmc04g0097011
SyntenyCmc04g0097011
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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AATGTCTAAGTAACATCCTTTCTATGTTGTGGCCGCCCATGACACCCATTTAGAGGTTTTCTCACCTAATGCCCAAACAATAAGCCTTAGCCGCCTAGACATGTCTAAAACAACTACTAACCTCTTTAGAGGTTATTTTCCATCCCTTGGCCGCTCAATACACCACTAAAATAACCTCTAATCGCCTAGCACTTCAATCCTTGACACGTAGCCAAATTTTCCTCTTTCTCCAATAATCAGGACACTTTTAACGACACTTTTAGTTACTTTTCAACCTTAACCCCGATCAACTCTTATCTTTTCAAGCTCTTCAAAAGAATTAAGTTTTCTTAGGATTCAGGGTTTACATTTTAATCCAAAATGGGTGTCATGGTTGGGGCTATTTCTAGTGGACAGATAGCCGAATACATTGGTCGAAAAGGAGTAAGATCCTTTCCTGAATCATTTTCCGTTCAATCTGTCTTGTTTAATTAGTTTCCATAGGTTTTCATGATTAATTTGTCTTGGTTTATTTTAGTCTTTGATGATTGGTGTAATTCCTAATATTTATGTTGCAGGAGATTAAGGTTTTGAAGTTCTTGGGATTTATGTGGAACCCTCTCTCATGGGTCATGGAAGCTGCAGCTATAACGACTGTTACTTTAGCTAACGGAGGAGTGAGTTTTTAGTATCTTAATTTAATTTATTGATAATGAGAAATGGAAATATTTATGCTAACTGTTTTTAATTTCCTTCAAAAAAAATTTTGGGTTCTTTTGCATATTTTGATTGCTGCCATCAATTTATCCACCCACCCATAGACGCTTTCGAAGCGTAAGAACTTTTTTCCGCTTTTAACGTGAGTTCTTCCACTTTTCTCAATTCCAGAAGATTATATTGATATTAATCCTCTTACCCAAACCAAGAAACTCCCCTTTTTTTTTCGTTTTCTAATTTTTTTTGAATTTATTGATTTATTGATTTATGGAGGATTGGGTTTATATTCTTTTTTGTCTCTGGGTGTTCTTTTTTAAATCTTCTCTGTCAAAATGAGATATTGAAAACCAAGAAAGAGAATTTCATTTTGGCTTCTGGGTTCTCTCCATTGAATTTGAGACTACTAATTACAGTACTCAAATATCAAATGAAAATTATGTGTGGTAACCAACTCTTTGCTTCATTAATTAATAATCACTACTAGTAACTAGGTCATAACTTTGTTACTTATCAATTCAACCATTAGTTTTATAGTGAAGAACAATGTTGGAGATGCTACAGTCGTTCTCATGGCTCATGTATTGTGGTCTTAAAAGGTCTTGCCATAAACCATTATAAAAGCAATTTGATCTTGGTTCTTGTAGTCTTTAAAGGTCTTATGATTTGGGTTTACTATCAATTTGAATCCTGTGGTTTTTAATTGTTTCCATTTAGCTTCTTTGATTTAAATAATTAAATTTCTACACTTTGGCTCCTACGATTTAGTTTATCTCTTAATTGTTTTTACTCACCAAAAACTAAATTATTTTATGTTTTTCTTTACTTAGTATGAAATCTTACTGCAATATAGGAATTACTATATATATATTGACTAAATTGAACTTTTAAAACCCTAAATAAGAGATTGAAATTATGTTCAAATACCAAATTGAAACTTTAAAACTACTAAATAGAAACTCTGAATTATACAATTTTTAATATCATTATATTATCCTTAATTACAAAGAATTAATTTATATACATTATTGTGTTTTGAGATTCGAAGTTGTGCTTAGGTATGTGTTAGTGTCACGCACCGAGGTATAATCTTTGATCAACGTAGCTTTAGAAGCTTTTCGTTTTAATTAAACCTTGCCTTTTATGATTGCTGATTTATGTTTTTTTTCTTTTTGATTTTACTGTGCTTATAAAAATTCTGATTTTTGTTCTACCAGTCAATACTATTTTCTTGTAGTTTCTTTAATTGATTTGTTGAGTTAACAAGGTTTTATTTTATATGTAAGCTGGAATGATTTAACTTGGCAGATCACGTAAATATTACTTTTTATTCATAGAATGATGGATTGAAACATTTTTTTTCTATTTTTATGGATGTTTTTTTTTATAATTGTTGATCCATTCCACGATCTGTTTTGGAACTAAAAAAAGGAGGTAGCGGAGTACGACGATTTGAAGAAGAGTATAGTAAGCTACCTTATAAAACGTTAGTATATTGATTATTAGTACTTTCTTAATTCTAGGAGAATTATATTGGAATTGCCTGCTAAATATTACATCTCCTTTACTTGAATTGAAAGTTTGCTAATGGCTTTTCCGGTCCCAGGAGAACCTCGCATTGCTCACTGCAGCTTTCTGTTTGTTAGTGTTTGAGACCAGGGATTTGTTCAGGAGCAGAAGGTTCACGTTGATGCCTATGACAATTGTAAGAAGGCGGAAAAGGCAGGGAAGATTTTCGAAGTACAGGGACTTGTATGTATGCCTTTGATGAACTGAATTTTAATCTTTTCACATGGGTGAGCAATAGTTAAATCTAGAGGAGGTTGGGGCATTTAGACCGTCCAATGTAGACAATGAATAGTTAAACTTTATCTAGAGACTATATTGCCTAGACTTTCGAAATACTATAAATACTATAAATACTATATTACTATATTATAGCTTACTAATATGAGTTGTCAAGACTTTCGAAAAAGGCTATAAAGGCTATAAAATATATGATAGCGTTTTTCATTAGCTATCGTATATGTTATTTCCTGTAGTATGAAAAAGGTCTCAGGGCTAAAATACCTTCAAAGCTTGTACATTCGAACCTTTGTAGACCAATGAATGTTAAAGTTCAAGGTGGATATTAATATTTAATCAATTTTGTTAACGATTATGCAAGGTTTGGTCATGTTTACCTATTGCATCACAAGTCTGATTCTCTTAAAAAGTTCAGAAAATATAAGACTGAAGTTAAAAATCATC

mRNA sequence

ATGTCGTCTGTCACTGGCAATCGTGCCCACCGTTCGTCCCCGGAACTCCTCACCCGTCGTCGACAATGTTTCGTCAGGCTTTTCTTCATTTTTCATCAGGTTAGGTTTTGCTTCCATCTCTTTGAGCATCAGAAAATGGGCAACGACAGCAAAAGTATGGCATTGGCTATTTGCAGTGATATAAACATGAGATTGGGGATTACTATTTGAGATGTGAAAACAAGCCAAACTCTCCTTCACATTCCGACTTGCATTTTGACTCCTTACGACTTTATTTTCTTGAGAAACAAATTCTTTGTTGCTTCTCAGACTTGTAAGGAAGGGTCCATCGGTGGTGGATCCATTTTCATTTGATCACTCAACAAGCCTCAACTGCCCGTTATGAGCTTTACATTAGAGACCATTGGACCACTCGCTTCAACAAAGGATAGTGTATATCTTGCAAGCGGAACTCATTGAGAAAATATTCTTCTTTGGGAGGAGATTAAGGTTTTGAAGTTCTTGGGATTTATGTGGAACCCTCTCTCATGGGTCATGGAAGCTGCAGCTATAACGACTGTTACTTTAGCTAACGGAGGAGTGAGTTTTTAGTATCTTAATTTAATTTATTGATAATGAGAAATGGAAATATTTATGCTAACTGTTTTTAATTTCCTTCAAAAAAAATTTTGGGTTCTTTTGCATATTTTGATTGCTGCCATCAATTTATCCACCCACCCATAGACGCTTTCGAAGCGTAAGAACTTTTTTCCGCTTTTAACGAGGTAGCGGAGTACGACGATTTGAAGAAGAGTATAGTAAGCTACCTTATAAAACGTTAAACCTCGCATTGCTCACTGCAGCTTTCTGTTTGTTAGTGTTTGAGACCAGGGATTTGTTCAGGAGCAGAAGGTTCACGTTGATGCCTATGACAATTGTAAGAAGGCGGAAAAGGCAGGGAAGATTTTCGAAGTACAGGGACTTGTATGTATGCCTTTGATGAACTGAATTTTAATCTTTTCACATGGGTGAGCAATAGTTAAATCTAGAGGAGGTTGGGGCATTTAGACCGTCCAATGTAGACAATGAATAGTTAAACTTTATCTAGAGACTATATTGCCTAGACTTTCGAAATACTATAAATACTATAAATACTATATTACTATATTATAGCTTACTAATATGAGTTGTCAAGACTTTCGAAAAAGGCTATAAAGGCTATAAAATATATGATAGCGTTTTTCATTAGCTATCGTATATGTTATTTCCTGTAGTATGAAAAAGGTCTCAGGGCTAAAATACCTTCAAAGCTTGTACATTCGAACCTTTGTAGACCAATGAATGTTAAAGTTCAAGGTGGATATTAATATTTAATCAATTTTGTTAACGATTATGCAAGGTTTGGTCATGTTTACCTATTGCATCACAAGTCTGATTCTCTTAAAAAGTTCAGAAAATATAAGACTGAAGTTAAAAATCATC

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTCTGTCACTGGCAATCGTGCCCACCGTTCGTCCCCGGAACTCCTCACCCGTCGTCGACAATGTTTCGTCAGGCTTTTCTTCATTTTTCATCAGGTTAGGTTTTGCTTCCATCTCTTTGAGCATCAGAAAATGGGCAACGACAGCAAAAGTATGGCATTGGCTATTTGCAGTGATATAAACATGAGATTGGGGATTACTATTTGA

Protein sequence

MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQVRFCFHLFEHQKMGNDSKSMALAICSDINMRLGITI
Homology
[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match: XP_016900379.1 (PREDICTED: ATPase 7, plasma membrane-type-like isoform X4 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 8.5e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match: XP_016900377.1 (PREDICTED: ATPase 10, plasma membrane-type-like isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 8.5e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match: XP_016900378.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489801 isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 8.5e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match: XP_016899511.1 (PREDICTED: protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3-like isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.4e-06
Identity = 28/34 (82.35%), Postives = 30/34 (88.24%), Query Frame = 0 

Query: 36 FCFHLFEHQKMGNDSKSMALAICSDINMRLGITI 70
          FCFHLFEHQKMGN  +SMALA+CSD NM LGITI
Sbjct: 8  FCFHLFEHQKMGNGGESMALAVCSDRNMGLGITI 41

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWM5 (uncharacterized protein LOC103489801 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489801 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 4.1e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWM4 (ATPase 7, plasma membrane-type-like isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489801 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 4.1e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWL3 (ATPase 10, plasma membrane-type-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489801 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 4.1e-09
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 34
          MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ
Sbjct: 1  MSSVTGNRAHRSSPELLTRRRQCFVRLFFIFHQ 33

[Close]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DU43 (protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484316 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 6.6e-07
Identity = 28/34 (82.35%), Postives = 30/34 (88.24%), Query Frame = 0 

Query: 36 FCFHLFEHQKMGNDSKSMALAICSDINMRLGITI 70
          FCFHLFEHQKMGN  +SMALA+CSD NM LGITI
Sbjct: 8  FCFHLFEHQKMGNGGESMALAVCSDRNMGLGITI 41

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_016900379.18.5e-09100.00PREDICTED: ATPase 7, plasma membrane-type-like isoform X4 [Cucumis melo][more]
XP_016900377.18.5e-09100.00PREDICTED: ATPase 10, plasma membrane-type-like isoform X1 [Cucumis melo][more]
XP_016900378.18.5e-09100.00PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489801 isoform X2 [Cucumis melo][more]
XP_016899511.11.4e-0682.35PREDICTED: protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3-like isoform X2 [Cucumis melo][more]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S4DWM54.1e-09100.00uncharacterized protein LOC103489801 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10... [more]
A0A1S4DWM44.1e-09100.00ATPase 7, plasma membrane-type-like isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103... [more]
A0A1S4DWL34.1e-09100.00ATPase 10, plasma membrane-type-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10... [more]
A0A1S4DU436.6e-0782.35protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=L... [more]
BLAST of Cmc04g0097011 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc04g0097011.1Cmc04g0097011.1mRNA