CmaCh09G010470 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGAATATGGCACAGTATCGAGGCCGAGTCCTCCCCGTCGGCGTTGAAAAAGTATGCGTTCATCAAACGGGTCTTTATCAGCATGGCCGGTTGGCTAATTCCCCCATTGACTTGCTGTGCAATTCGTCTGCAATTCCTCGCTTGTTCCTCTCTTTCATCTGCGCAATTCTTCGATTCTTTCTGTTGATTCATGAAGCATTTCCTCTGAGAATTTGGGATCGGGATTTCTAGTGGGAGTTTCAGATTTTTTTCGAACAAGAATGCCAGCGACCCCATCTTCCAATTTGATCCATGTTCATGGCTGCAATCGATTGATATCGCCGCCATCTGTTTCTTCTTCCACTTGTTCGTTGAGTGTTCTATCGATTTCTCATTTATCTGGACGGCAAATCAATGGATTCCCATCTTCCAATCTCGTGTTCTCGTTTTTCCCTTCTTTTCTCACATCATTTCGTTCGCCAAATGGTTTCATCAGCGGTAAACCTCGGCGGAAGAGGCGGCTGAGGATTCCGATCATTTCCGCCATTTTTGAGCGGTTCACCGAACGAGCGGTAAAGGCTGTGATCTTCTCGCAGAGAGAAGCGAAGGCCCTTTTGAATGGTTTGGTTTTCACCCAACATCTTCTTCTGGGTTTGATTGCTGAGGAATATCATAATCAGTCTCCTGGCGGTTTTTTGAATTCGGGTCTAACACTACATGAGGCACGTGAGGCTGTTCGCGGCATTTGGCATAGCAACGATGCGGAAGCGGATATGAGTGTTGATAGTGCGGCTGTTACGCCTCATGTTCCTTTTTCTGTCGGCACCAAGCGGGTGTTTGATTCAGCTGTTGAGTATTCCAAGAAAATGGGCCATCATTTCGTTGGACCTGAACACCTCTCCATTGCTTTACTTGCTGCTGATGATGATGGAAACATAGAGTTGATTTTGAGGAGGTATTGTTCATTATATTCATTTCTCTCACTAGACCATTTTGCATAACCATGGTGGATTTCTCAGCTCCTTTTATCTCATGAACTTGAAGAAATCGGCTGCCTTTGTCTGTTCGTGGTCTGAATTGTTTTCCATTATGTCTGTTTTTTTAATATCAGAAGTTACTGTTGTTCTTGTTCATGTTTATTGTTTTTTGCGGTTTGCTTCTGATGTTTTTAGTGAGTTTTAGTGAGGCAATCCAATTAGTTTCATTAGCGGAGCAGATATTTTTGGGTGGACCACTTGACATATACACCTCCATTGATGAGGTGTTTGCATCCTTGGACTAATAGTAGATTCAATTTGATGCTGTTGGTGAAGAGAGTTAAGATTTGAGATCAGTCTAGTGATCAAGGGAACAATGAGAGATCTCACATTGATTGGAGAAGGGAACGAGTGTCAACAAGGATGTTGGGTCCCGAAGGGGAGTGAATTGTGAGATCCCACGTCGGTTAGAGAGGGGAACGAAGCATTTTTTATTAGGGTGTGAAAACCTCACATCGATTTGAGAGGGGAACGAGTGCCAGCGAGGATGCTGGGCCCTGAAAGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACTTCTTTATAAGGGTGTAAAAACCTCTCCCTAACAGACGCGTTTTAAAACCTTGAGGGGAAGCTCAAAAGGTAAAACCCAAAGAGGACAATATCATTCAAAGAACTTTGTAATTGGGAGATCGGTATAAATATTAGATGAAGTGTTCATATGCGTGCAATGAGGAAATTGTGGCTTACCAAGGAGAAATAAGGCAATTGTGGGAATTGAAAAGACCTTTGATCTTGTAGATTGGAACATTTTGGATAAGGTGCTTTGAAAAATGGGCTTGGTTTAGAGGTTTTGGATATGGAATTGTATGTCTTCTGCCGTATATTTTATCTTTATTGATGGAAAACTTAGGGGAATATTTTTGCCTCTAGATGGCTCAAGTAGGATGTCTAGGGCACCGTTCTTTAAACCAAGCTGTCATTTGGAAAGCCAAAAGATCTTTAATGGTGATGGTAAAATTCATCTTACTCCTTAGCAGTTCATTGATCATACCATTTTCTTTTGGAGTGGAGGGGAATATGTTTTTACCTCCATGGAGAGATATCTCTGGTGATAGTTCTTGCCCATTTTCTCGTATGGTTCGTTCTCTTCTTCCAAGTCGATCCAAAATAGTTTCTTGAATTGAGGGCCTCGCACAAATGTCTCATCGCAATTGAAGCACAACCCTTTCTTCCATTTCTTCTCTAGTGAGTCGTTTTATCAAACAGTTGGTGCGGGTATCAAAAATTGGTGAATTGTGTTTGTTATCTTGGTTGGTGGTGGCCTTGGGATATATATTCTTTTCGTACAAATGAGACATACTCATTGCGGTTACCAAGTCCTGTGGCTGGTGGAGCTCCACCTCAATTGATATAGACTCTTGCAATCCGCTAATATACAACTGAATCTTTTGATTTTGAGTTAAAATTCCAGCTCTTGAAACCAACACTTAGAATTTTTTTTGGTACTCTTCCACTGAACCCGTTTGTTTTTAGCTTAGCGAGCTCCCCCAATATATTGCTTCGGATGGGAGGTTCAAACCGCAAATTGCATTGGTGGGCAAACACTATCGAGGTGGGATGTGGAATATCCTGTACCATCTGTAAATACCATAGTTGAGCAATTCCTCTAAGTGATAAGAGGCTAAGCTCTTTCTTCCTCGGGTGTCGATTGATGTGGAAAAAGTGTTGACAATAGCTAATCCAACCCAAGGGGTCCTCCAGCCCATTGAAGCGAGGGAAGTCAAGTTTCATGAATTTGGGTTCTATCAAGTTTCTTCCATCATTTTCAGAAATGGTGCCCTAGAAATCCCCTTATCTCTCCTTGTTTTTGCTCGACTTTCAGCACTTGAAGAAGTCAACCTGACTTCTTTGTGGATTCCAAGTCAAGGGACATGACATCCAATTTGGCATGAAGCTATTTAACCTTCTCATTACGCGCTTGATTGGCCTGTTCTTAAGATAAGAGTAACTTGAAGAGTTTGGTAAATGGTTCTTGTATAGACTCACCCATATTGTTGGCTCTAATACCAAATTGTTACGTGCCCAAGTCTGCGATCGAGTTATGAGTCTATCATAAGTGGAGATAGACGATATTGTGTGGGGGAAGAAGTAGAATTCTTCTTTCGACCTATTTTAAATAATTGTTTGGCTCAATTGGAGGGAACCTTAATACCTCTGAGTTAAAAGTACTCAAGATTAAATTTGACTAAATTGAAAATTTTTAGGTACCATCTTTATTGATGTTTATGACTATTTATACAAGTTGTGTAATAACCATTACTACATCAATGGAACCATGATTCAATCATGGAGGATTAACCTCCTTAAACAAAGGAAATAACTAAAAATAGAAATGAAAGTGGAGTCCTTACAACCATTACTACATCAATGCATGACTCAATCATGGAGGACCATTCTCCTAAAACAAGGGAAATAACTAAAAATAGAAATGTTGGTGGAGAATTCCTCCTTACAATAAGGAAACTGAAAAAAAAACTACATAAGAAAAATTCAACCAATGGCTTCCATACATACGCGATTGGTTCTTTTTTCCATGAGTGTAACATGTGTACACTTGTAGTGACATTGTATCAATGTCATTCTTCGAAAAAGAGATTCCATGCAGTAAATCCTTAAAGACAGCCTTTAGGAAGCTCAGAATAGAAAGAAGGATCGATATGATCAATTGCACATATCGCACCGACCATTTGAGTTCAATATTGGAGACAAGGTCCTGCTGCATCTTCAACCATATCGCCCGTCTTTGTTAGCTTCTTGGAAAAATCAAAAGCTTGCCGCAAAATTCTCCGAGCCTTTTGAGGTATTAGAACGAATTTGTTCTATGACCTATAAGTTAAACTTACCAACCGAATCAAAATTACATCCAGTGTTCTACGTTTCCACACACAAACCATTCCATGAAGGCAATGTCAATCATAATCCAAAACTTCCTCCAATTCCAGCCCCTGACCCTCCTCAACCACTTGCTATTTTGGACCATCAATTTAAAGCTAGATAGTCAGAAGTTTTGATACACTGGAGCCACTCTTCACCAGCTGATGCCTCTTGGGAAATGTTCAAGATACGACCAAACGATTTCCATAATTCAAGTTTGAGGAGAAGCTTTCTTTGAGGTCGGGAAGTTTGATACAATGCCACTATAAATGTACACACGTTACACTCATGGTAGAAAGAAGCATTCGCGTATGGAACCCATTGGTTGAATTTTTCTTTATGCTGTTTTTTTTTTTTCCCAGTGTCCGTACTATAAGAAGTCCTCCACCTTCATTTTTATTTTTAGTTATTTCCCTTGTTTTAGGAGGATGATCCTCCATGATTGAGTCATGACTGTATTGATGTAGCAATAGTTATAGGAACTCCACTTTCATTTCTATTTTAAGTTATTTACTTTGTTTTAGGAGAGGATGATCCTCCATGATTGAGTCTTGGTTCCATTGATGTAGCAATGATTATTATACAACTTGTATAAATAATCATAAACATCAATGAAGATGATACTTAAAAATTTTCAATATAGTCTTGAGTACTTTAACCTAGATGTATTAAGGTTCTCTCTGTTTGAGCTTTACAATTATTCAAAATAAGTCGAAAGAAGAATTCTACTTCTTCCCCCGCACAAACACCATCTACCTCCATTTACGAAAGACCCATATCCCTAGGATGTTAAAATTTCGTAGGACATATAATGCGAACTTTGTTCAAAGATCTTCTATGGCTTTGGATTCTAGTGTTGCATTGTGCAGAAAGCAGTGGAGAATTTTCTTTTCTTTTAGGTTTATAAGTGAGAACACTATATTAAAAGAGGAGCTAAAAAAGACAGCCTACGGGCTCGGTAGAGAAAACGAAGCAGTGAGGATTTAGATCATGTGCTTTGGAAGCGATGCTTTATCGTGAAGCTTTGGGCCGTACTCTTGGATACCTTTGGTTCTGGTTTGACCTTGCCAAGAGGGTGTATGAGTATGG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MPATPSSNLIHVHGCNRLISPPSVSSSTCSLSVLSISHLSGRQINGFPSSNLVFSFFPSFLTSFRSPNGFISGKPRRKRRLRIPIISAIFERFTERAVKAVIFSQREAKALLNGLVFTQHLLLGLIAEEYHNQSPGGFLNSGLTLHEAREAVRGIWHSNDAEADMSVDSAAVTPHVPFSVGTKRVFDSAVEYSKKMGHHFVGPEHLSIALLAADDDGNIELILRSLGVNVTQLVDAAISRLKGELAKDGREPSSALQQWVPKKSASRKVLRIKPSQKEKENSALAQFCVDLTARASEGFIDPIFGRDSEVKRVVEILCRRTKNSPILIGESGVGKTAIAEGLALSIAQADAPFVLLNKQVMSLDIGLLVSGAKERGELEARVTALINEITESGNIILFIDEVHSLAELGAAGGGSKGSGLNFANLLKPSLGRGKLQCIASTTIGEYRKKFETDKALARRFQPVLIEEPSQDNAVRMLLSIREKYEAHHNCRFTFEAINAAVYLSARYISDRYLPDKAIDLIDEAGSRARMEAFKKRKELQTSILSKSQDEYWQEIKAIQAMHEMNLANKLKDGEVQSLDSSGNNIVESTLSSMSDNFEPVVVGPDDVAAVTSLWSGIPVQQLTVDESVLLMGLDEQLKKQVVGQDEAISAISRAVKRSRVGLKDPDRPLAVLLFCGPTGVGKTELTKVLARCYFGSEAAMLRLDMSEYMERHSVSKLIGSPPGYLGYGDGGTLTEAIRRKPFTVVLLDEIEKAHPDVYNIVLQLFEDGHLTDSQGRRVSFKNALIVMTSNIGSTSIIKGRHHSIGFFTSEDESSSSYAGMKSLVIEELKGYFRPELLNRIDEIVVFQPLQKAQMLEILNLMLQEVKDRLMSLGMGLELSESVKDLICQVGYDQAYGARPLRRAVTLIVEDPLSEAFLYGDPKPGDTFVVDLDPTGNPFISVNSVKSTTLCVPFSLVLISRSSKSGILDRLFLVLLQSIMASSGSGLTFKLHPLVIVNISDHYTRVKSQMNPPSSCCSAPSPCALSNDADVADSVDLTTSPPAPRVYGCVVGVQRGRTVEIFNSFELLYDPKTQSLDRTFLEKKQELYKKVFPHFYILGWYSTGSDALESDMHIHKALMDINESPVYVLLNPSINHAQKDLPVTIYESELHVIEGIPQLIFVRSSYTIETVEAERISVDHVAHLKPSDGGSAATQLAAHLAGIHSAIKMLNSRIRILHSYLLAMQNGDVPMESSLLRQVSSLLRRLPVTESIKFQDDFLMDYNDTMLITYLAMSTNCSSIMNELIEKFNTAYDRHSRRGGRTVFI Homology
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42762 (Chaperone protein ClpD, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CLPD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/950 (63.16%), Postives = 751/950 (79.05%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6H795 (Chaperone protein ClpD1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CLPD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1058.9 bits (2737), Expect = 4.6e-308 Identity = 558/880 (63.41%), Postives = 688/880 (78.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XL03 (Chaperone protein ClpD2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CLPD2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 6.9e-304 Identity = 549/877 (62.60%), Postives = 687/877 (78.34%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2QVG9 (Chaperone protein ClpC2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CLPC2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 711.1 bits (1834), Expect = 2.4e-203 Identity = 414/931 (44.47%), Postives = 593/931 (63.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FI56 (Chaperone protein ClpC1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CLPC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 708.8 bits (1828), Expect = 1.2e-202 Identity = 396/858 (46.15%), Postives = 563/858 (65.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IN33 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476726 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1808.9 bits (4684), Expect = 0.0e+00 Identity = 938/939 (99.89%), Postives = 939/939 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F882 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443037 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1762.3 bits (4563), Expect = 0.0e+00 Identity = 914/939 (97.34%), Postives = 926/939 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DHZ6 (Chaperone protein ClpD OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold142G002890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1615.1 bits (4181), Expect = 0.0e+00 Identity = 842/956 (88.08%), Postives = 894/956 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BIA0 (chaperone protein ClpD, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1615.1 bits (4181), Expect = 0.0e+00 Identity = 842/956 (88.08%), Postives = 894/956 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FJV1 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 832/953 (87.30%), Postives = 893/953 (93.70%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. NCBI nr
Match: XP_022976284.1 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1808.9 bits (4684), Expect = 0.0e+00 Identity = 938/939 (99.89%), Postives = 939/939 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. NCBI nr
Match: XP_022936409.1 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1762.3 bits (4563), Expect = 0.0e+00 Identity = 914/939 (97.34%), Postives = 926/939 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. NCBI nr
Match: KAG6592132.1 (Chaperone protein ClpD, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1751.1 bits (4534), Expect = 0.0e+00 Identity = 907/939 (96.59%), Postives = 922/939 (98.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. NCBI nr
Match: XP_023535997.1 (chaperone protein ClpD, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1750.3 bits (4532), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/939 (97.02%), Postives = 922/939 (98.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. NCBI nr
Match: XP_038897556.1 (chaperone protein ClpD, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1619.4 bits (4192), Expect = 0.0e+00 Identity = 843/956 (88.18%), Postives = 896/956 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. TAIR 10
Match: AT5G51070.1 (Clp ATPase ) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/950 (63.16%), Postives = 751/950 (79.05%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. TAIR 10
Match: AT5G50920.1 (CLPC homologue 1 ) HSP 1 Score: 708.8 bits (1828), Expect = 8.3e-204 Identity = 396/858 (46.15%), Postives = 563/858 (65.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. TAIR 10
Match: AT3G48870.1 (Clp ATPase ) HSP 1 Score: 700.3 bits (1806), Expect = 3.0e-201 Identity = 399/883 (45.19%), Postives = 566/883 (64.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. TAIR 10
Match: AT3G48870.2 (Clp ATPase ) HSP 1 Score: 700.3 bits (1806), Expect = 3.0e-201 Identity = 399/883 (45.19%), Postives = 566/883 (64.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh09G010470 vs. TAIR 10
Match: AT5G15450.1 (casein lytic proteinase B3 ) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 2.6e-165 Identity = 349/906 (38.52%), Postives = 516/906 (56.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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