CmaCh10G010770 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTGTGCAGGATCATGGAGCTTTCATAGAGAAATTCATCCTGCAACTGAGCTCCCCGTCCGATCCACTTCCCTTGGCTGGCCTTACTTTCGCTGTTAAAGACATGTAAGTTTCCGATTCTTTACTCTTTGGTGATTAACAGGTTGTGAAATCTGAAATTTCTATATGAATATTCTTGATAAATCAAAAGATTTCATGAAGGTTTTGGTGATAACAGGTTTTCAAATCTTGTAATATTGGTTTTAGATCGCAACTGGTTGTTAGTGTGTCCAAGTCGACGCTTAGTTCGATAAAATAATTCTTGGTTCTGTGTTTATATTAATATCATGGTCCTTGAATTATCAACGTCACAGTTTTTCTACATGAAATTGGGGTATTGAAGTCAAACATCTCACATTGGGATTTGAACCAAACAGATTTGATATGGAGGGATATGTAACTGGTTTTGGAAATCCTGAATGGCTAAGGACTCACCCACCAGCCAATCAAACAGCGCCAGCCGTGCTCGCTATCCTAAGAGGAGGAGCCACTTGCATCGGCAAGACTATCATGGATGAAATGGCCTTCAGGTAACAAGAAAACATACCATTTACTCTTTTTTTTTGTTAGCTCATTTTTTTCAATTGATGACAAACAGACAACCCATAAGCTTTAAGCTTTGCCAGGATAGAGGGGATAATAATTATTCTTTTGAGCTGAGCTAATAAACTTGATTTAATAGAGTAAGTTACTAAGTAAAAGAATGGTTAGTAGGAATAAGTTACTAACCTATGGAGTAATCATAGGAGAATTGGTAGTTGTTGACAACTTGTGGACCAAATTTTGTGATTGTGGACCAAATTTTATGCTTTGGCTTGATTAAGAAGATTCTCAGTGGTACTTGATTAGAAAGTTTAGGAAGCTAGTTAGTGTTTTCTCCACTATAAATAAATACATGCTCTTTTCACAACAACTACAACAACCAACTGAATTAAAAACCCAAGTGTTTCTTTGTTCCAAAAAATCTCTTGACATATTGTGATCCTAGGTCAAATCCAACACAGACTTAACTAGATTCTTATCATTCTTTTTCAATCACACAGCTCTGCATTAAAATTGGTTAAAACATGAACGTGAACCAATTGATTTTTATCAGGTTTCTAATTGGTAATTGAAATGCTTTGACCAAATCATTCATCCGAACACGCAGGCTTTTGAGTGAGTTTTTATATTAGTGGAATCACTAATTTGATAATCATATTTTGTCAGTATAAGTGGGGAAAACTTTCATTATGGCACACCCCGAAACCCATATGCATCAGATCGTATTCCTGGAGGATCTTCCAGCGGCTCTGCTGTTGCTGTTGGTGCAAAGCTTGTGGATTTCTCCTTAGGCAAGTTCTTAGTTCCAAGACGTTGAATAATTTGTGATTCCATGCCTTTTTCTGGGTAAAATATTGTAAAAGACCTTACCTAGATTTGTAGGAACCGATACTGGAGGTAGCGTAAGAGTGCCTGCTTCTTATTGTGGAATTCTTGGATTCCGGCCTTCACATGGTGTGGTCTCTACATCTGGAGTAATACCCATGACGCAGAGCTTCGATACAGTAGGTAATGTGTAATGTCTCATTGTCACTTTGTCCACCTCTTTTTTTGTAGATTTTTTTTTTATACTAAGTCCCTTTGGTGTTTGGTGATTGTTGTTGGGATATGGAGCCTGGTGCCTATATTTGGTAGGGATATATTTGGAAGATATTTGATAAAAATATGATAGAGATATATATGGTAGATATTTGGTAAAGAAAAGATATGATAGAGATATATATGGTAGATATTTGGTAACGATTTGATAGAGATATATTTGTTAGATTATATATCGGTTTAAATCTTTGTAAGCTATATTTAGTAAATTGAAACCATATATATACCCATTACAATGTATTCATCTTCATTATTTGTATTCTATATTGTTATACCTACATAAAGTCATCAATAATATGCCAATATTCCTCCTTGTATTTTCTCTTTCCTGTTCTTTGTGTTCATCTTGATATTTGTGTTCATCTTTATAGTGTGTGAGTTGTTGAGCGATCCTAACCATTGGTATCAGAGCTAACAACTGGTATCGATCCTAACAATTGTCATGCAAAGTTGTTATTTCCTTTTTCTCCACTTATTACTTTTAAATTTTATAAGTAAAAGGTCCTTTGACTAATATTTGTGAAAATCCAATACTGTATAATCGGTTGAAGATTGTTGGGAGAGGAGTCCGACATCGGTTAATTAAGGAGTTGATTATGGGTTTATAAATAAGGAATACATCTTCATTCGTTTATGAGACCTTTTGAGGAAACCAAAAATAAAACCATGAGAGCTTAGGTTTAAAGTGGATAATATCATACAATTGTGGAGAGTCATGGATTCTAGCATGGTATCAGAGCCAATCTCTTAACTTAGTAAAAAAGTGACTCAAGTGTCGAACAAAGGGTGTTCTTTGTTCGAAGGCTCCAAAGGAGTCGAGCCTCAATTAAGGGGAGGCTGTTTGAGGGACCCATAAGCCTCAAGGGAGACTCTGTAACAACCCTGAGGGCTCCATAAGCCTCAGGGGAGACTCTGTAATGACCCGAAAAAAAAAAAAAGAAATAATAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAAGGATGGACTCTCTCTCCACCTTCCCCAAATATCTCCCCCTAACACCTCCTACACAACTGCAAAATGATCTGAGAAAAAGAAAAAAAAAAAACAGAAGCCCATGAACGGATAACGACAGCATCATGATCTGTGGTGCGTGCATAGGATAGTTGCATATTTAAAATTCCTAGTCTGTTTTATCTTATTTTGAACTCCAGCATGATGTTTGAAACACGTAAGTCCAGTGTTTTCTAATGTTTTAATGTATTCTGAAATTTTAAATTTTTCTGCTAATAAAGATGAGCATTCTTAGAGTTATATTCTGCATTGGAGATGAGCATGAAATGTTAGTGGCGACTCTAGATAAGTGAAAATTTAGGGTCGTTACAGACTCTATGGTGTACTTTGTTCGAGAGGAGGATTGTTGGGAGAGGACATTGGTTAGTTAAAGAGTTGATTAGGGTTTATAAGTAAGGAATACATCTCCATTGGTATGAGAGCCCTTTTGGAGAAACCAAAAGCAAAACCATGAGAGTTTACGATCAAAGTGGACAATATAATACCATAGTGGAGAGTCGTGGTTTCTAACATCATTTTCATTATAATCATGACATCGTTGTTATGATGATGGCTATGTTTCTCATGATTTTGCATATAGATGATCGATATGATGTTGATTGGTAGCAGAGCCATTGGTTGCTTATAAATAGAATAGAGCCCATAGCTCAACAAATATTATCTATTGGAACATGTTATCTCTTTCCTTCAACATTAACCATGTTCCTGCCATGTTAAAAAGGTACATTTCTTTGACACCATCTTCTCATTTTAGGTTGGTTTGCCATCGATTCTGCCGTATTCAAAAGAGTAGGTCGGCTGCTGCTGCAAGAGCCAGAGGTTGAACATTACAAGCCTACACAGGTGCTGATTGCAGAAGATTGTTTCAAGCTCTCAAGCATTCCTAGTGAGCGATTGACACAAGCTTTTGTTAATTCAGTGAAGAAGTTATTTGGTGGTAAGTCTGACACTCAGTAAGTTTTTATTTATTTATTTATTTATTATTATTATTATTATTAGTACCATGCTTTCATTGAGGATGAATGAAAAAAATACATGGGAATAAGAAGAAATCCTCAAATTCTTCTTTCACTCTTTCTTTCACAAGGTAAAGCGGCGGGATGATAATCTCCTTCCCCTGAACCTCTATTTCCTGACCATATCATGAAACTGTTCCTTATCCACCAGGGTACCAAATCCCACTTTTTTCTATCTTTGATGGGAGAGGTTGCCCTAAAAGACACTGATCTCATTTCATTACCGCTTGTCGGGACACTACCACAAAATGGGTCTTTGTCATTGAGACAATTTCCCCTTTCCTTGGTCCTGCCTATGAGTGGTATGACAATCTCAAGCCCGGGTCCATATCAAGCTGGAAACAGATGCAAAGGGCTTAGGCAAGTACTCGGGTCAACGGATCTGCTTAAGAAAGCAAATCAAACTAAAATGTCTTCAAGCTCCCTTCTGAATGAAACCTCTTTGCTTGCAGGGGCAGGAGTGGAAACGTTTGAGAGAGCGCTTGGCGAAAGAATCGTGTGCAGCACCTATTAGTTCAATCAACATACGTTTCAAAAAGCATTTTGAAGTCATATAACCATTTCAGCCTGACTCCCAATTTTCTCTTAAATCAAGCTATGAAAAAACGGGAGTAATGTGGAATGACTCCATTCCTGTGAGCTATAGAGTTAGTTATCCCTTATCATCCTTGGTATTCCTCCTCTCTATGAGATGTGGGATCGACCCTGCTCTTTCCACATCCTTTTGGATATCGAAGAAAGAGATCATAAAACCAATTTAGCCGAGCTAAGGTGTGGAACCCTCGTTTTTGAGTTTTTGATTTTATAATAAGCTAAAGGGGCTGGGGTTTCTATCCGAACTTTGAAAACAGAAGTCAGAATCTTATTTGAATTTCTCTTCAATTTTGAGGATTGTGTGAAAAAAAAAAAAAAGAATAGTAAGCTTAGAACTACAGATTTCCATAATTTAGCCCGATTTGATGAAATTTGATTGATTAGGTACTGATCGTCTTAATAGGTATCAAATCAAACCCATACAAAATAATAGTTCAGAAAGTGAGGAGCCAAGCTAAAATAAAAAGGGACTCCAATCAAGCTTAATAAGGCCTAAAGTGTAATTATGAAAGTTTTTGAACACCAAGCCCAAAGAGAG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ATGGCTGTGCAGGATCATGGAGCTTTCATAGAGAAATTCATCCTGCAACTGAGCTCCCCGTCCGATCCACTTCCCTTGGCTGGCCTTACTTTCGCTGTTAAAGACATATTTGATATGGAGGGATATGTAACTGGTTTTGGAAATCCTGAATGGCTAAGGACTCACCCACCAGCCAATCAAACAGCGCCAGCCGTGCTCGCTATCCTAAGAGGAGGAGCCACTTGCATCGGCAAGACTATCATGGATGAAATGGCCTTCAGTATAAGTGGGGAAAACTTTCATTATGGCACACCCCGAAACCCATATGCATCAGATCGTATTCCTGGAGGATCTTCCAGCGGCTCTGCTGTTGCTGTTGGTGCAAAGCTTGTGGATTTCTCCTTAGGCAAATTTGTAGGAACCGATACTGGAGGTAGCGTAAGAGTGCCTGCTTCTTATTGTGGAATTCTTGGATTCCGGCCTTCACATGGTGTGGTCTCTACATCTGGAGTAATACCCATGACGCAGAGCTTCGATACAGTAGGTTGGTTTGCCATCGATTCTGCCGTATTCAAAAGAGTAGGTCGGCTGCTGCTGCAAGAGCCAGAGGTTGAACATTACAAGCCTACACAGGTGCTGATTGCAGAAGATTGTTTCAAGCTCTCAAGCATTCCTAGTGAGCGATTGACACAAGCTTTTGTTAATTCAGTGAAGAAGTTATTTGGTGACCATCTTATAAAACAGATTAGCATCGGGAGTTATGTTGAGGATAAAGTTCCAAGTTTGAAGCATTTCATGATTGAAGAAAACGATGGCTATAAGCATAGCATTCCATCCTTGGCTGCTCTTGTAAGGTCTAAGGTATTGCTTCAGAGGCATGAGTTCAAAATCAATCACGGAGAATGGGTTAGGTCCTATAGTTCTCATTTGGGCCCAGGAAAATCAGAACGAATATCAGAATACATCAGGGTGGCAACGGATGAAAATACTGATCTAAGTCACTCCGTTCAAATTGAACTGCGTGTTGCTCTTGCTGCTCTTCTTGAAGCTACCATACCTCTAGGATTGTACAACGGCCTTCCTGTGTCTATATCTTTGCTAGCAAAACATGGTTCAGATGGGTTTTTGCTCAATGTTGTTGACACTCTTTACAGCACTCTAAAACAAGAACCACTATTAAGGTGGTTGTGGCGGACTCTGATTCCGGTTAGATTCGAAGAAGAAAGGGGGAGAATCTCCGGAGTTGTAATGGCTGTGCAGGATCATGGAGCTTTCATGGAGAAATTCCTCCTGCAACCGAGCTCCCCGTCCGATCAACTTCCCTTGGCTGGCCTCACTTTTGCTGTTAAAGATATATTTGATGTGGATGGATATGTAACTGGTTTTGGAAATCCTGAATGGCTAAGGACACATCCACCTGCTAATCAGACAGCCCCTGCCGTGTCGTCGATCCTAAAAGGAGGAGCCACCTGCATTGGCAAGACTATCATGGATGAAATGGCCTACAGTATAAATGGGGAAAACATTCACTATGGCACCCCCCAAAACCCACATGCATCAGATCGGATACCTGGAGGATCTTCCAGTGGCTCTGCCGTTGCTGTAGGAACTGATACTGGAGGTAGTGTAAGAGTGCCTGCATCCTATTGTGGAATCTTTGGATTTCGGCCTTCACATGGCGCAGTCTCTACCTCTGGAGTAATTCCCATGGCACAGAGCTTTGATACAGTAGGATGGTTTGCCAGGGACCCTATTGTATTAAAAAGAGTAGGCCAGCTCCTGCTTCAACAGCCAGAATTTGAACATCACAAGCCTACGCAGGTGCTTATTGCAGAAGATTGTATGAAGCTCTCATGTATTCCTAGTGAACGATTGACGCAAGTTTTTGTGAATGCAGTAACAAAATTATTTGGTGGCCATCTTATAAAACAAGTTAGCCTTGGGAATTATGTTGAGGACAAAGTTCCAAGTTTGAAGCATTTCATGATTGAAGGAAATGCAGGCCATGAACATAGCATACCATCCTTGGCAGCCCTTGCAAGATCGATGCAATTGCTTCAGAGGTATGAGTTCAAAATCAATCACGAAGAATGGGTTAGGACTTGCAATCCTCATTTGGGTCCAGGAATATCAGAACGAGTATTAGAAGCCATGAGGACGACAGATGAGAATATTGATCTGTGTCGTTCCATTAAAGTCAAGCTGCGGGAAGCTCTTGCTTCTCTTCTTGAAGATTTTGGGGTCCTTGTAATTCCTACAGTCCCAGGCCCCCCTCCAGAACTAAACACAGACGTCTCAAAGCTACACGACTTTCGTGCGAAAGCTTTCAGCTTGCTTTCCATTGCTGGAGTTTCTGGATTGTGTCAGGTTAGCATACCTCTAGGCTTGTACAATGGCCTTCCGGTTTCATTATCTTTGCTAGCAAAACATGGTTCAGATGGATTTTTGCTCAATGTTGTTGATAGTCTTTACAACACTCTAAAACAAGAAGTTGAGATTGGAAGAATGAAAGCATGTGCAAGCCAGGCATAA 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BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FR37 (Amidase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AMI1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 528.9 bits (1361), Expect = 1.1e-148 Identity = 270/416 (64.90%), Postives = 321/416 (77.16%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XTK3 (Amidase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=AMI1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 3.1e-132 Identity = 238/420 (56.67%), Postives = 305/420 (72.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MUK5 (Translocon at the outer membrane of chloroplasts 64 OS=Pisum sativum OX=3888 GN=TOC64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 417.9 bits (1073), Expect = 2.6e-115 Identity = 208/427 (48.71%), Postives = 290/427 (67.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVH5 (Outer envelope protein 64, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OEP64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 5.0e-114 Identity = 204/423 (48.23%), Postives = 284/423 (67.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KCL7 (Outer envelope protein 64, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OM64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 380.2 bits (975), Expect = 6.1e-104 Identity = 197/428 (46.03%), Postives = 275/428 (64.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498IK00 (Mevalonate kinase OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_036643 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 991.9 bits (2563), Expect = 1.6e-285 Identity = 520/885 (58.76%), Postives = 626/885 (70.73%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HY10 (amidase 1 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467873 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 836.6 bits (2160), Expect = 8.8e-239 Identity = 416/426 (97.65%), Postives = 417/426 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HAS6 (amidase 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462124 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 830.1 bits (2143), Expect = 8.3e-237 Identity = 412/426 (96.71%), Postives = 416/426 (97.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HVP2 (amidase 1 isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467873 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 828.2 bits (2138), Expect = 3.1e-236 Identity = 412/426 (96.71%), Postives = 415/426 (97.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CG55 (Amidase 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G003790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 752.7 bits (1942), Expect = 1.7e-213 Identity = 373/446 (83.63%), Postives = 402/446 (90.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. NCBI nr
Match: RXH82302.1 (hypothetical protein DVH24_036643 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 991.9 bits (2563), Expect = 3.4e-285 Identity = 520/885 (58.76%), Postives = 626/885 (70.73%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. NCBI nr
Match: XP_022968725.1 (amidase 1 isoform X3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 836.6 bits (2160), Expect = 1.8e-238 Identity = 416/426 (97.65%), Postives = 417/426 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. NCBI nr
Match: XP_022961591.1 (amidase 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 830.1 bits (2143), Expect = 1.7e-236 Identity = 412/426 (96.71%), Postives = 416/426 (97.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. NCBI nr
Match: XP_022968726.1 (amidase 1 isoform X4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 828.2 bits (2138), Expect = 6.5e-236 Identity = 412/426 (96.71%), Postives = 415/426 (97.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. NCBI nr
Match: KAG6590388.1 (Amidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 827.0 bits (2135), Expect = 1.4e-235 Identity = 411/426 (96.48%), Postives = 415/426 (97.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. TAIR 10
Match: AT1G08980.1 (amidase 1 ) HSP 1 Score: 528.9 bits (1361), Expect = 7.6e-150 Identity = 270/416 (64.90%), Postives = 321/416 (77.16%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. TAIR 10
Match: AT3G17970.1 (translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-III ) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 3.5e-115 Identity = 204/423 (48.23%), Postives = 284/423 (67.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. TAIR 10
Match: AT5G09420.1 (translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-V ) HSP 1 Score: 380.2 bits (975), Expect = 4.3e-105 Identity = 197/428 (46.03%), Postives = 275/428 (64.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. TAIR 10
Match: AT3G25660.1 (Amidase family protein ) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 1.3e-21 Identity = 61/153 (39.87%), Postives = 82/153 (53.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh10G010770 vs. TAIR 10
Match: AT5G64440.1 (fatty acid amide hydrolase ) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 4.0e-18 Identity = 53/150 (35.33%), Postives = 76/150 (50.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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