
CmaCh02G003670 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTACACTCCCATGGCGGAGCATTCGCTCTCTCTCGCTCCGATCCATTTCCAGGCGCCAAAGATGTCTTTCAGAACCCTCCATTGTCCTTCTTCGATCGCTGCTCGAATCCATATCCCCAGAGTTCTCGGACCATTCTCTCGCCCTTCCTTTCCCTTCACCCGCCATTCTTTCTCCACCAACACCTCCCCTTTATCCGTCGATGTATCGCCGCGGGTTCGCCGTCGGTTCGCGGTTCCTCGCGATAATCAGGAGCGGGAAGGCAGTAATGAGATTGACAATGAAGTACAGGAAAATGAGCAGTTATTGGGGATTGGAAGAGAAGAATTGGGGATCCAAGGGTTGTTGAGTCAGATGAAGGAGATTGTAACTTTTACTGGTCCGGCCATTGGATTGTGGATATGTGGACCGTTGATGAGTCTCATTGACACTGCGGTTATTGGCCAGGGGAGCGCTGTTGAGCTTGCTGCTTTGGGTATTCTCGTGAATTTCTCTTACTTTTGCTTTTTTTGTGATTCTTGTTAAAAGTAAGAATCTAAAGGGTTGGAAAATATAACTTGAATATTGCTAATGGATCGAGAAAACAGTAGGTTCTTGCTTCCAATCTACTGGATCGAATACTCGAATTCAACCAGCTATGAGCTACAGTTACTTAAGATGAGCTAATTACTTATTTTGAAATCTAAAAACGGTTCGAAATCACGACTCTCTATAATAGTATGATATTGTCCATTTTGAGCATAAGCTCTCGTGACTTTCCTTTGTGCTTTCCCAAAAAGTCTCATACCAATAGAGATGTATTCCTTTCTTCTGGTGTGGGACTCCCTCCCAACAATCCTCCCTTGAACAAAGTACACTGTAGAGTCTCCCCTGAGGTTTATGGTCCTCGAACAGCCTCCCCTTAATCGAGGCTCGACTCCTTCTTTGGAGTCTTCGAACAAAGTACATTCTTTGTTCGACACTTGAGTTATTTTTGACTGCACAGTCTAGGCTCACAACTTCTTTTTTCGACATTTGACGATTCTATTGACATAGCTAAGTTAAGGGCATGACTCTGATACCATGTTAGAAATCACGAACTTCCTATAATAGTATGATATTGTCCACTTTGAGTATAAGCTCTCATGACTTTGTTTTGGGCTTCTCCAAAATGCCTCATTCCAATGGAGATGCATTCATTACTTATAAACCCATGATCATTCCTTAAATTAGTCCGTGTGGACCCCTCCAAACAATTATCAACAAAAACGACGTTAGATTTCAATTTTCCATATTTGATTTACGGTCTTTAAACTGTGACTTCTATCTGGTGGCTACTGTGAGTATTAATTTTCTGAAATGTATCTGTTTGAAACTTTTGGCTGGCAGGCCCAGCGACAGTTTTATGTGATTATACGAGCTTTGTGTTCATGTTTCTTAGTATTGCAACTTCAAATATGGTAGCCACGGCCCTTGCCAAACAGGTTCAACCCATAATCGAAGGACTTCCTATTACAGATTATTGAATAATTGTGCTGCATTGCTTGACCAGTAAGATTATTGCAGGATAAAAACGAAGTGCAGCATCACATATCTACATTGCTATTTGTTGGGTTGGTATCTGGTTTTTTGATGCTCTTAGCTACCAAACTATTGGGTTCAGTGGCGCTAACTGGTACTAAACTTCTGCATTCTTGCTTAGTTAATGAAGGGCTCATTACATTCATCAGTTTTATGGACTATTCCTTTAATTTCTTCGCCACATAGATAGCTAGAACTTTGTCATCTGTTAAAAGTAGGAGGGATGCCATTAACAAGACGTTATTGTAAATTTTCAGCTTTTGTGGGGACAAAGAATGCAAACATCATACCTGCTGCAAACACGTATATGCAGGTTTGTCTTTTAGCATAGAAGTTTGCCTTATAAAGCTTCATATGTGATATGTTTCTTTTTTGGTTGTATGTGTCTCTTTTGCTTTTTGAACTCTACTTTTTTTGTTAGCTTCATCTAAAAGAGAAAAACTCGAAATTTCTATCACTTTTTTAAAATTTGGAGGAGGTATGGTAAATTTAATTATATCAACACTCAGAACAAAAAAAAAAAAAAATCTTTCTTAGACGACTTTTATTTTCTCTTCTAAATTTTCTTCAATTTACTAAGTGCTATATTATGTATGTTTATCACTAGCAATTTTAAAAATTACCAATAATGAAGGACTAAATTAAAGAAAAAATGTTAAAACGTAACGGGCTAAATCTTAACCTTTTTAACAATTGGGCCAAATTTGAAAAAACACCCAAAATTAGGTACAAAAACATAATTTTAGCCTATTAGAATGTATCACAATTATCATAACTATTGATGCATAAAGTTATGTCAAACTGAAGATCTTAATCTCTAAAATCATATGTTCTGTTGTACCTATAGATTGTGAACTAGTGATATGAATGTCTTTTCCTGCACAGATAGTGTATATAAAATCACTTTCTGGTGGCAAACAGAGCTTTCACCAAGAATGTGATCACTGCATACTGATACTTTGTCATGCTTTCTTGATTTCTTCTTGGTTCAATGACTTTAAGCTGAACAGATTCATTTTTTGTTGGTAGATTCGTGGTTTGGCATGGCCCGCAGTTCTTACTGGATGGGTTGCGCAGAGTGCAAGGTTCCTAATTTCTGTTACTAGATCCATGCTCCATCTACTTTATTTTATTTTTAAAATTTTAATTTTTATAGATTTGTTCTGTTCATGATGACATGCCAAAAATGAACAATATAAAATACGATTTGTGAAAACTTGCAGTACCAGTTGCTTGAAAATTCACCAGATTGATTAACTTCTAATTTCATATTTGTGTTAGTCTTGGCATGAAAGATTCCTGGGGACCGTTGAAGGCTTTGGCAGTTGCGAGTATTGTAAATGGCATAGGTGATATTGTTCTATGCATGTTTTTAGGATATGGTATAGCTGGTGCTGCATGGGCAACTATGGCATCACAGGTACCCTTCTTTCTGTTTATGTTAATGTGCCTCTTTTTCACTGCATTTGTATTTATTCACACCTAAACTGATCTCATTTTCTCCCCATATGAGCTTTAGGTTATTGCAGCTTATATGATGATAGAATCACTGAACAAGAAAGGATACAGTGGATATTCTCTGTCTATTCCCTCACCTACTGAATTCTTGTCAATACTTGCACTTGCTGCTCCTGTATTTATGACAATATTGTCAAAGGTTATATTTTGTAAAACCCCTTACATTCATCTGTTAACATTTGAGTAACATGTCTTGTGAGATCCACATCGGTTGGGGAGGAGAACGAAATGTTCTTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGACGTGTTTTAAAAGCCTTGAGGGGAAGCCCGAAAGGGAAAGTCCAAAGAGGACAATATCTACTAGCAGTGGGCTTGAGTCGTTACATGTCTAATATTATTATCTTTTAGGTGGGCTTTTATTCTCTCCTCATCTATTATGCTACGTCTATGGGCACACACACCATGGCTGCTCATCAGGTTAAGTTTCATGGTTATTTTCATTTTTATGTTTCCATGCAAGTCTGCCCTTTCTTTTCTATTGAAAGTCAATGGTCATGTCAAATTGATTGCTTGTCATGTACTTTTAGGTCATGAATCAAATATTCTACATGTGTAGCATTTTGGGTGAACCTCTTTCTCAAACTGCTCAGGCATTCATGCCTGGGTTGATAACCGGAGTGAATCGAAGTTTTGATAAGGTGAGAACTCTAATTTCTAATGATATGCTTATCAACTTTTTTACTTTTTGGAATTTTGTTTGCGTGATACTACAGTAGCCACACCAACTTCATTTAACTGAAATAGATTCCTTACATTGTTATGGATATTCATAAACCTTAGGTGGCGGGTAGTTTATGGCTGTAAACCTTAGTTTGTTTCATATCTAACCGGTGGCGTACGAGAGGGGGGAGCCTAAATACTGTGCCCCCATACTGGTGTGGACCGTTCTTGCCTTTGGTAATATCTGGTTGCTGGTTTGCTTCACATGGGTCCCCTTTTTTTCATACTTCTGTTATTCGATTTTTGCGGGCAAAAGATATTATGACCTTAGTGATGCTTGCGTTGAGTATAATAATAAATACCAATTTTGTATGAACTTATTGTGTAACCTTTTTATGTTGTGTAGGCTCGGATGCTGCTCAAGTCACTCTTGATCATAGGAGCTATCTTTGGTTTGGTCTTAGGGACTATTGGAACATCAGTTCCTTGGTTGTTCCCTAATCTCTTTACGCCCGATAAGAAGATTATTCAAGAGGTTTGTTCTTGATATCCATACCATGACATTTGGAATATGAACCATTATTGTTTCAATATCATTCTATTGTTTTCTTTTGACTCCCTGCATTTTCATCATGATAAATAATCCATGTCGGGTTGCGTTGTAAATGCGTAAGTGTTCTCCTAAAATAGCTTAATTTTTTTGATCATGCAGATGCATAAAGTGTTGATTCCATATTTCTTGGCGCTAGTCATAATGCCCGCAACCCTTAGCTTAGAAGGGTCATTATTGGTATGCTTGCTCACCTTACAGATTTTGCTTTAGTTTTTGTGCCTGAATTGGACGTTCACGGAGTGGGGGCAGGGCAGGAACAAGGATGGTTTTTCAGTTTAGAAATAATTGTTGTTTGGTTTTACCCCATTCAAAATTCCTCCCAAATTCTTTCTTGCGTGCAATTAGGTTCATCTTTGATTCAATGACAAATATAAATACTCTGGGTGGTTTAGTACATAGATGCATTTCCCCCACTAGCGGTTAGGGTAGAAAAGAAATGAAGATGTGAGATCCCACATCGGTTAGAGAGGAGAATAAAACATTCTTTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGAAGCATTTTAAAGCCTTGAGGAGAACCCCGAAAGTGAAAACCTAAAGAGCACAATATCTGCTAGCGGTAGGCTTGGGCCGTTATAAATGGTATCAAAGGCA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MAEHSLSLAPIHFQAPKMSFRTLHCPSSIAARIHIPRVLGPFSRPSFPFTRHSFSTNTSPLSVDVSPRVRRRFAVPRDNQEREGSNEIDNEVQENEQLLGIGREELGIQGLLSQMKEIVTFTGPAIGLWICGPLMSLIDTAVIGQGSAVELAALGPATVLCDYTSFVFMFLSIATSNMVATALAKQDKNEVQHHISTLLFVGLVSGFLMLLATKLLGSVALTAFVGTKNANIIPAANTYMQIRGLAWPAVLTGWVAQSASLGMKDSWGPLKALAVASIVNGIGDIVLCMFLGYGIAGAAWATMASQVIAAYMMIESLNKKGYSGYSLSIPSPTEFLSILALAAPVMNQIFYMCSILGEPLSQTAQAFMPGLITGVNRRTIGTSVPWLFPNLFTPDKKIIQEMHKVLIPYFLALVIMPATLSLEGSLLAGRDLKFISLSMCGCFSLGAILLLFPKMLLKPFHGSSSATAQIHNHQILRPLPRPSFPFTHRPLSNSAVLFRSLSSPSYVNVVPSRIRRRFAVPYDGHEREVSILEIESEVDDDLQPNEQSLGNQGLLSQMKEIVTFTGPAIGLWICGPLMSLIDTAVIGQGSAVELAALGPATVLCDYTSYVFMFLSIATSNMVATAIAKQDKNEVQHHISILLFVGLTSGFLMLVATKLFGSVALTAFAGPKNADVIPAANRYIQIRGLAWPAVLTGWVAQSASLGMKDSWGPLKALAVASIVDGIGHLVLCTFLGYGIVGAAWSTMASQVIAAYMMVGALNKKGYSAYSPSVPSTGEFLSILGIAAPIFLTMMSKVVFYSLLIYYATSMGTHTMAAHQARMLLKSLLIIGAIFGLVLGIIGTSVPRFFPNLFTPEEKIIQEMHRVLIPYFLALVITPPTLCLEGTLLAGRDLKFISLSMCGCLSLGALLLLVISSRGYGLVGCWYALVGFQWARFLSALRRVLSPDGVLYSSDLSHYRLVKQKAA Homology
BLAST of CmaCh02G003670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4G3 (Protein DETOXIFICATION 46, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX46 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 3.9e-163 Identity = 303/480 (63.12%), Postives = 367/480 (76.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q945F0 (Protein DETOXIFICATION 47, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX47 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 2.8e-145 Identity = 281/524 (53.63%), Postives = 365/524 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84K71 (Protein DETOXIFICATION 44, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX44 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 1.3e-12 Identity = 60/213 (28.17%), Postives = 107/213 (50.23%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P28303 (DNA damage-inducible protein F OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=dinF PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 5.9e-10 Identity = 73/243 (30.04%), Postives = 116/243 (47.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SYD6 (Protein DETOXIFICATION 42 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX42 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 6.8e-06 Identity = 103/461 (22.34%), Postives = 169/461 (36.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. TAIR 10
Match: AT2G21340.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 2.8e-164 Identity = 303/480 (63.12%), Postives = 367/480 (76.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. TAIR 10
Match: AT2G21340.2 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 568.2 bits (1463), Expect = 1.3e-161 Identity = 301/480 (62.71%), Postives = 365/480 (76.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. TAIR 10
Match: AT4G39030.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 2.0e-146 Identity = 281/524 (53.63%), Postives = 365/524 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. TAIR 10
Match: AT2G38330.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 9.1e-14 Identity = 60/213 (28.17%), Postives = 107/213 (50.23%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh02G003670 vs. TAIR 10
Match: AT1G51340.2 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 4.8e-07 Identity = 103/461 (22.34%), Postives = 169/461 (36.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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