CmaCh09G010990 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh09G010990
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	extensin-3-like
Location	Cma_Chr09: 6018998 .. 6019978 (+)
RNA-Seq Expression	CmaCh09G010990
Synteny	CmaCh09G010990

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCATATCTCGTAGCTACTGTTTTGGTGGCACTTTTGAGTTTTACGTCGGTGATCGCTATTGATTATAGCTACTCTTCTCCACCGCCTCCTTACTATGTGTATAAATCTCCTCCTCCGCCGGTTTATCATTCACCCCCGCCACCGAAGGTAAAATATGAGTACAAATCGCCACCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTCCGGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCCCCACCTGTCTATCACTCGTCCCCTCCTCCTGTTTATTATTCTCCACCACCAAAGAAAGAGTATAAATCGCCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCGGTTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTATCACTCTCCTCCACCACCGATTTACAAGTCACCGCCACCTCTAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCTCCGCCACCAATTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCTCCTCCACAAGTTTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCCCCACCCGTTTATCACTCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCAGTTTATAAGTCACCGCCTCCTCCAATTTACCATTCTCCTCCCCCACCTGTTTATCACTCTCCACCTCCTCCCGTTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGGTGTACAAATCACCACCTCCACCTGTATACTACTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCTCCTCAATACTATTAG

mRNA sequence

ATGGCATATCTCGTAGCTACTGTTTTGGTGGCACTTTTGAGTTTTACGTCGGTGATCGCTATTGATTATAGCTACTCTTCTCCACCGCCTCCTTACTATGTGTATAAATCTCCTCCTCCGCCGGTTTATCATTCACCCCCGCCACCGAAGGTAAAATATGAGTACAAATCGCCACCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTCCGGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCCCCACCTGTCTATCACTCGTCCCCTCCTCCTGTTTATTATTCTCCACCACCAAAGAAAGAGTATAAATCGCCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCGGTTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTATCACTCTCCTCCACCACCGATTTACAAGTCACCGCCACCTCTAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCTCCGCCACCAATTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCTCCTCCACAAGTTTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCCCCACCCGTTTATCACTCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCAGTTTATAAGTCACCGCCTCCTCCAATTTACCATTCTCCTCCCCCACCTGTTTATCACTCTCCACCTCCTCCCGTTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGGTGTACAAATCACCACCTCCACCTGTATACTACTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCTCCTCAATACTATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCATATCTCGTAGCTACTGTTTTGGTGGCACTTTTGAGTTTTACGTCGGTGATCGCTATTGATTATAGCTACTCTTCTCCACCGCCTCCTTACTATGTGTATAAATCTCCTCCTCCGCCGGTTTATCATTCACCCCCGCCACCGAAGGTAAAATATGAGTACAAATCGCCACCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTCCGGTTTATCACTCTCCACCGCCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCCCCACCTGTCTATCACTCGTCCCCTCCTCCTGTTTATTATTCTCCACCACCAAAGAAAGAGTATAAATCGCCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCGGTTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTCTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTATCACTCTCCTCCACCACCGATTTACAAGTCACCGCCACCTCTAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCCCCTCCGCCACCAATTTACAAGTCACCGCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCTCCTCCACAAGTTTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCAGTTTACCATTCTCCTCCCCCACCCGTTTATCACTCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCACCACCAGTTTATAAGTCACCGCCTCCTCCAATTTACCATTCTCCTCCCCCACCTGTTTATCACTCTCCACCTCCTCCCGTTTATTATTCTCCACCTCCACCAAAGGTGTACAAATCACCACCTCCACCTGTATACTACTCTCCTCCCCCACCCGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCTCCTCAATACTATTAG

Protein sequence

MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY

Homology

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 322.0 bits (824), Expect = 7.7e-87
Identity = 238/338 (70.41%), Postives = 256/338 (75.74%), Query Frame = 0


Query: 8   VLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPP--YY----VYKSP--------PPPVYHSPPPPKVKY 67
           VL   L+F S    +Y YSSPPPP  +Y    VYKSP        PPPVY SPPPP   Y
Sbjct: 6   VLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHY 65

Query: 68  E----YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPP 127
                YKSPPPPV Y  PPPVY SPPPPVY SPPPPV H SPPPVY SPPP  ++ S PP
Sbjct: 66  SPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYS-PP 125

Query: 128 PVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPI-YKSPPPLVYHSPPPPVY 187
           PVY SPPPPV    PPPVY SPPPPV H  PPPVY SPPPP+ Y SPPP VY SPPPPV 
Sbjct: 126 PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPP-VYKSPPPPVK 185

Query: 188 HSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP 247
           H  PPP+YKSPPPPV +  PP VYKSPPPPV +  PPPVYKSPPPPV Y  PPPVYKSPP
Sbjct: 186 HYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP 245

Query: 248 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKV 307
           PPV++SPPP VYHSPPPPV+YSPPP VY SPPPP+++SPPP VYHSPPPPV+YS PPP V
Sbjct: 246 PPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYS-PPPVV 305

Query: 308 YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
           Y SPPPPV+YSPPP VY SPPPPKK YEYKSPPPP +Y
Sbjct: 306 YHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHY 340

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 1.4e-83
Identity = 250/376 (66.49%), Postives = 263/376 (69.95%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLS--FTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSP-----PPPVYHSPPPPKVKY 60
           MA LVAT+LV  +S  F S    +Y YSSPPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK  Y
Sbjct: 5   MASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 64

Query: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKE---YKS 120
           EYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H SPPPVY+SPPP K+   YKS
Sbjct: 65  EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKS 124

Query: 121 PPPPVYYSPPPPVYKSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----IYKSPPPL 180
           PPPPV +  PPPVY SPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    +YKSPPP 
Sbjct: 125 PPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 184

Query: 181 VYHSPPPPVYHSPPPP----IYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPP----VYYSPPPPVYKS 240
           V H  PPPVYHSPPPP    +YKSPPPPV H  PP VY SPPPP    VY SPPPPV   
Sbjct: 185 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 244

Query: 241 PPPPVYYSPPPP----VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYYSP--------PPP 300
            PPPVY+SPPPP    VYKSPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SP        PPP
Sbjct: 245 SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPP 304

Query: 301 VYKSPPPP----IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK---VYKSPPPPVYYSPPPPVYKS 324
           VY SPPPP    +Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPK   VYKSPPPPV +  PPPVY S
Sbjct: 305 VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 364

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 230.3 bits (586), Expect = 3.1e-59
Identity = 216/340 (63.53%), Postives = 229/340 (67.35%), Query Frame = 0


Query: 23  YSYSSPPPPYY------VYKSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVY 82
           Y YSSPPPPYY       YKSPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 200 YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 259

Query: 83  HSPPPPV-YHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV-YH 142
           +SP P V Y SPPPP  +SSPPP YYSP PK +YKSPPPP  YS PPP Y SP P V Y 
Sbjct: 260 YSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 319

Query: 143 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPI-YKS-PPPLVYHSPPPPV--------YHSPPPPIYKSP 202
           SPPPP  +S PPP Y+SP P + YKS PPP VY SPPPP         Y SPPPP   S 
Sbjct: 320 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSS 379

Query: 203 PPPVYHSPPPQV-YKSPPPP-VYYSPPPPV--------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPP 262
           PPP Y+SP P+V YKSPPPP VY SPPPP         YKSPPPP  YS PPP Y SP P
Sbjct: 380 PPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 439

Query: 263 PVYH-SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV-YKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYY-SPPPP 322
            VY+ SPPPP  +S PPP YYSP P V YKSPPPP  +S PPP Y+SP P VYY SPPPP
Sbjct: 440 KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP 499

Query: 323 KVYKSPPPPVYYSPPPPV-YKSPPPPKKDYEYKSPPPPQY 326
            VY SPPPP YYSP P V YKSPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 500 YVYSSPPPP-YYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYY 535

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 1.9e-40
Identity = 194/353 (54.96%), Postives = 209/353 (59.21%), Query Frame = 0


Query: 26  SSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 85
           +SPPPP     SPPPPVY  PPPP        PPPP  YSPPPP    PPPPVY  PPPP
Sbjct: 424 TSPPPP-----SPPPPVYSPPPPP--------PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPP 483

Query: 86  VYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP---- 145
                PPPVY  PPP      PPPP  YSPPPP    PPPPVY  PPPPVY SPPP    
Sbjct: 484 PPPPPPPPVYSPPPPS---PPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSP 543

Query: 146 ---PVY--HSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP---PPVYHSPPPQVYK 205
              PVY    PPPP +  PPP     PP P Y+S PPP + SPP   PP  HSPPP +Y 
Sbjct: 544 APTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYP 603

Query: 206 --SPPP---PVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP-----VYKSPPPPVYH---SPPPPVY 265
             SPPP   PV   PP PVY  PPPP    PPPP         PPPPV H    PPPPVY
Sbjct: 604 YLSPPPPPTPVSSPPPTPVYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPVVHYSSPPPPPVY 663

Query: 266 HS--PPPPVYYS---PPPPV-YKSPPPP--IYHSPPP-PVYHSPPP-----PVYYSPPP- 325
           +S  PPPPVYYS   PPPPV Y SPPPP   YHSPPP PV++S PP     P   SPPP 
Sbjct: 664 YSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPSPVHYSSPPPPPSAPCEESPPPA 723

Query: 326 PKVYKSPPPP-VYYSPPPPV-YKSPPPPKKDYE----------YKSPPPPQYY 327
           P V+ SPPPP V++SPPPPV ++SPPPP  +YE          Y SPPPP +Y
Sbjct: 724 PVVHHSPPPPMVHHSPPPPVIHQSPPPPSPEYEGPLPPVIGVSYASPPPPPFY 760

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P13983 (Extensin OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=HRGPNT3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 8.9e-35
Identity = 172/313 (54.95%), Postives = 183/313 (58.47%), Query Frame = 0


Query: 28  PPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYH-SPPP-P 87
           P PP Y   SPPPP Y   P P   Y   SPPPP Y  PPP   +SPPPP Y  SPPP P
Sbjct: 260 PQPPTY---SPPPPAYAQSPQPSPTY---SPPPPTYSPPPPSPIYSPPPPAYSPSPPPTP 319

Query: 88  VYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVY--------YSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH 147
               SPPP  YSPPP     SPPPP Y        YSPPPPVY  PPPP Y SPPPP Y 
Sbjct: 320 TPTFSPPPPAYSPPPT---YSPPPPTYLPLPSSPIYSPPPPVYSPPPPPSY-SPPPPTYL 379

Query: 148 SPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPP---PPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKS 207
            PPPP   SPPPP +  PPP    SPPPP  +SPP   PP Y SPPPP Y SPPP  Y  
Sbjct: 380 PPPPP--SSPPPPSFSPPPPTYEQSPPPPPAYSPPLPAPPTY-SPPPPTY-SPPPPTYAQ 439

Query: 208 PPP-PVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPP 267
           PPP P  YSPPPP Y SPPPP  YSPPPP Y  PPP     PPPP  +SPPPP Y  PPP
Sbjct: 440 PPPLPPTYSPPPPAY-SPPPPPTYSPPPPTYSPPPPAYAQPPPPPPTYSPPPPAYSPPPP 499

Query: 268 -PVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPK 326
            P+Y  PPP +   P PP +  PPP   + PPPP     PP P Y  PP P   SPPPP+
Sbjct: 500 SPIYSPPPPQV--QPLPPTFSPPPPRRIHLPPPPHRQPRPPTPTYGQPPSPPTFSPPPPR 552

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IER1 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 576.6 bits (1485), Expect = 6.4e-161
Identity = 326/326 (100.00%), Postives = 326/326 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP 60
           MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP
Sbjct: 8   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP 67

Query: 61  PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 120
           PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY
Sbjct: 68  PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 127

Query: 121 KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP 180
           KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP
Sbjct: 128 KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP 187

Query: 181 PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 240
           PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 188 PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 247

Query: 241 HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP 300
           HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP
Sbjct: 248 HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP 307

Query: 301 PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
           PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
Sbjct: 308 PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 333

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6U4 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 486.5 bits (1251), Expect = 8.7e-134
Identity = 299/371 (80.59%), Postives = 311/371 (83.83%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYH--------SPPPPKVK 60
           MAYLVATVLVA+LSFTSVIA DYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYH        SPPPPK  
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 61  YE--------------YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSP 120
           Y+              YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPPVY+SP
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 120

Query: 121 ---------------PPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV 180
                          PP   YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPV
Sbjct: 121 PPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPV--------YHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSP 240
           YHSPPPP+Y SPPP VY+SPPPPV        YHSPPPP+Y SPPPPVY+SPPP VYKSP
Sbjct: 181 YHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSP 240

Query: 241 PPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV 300
           PPPVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPPVY+SPPPPV
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 300

Query: 301 YKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY 327
           YKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY
Sbjct: 301 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY 360

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7A8 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 401.7 bits (1031), Expect = 2.8e-108
Identity = 267/361 (73.96%), Postives = 279/361 (77.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSS--PPPPYY-----------VYKSPPPPVYHSPP 60
           +A LV  +LV  LS  S IA +Y Y+   PPP Y            VY SPPPPVYHSPP
Sbjct: 5   VASLVIAILVVALSVPSSIAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPP 64

Query: 61  PPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSP-------PP 120
           PP     YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP+Y S PPPVYYSP       PP
Sbjct: 65  PP----VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYNSPPPPIYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPP 124

Query: 121 KKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVY 180
              YKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY SPPPP+Y SPPP VY
Sbjct: 125 PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVY 184

Query: 181 HSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPP 240
           HSPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVYHSPPP VYKSPPPPVY+SPPPP+YKSPPPPVYYSPP
Sbjct: 185 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPMYKSPPPPVYYSPP 244

Query: 241 PPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVY 300
           PPVY SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY SPPPP Y SPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 245 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPYYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVY 304

Query: 301 YSP---------------PPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQY 327
           YSP               PPP VY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP     Y SPPPP Y
Sbjct: 305 YSPPPVVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP----VYSSPPPPVY 357

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6D2HCM3 (Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MERR_LOCUS720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 394.0 bits (1011), Expect = 5.9e-106
Identity = 275/377 (72.94%), Postives = 288/377 (76.39%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLS--FTSVIAIDYSYSSPPPP--YY---VYKSPPPPV--------YHS 60
           MA L AT+LV   S  F S    +Y YSSPPPP  +Y   VYKSPPPPV        YHS
Sbjct: 5   MASLAATLLVLAFSLCFVSETTANYYYSSPPPPIKHYSPPVYKSPPPPVKHYSPPPIYHS 64

Query: 61  PPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYK 120
           PPPP     YKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVY S PPPVY+SPPP   YK
Sbjct: 65  PPPP----VYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-PYYK 124

Query: 121 SPPPPVYYSPPPPV----------YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSP 180
           SPPPPVY+SPPPPV          YKSPPPPVYHSPPPPVY SPPP VYHSPPPP+YKSP
Sbjct: 125 SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPRVYHSPPPPVYKSP 184

Query: 181 PPLVYHSPPPPV----------YHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPP 240
           PP VYHSPPPPV          Y SPPPP+YKSPPPPVYHSPPP VYKSPPPPVY+SPPP
Sbjct: 185 PPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP 244

Query: 241 PV----------YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV 300
           PV          YKSPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPV
Sbjct: 245 PVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPV 304

Query: 301 YKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVY-YSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP----- 326
           YKSPPPP+YHSPPPPVY SPPPPVY Y  PPP VYKSPPPPVY+SPPPPVYKSPP     
Sbjct: 305 YKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYH 364

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IP49 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476988 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 383.3 bits (983), Expect = 1.0e-102
Identity = 261/345 (75.65%), Postives = 276/345 (80.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSS--PPPPYY---VYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEY 60
           MA LV  VLV  LS +  +A +Y Y+   PPP Y    +Y+SPP PVY+SPPPP     Y
Sbjct: 5   MASLVIAVLVVALSVSPSMAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPP----VY 64

Query: 61  KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSP 120
            SPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYHS PPPVYYSPPP   YKSPPPPVY SP
Sbjct: 65  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPP-PVYKSPPPPVYSSP 124

Query: 121 PPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPI 180
           PPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP+Y SPPP VY+SPPPPVY SPPPP+
Sbjct: 125 PPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 184

Query: 181 YKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSP 240
           Y SPPPPVY+SPPP VYKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SP
Sbjct: 185 YLSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSP 244

Query: 241 PPPVYH--------SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSP---- 300
           PPPVY+        SPPPPVY SPPPPVYKSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SP    
Sbjct: 245 PPPVYYFPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPVY 304

Query: 301 --PPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
             PPP VYKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPP     Y SPPPP YY
Sbjct: 305 YSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPP----VYSSPPPPVYY 340

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr
Match: XP_022976067.1 (extensin-3-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 576.6 bits (1485), Expect = 1.3e-160
Identity = 326/326 (100.00%), Postives = 326/326 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP 60
           MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP
Sbjct: 8   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP 67

Query: 61  PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 120
           PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY
Sbjct: 68  PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 127

Query: 121 KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP 180
           KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP
Sbjct: 128 KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP 187

Query: 181 PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 240
           PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 188 PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 247

Query: 241 HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP 300
           HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP
Sbjct: 248 HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSP 307

Query: 301 PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
           PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
Sbjct: 308 PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 333

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr
Match: XP_023536462.1 (extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 512.3 bits (1318), Expect = 3.1e-141
Identity = 302/327 (92.35%), Postives = 308/327 (94.19%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKS-PPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP 60
           MAYLVATVLVA+LSFTSVIA DYSYSSPPPPYYVYKS PPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP 60

Query: 61  PPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPV 120
           PPVYYSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPPVY SPPP   Y SPPPPVY SPPPPV
Sbjct: 61  PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP-PVYHSPPPPVYKSPPPPV 120

Query: 121 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSP 180
           Y SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP+Y SPPP VY SPPPPVY+SPPPP+YKSP
Sbjct: 121 YHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSP 180

Query: 181 PPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPV 240
           PPPVYHSPPP VY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPV
Sbjct: 181 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPV 240

Query: 241 YHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYS 300
           YHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK YKSPPPPVYYS
Sbjct: 241 YHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYS 300

Query: 301 PPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
           PPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
Sbjct: 301 PPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 326

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr
Match: KAG6592187.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 3.5e-137
Identity = 298/348 (85.63%), Postives = 313/348 (89.94%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYE------ 60
           MAYLVATVLVA+LSFTSVIA DYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVY+SPPPPK +Y+      
Sbjct: 8   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKKEYKSPPPPV 67

Query: 61  --------YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKS 120
                   YKSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY S PPPVY+SPPP   YKS
Sbjct: 68  YYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP-PVYKS 127

Query: 121 PPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPP 180
           PPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYHSPPPP+YKSPPP VY+SPPPP
Sbjct: 128 PPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP 187

Query: 181 V--------YHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYS 240
           V        YHSPPPP+Y SPPPPVY+SPPP VYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYYS
Sbjct: 188 VYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYS 247

Query: 241 PPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPP 300
           PPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPP
Sbjct: 248 PPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 307

Query: 301 VYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 327
           VYYSPPPPK YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
Sbjct: 308 VYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 354

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr
Match: XP_022936196.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 486.5 bits (1251), Expect = 1.8e-133
Identity = 299/371 (80.59%), Postives = 311/371 (83.83%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYH--------SPPPPKVK 60
           MAYLVATVLVA+LSFTSVIA DYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYH        SPPPPK  
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 61  YE--------------YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSP 120
           Y+              YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVYHS PPPVY+SP
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 120

Query: 121 ---------------PPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV 180
                          PP   YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPV
Sbjct: 121 PPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPV--------YHSPPPPIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSP 240
           YHSPPPP+Y SPPP VY+SPPPPV        YHSPPPP+Y SPPPPVY+SPPP VYKSP
Sbjct: 181 YHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSP 240

Query: 241 PPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV 300
           PPPVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPPVY+SPPPPV
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 300

Query: 301 YKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY 327
           YKSPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY
Sbjct: 301 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDY 360

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr
Match: XP_004139745.3 (extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 473.8 bits (1218), Expect = 1.2e-129
Identity = 288/333 (86.49%), Postives = 299/333 (89.79%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPPP 60
           MAYL+AT+LVA LS  SV+A +Y YSSPPPPYYVYKSPPPPVY SPPPPKVKYEYKSPPP
Sbjct: 9   MAYLLATILVATLSLPSVLAAEYVYSSPPPPYYVYKSPPPPVYSSPPPPKVKYEYKSPPP 68

Query: 61  PVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 120
           PVY+SPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVY S PPPVY SPPP   Y SPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 69  PVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVY-SPPPPVYKSPPP-PVYHSPPPPVYKSPPPPVY 128

Query: 121 KSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPP 180
            SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVYHSPPPP+YKSPPP VYHSPPPPVYHSPPPP+YKSPP
Sbjct: 129 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 188

Query: 181 PPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 240
           PPVYHSPPP VY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 189 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 248

Query: 241 HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK--VYKSPPPPVYY 300
           HSPPPPVY SPPPPVY SPPPP+YHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPK   YKSPPPPVYY
Sbjct: 249 HSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPPVYY 308

Query: 301 -------SPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQ 325
                  SPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPP+
Sbjct: 309 SPPPIYHSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 339

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 9.7e-85
Identity = 250/376 (66.49%), Postives = 263/376 (69.95%), Query Frame = 0


Query: 1   MAYLVATVLVALLS--FTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSP-----PPPVYHSPPPPKVKY 60
           MA LVAT+LV  +S  F S    +Y YSSPPPP   Y  P     PPPVYHSPPPPK  Y
Sbjct: 5   MASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 64

Query: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKE---YKS 120
           EYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H SPPPVY+SPPP K+   YKS
Sbjct: 65  EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKS 124

Query: 121 PPPPVYYSPPPPVYKSPPPP----VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----IYKSPPPL 180
           PPPPV +  PPPVY SPPPP    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPP    +YKSPPP 
Sbjct: 125 PPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 184

Query: 181 VYHSPPPPVYHSPPPP----IYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPP----VYYSPPPPVYKS 240
           V H  PPPVYHSPPPP    +YKSPPPPV H  PP VY SPPPP    VY SPPPPV   
Sbjct: 185 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 244

Query: 241 PPPPVYYSPPPP----VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYYSP--------PPP 300
            PPPVY+SPPPP    VYKSPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VY SP        PPP
Sbjct: 245 SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPP 304

Query: 301 VYKSPPPP----IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK---VYKSPPPPVYYSPPPPVYKS 324
           VY SPPPP    +Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPK   VYKSPPPPV +  PPPVY S
Sbjct: 305 VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 364

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 246.1 bits (627), Expect = 3.8e-65
Identity = 257/375 (68.53%), Postives = 263/375 (70.13%), Query Frame = 0


Query: 23  YSYSSPPPPYYVYKSPPPP--VYHSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPP 82
           Y YSSPPPP Y+YKSPPPP  VY SPPPP   Y YKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPP
Sbjct: 75  YVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPP--PYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 134

Query: 83  P--VYHSPPPP--VYHSSPPPVY-YS--PPPKKEYKSPPPP--VYYSPPPP--VYKSPPP 142
           P  VY+SPPPP  VY S PPP Y YS  PPP   YKSPPPP  VY SPPPP  VYKSPPP
Sbjct: 135 PPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 194

Query: 143 P--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--IYKS------------PPPLVYHSPPP 202
           P  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  +YKS            PPP VY SPPP
Sbjct: 195 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 254

Query: 203 P--VYHSPPPP--IYKSPPPP--VYHS--PPPQVYKSPPPP--VYYSPPPP--VYKSPPP 262
           P  VY SPPPP  +YKSPPPP  VY S  PPP VYKSPPPP  VY SPPPP  VYKSPPP
Sbjct: 255 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 314

Query: 263 P--VYYSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPPVY-YSPPPP---VYKSPPP 322
           P  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY+SPPPP  VY SPPPP Y YS PPP   VYKSPPP
Sbjct: 315 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPP 374

Query: 323 P--IYHSPPPP--VYHSPPPPVY-YS--PPPPKVYKSPPPP--VYYSPPPP--VYKSPPP 326
           P  +Y SPPPP  VY SPPPP Y YS  PPPP VYKSPPPP  VY SPPPP  VYKSPPP
Sbjct: 375 PPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPP 434

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10
Match: AT1G23720.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 8.5e-65
Identity = 213/339 (62.83%), Postives = 223/339 (65.78%), Query Frame = 0


Query: 23  YSYSSPPPPYY------VYKSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVY 82
           Y YSSPPPPYY       YKSPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 61  YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 120

Query: 83  HSP-PPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPP-VYYSPPPPV--------YK 142
           +SP P P Y SPPPP  ++SPPP YYSP PK EYKSPPPP VY SPPPP         YK
Sbjct: 121 YSPSPKPTYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 180

Query: 143 SPPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP-IYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPP-IYKS 202
           SPPPP VY+SPPPP Y   P P Y SPPPP IY SPPP  Y   P PVY SPPPP +Y S
Sbjct: 181 SPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYIYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYSS 240

Query: 203 PPPPVY---------HSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP-VYYSPPPPVYKSPP 262
           PPPP Y           PPP VY SPPPP Y   P P+YKSPPPP VY SPPPP Y   P
Sbjct: 241 PPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPIYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP 300

Query: 263 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSP-PPPVYKSPPPP-IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 322
            P Y SPPPP  +S PPP YYSP P PVYKSPPPP +Y+SPPPP Y   P P Y SPPPP
Sbjct: 301 KPAYKSPPPPYVYSFPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPAYKSPPPP 360

Query: 323 KVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQY 326
            VY SPPPP Y   P P YKSPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 361 YVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPP---YVYSSPPPPYY 396

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10
Match: AT3G28550.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 232.3 bits (591), Expect = 5.7e-61
Identity = 216/339 (63.72%), Postives = 225/339 (66.37%), Query Frame = 0


Query: 23  YSYSSPPPPYY------VYKSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVY 82
           Y YSSPPPPYY      VYKSPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 242 YVYSSPPPPYYSPSPKIVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 301

Query: 83  HSPPPP-VYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV-YH 142
           +SP P  VY SPPPP  +SSPPP YYSP PK +YKSPPPP  YS PPP Y SP P V Y 
Sbjct: 302 YSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 361

Query: 143 SPPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPIYKS-PPPLVYHSPPPP--------VYHSPPPPIYKSP 202
           SPPPP VY SPPPP Y   P  +YKS PPP VY SPPPP        VY SPPPP   S 
Sbjct: 362 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKIVYKSPPPPYVYSSPPPPYYTPSPKVVYKSPPPPYVYSS 421

Query: 203 PPPVYHSPPPQV-YKSPPPP-VYYSPPPP--------VYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPP 262
           PPP Y+SP P+V YKSPPPP VY SPPPP        VYKSPPPP  YS PPP Y SP P
Sbjct: 422 PPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 481

Query: 263 PV-YHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV-YKSPPPP-IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 322
            V Y SPPPP  +S PPP YYSP P V YKSPPPP +Y SPPPP Y   P  VY SPPPP
Sbjct: 482 KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVLYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP 541

Query: 323 KVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQY 326
            VY SPPPP Y   P  VYKSPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 542 YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP---YVYSSPPPPYY 577

[Close]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10
Match: AT5G06630.1 (proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 7.5e-61
Identity = 214/340 (62.94%), Postives = 228/340 (67.06%), Query Frame = 0


Query: 23  YSYSSPPPPYYV------YKSPPPP-VYHSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPVY 82
           Y YSSPPPPYY       YKSPPPP VY+SPPP    P  K  YKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 58  YVYSSPPPPYYTPSPKVNYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 117

Query: 83  HSPPPPVYH-SPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYH- 142
           +SP P VY+ SPPPP  +SSPPP+YYSP PK  YKSPPPP  YS PPP Y SP P VY+ 
Sbjct: 118 YSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPLYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYK 177

Query: 143 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIY--KSPPPLVYHSPPPP--------VYHSPPPPIYKSP 202
           SPPPP  +S PPP Y+SP P +Y    PPP VY SPPPP         Y SPPPP   S 
Sbjct: 178 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSS 237

Query: 203 PPPVYHSPPPQV-YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYY-SPPPP-VYKSPPPP------ 262
           PPP Y+SP P+V YKSPPPP  YS PPP Y SP P VYY SPPPP VY SPPPP      
Sbjct: 238 PPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 297

Query: 263 --VYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPV-YKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYY-SPPPP 322
              Y SPPPP  +S PPP YYSP P V YKSPPPP  +S PPP Y+SP P VYY SPPPP
Sbjct: 298 KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPNVYYKSPPPP 357

Query: 323 KVYKSPPPPVYYSPPPPV-YKSPPPPKKDYEYKSPPPPQY 326
            VY SPPPP YYSP P V YKSPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 358 YVYSSPPPP-YYSPSPKVHYKSPPPP---YVYSSPPPPYY 393

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q38913	7.7e-87	70.41	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9FS16	1.4e-83	66.49	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q9M1G9	3.1e-59	63.53	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q9T0K5	1.9e-40	54.96	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
P13983	8.9e-35	54.95	Extensin OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=HRGPNT3 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1IER1	6.4e-161	100.00	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F6U4	8.7e-134	80.59	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F7A8	2.8e-108	73.96	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1	[more]
A0A6D2HCM3	5.9e-106	72.94	Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MER...	[more]
A0A6J1IP49	1.0e-102	75.65	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476988 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022976067.1	1.3e-160	100.00	extensin-3-like [Cucurbita maxima]	[more]
XP_023536462.1	3.1e-141	92.35	extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
KAG6592187.1	3.5e-137	85.63	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_022936196.1	1.8e-133	80.59	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]
XP_004139745.3	1.2e-129	86.49	extensin-3 [Cucumis sativus] >KAE8646192.1 hypothetical protein Csa_016078 [Cucu...	[more]

BLAST of CmaCh09G010990 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	9.7e-85	66.49	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	3.8e-65	68.53	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	8.5e-65	62.83	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	5.7e-61	63.72	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT5G06630.1	7.5e-61	62.94	proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01217	PRICHEXTENSN	coord: 49..70 score: 37.27 coord: 28..40 score: 44.62 coord: 70..86 score: 36.47 coord: 90..107 score: 38.89
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 305..326
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF22	EXTENSIN-3-LIKE	coord: 186..324
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 186..324
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF22	EXTENSIN-3-LIKE	coord: 22..213
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 22..213
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 22..61 e-value: 1.4E-5 score: 25.1 coord: 271..323 e-value: 1.8E-6 score: 27.9

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G010990.1	CmaCh09G010990.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall