CmaCh18G002560 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh18G002560
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr18: 1350286 .. 1353030 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh18G002560
SyntenyCmaCh18G002560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATGGTTGTGAGGTGGACGGGGAGGCCATCGGTTTTTAAACGGCAGCAAGGCGGCGGAATCGCACCAAGAAGGTTTCGTTGTTGCCCTAATTTGCTAAAGGGCGTTTAAGGAGAGCGCAAAATCTGCTGTCTTGGGTCAATAGTGGGCCGGCCCAATCACTGGACTACGACATGTCGTCATTCACTTTTTTATTTTATTTTAATTTTGTTAGGCTTAATGTTTTATTATTAATTTAATATTTTTCTTTCTATTTTTAAAACCTTATTTAAAATATATACATATATAAGCACACTTCAAAAGAGCTTATTATAACGGAGAGTTGTATGATATGCTCGGAAATGATGAATCGCTCTCGAAATAAAATCCATCGATTCTTTTTTAATTGCTTGACCCATCAGTGCGACAATTTGTTTCACGAAAGAAGTCTCATTCGGTAAAAATATTTGTTAAAATCATGTTCTTATGCTCAAATGTTATGATGCATATGGTAAACCGTAATAGAAAATTAAATACATGTTTAAGACGGAATTTTAATCTCCTTTTAAAAACTATTTTGTTAGTGAAAGTACCATCCTACCCATGCCAAACAGCCACCGTACTCAGATACACAAGGAACAGCCTTGTCTTTTCATCCGAGGTGGAATAGGAATCCAAGGTTAAGCTTAGTATTCCCCTGACACAAAAATAAATAAAGAATAAAATAACTAAAAAAATAAATAAATTAAGCATTGCACGTGAGCTTCTTTTTTTTTTCATCGGCCCCCACTACTTTTAATATTTGCACGTGTGCACACATTTTTTCTATAATTATTTCTAATAATTATTTCTATAATTATTTCATGTCTGTTCTGGAGCTCCAAAAAGTAAAAAGCTATTTCTTCTGACACGTTTAATATATTTTACTTATAAAATGAAAAAAAAAAAAAACACATTTTTTTTATTATTCATAGTTTCAAGTACTTATTTTCAACGCACATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAGTATTTATTAGTTTTTTTTTATTTCTATATTTGTGAAAATTTATATAACTACTTACCATTAAACTTTTTAAATGAATTTTGTATTAAATTTTGAAATTAAATTCATAAATGCTAATTTCTTTAATTTTTAAATCTTACATTTTTTTTTTCAAAATACAAGTCGAGTATTGAACATAGTAATTTTTAAAATTACTTTTATTTTATATTTAATAAATACCTTATTAAAAAAATTATATTAGATATTATTAGATATAAAATTAAATTAATATTTAAAATATCAAATATTATTTAAAAAAAAAATTGTTTACTCATATAACTATGAACTTCTTATGATTGAGTCGCTCAGAAAGGAGAGGTATCTTTGTAACAACCCAAACTCATTGCTAGCAAATATTGTTCGATATGGTCTGTTACGAGTTGCTATAAGGTTTCTAAAACACGTTTGCTAGAAAGAAGTTTCCACACGATTAATGTTTCGTTCCTCTTTATAGTCGTAGGATTTCACCAAGCTTATGATATAAATGATTTCCAATTATTTTAAGTCTTTTTAGTTATCGTATTTGTTTGAATATTATAATTAATATCTTTTAACATTTAAAAAATATTTGAGTGATAAATTTGAAAATTAATAATATTATAAGTAAAAATAAGAATCCAAGAAAAGGACATTGAAGTTAGACATAAGAGCTGCCTCCAATAAGAAAACCCTTGCAATTACAGCTGTTTGCCAATTCTTTTAGTTTAATTTAAAAACCTTATTTAATTCACATAAATAAAAAATATATAATGGTAACCACAACTCTTACACAAAGAACATATTCTTCCTTGATAAAAACATTTTTTTAGATTTAATTTAATTATTCCGACAAAAAAAAAATTTAAATCATATAGGTTGGGTTGGGTTGGTAGACTCTATGGATGAGGTTTTGGAGTTAGCTCACTCTCGTAGGATCATGACCCTTTGTCCCCACCACTGTCACACATGTGTTGGCTAGGGCTTAAGGGGCATGATGACTTGACGTCATCCTCACCTATCACCGACAGTCTGTTCAGGGTTCCAACTTCAATGGTTGGCTACCAAACACAAGGGTTATGCTCGTTGCAAGACTTAACCCAACACTTTATGCACGAGCTGATGATGATGACAAGATCATGACAGCCATGCACCACTTGTACCCACATTCCCATTTATTGATTGATGTTTTGACAAATCGTTAAATTTTATCGAACAATACCAAAAATACATCAACATCAATAAGATTGGTATGAAATTTAATATCTTATTCTAATAAAAACTTTAGAATAAGATATATAATTTAATATGAAGTATTATATTAATAGGCGTGGAAAGTAGCGATGTTTTGTTTTCTCTTTTGCTTTTCGAAGGCAGCGAATGAATTTTTGGCATTTTGATACGCAATTTGTGACGAGAGAATAATGGCACTGCACATGCTGTTGCATGCCATTTACTTCCCTCTGCCGCTGCTCGCTCTTTTATTTCCCGCAAATCAAACCCCGTAGGATTCATCGGCGATTCATAGGCGGTTCATCACTCATCACTACCACTGATTTTCCCCCTTTTCCCTCTTTAGAATGATCTGAGATAGTGTAAATTCATCTTTATCCACTTGATTTCTAATGCATTTTGCTTCTATTTGAAGTTTAATTCATCTTTTGAGACGTTTCTCCATCATTTCGATGGTTTTTGCAGATCGGTTTCTTTGATTTAGCATTTTAG

mRNA sequence

ATGATGGTTGTGAGGTGGACGGGGAGGCCATCGGTTTTTAAACGGCAGCAAGGCGGCGGAATCGCACCAAGAAGTGAAAGTACCATCCTACCCATGCCAAACAGCCACCGTACTCAGATACACAAGGAACAGCCTTGTCTTTTCATCCGAGGTGGAATAGGAATCCAAGGTTGGGTTGGGTTGGTAGACTCTATGGATGAGATCGGTTTCTTTGATTTAGCATTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGATGGTTGTGAGGTGGACGGGGAGGCCATCGGTTTTTAAACGGCAGCAAGGCGGCGGAATCGCACCAAGAAGTGAAAGTACCATCCTACCCATGCCAAACAGCCACCGTACTCAGATACACAAGGAACAGCCTTGTCTTTTCATCCGAGGTGGAATAGGAATCCAAGGTTGGGTTGGGTTGGTAGACTCTATGGATGAGATCGGTTTCTTTGATTTAGCATTTTAG

Protein sequence

MMVVRWTGRPSVFKRQQGGGIAPRSESTILPMPNSHRTQIHKEQPCLFIRGGIGIQGWVGLVDSMDEIGFFDLAF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 15..36

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh18G002560.1CmaCh18G002560.1mRNA