CmaCh14G008790 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGTTTCCGACAGCTTTGGCTTTGCGCCGCTCAGCACAGCATCCAAGACAGGACAGGTCCGTCATGCAGAGAGCCACCGGCGAGTACCATGTTGCTGCTCTGGTCCCCTCCTCCTCCTCCACCACCACCACCACCACCACCATTACCCCCACCACCGCCACCTTTTTTTAAAAAAATGTTTATTTAATCAGTTACTTAGCACTTACAGTTGAGTTGCAGCGGATCTGTGGTAGATATTATAAGGATTTGTAATCATAATTTGAGTCACGAATTTTTGCAAATATGCTTCCCTTTCTGGTTTAGCCCCCACAATAAAGTAATCTCTACTCATGTATATGAATTTAATATGTTTTTATCTATAAAGTTGGTGGATGCCTCCTCGAGTTTTTAAGTATTATATGTGGAGGATTATTGGAGGTGAGTCTCATCTAGATAATTTAGTGAAGACCGTGAGTTTATAAGTGAGAAATACTATCTCAGGCCTTTTGGGAAGCCCAAAGAAAAACGACGAGAGCTTAGTGAATAATATCATACAATTGTAAAGAACCGTAATTCCTAACATACGATTTTTCATTTCTTTTACTTTCGTATTCGTCGATATTAGGTTAAGTAGAATTGAGTTCGAGAAATTTTTGGATCCATCTAAAATTTCAAATTCATCGAGTTAGTTGACCGAATGAATCGAAAAGAGTTGCGATCCAACCTAATCAAATCTAGTTTATCTCAAACTTGCTAAAAATGGACCGGATCAAGGCTAAATAATCTAAGCCCATTATAAAAAATTAAGTTAAGCCCAAATAAGCTTACACCTAAAAATATGATATTTTCTTACTCATGGAAATTTAATTTAATTTAATTTTGGGATTTGTTTTAGTTACTCCATAATTCTAATTAATAGTGGTTTATGTCATGAAATTCAATAGAAATCATTTTTAAAAAATGGTTAGGAAAAAATTAAAATAAAAATGCCTAAAATTTTGATTTTCAAACGGCAACAGCTTCTATTTTTATTTTTATTTAATTCTAAAATAAATTCACAATATTGCATTTAACACATCAAATTTGTCTTCTGGCTGTCTATTTACCCTCTAAAATTTTATTTAAATTCAAATCTTAGATTTTTTAATTCTTTTTTATTCTTTTTATTTATTTATTTCGTTAAATTATAAATTTAATCTTTTAACATTGTTATCTATTTTATCCATAAATTTTTAAAATTATAAATTATTTAAAATAGGCAGATTTATCGCATATAAAATTAAAAACTTAAACTTCTGCTACATATTAAATTCAAATTATATGCTAATTATTTTTTAAAAAAATTAAAAATTTAAAGAAATATTGAATTAAGATTTATATTATATTACCAAAAAAAGTAAAAAAAATTGTTTTGTTAAGAGTTATTGGATTATATATATAATTGCATCAAAAACATTTTTTTTTTTAATAATTTTAACCAAATTAGTTCATAAATTCACAGTTTGTTTTAACACAAAATTTGTGACAAAAAAAAAAAAATGTTTTCGAAGAGAATACACAAATTAAATTGGTATTAGAAAAACACAAAATTAAAGGTTATTATTATTATTTTTTTAAATTTTAAATATTTTAAATTTGAGAAATGAAATCTTGTAAACGAATCATGAAGGAGGTAGGCATTTCAGGAAAGCAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGAAGCAAATGACCAAAAAGCTGTATTGACGAGCAGAATAGAGTGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAAGGGAGGGAGAGAGAGACAGAGAGAGGGGGCATGGAAGCACTGAGATACATCTGGGAAGGTGCAATTCCATTACAGATTCATCTCCATGAGTCTGAAGTCACCACCATCCCTTCTCCACCGCCTGCAATGGTATTTTCTCTGTTTCCTCCCTTCGCTGCTGCACTTTCCCTTTTCTAACCATCAAATTTCAGGCTCTCAATTTGATCAGCAGATGACTATCATGGCCTCATTCTGTTTATTTATCTCTTTTCCTCTGAGAAATTTGACTTTTTTTCTTTACAAGGGTTGTTTGTATTTCCTGCTTCTTGTGTTTTTCAATTTGAAGTTTTGAATAAGGGATGGTTTTTTGTGTCTACTGTACCCCAAGTACATCGATCTTTGATTGAACTGAATCGAATTGCTTTCCATGTGGAATTTGTATTTTGATCTACTCTAGGTCTTGGCTCCTCGGATTGGCTACTTGCCTCTGTTGGCTTCTCAGATTAAACCTTACTTCAGTAGTACGCTTCCTCCTGGAGTGGACACCATTTGGTTTGAGTACAAGGGTTTGCCCCTTAAATGGTACGCTCTTCTTTTCTCTTTTAAATTTCATCTTTGTTAATAGTTTCTTCGAATTTTGTAGATCACTTTGAATTTTCTTTAATAATATACTACTATTCTCTGTTTTTGTCACTACGACACCGCTCTTCTCCGTCATTCTATGTCTCTTGGAGTTGTACTTCTGGCTGTCTTGTATAACTGTTCTTGCTACTTTTTCGCTTTTGATAAAAATCTGTCTCTCTTATTGCGTATGGCTCACAAGGTACACGGAGAGGAAAGCTGAAAATTGAAACGTGTTAAATTAATAATATGTACTATGTTTTAGTAGGAAGAACTTCCGTTAATATTGAAGACTATAGAAAGAAGAAATAGGATAAGATATTCATCTCAACCTAGTGATTTAGAATGGAAGAAGATGATAGACATTCATGATAAAAGAAAATGGTTGAAGGGAAACAATTTCGTAGGTAAAGCAAAAGAAATGAGAGGGAAAGATAGCCTTCACCAAGACTAAGGTTTGTTATATCTGTTAAAGCATGATTACTAAAAGTTTTGTTAAGTCTACACCATCAAGTCACTGTCTAAAGGACGTGATCCCCAAGAAAGGGGGAAGTTTTCCCCCCAAACACCAAAAACACGATGATTCCTTTCTAACCAAAGATTCCATTAGAAACTTGTGATGAAACTGATCCATAGAAAGTTAACCTATTCCTTGGAGGACGGTTTGTAGGAGGGAGTGAGGCTTAACATGACTATAGCTCAACTGGTTAAGGTATATGCCTTCGACCAAGAGGTTAGATGTTTAAATCTCTCCATCCTGCATTTTGTTGAACTAAAAAGGAGGGAGTGAGATTGGAACTAATGTCTTTATCTTATGGATGGGCATAGCAAAAGTAGGTTGTAATAGGATTCCACATGGTGGTGACGAATTGGCAATGAACAAAAATGTGGTGTTGCTGTTTTGAGGTCCTTTTGCAAAGACCAAACCAATTAGGGGAGAGAGCTGGATGCAGATTCCTCCTCTGAATTTTGTCACGGTGTTGCTGTTGTTTAGACTTAAGAGCAATTTCCTTAATGAAGATCACCAAATTGCCTTGCAAAAATTAGAATTGAATAGTTTCCTATCGATGTTAGGTCTTTGGGAAGAGACTTGCACATTGAATATCCTGAAAGGTAAAAATTTCAAGACCATTAATCTGGGGAACTCGAGGAGGATCAACCTTAAATATGTCACGAGGGAGAGAGTCCATCTGCAAAGTCCTTGCCATTAGAATTTCTTGTGAGCAAATTCCAAATCAAAAGTTCATTGACTAAATTTGGGCAACTATCGTATTTGAATCAACACAAGGGGAATAAAGTTGTGGGTAGAGGAAGCAAGGGAGGTTTTACCTCTCCAAGGGTCTTGATACAACAACACTAAGAGCTTTGGTGTAGGAAACATCCCAACCATGAACCTCAACATTTTCGTATCAATACAAAAAAAAAATACCTACGAAAATGTTAGAAACATATTACTTTATGGTTTATGATGAAAAGATTTGAGAATTCGTTCTTATCTCAGGTTTCAAACACTTCACAAGTTTGGTAACCAAACTTGAATGTTTGAAGATATGCAATCTTAACACTAGGCTTGCAAAGGGAACTGACACTCTGTTGTGTCAAGAAAAGTAATCAAATATCGGTCATCATCAATGTCTAAGAAGAACATGACATTCCTTGGGTTTATATAACCAAGGGTGAGAAAAATGGAGAATCTAAAGACTAGAGCTTGAAAATCCTAAATAATAAAGGGATAATTAAAAAATTATTCTAAAAATGGGAATTGTAAGATAATTGACAATTGATCCATCTAACATTCATTCCTAAGAATCATACATCGAGTTAAAATTGCAAAAATTGAAAGAAGCAAAATTCTTCAGGAAGGAGAGAAGGTTGGCAACAAGACAAGATACATGGGCGTAAGAGTGGTGCACGACAAGCAGCTGGTGGGTGTGCATCTAGGTCATTGTTGATCACATGGGTGTCGGGCAACATGCCTAGGGCATTAAGGCAGCATGCAAAGACACAAGTTGTTGCAAGGCAGGGTCTAGACAAAGGGCGTATGGCCGTGAGTGCATGCTGGCTTGTGCTGATAGGCCTACGTGGGCATGGGCTTCCTTTATGGATGCACAATGATGGGTTGTGTGAGGAAAACACTGATGGGCTGTGGAGACCACGGGTGCATGGTGGGAGCACAAATAGATTGTTTGACACCAATGGTGTGGGCATGTGGATGAACTTATGGTTGACTAGCGTAGGGCATCAGGTTTGCTCCTCAGAGGTTTTTTGTGGGCTTTCTTTTGCGATGGCATATTGAGCTTAATAAGTGGTTTCCAACTTTTGAGCCAGCTCCTTGCAATCTTGGATCTTCTTGATGTGGTCAAGGCAATGGTTTAATACCATTGTCAAAAGAATGGGAAACTCAGTAAGAGATTAGCTTTTTTGGCTTTCCAAATATTCTTCCAAAGGACTTTGGAGTGCTTGGTGTCATTCGGTGACTAGTTGCTAGGAGAAGGCTCAAATTTAGCTTTTAATGTTTTTTTTTTGAAAGTGAGCATTTTTTTCGTGAGTATAATGGTATGCCAATAGACCGACACTTTTGAATTGACATAAAAAAATGGCGAAAAGTCGTTACAACA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AATGCCATTCTGTATGTGGGTACTACCTAGGATTAGGTCTCCAAATCATGCAGTTGGATGTACCTTTTGGGGAATGGAGATAAATGTGGAGGGATTTTGAGAGGTTTTGTCTGCATTTACCTTGTAGTTTCTGTTTGGAGATATGAAAGCTGGAAATTAGAGAAAGTTTGGGAGTAAAGAAGAGGAATTTTATAGGTTTGGGACTATATTGCCCTTTGGTTTCTTTGTGCTTCTGCTAAAAGATTCTTTGTCCTCTGTATCTAATTTGCATATTGGAGTTTTATTCTGTAGACCCTTTCCAACTTCTTTCCAATGGCAGTGATCCTTGGGTAGCCACATTTATACCAAATGTAGACAATAATTACAAAACGTAACCATTGTAACCATTCGGTAGACAATAATTCCAAGATGTAACCATTATTCCTAATCATTTGTCTCTTCATCTATCCTTTTAAAAGAATTCACCATCAAGTGAAGTTTTTGACGGCATATATTTTCTCTTGGAGAGGGAGAGTTGTTCCAAATTGTTGTTTTGACTTCAAATGTGAGAGGTTTTGGTTCTTGCGCTAAAAGAACCATTGTCCACTAAACCAGACTTTGTGATTCCCATAGAAACGAAATCACGGATGCTGAATAGAAACTTTGTCAAATCTAGGGCATCTTTAGATGTGGATGTCTCCCCTGATTGTATTCTCGTTCTTTCGAAGGATGTCCTTGTTGAGATTATTGAGGTGCTTTAGGTAGGCTTCCTCTTTCCATCCTTGTTTCTATTTCCGATGGATTCTTTTGGCGGTTTATTGGGGTTTATGGGCCATCTTGTGGAAGGAGAAACCTCTTTAAATCAAACTAGTAGTGTTTTATCATTCTACTTTCTGGGTAATCTTTATTAGAAGCAAAAGAATGTCTATTAATGCTTCTGTATGCCAAGGAAAGCAAGTATTGTGTTGCAAGATATTGGATTTCCATCGAACTTTACATGAGGGTACCGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTAAGTTTGCACTTACATCTGTTACTCTCTTCCTTCAAGGCTAATATTCATTTACCCCGCTTTATGTTATCGTTTCACTTGTTAGGACAAGTTTCTTATTATTTAAGCATGTCCAGGTCGAATTCCCGTTCGATTGTATGTGAGGAATGTAGGTGAAGATTTTGATAATTTAGAAGATGCACCACCAGTTAATAATTGGGATGATGTCTCATACATTAACCGTCCAGTAGAGATTCATGAAGAATGTAAGGCAACGCTATCATTCTCTTTGTTTTTAGTTTTCTTATTCTTTTGGAAAAGCCTATTTTATGAGTACTGTGTTATTGAGTAGCCAGATTTATGTTGTCCAATCGATCAAAGAATGATAACAGAAAGATAGAAGCTAATTTATGAACAGGGAGGACTGATTTTTCACGATGAATCATAACTTGTCTGGTGCTTTTTTTTAATTGTCAACTTGAATATAGCTCAATTGATTTAAGGTCTATATCTTCCACAAAAAAGGTCCACATAATAAATCCCCACCCTCGTATGTTGTTGAACTGAAAGGGGGAAAAGAACACATTGAAGCGTCAACTTGTATTGTATCGTTATGTAGCAATTTCATTTAGTAGTCAAAGTCTTCGGCATATGCAGAGATTCTCGTCCTCATCTCTATACATTGCAGGTAAGTGCCTCACCTTACATGATGCTATTAGGAGTCTGTTATCCGAGCTTTTCCTCGAGAAGGCAACTACCAAGGAGGAATCAACAACTATTATAGGTGAAGAAGAACGAAGTGATTGTACAGAACAGGTGGATTGTAAAAAAACTGAAGAGAGGGGACCAAATTTTTGTGATGAACATTTTCAATCTTATCATCCAAGCATCAAGCTTGTTAGGATCCAAGGGATTGAACCAAAATGCGAAATTCCTTTCTCCTGGGTGGTGAACAACTTAATGAATCCTGAATACTTTCTTCATATATGTGTTTTTGTAACAGTTCAACAAGTCAGATGCTAAGCTATAGGGGGCCAAAGAGGAAGCTAAGACCAAGTAGGTGTTTCTATTCCTTCATTTGTGGTGCTGGGGACTGGACTTCTTTTATTTATTTATTTATTTTATTTATTATTGTCACTTTTGAGAACAATTATTATGTGAAAAGTTGTACAGAAAGTAATGATATCAATGTCTATAAGTAGTCATCCATTTCATTTCTCACATCTGGCTAGTTTAGTCAATCTCCGATTTCAATGTTCAATCTTCCTTTTGATCCCACTATTATCATCTTATGGAAGTGTACTCATCCAACTATTCAATCC 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ATGGCAGTTTCCGACAGCTTTGGCTTTGCGCCGCTCAGCACAGCATCCAAGACAGGACAGAATAGAGTGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAAGGGAGGGAGAGAGAGACAGAGAGAGGGGGCATGGAAGCACTGAGATACATCTGGGAAGGTGCAATTCCATTACAGATTCATCTCCATGAGTCTGAAGTCACCACCATCCCTTCTCCACCGCCTGCAATGGTCTTGGCTCCTCGGATTGGCTACTTGCCTCTGTTGGCTTCTCAGATTAAACCTTACTTCAGTAGTACGCTTCCTCCTGGAGTGGACACCATTTGGTTTGAGTACAAGGGTTTGCCCCTTAAATGGCATATACCGACTGGTGTACTGTTTGACCTTCTATGTGCAGAACCAGAAAGACCGTGGAATCTAACGGTACATTTTAGAGGTTATCCAAGACAACTGTTAATTCCTTGTGAAGGTGAAGATAGTATAAAGTGGAGCTTTATTAACTCATTAAAAGAGGCCGATTACATTGTCAATGGGAACACCAAGAATGTCATGAGCATGTCTCAACCTGATCTGGTGGAGTTATGGCGTTCTGTATTGAATGGTGACTTGGAAGCCTACCTACGTATATCATCTAAACTTAAGCTTGGAGGAACTGACCACGAGCAAGTGTTGAATTCTATAACAACTTCATCATTGCCTGGTCAAAGTACTAGTGAGATGGATATAGCAGGAAAAGTAATGACAGGTCGAATTCCCGTTCGATTGTATGTGAGGAATGTAGGTGAAGATTTTGATAATTTAGAAGATGCACCACCAGTTAATAATTGGGATGATGTCTCATACATTAACCGTCCAGTAGAGATTCATGAAGAATGTAAGTGCCTCACCTTACATGATGCTATTAGGAGTCTGTTATCCGAGCTTTTCCTCGAGAAGGCAACTACCAAGGAGGAATCAACAACTATTATAGGTGAAGAAGAACGAAGTGATTGTACAGAACAGGTGGATTGTAAAAAAACTGAAGAGAGGGGACCAAATTTTTGTGATGAACATTTTCAATCTTATCATCCAAGCATCAAGCTTGTTAGGATCCAAGGGATTGAACCAAAATGCGAAATTCCTTTCTCCTGGGTGGTGAACAACTTAATGAATCCTGAATACTTTCTTCATATATGTGTTTTTGTAACAGTTCAACAAGTCAGATGCTAA 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BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFI2 (Autophagy protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 447.6 bits (1150), Expect = 1.5e-124 Identity = 218/355 (61.41%), Postives = 264/355 (74.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2X052 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ATG5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 388.7 bits (997), Expect = 8.3e-107 Identity = 197/370 (53.24%), Postives = 261/370 (70.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZGL4 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 384.8 bits (987), Expect = 1.2e-105 Identity = 196/370 (52.97%), Postives = 260/370 (70.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1DMA1 (Autophagy protein 5 OS=Neosartorya fischeri (strain ATCC 1020 / DSM 3700 / CBS 544.65 / FGSC A1164 / JCM 1740 / NRRL 181 / WB 181) OX=331117 GN=atg5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 1.3e-30 Identity = 71/189 (37.57%), Postives = 108/189 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4WNA5 (Autophagy protein 5 OS=Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) OX=330879 GN=atg5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 6.2e-30 Identity = 70/189 (37.04%), Postives = 107/189 (56.61%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J5M0 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481509 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 747.7 bits (1929), Expect = 2.6e-212 Identity = 358/358 (100.00%), Postives = 358/358 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IXC8 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481509 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 743.0 bits (1917), Expect = 6.4e-211 Identity = 358/359 (99.72%), Postives = 358/359 (99.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3F6 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 5.6e-207 Identity = 349/358 (97.49%), Postives = 352/358 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9G3 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 725.3 bits (1871), Expect = 1.4e-205 Identity = 349/359 (97.21%), Postives = 352/359 (98.05%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQM9 (Autophagy protein 5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013264 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 7.1e-178 Identity = 298/359 (83.01%), Postives = 332/359 (92.48%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. NCBI nr
Match: XP_022982728.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 747.7 bits (1929), Expect = 5.3e-212 Identity = 358/358 (100.00%), Postives = 358/358 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. NCBI nr
Match: XP_022982727.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 743.0 bits (1917), Expect = 1.3e-210 Identity = 358/359 (99.72%), Postives = 358/359 (99.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. NCBI nr
Match: XP_023528056.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 1.4e-207 Identity = 349/358 (97.49%), Postives = 354/358 (98.88%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. NCBI nr
Match: XP_022935041.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 1.2e-206 Identity = 349/358 (97.49%), Postives = 352/358 (98.32%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. NCBI nr
Match: XP_023528055.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 728.4 bits (1879), Expect = 3.4e-206 Identity = 349/359 (97.21%), Postives = 354/359 (98.61%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh14G008790 vs. TAIR 10
Match: AT5G17290.1 (autophagy protein Apg5 family ) HSP 1 Score: 447.6 bits (1150), Expect = 1.1e-125 Identity = 218/355 (61.41%), Postives = 264/355 (74.37%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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