
Cmc04g0094881 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTATTTAAATTGACGATGGAATCCGATGGTCCTAATTGGTTGCCCTTAGTCGCAAGGTAGGACGTGAAGCAGTGGATTTGTTGTCGCCGGTACTCTTCCCCAGCCCACGACCACGGTGCTCACCACAGTTAGATTCATACTCACTGAACCTCTCTCTCTTCTTGTTCTCTCTGCAGCGACCTTTCCTCTCCATGGATCTATGATCTACAATTGTTTCCCATAGATTTAGGATGGCCAATTTCCTAGCTCAGTTCCAGACGATCAAGAGTTCCTTCGACCGCCTCGTAATTGCTGGTGATTCTCTATTTTCCCTCCACCCCGCTTCCAATTTTTAGCTTAATTATCAACTTTATTGATCTCATTTCTTTACAGTTGCCGATTTGAACTGCAATTGAGTTTACACTTGCTTTTTCCGTAATGCCAATTGGTACTGAGCTTCAGAAATGATAGTAGATTCTTGCTTAATCAACACATTGTTACTTCTCCAGCTGTGATATCTCATTGGTTTTGGTGTTCAAGTACCTATTCTGCTTGATTACTTTAAAACAAATTTGATATGGCAATGAGGACCTCGAACGATGATTAAACACTTTTCTTTATTTTTCTTCCGTTTTTTGTTCTAAGATTGAATCATTTCCAGATTGGTATTAGAAACTTCTCAGAAGTCCTTACCTTTATCCTTGTTGCCTGAATTTTGGTTGCCTTCCACTTGGTTGCTAGCAATTTTGTGTTCGAATGGTGGTTGTGCCAAGTTCTCTTCGGGAAGATCGTTATCCCAATCATTCTGAAATGTGTTTATAACAGTGAAAGATATAGATACCTTTATGTCTCTTTGTCCTTGCTTTACGTTGGTAGCGTAGCTAATCTTTTTGCTTTTGATTACTTTCAGTTGAAGACGTCAGTGACTTGTGGCCTACTGTAAAGAACGGATTTGAGGAGAGATTACCATTTAAAAGAGCTTGTTTGAATAACAAGACACGTAATCCCGTTTTAGTTGACAAATTGCCTGCTGAGTTCATATTGACTACAGATGCACGACTTCGTAGTAGGTTCCCTCAAGAGCAGTATTTATTTTGGTTTCGTGAACCATATGCAACTGTTGTTCTTGTCACCTGTGAGGTAACTAAAGGTTTTCTTGATCTTAAGTGCATTTGTATGGTATTGGGAAATAACTAACTTGGTCAGTTTTCTGACTTTTTTAATGTGAAGATAAAACTATTAAAGTTTCTTCATAGTTTGGGCTTCGTCGTGATGACACTCCTATTCTTTTCATACCTTTACGAGAACTAAACTTATACTTTCCTTTTCATTTGGTTTAGGATCTTGATGAATTTAAGACTATTCTTAAACCACGTTTGAAGCTGATTGTCCAAAATGATGAGCGGGAGTGGTTTATTGTATTTGTATCTAAAGCAAACCCAAATAACGATCAAGCCGCCAAACAGGCAAAAAAAGTGTATAGCAAACTTGAAGTTGATTTTAGCTCGAAGAAGAGAGAAAGGTAACCTAGTACTTGACTTGTATTTATTTTTCTCTAGTGTATTTATTATTACTCATAGGCTCATGTATTCACCTGGTTATTGAAAGGTCAATTAGATAGAAAGTTAGTACCTCTTTAGAAGATTTTATGTATAGACAGTATCACATCAGGAACTTCACAGCCTTTTTATTTATATGTGATTTCAGACATGTCATTGTAGTCGCATTCATCTTACTATATTATTGCACGGCCTAAGGCCTTAAAGAATTAAATCTTCCTATCTCCAGATTTGACCAGTTATATTTCTTACACTATTATACTTTTCCATGTATTTGATGATGTGAAATATTCAAGACCTTATGAGATGCATATATTACTGGGACTCAAAGATGAAATGAAGGTCAAAAGCAACTTAATGAATATGTTTATATGTTTCTTTCAGGTGCTGTAAATTAGACATCCTTTGCCCTGAAGCAAATTTTTGGGAGGATCTAGAGTCCAAGATAATGGAGTCCATAAGAAATACCCTGGATAGACGTGTCCAGTTTTATGAAGATGAGATTCGCAAGTTAAGCGAACAACGGTTGATGCCAGTCTGGAACTTCTGCAATTTCTTTATTCTGAAGGTTTGTCATTTGCCAATATGCTTGGACATAGAGGTTCCCAGATGTTAATTTTATTATCATAATTGTTTTTGACTTTAGACCACACCAATGACCTTAGAGGTTCTAGGCCATTTGACGTAAGTAAACAGTGTATTCTCTAATTATTTAAAGTCCTGTTTGATTAAACCCTTTTCAACGTACTTATCATAGCAATTTTCACTTTCTTATAGAAGTTTTTGGATCTTTTAACACTTTATTATATCCCAGGAAAGCTTGGCATTTATGTTTGAGATGGCTCAGCTTCATGAAGATGCATTACGCGAATATGATGAACTAGAGCTCTGCTATTTAGAAACAGGTGTCATGCTTTTTTCTTTTCTTGTTTTTTTTTCTTGGGATAAAAGGTGTCGTGCATTTCTATTATACGAATATGTCTATATCCCCATATGCAGAAACTTAATTTCTACATTTTTAAGTTATGCTTGATATTAAATGAATAATACTCCCCTTTCAAAAGAAATATATTGTTTATGCTTATGGATATGAAAACAAATAAATAAACTAAGAAGCAAAAAACTCATCCTTTACTGATGGGTGCATCCTCTTGCCTCTTGATAAAGAAGGGTATCTTGGCTCTGTTTAAGGTAGCCCTTTTCTACATCCAATCCTATTGATAAATGTCGTTTCCTACTCACACATGCACACATGTGCATACCCCACTTTCCTTGACATTTGTCTGATTCAGGCAATGGTTGTATGTGTCACGATTTTTTGTCTTTCTGGTCAAGGAAACTATTGGGACCTTTTTTAGTTTCAGCACTTGGTCATGGCTGGTAATTTTCTTTGTGGTTGATGAAGTATAACGTAGTTGAATTGTGTAGTGAATATGATTGCAAAGCAGAGAGATTTTGGTGGAATTGACCATGGTGACGACCAAGCGACGTTGCTTAATCCTGGGAGCAAACCATTGACACAGATTGTTCAAGATGACTCATTCCGGGAATTTGAGTTTAGACAATATCTTTTTGCTTGCCAATCAAAGGTGTGCATTACCATTACTGAGATGACCTGCGTTACTGTTTAAGATTTATGTCCATGGCATTTCAATCTACAAGATATTCATACCTTTCTGGTCTGAGTTTACTGCAAATTTGTTTGTTACTATGCTTTTGCAATTCTTTTTAATCTAATTGACTGCTTCAAGTGGATTTTATAGCTGGTGAAATGTGAGTTTAAGTTGGTAAACTGCTGGTCTCTATGGAAAGTATGCACGGTTTGATGAGACAATGATGTTGGCTAATGCATTCTCCATTTTTATCTTGCATAAATTTTATCGTTTACTGTTTGGAGTGGTTATTCAGATAGCTTCAGTGTAATGGATCTGATGCAGCATAATGAATAACTATTTTGTCAATTTTCATTTGAATTCTAATGGTTAATTGTTTTAGTTAGTTGTTAGTTAGTTACCTAGTTCGTAGGTTATAGGCTAACCAACTAGTTCCTGTAAAATAGATGGTTAATCTTTTGTTATCGCCTTGCTTTTTGATTCCTAATAAACATCCCTTTGAGAAGTCTTGAAGATTTCTCCTTTGATGTTGGGTTCATTTAATTATTATTATTATTGTTAGTTCAAACGAAGGGATGGGCAAGGGATTTGAACCTTTTAACTTTTCAAGAAAGTTACTAATACCTTAATCTATTGTGATATACTAAGATTGGCCGATAGTTGTAAGTTGTAACCAGTTAATTTGTTGGCCAGCTATGTTGAATAATCTTACTTTGATATGGAAGTATTGAAGGAAATTGATAATCAAAATATATTTGGATTTAATTTAAGAGATAAAAAAAAAATTACCCTATTATATTGAGTACCCGTTTCTTATTTCAAATTAACAATCTGGTAGATTGTGATCATTGACTGAGAAATCTCTCTCATGCACACATGCACATTAACACTTGCACAAATAGTTGCACCCAAAAATTCATACAATGCTGAATACAACCAATATATTATTGTTGCCAATTGGATGGTACATGGTACCACTTGCTTGCCACTAAGTAATCAATCTTCCATATGGTATGTATGAAATTTTCTTTTAAATAAGATTTAAAATTTGCACTTCTATAGCTAGAGTTTCATCTAAATTGAGTTCTACTTTTGGCATCTTTTCATTGTCTTTTAGGTTATCTAAAGGAATTCTTTTCTTAAAGACTTGAACTGTCGCTCACCTACGTATATGTTATTTTTCAGCTATTATTCAAGCTGAATAGACCATTTGAAGTTGCTTCGAGAGGCTATACATTCATCATTGCCTTCTCAAAGGCTCTGGCTATACATGAGGTGTCTATTTTCTATATATTGTTTATCTTCCTGTGTATCATAAGAAATATTCTTTTGTAGCTAGTTAGAGATGCTATTCTGGTTGGGGATCTCTTTTCCCTTTCAATTATTGTTCCACGTTCTTCACTTAACAATTTGTCCTTCTCAAATTCCTCAGAACATATTACCTTTTTGTATGCGTGAAGTTTGGGTAACAACTGCTTGCCTGGCCTTGATCAATGCAATTGCTTCACATTTTAGTGAAGGTACTATGGCCCCAGATACAGAAAAGGAGTTTTTCCGCCTACAGGGGGATCTTTATTCATTATGCCGAGTGAAGGTAAAATTTCTTCTTAGAATGCTAAACTTTCTTTTCAGCTTATATACTTTTGTAATATTTATCGGCATTTTAGGTTGTAATTGTAGAAGGATCATACTGTGATGTTTCATCTTTACTTTATACCCATCTAAATAGTGCCAGTACTACTATCTCCTCTTCTTCTCTTAAGTTAAAAGTCCTTTTTTTTCACGCCCTTTCTGCTATCTTGTGAGTTGTGTCTGTCATCATTGAACACATTCAAACAT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MANFLAQFQTIKSSFDRLVIAVEDVSDLWPTVKNGFEERLPFKRACLNNKTRNPVLVDKLPAEFILTTDARLRSRFPQEQYLFWFREPYATVVLVTCEDLDEFKTILKPRLKLIVQNDEREWFIVFVSKANPNNDQAAKQAKKVYSKLEVDFSSKKRERCCKLDILCPEANFWEDLESKIMESIRNTLDRRVQFYEDEIRKLSEQRLMPVWNFCNFFILKESLAFMFEMAQLHEDALREYDELELCYLETVNMIAKQRDFGGIDHGDDQATLLNPGSKPLTQIVQDDSFREFEFRQYLFACQSKLLFKLNRPFEVASRGYTFIIAFSKALAIHENILPFCMREVWVTTACLALINAIASHFSEGTMAPDTEKEFFRLQGDLYSLCRVKFMRLAELIGYGPYIERSPVNSASLSMLPWPKPSIWPAVPPDASSEVLAKEKIILQETPRVKHFGIQKKHLPLEPSLLLREANRRRASLSAGNTLEMFDGRPAFIDGPGLDMSPKMSPNKTPGSSMSRTYSSPGFENTIDRPMRLAEIYVAAEHALKQTISSSDLWKCLSAVEEFEKKYLELTKGAAENYHRSWWKRHGVVLDGEIAAVSFRHGNFDLAAKSYEKVCALFAGEGWQDLLAEVLPNLAECQKELNDDAGYLSSCVRLLSLDKGLFLTKDRQAFQSEVIRLAHSEMKDPVPLDVSSLITFSGNPGPPLELCDGDPGTLSITVWSGFPDDITLDSLSLTLMATYNGDEGVKPIRSSTETVLNPGRNIITLALPPQKPGSYVLGVITGQIGKLRFRSHSFSKGDPADSDDFMSYEKPTRPILKVFKPRPLVDLISAISSPLLVNEPQWVGIIVRPINYSLKGAILHIDTGPGLKIVESHEIEMETYVDLLKSSIDVAHTGDSKNFERLCLSDGRLEFPDWASNETSILWIPIHAVNERLARGSTSATSQRLSIVDGMRTIALKLEFGAFHNQTFEKTLAVHFTDPFHVSTRIADKCNDGTLLLQVIIHSEVKATLTVYDAWLDLQEGFVHNGNDNGRPSSGYFPLVISPSSRAGILFSIRLGKTNNEDEGEVTNPESILNIRYGISGDRTLGAHLPVIIESSGIEDAKQDLLFKSALVLQRPVLDPCLTVGFLPLPSEGLRVGQLITMKWRIERLNNLQENEDSKCNLDDVLYEIDAKSENWMIAGRKRGHVSLSPDQGSRMVISILCMPLVAGYVRPPKLGLPNIDEANISCNPAAPHLVCVLPPPLSSSFCIPA Homology
BLAST of Cmc04g0094881 vs. NCBI nr
Match: XP_008454662.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2520.0 bits (6530), Expect = 0.0e+00 Identity = 1249/1250 (99.92%), Postives = 1249/1250 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. NCBI nr
Match: XP_004150108.1 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog [Cucumis sativus] >KGN59892.1 hypothetical protein Csa_000999 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2498.0 bits (6473), Expect = 0.0e+00 Identity = 1233/1249 (98.72%), Postives = 1242/1249 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. NCBI nr
Match: XP_038897998.1 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2449.1 bits (6346), Expect = 0.0e+00 Identity = 1212/1249 (97.04%), Postives = 1228/1249 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. NCBI nr
Match: XP_022139450.1 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog [Momordica charantia] >XP_022139451.1 trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2348.2 bits (6084), Expect = 0.0e+00 Identity = 1161/1249 (92.95%), Postives = 1201/1249 (96.16%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. NCBI nr
Match: KAG7037391.1 (Trafficking protein particle complex II-specific subunit [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2340.8 bits (6065), Expect = 0.0e+00 Identity = 1153/1249 (92.31%), Postives = 1205/1249 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4K0C4 (Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TRS130 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1916.7 bits (4964), Expect = 0.0e+00 Identity = 942/1258 (74.88%), Postives = 1072/1258 (85.21%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2QNU0 (Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TRS130 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1764.2 bits (4568), Expect = 0.0e+00 Identity = 858/1264 (67.88%), Postives = 1031/1264 (81.57%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q556Z3 (Trafficking protein particle complex subunit 10 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=trapcc10-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 221.5 bits (563), Expect = 5.4e-56 Identity = 288/1373 (20.98%), Postives = 543/1373 (39.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3TLI0 (Trafficking protein particle complex subunit 10 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Trappc10 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 8.8e-22 Identity = 77/291 (26.46%), Postives = 133/291 (45.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P48553 (Trafficking protein particle complex subunit 10 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TRAPPC10 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 1.3e-20 Identity = 77/291 (26.46%), Postives = 131/291 (45.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ53 (LOW QUALITY PROTEIN: trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495014 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2520.0 bits (6530), Expect = 0.0e+00 Identity = 1249/1250 (99.92%), Postives = 1249/1250 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LGE1 (Foie-gras_1 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2498.0 bits (6473), Expect = 0.0e+00 Identity = 1233/1249 (98.72%), Postives = 1242/1249 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CCB8 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010378 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2348.2 bits (6084), Expect = 0.0e+00 Identity = 1161/1249 (92.95%), Postives = 1201/1249 (96.16%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FKM3 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446289 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2338.9 bits (6060), Expect = 0.0e+00 Identity = 1153/1249 (92.31%), Postives = 1203/1249 (96.32%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J1W0 (trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480507 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2336.2 bits (6053), Expect = 0.0e+00 Identity = 1154/1249 (92.39%), Postives = 1202/1249 (96.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0094881 vs. TAIR 10
Match: AT5G54440.1 (CLUB ) HSP 1 Score: 1916.7 bits (4964), Expect = 0.0e+00 Identity = 942/1258 (74.88%), Postives = 1072/1258 (85.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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