CmaCh02G012440 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh02G012440
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	extensin-2-like isoform X1
Location	Cma_Chr02: 7313517 .. 7316327 (+)
RNA-Seq Expression	CmaCh02G012440
Synteny	CmaCh02G012440

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAAGTCGATGATGATTTGTTGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCAACATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATACGTCTACAACTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACCAATCTCCGCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCGCCACCCTATGCTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTACACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCCCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCACTATGTCTACAAGTCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCACCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCCCCACCTTATTACTACAAATCACCACCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

mRNA sequence

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAAGTCGATGATGATTTGTTGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCAACATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATACGTCTACAACTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACCAATCTCCGCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCGCCACCCTATGCTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTACACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCCCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCACTATGTCTACAAGTCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCACCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCCCCACCTTATTACTACAAATCACCACCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAAGTCGATGATGATTTGTTGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCAACATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACAAGCCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCACCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCCCCACCTTATGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCCCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATACGTCTACAACTCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACCAATCTCCGCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCGCCACCCTATGCTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACATTTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCACCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTACACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCCCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCACCTCCACCGCCTCACTATGTCTACAAGTCTCCTCCCCCTCCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCACCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCCCCACCTTATTACTACAAATCACCACCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Protein sequence

MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQVDDDLLLPIKNPELGGDLPKHQHHNTYPPVDHHHKPPQSKYGHHHKPPPPPKYKHHHKPPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPTPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPHYVYKSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPHKSKYPH

Homology

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 273.5 bits (698), Expect = 9.0e-72
Identity = 473/836 (56.58%), Postives = 486/836 (58.13%), Query Frame = 0


Query: 115 PYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP-----PPYVYKSPPPPPYVYK 174
           P  Y SPPP   +Y SP P   V    PP PY+  SPPP     P   YKS PPPPYVY 
Sbjct: 25  PETYASPPP---LYSSPLPE--VEYKTPPLPYVDSSPPPTYTPAPEVEYKS-PPPPYVYS 84

Query: 175 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 234
           SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY 
Sbjct: 85  SPPPPTY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYN 144

Query: 235 SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 294
           SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY 
Sbjct: 145 SPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKS-PPPPYVYS 204

Query: 295 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIY 354
           SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y      P P   YKS PPPPY+Y
Sbjct: 205 SPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVEYKS-PPPPYVY 264

Query: 355 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 414
            SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY
Sbjct: 265 SSPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVY 324

Query: 415 KSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYV 474
            SPPPP Y     P P   YKS PPPPY+Y SPPPP Y      P P   YKS PPPPYV
Sbjct: 325 SSPPPPYY----SPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVDYKS-PPPPYV 384

Query: 475 YKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKS 534
           Y SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y       PSP      PPPPYVY S
Sbjct: 385 YSSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPTY------SPSPKVDYKSPPPPYVYSS 444

Query: 535 PPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 594
           PPPP Y       PSP      PPPPYVY SPPPP Y      P P VY   PPPPYVY 
Sbjct: 445 PPPPYY------SPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYS 504

Query: 595 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 654
           SPPPP Y      P P VY   PPPPY+Y SPPPP    Y SP P  Y YKS PPPPYVY
Sbjct: 505 SPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP----YYSPSPKVY-YKS-PPPPYVY 564

Query: 655 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 714
            SPPPP Y      P P VY   PPPPY+Y SPPPP Y      P P VY   PPPPY+Y
Sbjct: 565 SSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVY 624

Query: 715 KSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYI 774
            SPPPP Y      P P ++   PPPPYVY SPPPP Y       P P V+   PPPPY+
Sbjct: 625 SSPPPPYY-----SPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYY------SPSPKVHYKSPPPPYV 684

Query: 775 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPTPPPYVYKSPPPPPYV 834
           Y SPPPP Y      P P VY   PPPPYVY SPPPP Y     +P P VY   PPPPYV
Sbjct: 685 YNSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYV 739

Query: 835 YKSPPPPHYVYKSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSP---SPPPPYYYKSPPP 894
           Y SPPPP+Y   SP P   YKSPPPP  SP P   YKSPP P      PPPP Y  SP  
Sbjct: 745 YSSPPPPYY---SPSPKVYYKSPPPPYYSPSPKVYYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPKV 739

Query: 895 PSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPS-PSPPPPYYYKSPPPPHKSKYP 936
              SPPPPY Y SPPPP  SP P  YYKSPPPPS  SP P   YKSPPPP  S  P
Sbjct: 805 VYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPSYYSPSPKVEYKSPPPPSYSPSP 739

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 178.3 bits (451), Expect = 4.0e-43
Identity = 280/460 (60.87%), Postives = 296/460 (64.35%), Query Frame = 0


Query: 111 KSPPPYLYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVY 170
           +S   Y Y SPPPP   Y     PP  + SPPP   +Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y
Sbjct: 24  QSTANYFYSSPPPPVKHY----TPPVKHYSPPP---VYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHY 83

Query: 171 KSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YIYKSPPPP 230
            SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP   Y SPPP   +Y SPPPP   Y+YKSPPPP
Sbjct: 84  -SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 143

Query: 231 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKS 290
              Y SPPP   +Y SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   Y+YKS
Sbjct: 144 VKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKS 203

Query: 291 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPP-Y 350
           PPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   Y
Sbjct: 204 PPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHY 263

Query: 351 VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 410
           VYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP
Sbjct: 264 VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPP 323

Query: 411 P--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPP--YVYKSPPP------PPYIYQSPPPP 470
              YVYKSPPPP   Y SPPP   VY+SPPPP   YVYKSPPP      PP +Y SPPPP
Sbjct: 324 KKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPP 383

Query: 471 P--YIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 530
              Y+YKS  PPPP  + SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP   Y SPPP   +Y 
Sbjct: 384 KKHYVYKS--PPPPVKHYSPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYH 431

Query: 531 SPPPP-SPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPY 541
           SPPPP   Y YKSPPPPP  + SPP  PY+YKSPPPP  Y
Sbjct: 444 SPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHYSPPHHPYLYKSPPPPYHY 431

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 6.8e-35
Identity = 263/447 (58.84%), Postives = 276/447 (61.74%), Query Frame = 0


Query: 136 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 195
           Y Y SPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP  
Sbjct: 21  YFYSSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP-- 80

Query: 196 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 255
            VYKSPPPP   Y SPPP   +YKSPPPP  VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP 
Sbjct: 81  -VYKSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPP--VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPV 140

Query: 256 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 315
             Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKS PPPP
Sbjct: 141 KHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKS-PPPP 200

Query: 316 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 375
             Y SPPP   VYKSPPPP  +   SPPP   +YKS PPPP  Y SPPP   VYKSPPPP
Sbjct: 201 VKYYSPPP---VYKSPPPPVKHY--SPPP---VYKS-PPPPVKYYSPPP---VYKSPPPP 260

Query: 376 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPP 435
              Y SPPP   VYKS PPPP  Y SPPP   VYKSPPPP +      PPP VY SPPPP
Sbjct: 261 VKHY-SPPP---VYKS-PPPPVKYYSPPP---VYKSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPP 320

Query: 436 PYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 495
            +      PPP +Y SPPPP  Y+     PPP VY SPPPP +                P
Sbjct: 321 VHY----SPPPVVYHSPPPPVHYS-----PPPVVYHSPPPPVHY--------------SP 373

Query: 496 PPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYK 555
           PP +Y SPPPP  Y+     PPP VY SPPPP   Y YKSPPPP  Y+      PP VY 
Sbjct: 381 PPVVYHSPPPPVHYS-----PPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYS------PPTVYH 373

Query: 556 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 581
           SPPPP + Y SPP  PY+YKSPPPP Y
Sbjct: 441 SPPPPVHHY-SPPHQPYLYKSPPPPHY 373

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 149.4 bits (376), Expect = 2.0e-34
Identity = 233/426 (54.69%), Postives = 256/426 (60.09%), Query Frame = 0


Query: 272 PPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 331
           P PP +   PPP      SPPPP  ++ +PP       SPPPP     SPPPP Y   SP
Sbjct: 394 PRPPVVTPLPPPS---LPSPPPPAPIFSTPP----TLTSPPPP-----SPPPPVY---SP 453

Query: 332 PPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 391
           PPP       PPPPP +Y  PPPPP     PPPPP VY  PPPPP     PPPPP VY  
Sbjct: 454 PPP-------PPPPPPVYSPPPPPP-----PPPPPPVYSPPPPPP----PPPPPPPVYSP 513

Query: 392 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKS 451
           PPP P     PPPPP VY  PPPPP     PPPPP VY SPPPPP +Y SPPPPP    S
Sbjct: 514 PPPSP-----PPPPPPVYSPPPPPP-----PPPPPPVY-SPPPPP-VYSSPPPPP----S 573

Query: 452 PPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAY 511
           P P P Y  + PPPPP+   SPPPP   +  PPP PY Y SPPPP   + SPPP SP   
Sbjct: 574 PAPTPVYCTRPPPPPPH---SPPPPQ--FSPPPPEPYYYSSPPPP---HSSPPPHSPPPP 633

Query: 512 KSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 571
            SPPPP Y Y SPPPPP    SPPP   Y   SPPPPP   + PPPPP +  SPPPPP V
Sbjct: 634 HSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTPVY---SPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPV 693

Query: 572 --YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPP 631
             Y SPPPPP  Y SPPPPP  Y SPPPPP V+ S PPPP ++   PPPSP  Y SPPPP
Sbjct: 694 VHYSSPPPPPVYYSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPSPVHYSSPPPP 753

Query: 632 PYV--YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP--PYVYKS 691
           P     +SPPP P V+ SPPPP  +    PPPP +++SPPPP   Y+ P PP     Y S
Sbjct: 754 PSAPCEESPPPAPVVHHSPPPP--MVHHSPPPPVIHQSPPPPSPEYEGPLPPVIGVSYAS 759

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 630.6 bits (1625), Expect = 2.1e-180
Identity = 402/458 (87.77%), Postives = 414/458 (90.39%), Query Frame = 0


Query: 126 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 185
           Y Y  P PP YVYK   PP +IY SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 28  YTYSPPSPPSYVYK---PPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPP 87

Query: 186 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 245
           YIYKSPPPPPYVY SPPPPPYIYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPP
Sbjct: 88  YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPP 147

Query: 246 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 305
           YVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 148 YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 207

Query: 306 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 365
           YVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKS PPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 208 YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKS-PPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 267

Query: 366 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP 425
           PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY+SPPPP
Sbjct: 268 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 327

Query: 426 PYVYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 485
           PYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPY+YKS PPPPPY Y SPPP PYVYKSPPPPPY+Y SPPP
Sbjct: 328 PYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKS-PPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPPP 387

Query: 486 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSP 545
           PPYVYKSPPPPPY+Y SPPPP PY YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SP
Sbjct: 388 PPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSP 447

Query: 546 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP---YVYKSPPPPPY 581
           PPPPYVYKSP PPPYVYKSPPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 448 PPPPYVYKSPSPPPYVYKSPPPPPSYSYSYSSPPPPIY 478

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 506.1 bits (1302), Expect = 5.9e-143
Identity = 354/442 (80.09%), Postives = 371/442 (83.94%), Query Frame = 0


Query: 130 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 189
           SP P PY     P PPY+Y S  PPPYVY SP PPPYVYK   PPPY+Y SPPPPPY+Y 
Sbjct: 28  SPTPTPY----SPLPPYVYNS--PPPYVYNSPSPPPYVYK---PPPYIYSSPPPPPYVYS 87

Query: 190 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 249
           SPPPPPYVY SPPPPPY+Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY 
Sbjct: 88  SPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 147

Query: 250 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 309
           SPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y  PPPPPYVY+SPPPPPYVY SPPPPPYVYK
Sbjct: 148 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 207

Query: 310 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 369
           SPPPPPYVY SPPPPPYVYKS PPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVY
Sbjct: 208 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKS-PPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 267

Query: 370 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVY 429
           KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPYVY+SPPPPPYVY
Sbjct: 268 KSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 327

Query: 430 KSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 489
           KSPPPPPY+Y SPPPPPY+YKSPPPPP     SPPP PYVYK   PPPY+YK   PPPYV
Sbjct: 328 KSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYK---PPPYVYK---PPPYV 387

Query: 490 YK-SPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPP 549
           Y  SPPP PY+YK  PPP  Y+Y SPPP PYVYK   PPPY+Y   PPP+PY YK   PP
Sbjct: 388 YNYSPPPAPYVYK--PPPYVYSY-SPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PP 443

Query: 550 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 571
           PYVY SP PPPY Y SP PP Y
Sbjct: 448 PYVYSSPSPPPY-YSSPSPPLY 443

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10
Match: AT3G28550.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 1.0e-126
Identity = 615/1038 (59.25%), Postives = 635/1038 (61.18%), Query Frame = 0


Query: 78   PPP---PKYKHHHKPPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYL-YKSPPPPPY------V 137
            PPP   P  K  +K PP P    +  PPPP  Y    SP P + YKSPPPP Y       
Sbjct: 31   PPPYSVPLPKVEYKSPPLPDV--YSSPPPPLEY----SPAPKVDYKSPPPPYYSPSPKVE 90

Query: 138  YKSPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPP 197
            YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPP
Sbjct: 91   YKS-PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPIYSPSPKVDYKS-PPPP 150

Query: 198  YVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKSPPP------PPYIYKSPPPPPYIYKSPPP 257
            YVY SPPPP Y       YKS PP PYVY SPPP      P   YKS PPPPY+Y SPPP
Sbjct: 151  YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKS-PPSPYVYNSPPPSYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPP 210

Query: 258  PPY------VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPY----- 317
            P Y      VYKS PPPPY+Y SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y     
Sbjct: 211  PYYSPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPK 270

Query: 318  -VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPP 377
             VYKS PPPPY+Y SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y      VYKS PP
Sbjct: 271  IVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKS-PP 330

Query: 378  PPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKS 437
            PPYVY SPPPP Y       YKS  PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY S
Sbjct: 331  PPYVYSSPPPPYYSPTPKVDYKS--PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSS 390

Query: 438  PPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV- 497
            PPPP Y      VYKS PPPPYVY SPPPP Y      VYKS PPPPYVY SPPPP Y  
Sbjct: 391  PPPPYYSPSPKIVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYTPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSP 450

Query: 498  -----YKSPPPPPYVYNSPPPPPY------VYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPP 557
                 YKS PPPPYVY+SPPPP Y      VYKS PPPPY+Y SPPPP Y      P P 
Sbjct: 451  SPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPK 510

Query: 558  YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------IYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------IYKSPPP 617
              YKS PPPPYVY SPPPP Y      +YKS PPPPYVY SPPPP Y      +YKSPPP
Sbjct: 511  VDYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVLYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPP 570

Query: 618  PSPYAYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYIYKSPPP----PSPYAYKSPPPPPYVYKSP 677
              PY Y SPPPP Y      VYKS PPPPY+Y SPPP    PSP      PPPPYVY SP
Sbjct: 571  --PYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSP 630

Query: 678  PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP-----PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-------YVYK 737
            PPP   Y SP P  Y YKSPP     P P V    PP P+V   PPPPP        VYK
Sbjct: 631  PPP---YYSPSPKVY-YKSPPSPYHAPSPKVLYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPKVVYK 690

Query: 738  SPPPPPYIYKSPPP----PSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYVYK 797
            S  PPPY+Y SPPP    PSP  +   PPPPYVY SPPPP     P V+   PPPPYVY 
Sbjct: 691  S-SPPPYVYSSPPPPYHSPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYS 750

Query: 798  SPPPPPY------VYKSPPPPPYIYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPY- 857
            SPPPP Y      VYKS PPPPY+Y SPPPP Y      VYKS PPPPYVY SPPPP Y 
Sbjct: 751  SPPPPYYSPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYS 810

Query: 858  -----IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP-----PP 917
                 +YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P  VYKS PPPPY+Y SPPPP     P 
Sbjct: 811  PSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPK 870

Query: 918  YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YK 936
             VYKS PPPPY+Y SPPPP Y     P P  VYKS PPPPYVY SPPPP Y       YK
Sbjct: 871  VVYKS-PPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 930

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10
Match: AT3G54580.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 1.6e-116
Identity = 572/985 (58.07%), Postives = 590/985 (59.90%), Query Frame = 0


Query: 83  YKHHHKPPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPP-PYLYKSPPP-----PPYVYKSPPPPPY 142
           Y  +    PPP Y      P PK    +K+PP PY+  SPPP     P   YKS PPPPY
Sbjct: 23  YDPYTDSSPPPLYS----SPLPK--IEYKTPPLPYIDSSPPPTYSPAPEVEYKS-PPPPY 82

Query: 143 VYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPP 202
           VY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 83  VYSSPPPPTYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPP 142

Query: 203 PYI------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI- 262
            Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y  
Sbjct: 143 TYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSP 202

Query: 263 -----YKSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKS 322
                YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS
Sbjct: 203 SPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKS 262

Query: 323 PPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVY 382
            PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY
Sbjct: 263 -PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKS-PPPPYVY 322

Query: 383 KSPPPP-----PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 442
            SPPPP     P   YKS PPPPY+Y SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP Y
Sbjct: 323 SSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTY 382

Query: 443 ------VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPY---- 502
                  YKS PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKS PPPPYVY+SPPPP Y    
Sbjct: 383 SPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTY----SPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTYSPSP 442

Query: 503 --VYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 562
              YKS PPPPY+Y SPPPP Y      P P   YKS PPPPYVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 443 KVEYKS-PPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPTY----SPS 502

Query: 563 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPP----PSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYA 622
           P   YKS PPPPY+Y SPPP    PSP  Y   PPPPYVY SPPPP Y       PSP  
Sbjct: 503 PKVDYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY------SPSPKV 562

Query: 623 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYVYKSPP 682
           Y   PPPPYVY SPPPP   Y SP P  Y YKSPPPP     P VY   PPPPYVY SPP
Sbjct: 563 YYKSPPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKVY-YKSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPP 622

Query: 683 PP-----PYVYKSPPPPPYIYKSPPP----PSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYV 742
           PP     P VY   PPPPY+Y SPPP    PSP      PPPPYVY SPPPP     P V
Sbjct: 623 PPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYHSPSPKVQYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKV 682

Query: 743 YKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYIYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYV 802
           Y   PPPPYVY SPPPP     P VY   PPPPY+Y SPPPP     P VY   PP P+V
Sbjct: 683 YYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPHPHV 742

Query: 803 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYIYKSPP 862
              PPPPP      P P  VYKS PPPPY+Y SPPPP     P VY   PPPPY+Y SPP
Sbjct: 743 CVCPPPPPCY---SPSPKVVYKS-PPPPYVYSSPPPPHYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPP 802

Query: 863 PP-----PPYVYKSPPPP-----PYIYKSPPPPPYIYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPY 922
           PP     P   YKSPPPP     P ++   PPPPY+Y SPPPP     P V+   PPPPY
Sbjct: 803 PPYYSPSPKVHYKSPPPPYYAPTPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPY 862

Query: 923 VYKSPPPPPY------VYKSPTPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPHYVYKSPPPP 924
           VY SPPPP Y       YKSP PPPYVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP
Sbjct: 863 VYSSPPPPYYSPSPKVEYKSP-PPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPP 922

[Close]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10
Match: AT1G23720.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 416.8 bits (1070), Expect = 4.7e-116
Identity = 586/967 (60.60%), Postives = 604/967 (62.46%), Query Frame = 0


Query: 75  HKPPPPPKY-----KHHHKPPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPPYVYK 134
           +  PPPP Y     K  +K PPPP    +  PPPP  Y    SP P +    PPPPYVY 
Sbjct: 11  YSSPPPPLYDSPTPKVDYKSPPPPYV--YSSPPPPLSY----SPSPKVDYKSPPPPYVYS 70

Query: 135 SPPPPPY------VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 194
           SPPPP Y       YKS PPPPY+Y SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP   
Sbjct: 71  SPPPPYYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS-PPPPYVYSSPPPP--- 130

Query: 195 YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYIYKSPPPPPYV---- 254
           Y SP P P  YKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPY+Y SPPPP Y     
Sbjct: 131 YYSPSPKP-TYKS-PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVEYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPK 190

Query: 255 --YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 314
             YKS PPPPY+Y SPPPP   Y SP P P  YKS PPPPY+Y SPPPP   Y SP P P
Sbjct: 191 VDYKS-PPPPYVYNSPPPP---YYSPSPKP-TYKS-PPPPYIYSSPPPP---YYSPSPKP 250

Query: 315 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPPYVYKSPPPP 374
            VYKS PPPPYVY SPPPP   Y SP P P  YKS PPPPYVY SPPPP    Y SP P 
Sbjct: 251 -VYKS-PPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKP-AYKS-PPPPYVYSSPPPP----YYSPSPK 310

Query: 375 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 434
           P IYKS PPPPYVY SPPPP   Y SP P P  YKS PPPPYVY  PPPP   Y SP P 
Sbjct: 311 P-IYKS-PPPPYVYNSPPPP---YYSPSPKP-AYKS-PPPPYVYSFPPPP---YYSPSPK 370

Query: 435 PYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPY------VYKSPPPPPYIYQSPPPPPYIYKSPPPPPPYA 494
           P VYKS PPPPYVYNSPPPP Y       YKS PPPPY+Y SPPPP   Y SP P P Y 
Sbjct: 371 P-VYKS-PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPAYKS-PPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKPTY- 430

Query: 495 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPY 554
               PPPPYVY SPPPP   Y SP P P VYKS PPPPYIY SPPPP    Y SP P P 
Sbjct: 431 --KSPPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKP-VYKS-PPPPYIYNSPPPP----YYSPSPKP- 490

Query: 555 VYKSPPPPPYIYKSPPP----PSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPP 614
            YKS PPPPY+Y SPPP    PSP       PPPYVY SPPPP Y      VYKS PPPP
Sbjct: 491 SYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKLTYKSSPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKS-PPPP 550

Query: 615 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------IYKSPPPPSPYAY 674
           YVY SPPPP   Y SP P P  YKS PPPPYVY SPPPP Y      IYKS  PP P+  
Sbjct: 551 YVYSSPPPP---YYSPSPKP-SYKS-PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVIYKS--PPHPHVC 610

Query: 675 KSPPPPPYVYKSP------PPPPYVYKSPPPPPYVYKSP------PPPPYVYKSPPPPPY 734
             PPPPP    SP      PP PYVY SPPPPPY   SP       PPPYVY SPPPP  
Sbjct: 611 VCPPPPPCYSHSPKIEYKSPPTPYVYHSPPPPPYYSPSPKPAYKSSPPPYVYSSPPPP-- 670

Query: 735 IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY------IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKS 794
            Y SP P P VYKS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SPPPP   Y S
Sbjct: 671 -YYSPAPKP-VYKS-PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPTYKS-PPPPYVYSSPPPP---YYS 730

Query: 795 PPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP-----PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY------IY 854
           P P P  YKS PPPPY+Y SPPPP     P   YKS PPPPY+Y SPPPP Y       Y
Sbjct: 731 PTPKP-TYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKS-PPPPYVYSSPPPPYYSPAPKPTY 790

Query: 855 KSPPPPPYVYKSPPPPPY------VYKSPPPPPYVYKSPTPPPYVYKSP------PPPPY 914
           KS PPPPYVY SPPPP Y       YKS PPPPYVY SP PPPY   SP      PPPPY
Sbjct: 791 KS-PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKS-PPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPY 850

Query: 915 VYKSPPPPHY------VYKSPPPPYIYKSPPP-----PSP-----SPPPPYIYKSPPPPS 930
           VY SPPPP+Y       YKSPPPPY+Y SPPP     PSP     SPPPPY+Y SPPPP+
Sbjct: 851 VYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPT 891

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh02G012440 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9M1G9	9.0e-72	56.58	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q9FS16	4.0e-43	60.87	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q38913	6.8e-35	58.84	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9T0K5	2.0e-34	54.69	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]

BLAST of CmaCh02G012440 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G26240.1	2.1e-180	87.77	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	5.9e-143	80.09	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	1.0e-126	59.25	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G54580.1	1.6e-116	58.07	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	4.7e-116	60.60	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 142..184 e-value: 3.5E-5 score: 23.8 coord: 494..537 e-value: 1.3E-5 score: 25.2 coord: 373..415 e-value: 3.6E-5 score: 23.8 coord: 748..790 e-value: 4.0E-5 score: 23.6 coord: 525..568 e-value: 1.3E-5 score: 25.2 coord: 677..719 e-value: 3.2E-5 score: 23.9 coord: 789..840 e-value: 2.1E-4 score: 21.3 coord: 454..496 e-value: 5.1E-5 score: 23.3 coord: 292..334 e-value: 2.6E-5 score: 24.2 coord: 152..194 e-value: 4.5E-5 score: 23.4 coord: 809..849 e-value: 2.7E-6 score: 27.4 coord: 606..649 e-value: 1.1E-5 score: 25.4 coord: 627..669 e-value: 2.7E-5 score: 24.1 coord: 737..780 e-value: 1.7E-4 score: 21.6 coord: 263..304 e-value: 1.1E-4 score: 22.2 coord: 252..294 e-value: 3.2E-5 score: 23.9 coord: 667..709 e-value: 7.4E-5 score: 22.8 coord: 212..254 e-value: 1.9E-4 score: 21.4 coord: 697..739 e-value: 4.6E-5 score: 23.4 coord: 413..455 e-value: 1.2E-4 score: 22.0 coord: 182..224 e-value: 6.8E-5 score: 22.9 coord: 423..466 e-value: 3.0E-4 score: 20.8 coord: 586..629 e-value: 1.7E-5 score: 24.8 coord: 464..517 e-value: 2.3E-4 score: 21.1 coord: 717..760 e-value: 6.7E-5 score: 22.9 coord: 566..608 e-value: 2.7E-5 score: 24.2 coord: 546..588 e-value: 2.9E-5 score: 24.1 coord: 708..749 e-value: 1.7E-4 score: 21.6 coord: 232..274 e-value: 3.9E-5 score: 23.6 coord: 302..345 e-value: 6.1E-5 score: 23.0 coord: 192..234 e-value: 5.8E-5 score: 23.1
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 67..113
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 46..66
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 46..114
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 426..618
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 373..506
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 660..820 coord: 275..453
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 787..931
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF19	EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED	coord: 508..747
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 508..747 coord: 4..234
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF19	EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED	coord: 373..506
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF19	EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED	coord: 787..931 coord: 660..820 coord: 4..234
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 145..376
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF19	EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED	coord: 145..376
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF19	EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED	coord: 426..618 coord: 275..453

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh02G012440.1	CmaCh02G012440.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall