CmaCh09G004890 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh09G004890
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr09: 2190337 .. 2194870 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh09G004890
SyntenyCmaCh09G004890
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGCAGTTGAAGGACGCTGGATGTTAAAGCATACGTGTGTCACTGTGGCAACATCTTTTTCAGGTCAGTGACTTCTTTCTATTCTACTGATTCTTTTGATCTTAATGAATCTCATATCATTTCAATTTCTTTAATGATAGATACCCAAACCAATATTATCTGAATTATTCCTTCATCATTATCATCATTATTAATATCTTGTTGATTTCCTAAGTTGGTTTAAAACTCTGGCTAAAGAGTCAACATGTTCCTAACTCAGTTAGTAAGGGATTGATAAGGTTCATCATGAATCGTTAGTTCAAATTTCTATCTCTGTTTTTTTCTGTTCGAACATCGTAAGTTAGTGATCGAAGATTAACTTTTAAGATGTAATTGATATTTCGGAAATCTGTGGCCAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTACCATCATAATATGTTGCTAGTTTGAATCACCTTGTGTAACTGAAGAAGATACTATTTATGGATGGGATGTGAGTGGAGGGCCCCACAGTTCTTTAACGTTTTTGGAGATTTTTAACCGTTCCTCATGGCTGAGAATAGTAGGACAGTTGGCTTAACTTGCTTCCTCCTGTCCTTTAGCCACCTTTTGTTGCTGTGATATTTCCTAAGAATATTCCTACTCTTTACGCCCCTTCTTTTTGCTTCACTTTTTACCATCCATCTTTTCTGCTTATCTCAACAACTTTCTGGGGTGGCGATTTGATCCCAAAATCCCTTTGCTTACAATCTGTTGATTCTTCTATCCTAAACTTACATTCATTCTATTCCTTCTTGTCATTTTGTTTTGAATTTATTGATATTTTGGAATTCAAATCTCTTGGGTTTTTAAGGAACAAAAAAGAAAAACATCCTAGAGAATTCTTCTTACTACGAGTAGATATTGTCCACTTTGGCCTATTATATAATACTCACGGGTTTTAAAACGCGTTTACTAGGGAGAGGTTTCCACACTCTACTAAGGAATGTTTTGTTTCCCTTTCTAACCAATGTCAGATCTCATAATCCACTCCCTTGAGAGCCCAAAGTCCTCACCAGCAGACCGTCAAGTGTCCAGCTATGATACCATTTGTAATAGTCTAGCCTAAGTCTATCTTTAGTAGATATTGTCCGTTTTAGCTCGTTACATATCGTCACTAATCTCACGATTTTTGAAACACATCTAATAGAAAGAGGTTTTCACACCTTCAACGAAAGATAAAGATATTAAAAGAAAACAAATATAATTCTGAAAAACTACTAAACAAATATTTATCATAAACGACCCTAAACCTAGACAGAACCGTAGTTTGAGCACATTTGTACTGAATTTTGTGGTAAATAAAGATGAAATCTATAGGTTGTGAAGACTAGTCGTTATCAGCCGAAAAAGGAAAGATAAACTATTGGGTTAGTTTCCCCTGGAATTAAAAAAAGAAAATTATCCACTTTTTATGGAATCCAAAATTTCCCCAAATCTTCCCATAAGATTTAGTTCTTGTACTCAAGGGAGCACAAAGAATCGATGAAAAAGGTGTGCATCTTTTTGGATTATTCGTGCACACCCACGTCCATGACTCGTCATAATGTAAGTAATATGTGTAAACATGTGAACGTTTTATTCCATTTTTTGCTTTGAAAATGACGTTAAAAGTGGGTTCGGTATCCTTATCGTATCCATATGTTGTGCACTGGGGCTAGTATAGTGATGGCTGAGTGGGCTTCTACTAGTCTGGGTGGCTGCTCTTATTCAGCTTCCTCCCAAGGGGGTTTTGAATTGCCTCAAGGATTAATCATTTTTAAGGGGAAGATCATTTCTTAACCCCTCGAACGAGACAATATCGAAATGAGAGTGATCTTGAGTATGTATATGTATGAGATCCCAAGTTAATTAGAAAGAGGAACGAAACATTTCTTAGAAGGGTGTAAGACCTCTCTTTAGTTAACATATTGTAAAATCGTAAGGTTGACAATGATACATAACAGGTCAAAGCGGACATGAGTTTGGGCTGTTATAAATAGTATTAGAGTTAGCCACTGGGCAGTGTGTTAGTGATGTTGAAATTTTTTCTAAGAAGCATGTTGAAAGGACTCGAATTTGTGGGGATGGTAGTTTTCAGTCTTGGAAACGATGAGGAAGCATGTTAAAAGAACTCTTCACTCTTAGAACCACAGCAAATGTTGAGGATTATTGGGAGTAAGTCCCACATTGACTAATTTAGAGAATGATCATGAGTTTAGAAGTGAGGAATACTATCTCTATTGTTAAGAGGCATTTTGGGGAATCCCAAAGCAAAGCTATGAGAGCTAATACTAAAAATGGACAATACCATACTATTGTGGAGAGTCGAAGCCGTGAGAGCTAATGCTCAAAGTGGGTTTTTGGGTAGATTATATATTTATTTTATAATTTATTAAAAATAAAAACAAATATAGACGTGGCAAAGATGAGTCCCATCCCCATCCCATTCTTTTCTTCCTTGTCTGATCTGATAAACATCAAAATAGTTAGCTGTTTTCATTTGACAAAACACGTGATTCCGTGATACACCCTTCCTCCTGGTTTTTCTCCCCCAAACACTTATCCAAAACTCTTTATTATTATTATTATATTCACGGTCATCCGTCCACGTCATTTCTTTTCTAATTTTCATCTTGACACGTGGCACACAAAAAAAAAAAACGACGCTTCATCACTTCCCACTCCACCCGTCACTTTAAATCTGAACCGTCGAAACTGAATCTCCGTGACCTGTTGTTTGGCTTCTGGAATCAAACACGCTTCAACATAACCGACAATTTTGAATTTTCGGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATAAATTACAACTGTAATCCATTCATCTATGTTCTTATTTCCATAGATTCCCTCTCTTTTGGTTTTTCCTCCCTTACCGTTGATTTTTATTTTATTCATCTAATTTTTAAATTTCTTATTTTTCATTTTATAGTTTTTTTTAATCTACTAAACATTGATTATATCCTATTTTATTTTCCAATTTTTGTTTTTTGTAATAAATTGTATTAAATAAATGAATCCACTGATTTCAGTTTCTTTTTTTACAATATTGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTCGTACTTATTTGATTGTACTATCTATATTTTTCATATTTATTTAGGCTCAAAAAGATAATTTTAGAATCTTCCGCCAATTTTGAATAATTCCTAAAAGAAATTGGAAAATTCGATCTTCTTGGGAAAGAAAACTAATCAGATTACTCAATGGTCAAAATAAATTACTAATTAATTTTTTTTTTTGTCACTAATGGAAATTATAAACATAAATTTCAGTGTCATTTATATATTTGGATTAAAAAAGTATTTACATTTTTTTTAATATTTTTAAAAATCCATAAAATTAGTATGAAATAAAGAAAATTATATTGCTGTAGAAGCATCGGAATCTTTGAGAAACATGGCTTTTGTTCTTTACAGCTATAAATTTGGTCCAAAAAAACACACACATTCAAACACAGCTATAAAACTTGCTGCAAAAGGAAAATTTTGCTAAAATAAATTTAAATTAGTTCCTAAAACTAAAAATTTAGTAATTGAATTATTATATTTTTTAAATTTTATAAATTTACTGAACCAAAAAAAATTAAAATTTAAGGATATATGGATATAAAATTTAAATTTATATCTAATAGGCTGATTATTTTTTTCTTTTTTTTTTAAAATTATTGTGAGTTAAAAATTTATGGTATATTAAATTTATATAAAAAAAAAAATGCAGTATTGAAGATAATTCAAAAGATAGGGGTAGAAGAGGAAATTCATGCGCTGGCCATATGGGATGGCGACACCCGAAGCTTCACAGTATCGCTGTCGTTCTTTGAGAAACGCGCGTTGCGAAGCCTCTGGAAATCGCGCCCTCGCCTTTACTATAAATACCGTTTCACTTTGAACTGTACCTCACACACCTTCGGATTCTTTGTTTCTCATCTGGTTCTTAAACTCAGCGGGTTTCTCGGCTGTTCGGTGCTTCGATTTTTGTGTTGGATCTCTTTTGTAGCTGTTTTTGGTATTCGGGTTCGCATCCGCAAGCTTGTGTGTTCGCCGACTGAACGAAGTTCGTTATTCTATTTAGACAATTTTCTGTAGTTTTTCTGTAGTTCGTAATTCTTGTTTTTGATTATCTTTTGGTGGAACGGTTGGATTTTAGTTTTATCTTGTCTTCTTTCTTCGGCAAATGTGATGTGCATTTTCTCTCTGGCTGGAATTTTTTGTTTGGTTTCTTTGATAATTTTATCGCGAAATAGATGGGGATTTGGGATCTTATACCTTCTGGTTTAGTTCAACTTGTTGTGAGTGGTTCTCGATTGTGTTCTTGTTCCCTCTGCGACTACAATTGTGGAGGTATATGGTCCCAAATTTTCTATAATTTTTTTTCCTTGCGATAATGAAGTCAAAATTCTCCTTGCAATTTTTTGGGTGCGCACTAGGCTGTTTGGTTCTCTGCGATTGATGGCTCTGGGGATGTTCGTTCCCTAG

mRNA sequence

ATGGCAGTTGAAGGACGCTGGATGTTAAAGCATACGTGTGTCACTGTGGCAACATCTTTTTCAGTATTGAAGATAATTCAAAAGATAGGGGTAGAAGAGGAAATTCATGCGCTGGCCATATGGGATGGCGACACCCGAAGCTTCACAGTATCGCTGTCGTTCTTTGAGAAACGCGCGTTGCGAAGCCTCTGGAAATCGCGCCCTCGCCTTTACTATAAATACCGTTTCACTTTGAACTGTACCTCACACACCTTCGGATTCTTTGTTTCTCATCTGGTTCTTAAACTCAGCGGGTTTCTCGGCTGTTCGGTGCTTCGATTTTTGTGTTGGATCTCTTTTGTAGCTGTTTTTGGTATTCGGGTTCGCATCCGCAAGCTTTTCGTAATTCTTGTTTTTGATTATCTTTTGGTGGAACGGTTGGATTTTAGTTTTATCTTGTCTTCTTTCTTCGGCAAATGTGATGTGCATTTTCTCTCTGGCTGGAATTTTTTGTTTGTGGTTCTCGATTGTGTTCTTGTTCCCTCTGCGACTACAATTGTGGAGGTATATGGTCCCAAATTTTCTATAATTTTTTTTCCTTGCGATAATGAAGTCAAAATTCTCCTTGCAATTTTTTGGGTGCGCACTAGGCTGTTTGGTTCTCTGCGATTGATGGCTCTGGGGATGTTCGTTCCCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGTTGAAGGACGCTGGATGTTAAAGCATACGTGTGTCACTGTGGCAACATCTTTTTCAGTATTGAAGATAATTCAAAAGATAGGGGTAGAAGAGGAAATTCATGCGCTGGCCATATGGGATGGCGACACCCGAAGCTTCACAGTATCGCTGTCGTTCTTTGAGAAACGCGCGTTGCGAAGCCTCTGGAAATCGCGCCCTCGCCTTTACTATAAATACCGTTTCACTTTGAACTGTACCTCACACACCTTCGGATTCTTTGTTTCTCATCTGGTTCTTAAACTCAGCGGGTTTCTCGGCTGTTCGGTGCTTCGATTTTTGTGTTGGATCTCTTTTGTAGCTGTTTTTGGTATTCGGGTTCGCATCCGCAAGCTTTTCGTAATTCTTGTTTTTGATTATCTTTTGGTGGAACGGTTGGATTTTAGTTTTATCTTGTCTTCTTTCTTCGGCAAATGTGATGTGCATTTTCTCTCTGGCTGGAATTTTTTGTTTGTGGTTCTCGATTGTGTTCTTGTTCCCTCTGCGACTACAATTGTGGAGGTATATGGTCCCAAATTTTCTATAATTTTTTTTCCTTGCGATAATGAAGTCAAAATTCTCCTTGCAATTTTTTGGGTGCGCACTAGGCTGTTTGGTTCTCTGCGATTGATGGCTCTGGGGATGTTCGTTCCCTAG

Protein sequence

MAVEGRWMLKHTCVTVATSFSVLKIIQKIGVEEEIHALAIWDGDTRSFTVSLSFFEKRALRSLWKSRPRLYYKYRFTLNCTSHTFGFFVSHLVLKLSGFLGCSVLRFLCWISFVAVFGIRVRIRKLFVILVFDYLLVERLDFSFILSSFFGKCDVHFLSGWNFLFVVLDCVLVPSATTIVEVYGPKFSIIFFPCDNEVKILLAIFWVRTRLFGSLRLMALGMFVP
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh09G004890 vs. NCBI nr
Match: KAG7031825.1 (hypothetical protein SDJN02_05866, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.4e-06
Identity = 30/58 (51.72%), Postives = 37/58 (63.79%), Query Frame = 0 

Query: 26 IQKIGVEEEIHALAIWDGDTRSFTVSLSFFEKRALRSLWKSRPRLYYKYRFTLNCTSH 84
          +  +GVE   +   I+D DT + T S SF EKR L SLWK RPR  YKY F LNCT++
Sbjct: 14 VHYLGVEAYFYVQTIYDSDTLNSTESFSFIEKRELGSLWKPRPRSCYKYCFDLNCTTY 71

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh09G004890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh09G004890 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh09G004890 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7031825.13.4e-0651.72hypothetical protein SDJN02_05866, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of CmaCh09G004890 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh09G004890.1CmaCh09G004890.1mRNA