CmaCh19G002990 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGGAATCCATATCCATCAATTGAATCCAATCATAGAACACGCATACGGCAGCACTTCTGTTCCGCCATCTGTAAGGCCGATCGGCTTTTGTTATTTCGGGGTGGAGGATTTTCTCTCTTTTCGGAGCAAAAAATATCAAGCTCAGCTCATTTTGCTTTCAATTTTTCCAATACAACCTCCACATGGAGGTTAAGATTCTTCTACTTCAGCATCTCCCATAAACATGGATTCCCATTTCGAAGGGTCCTTGAATTGAAACAGAAATGCTCTGTAAACTCCCTTCCACGTGCTTAAAATCATCTTCCGCAGGATTGGATCCTTCGATTTCTCACCATGGTTATAATCGCAAGTTTGGATGTTCCACTAGAAAGAATGTTCCAGAGCCCAAGTATCGGTTTAAGATTGTGGGTCTTTCGAAGGGAGATAAATGGCCTCTCAATGACATTGATGCAAGTGAGTTTGTCAATACAATTCTATGGATTTGAGTTTATTTTGTATATCTGTTTCTGTGTTTTCCTGGTATAGCTGTTTGATTTCTACTTATGTAGCTTTTTGGTGAAGAGTAATTACTCTTGGCTGTGATTGAACACTAGATCATTTCATGATTATTTTACTTATGGAGCTAGAAAATAATATTTTAGATTGAATGCTGATAGTCAATAGACATGGAAACTCTAGGTGTTCTTCTTTGTTATGGTGTGTGTATATAATCTGTGGCAGCTTTGATATTGTGAAAGTAGGAAATTTTTAAATCTGGAGGAGGAAGTTCTTAGGGTGTCATCCTGTGTGTTCCACGGCGAAGTGTAGATGAATGGAGGGAAGCGATGAGGTCGCAAACTTCTATGAAATTTGCTTAGTCAGTGATGGCAATTGTTGGTCATGTAGTGTCATTTGAAGTGGTCGTTGGAAGTTTGATGCGTGGTGTCATAGTTATGCTTGTCCGTGGCGTGTTGCCTGTAGCCGCATGTTGGATGTCTCGATCATGCTTGTCTAGGGTGTGTTGTCCATGGCTGCATGCCCGTTCCAAACCCCTTTTACTTATTTTCATATGTAGTTAGGTCATGATTATTCTTGTCATGTCAATATGGGGGTGCATGACCATTCACCAAAATCATGTCTACGCTCGCTAGGGTTAAAATGCCCCAAAATGTAGCATAAAGGGATGTGACGAATTGGATGTGACTAATTGTCAATTCTTCCTACCTAGGCTATACCTATCAAAGCCATGGTTTTTGCTTATTCGCTTTAAGCCTACAACATTGTTTTCAACCCATTTCCTCGCTCATGTTTTCTAAAATATTTCTTAAACGTGACTTAAGGCTCAATCATACGTCAAGATTGTCCGCAATGTTTGACTCTCACACAGCTGACTAGTTTGTTGGGTTCAAATAATTGCCGCACAATCGTTCCACTGCCACAATTATCATAAATGTGAACGGTCGACAAGATAAATCTAAGCTAACCAAAGTACTTAAAAGATGAGAGGTTTCATGAAAATGGCATGAGAAAAATAACAAAAAGAGAACACAAACTAAACTGACATTTAATGCTTTAAACGGACAACAGTAACATAATTAATTAAAATGATAGTGTTTGGTTAATATAACCGAAGCGACATTGTTTTATGCTAACATATTAACACTCCCCCTCTAACCAAACAATAAGGAAATGATGTGGAGTTCGTGACGCAGCTCAATGAACTTGGCCTCTGATAACGCTTTGGTTAGTCCTTTTGCAAGCGATCAGAGTTGGGATCATGCTGCACTTGCAAGGATTTGTCAAGGACTTTATTGTGAATGAAGTGTATGTCAAGTTCCACATGTTTATTCAGGTATTATGAAAAACTGGGTTTGAAGCAAGGGAAAATGCGCTGATGTTGTCACACCAGATACTTGGTGTAGCAGCAACTGATTTCATTGAAAAGAGACTGAAACCAGCTAATCTCAGTTACTGTGCGGGCCAAAGAAAGGTACTCTGATTCTGTGTTGAACCTTGAAACATGTTGCTTCTTGGATGACCAAGCAATTAAAGAATGCCCAAGGAATACTAAGTGTGAAGCTATAGATTTTCAATCATCATGTATGAGCACGCCCAATCTACGTCTAAGTATGCAACAGTGGAGAAGTCAGCATATTTGGGAATTTGTAAGCCATGTGATACCTTTGATGTTATTGACGGCTTGCAAATGGACGGATGTAGGATTCAGAAGAAACTGACTGAATTTGGTGATGGTAAATCAAATTTTAATTCTTGTGTGTGTAAGGTATCGAAGGGTTCAATCGCAGTTCGATTTACAATGTAGGATTTTCCATTAGTTATCCGGCATTGGCTGTTAGGTATTTCTAGTGATGGTTGGTGTAGAGCATGGCTTGATGCGAGCTAGGACGAATCTTTCGAGAAGATTCGATGCATACTTGGTTTGGTTGGGATGGATTCCATTATTGTCAGGATGAACTGAAATACCAAGGAAGTAGGATAGATTTCCCAAGTCCTCCAAAGAAAAAGTTTTGTTAAGTTCGACAACAAAATAGTTGATGATAGCAACGTCAGTCCCTGTCACTAACATGTCATCAACATAGCTTAGAATAAAGATCTTAGTTGATGCAGTAACAAGCAAAAATTAAGAATTATCAGCTCTTGAATTTTTAAAACTCCATTGCAGTGGCACTTGTCCAAGCCTCTCCATACAAAGAGCCTTTTGCAGTAATTGCAAACAGTCAAGAAGCCACCACAAGCCCTAATTTCATCCATTCCACCACAAGCCCAGATTTCCTCTCCTAGCCAATCACTTGCAAGATGACGACATTATGAAGCATTCATTTGACGAGGCTCTTCATTCCTTATTCCAAAAGGAAAATCTAATTAACGCTTCAGCAAAGAAAAAAACTTCTGATTTGAGGATTTCTAAAGCCCTATTAACAGTAAGATCTTTTGTTTTCTCCTTCCATACTGGACAAAAGGAAATTCTCTTGATTTCTTGAAGTTTGTGGTTTTCAAGTTCGTGAAATTATTCCAACATCAGAAGAAAAGGTCAGTGTTTGGCCATTGGGTTCCCTGAAGCCTTTCATGGATCATATTTTTTCGAATTCTGTTAAAAGGAAACAGATGTTTTGTTTTGTCTCTTTTGTTGGTGTGTTTGGCGGCAGCATTTCATGGGGTTTTGTTGTCTCAAGAAAGTGCTTTTAGCGTCTTTGGCTACATAGATTTTTGTAAGCAAGCCTCTTATTTGGCTAGATCACTTTGATGCCGCTAGTGTAAAGACTTCCTCTTGACTTTATCTATTCTAGCTTTTTGTTGGGTTTTCTTTTCAGTTTAATTTTTTAATATGGGATGATAAGTTTGTATCTTTGGAGCATTAGTCTCGTTGTTTATCATTGAAAGCTTTGTTCCTTGTTTTAAAAAAAGGTGTACATTTTCACTTTTGGCCAATAGGAAGTGCTTTATGTAGATTCCTTGGAAAGGGGCTGTTAACCTTCTTATTTTACGTAATTTCATCTTATAAAAAATGAATGTTTTCTCATAAAATAAAAGATGTTGATATGTCATATGAAGGTCAATGGTTAATTCTTATTGCCTTTTTATCTTAGTATTGCTTTTTTGTTTCCCCTCCTCCCTCCTAATGCTGTCTTGTCCGTGCTCTATTCCCATATTGACAGACGCAGTGCAACAAAACTTAAACAAATGGCTGCTGAAGACGCAAAACTTCTTAAATGAAGTTACATCTCCCCGGGGGAAAAACAGTAAGAACAAAGATCATATTCCAACAGGAGCCTCCACCGACATAGAGGATCTAGTTATGGCGGAATATACTGTTAATATCAGGACACCGAATGGCCTCCTCTCTTCTACTGCTGTTGTATCCATTGAGCAATTTAGCAGGTCAGATTATTATAAAATTTGGTCATTTAATCTAAAGATAATTGACATATTGTTACCTTTTTGACTTATTCTTCATTTTAATGGCCCCTCCTATTAGACATCATCCATTACAGTGTTTGATTATTTAGCAGATTTGCCCAAAATTTGAGATCATATGAACAATCAAAGCATATGATTGTCATCATGAACATCATAATAAGATGGAAATGATGAAATTGTGCCTCTGGAAATCATTATTCAACAATGTGTACATTGAGTTGCAATAACGAGGCTAGTCATGTGTGAAGACTTTGTATATAAATCATTTATGTCCCATGCATATTTGTTTGAGGATGAAAACCTTGTTATGGCGTGGCAACAGTTTCACTTAAAATTGTTGAATCATCAAGTTTTATTGATGAAAAGAAGCAGATATACAGATCCAAGTATTTCCTACCAGGTAATAGAAACTCAGAGAAAGCCAGGTAACTAAGTTTCTCTGGAGTTCCTAAGACTGCGAATAAAAGGTCCAGTTGTTCATTAACACATTTTTTTTTCTGCATGCATGGCTATTTATGGCCTGCATACGGACAAAGAAAGAAACAGAAATCCAGAGATCCCTCGACGCAATTTATAGGAATCTGAAAAAGGAATAGTAAGCTTCTAGAAGGAAACAGTTTAGTCCTGTTATTACAGCATTCACTGATTTATTGTCAACTAGCTGGAAGAAAACAGGTTTTTGATTATCTGTCACGTGAGATGGCATTACACTCTCCTCTCTAACTGATTCAAAGATATTCTATCGGTCCTGTCTTGCTGATTATTTCCTGAAAGACCTTTGGCAGTGGTTTAGTTTGCTCATGTGCAAGTTGATTTTGAATGGATGCATAAGGAGTGCAAATAAATCTTGCTTCCAACTTCTCCTCATAAAAGAAAAGACCCTGTAGGATATTGTAGAAGTAGAACCAACATCACAGACATATCCCACTGGGTTGTGTTCATTACTGATGGCTACTTTGTTATCATATTCAAATTTAATCGGAGGTTTACTGTATATTTCAAGTTTTTCCATTAAGATTAACACTTAACCATTTTTTTTCTTTAGAAACTAGACTTTCATTATCAAAGAAGCA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BLAST of CmaCh19G002990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HX34 (uncharacterized protein LOC111467032 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467032 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1611.3 bits (4171), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/816 (100.00%), Postives = 816/816 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HG64 (uncharacterized protein LOC111463987 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463987 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1596.6 bits (4133), Expect = 0.0e+00 Identity = 808/816 (99.02%), Postives = 813/816 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DTB7 (uncharacterized protein LOC111023786 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023786 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1428.3 bits (3696), Expect = 0.0e+00 Identity = 731/820 (89.15%), Postives = 770/820 (93.90%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B8Z7 (uncharacterized protein LOC103487477 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487477 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1368.2 bits (3540), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/898 (79.84%), Postives = 760/898 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS40 (uncharacterized protein LOC111023786 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023786 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1206.0 bits (3119), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/680 (90.59%), Postives = 646/680 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. NCBI nr
Match: XP_022967569.1 (uncharacterized protein LOC111467032 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1611.3 bits (4171), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/816 (100.00%), Postives = 816/816 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. NCBI nr
Match: XP_022963792.1 (uncharacterized protein LOC111463987 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1596.6 bits (4133), Expect = 0.0e+00 Identity = 808/816 (99.02%), Postives = 813/816 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. NCBI nr
Match: KAG7011441.1 (hypothetical protein SDJN02_26347 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1593.6 bits (4125), Expect = 0.0e+00 Identity = 807/816 (98.90%), Postives = 812/816 (99.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. NCBI nr
Match: XP_023554740.1 (uncharacterized protein LOC111811914 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1572.0 bits (4069), Expect = 0.0e+00 Identity = 798/816 (97.79%), Postives = 806/816 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. NCBI nr
Match: XP_038887911.1 (uncharacterized protein LOC120077886 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1491.1 bits (3859), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/817 (92.66%), Postives = 785/817 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. TAIR 10
Match: AT1G71240.2 (Plant protein of unknown function (DUF639) ) HSP 1 Score: 921.0 bits (2379), Expect = 6.7e-268 Identity = 479/813 (58.92%), Postives = 606/813 (74.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. TAIR 10
Match: AT1G71240.1 (Plant protein of unknown function (DUF639) ) HSP 1 Score: 916.4 bits (2367), Expect = 1.6e-266 Identity = 479/814 (58.85%), Postives = 606/814 (74.45%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. TAIR 10
Match: AT1G48840.1 (Plant protein of unknown function (DUF639) ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 4.1e-68 Identity = 211/756 (27.91%), Postives = 368/756 (48.68%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. TAIR 10
Match: AT5G23390.1 (Plant protein of unknown function (DUF639) ) HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 7.8e-67 Identity = 204/723 (28.22%), Postives = 349/723 (48.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G002990 vs. TAIR 10
Match: AT3G18350.1 (Plant protein of unknown function (DUF639) ) HSP 1 Score: 248.8 bits (634), Expect = 1.5e-65 Identity = 204/693 (29.44%), Postives = 354/693 (51.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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