CmaCh01G014250 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh01G014250
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr01: 10035036 .. 10042686 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G014250
SyntenyCmaCh01G014250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCACAGGTTCTTTACAAAACCAGATGAGCCACTTCTTGATCTACAAGAGGACTTGACTGGGACTGTTATGGGGACGGTGCTGAGAGGAATTCTTCCCAGGAGTTACAGGTAAAGCAGTCATTTTCCTTTCTCCTTCCCTCTAAAATACTTGTTTTGATTTTGATTTTTGTCCCCACCACACACGGGTACGAATATTAATTTCAATTTATTATAGAGATTTATTTTCGTTTTAAAGTTATAAATTTGTGTGCTTATTTGGACAACATGATGCATGAATTTAGGTAAGGTTAGAGCCACATATTTAGTTTATAGAATTTTGATTTGTATCTATATAGTTTCTTAAATGTTAATGTATTAAAGAATGATGATTTGGACAACATGATGCATCAAAATAGCCTAGCTAGATAATGTTAGGACGGTAGACCAAAAAATTGGGTCAAAATCTGCTATGCCTAACCCTTCCATTGATCTTTTTAGAAATTTGTGAAGATGGCCGTAATAATAAATAAATCAGAATTTCATACCTGAAATCAGAATTTGAATGAACTTTTTTATTTTAGATTTTAAAATTTATTGGATAAAATTAAAGCAAAAACTGGAATAGCTTAGATGGTCAGACATTCAAACTCTCCTTTTGACGTTTGCTAAATATTTTTTTGCTAATTTTTTTTATCAATATTATCAATTTGTTTATTATTTTGTTTTCAAAGAAAGCAAGTGGTACTATTTCATAGCATAATCGTATATCTATATGCTGCAATGTTTCATAACATAGGTTCTATCAAAATTGAAAGTGCCTAAAAATGACATGAAAGAGAACCGTCATAAGCTGTCCATCACATGGAATAGAGATAACACAAAGCCCCTCCTTCCTAAGTTGTCCATCTCCTGAATAGAGATAACACAAAGCCCCTCCTTCGTCCTAAACTGTCCATCATCTGAAATAGTGATAACACAAAGCCCCTCCTTCGTCCTAAGCTATCCATCACCTGGAATAGAGATAACACAAAGCGCCTCTTTCTGTGCCCTCTTAATGTCATCAAATTGTTTCTCATTTTGTTTACAAAATAAAACCATGGAATAACTCATGGAAAGTGTCTAAAAATGACATGAATCATAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGTTGAAATACATTAAAGCACCAAAAAGAGGTTGGAATAGTTTAGTTCATTAGAGCGTGTGGACCTTAACCACAAGGTCCAAGGTTCAACCCCTCTTTCTAGCGAGTCCTTCTTAATTGTCATCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACCATGGAATAACTCATTGAGAGTGTCTGAAAATGACATGAAAGAAAACAGTCCTAAACTATCCATCACCTGGAATAACTATAGTTTAAAGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAATTGATAACACAAAGTTAAGTGTTAACACAAAGTTAAGTGTCGTATTAAGCATTAAAAAAGTGTTGGAAAAGCTCAGTTGGTTAGAGTATGTGACCCTTAATCACAAGGTCGGAGGTTCAACCCCTCCTAGCGTGCCTTCTTAACATCATCAAATTCAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGCTAAAATACATTTAGCACCAAAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAGAGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTCGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTAGCGAGCCCTCTTAATTTGGTGTCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACCATGGAATAACTCACTGAATGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGTTGAAATACATTAAATACCACAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTTGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTAGCGAGCCCTCTTAATTTGGTGTCAAATTGTTTTTCATTTTGTTAACCATGGAATAACTCACTGAAGGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGTTGAAATACATTAAATACTAAAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTCGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTAGCGAGCCCTCTTAATTTGGTGTCAAATTGTTTTTAATTTTGTTAACCATGGAATAACTCACTGAAGGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGTTGAAATACATTAAATACTAAAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTCGGAGATTCAACCCCTCCTTTTAGCGTGCCTTCTTATTAACGTCATCAAATTGTTACTCATTTTGTGAATCACAAATGATAACAAAAAGTTAAATGCCGTATTAAGCACCAAAAAGAGGATGGAATAGCTCAGTTAGTTAGAGCGTGTGACCTTAACCACAAGGTTGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTAGTGAGCATTCTTAATTGGTGTCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACCATGGAATACCTCGTTGAAAGTGTCTTTTAAAGTGCCTAAATATGACATGAATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGCTAAAATACATTAAGTACCAAAAAGAAATTGGAATAGATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGCTAAAATACATTAAGTACCAAAAAGAAATTGGAATAGATCAGTTGGTTAGAGTGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTTGGAGTGGTCGGAGGGGCGTCTATTATTGAATTCACCCGCCCCGATAGTACCCCATTTTTGGAACGTCCAGTGCCAAAGTCACTGAATGGGTAAGTAGCCAATCCCTAAAACGGACTATGTAATGTACTTTCTGGGTTACGGGTGGGCATTTTCCCAGAGGTTTCTATTGTATCAATCTACCCTTGTTTCATTCCTGTTGAAGCATATACTCGGGGGGTGCAGGGCGGACGATTTCAAAGCGGACTCCCATTCAAGAGAAGATCGCCAAGATTTCGTGATCCGCTGCCGAACTTATTCCTTCCAATTCAACGGGCATTCTCTTCTAGCGAGCCTTCTTAATTGGTGTCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACCATGGAATAACTCATTGAAAGTGTCTTTTAAAGTGCCTAAATATGACATGAATCACAACTTGAGATAACACAAAGTTAAGTGCTAAAATACATTAAGTACCAAAAAGAAATTGGAATAGATCATTGTGGCGGTTAACCACAAGGTTGGAGGTTTAACTCCTCCTAGCGTGCCTTCTTATTAATGTCATCAAATTGTTACTCATTTTGTGAATCACAAATCATAACAAAGAGTTAAGTGCCGTATTAAGCACCAAAAAGAGGATGGAATGAGATAACACAAAGTTAAGTGTTGAAATACATTAAGTACCAAAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGATTAGAGCATGTGGCTATCAACCACAAGGTCGGAGGTTCAACCTCTACTAGCTAGCAACCCTTCTTAACATCATCAAACACAAAGTTAAGTGCTAAAATACATTTAGAACCAAAAATAGGTTGGAATAGCTCAGTTAGTTAGAGCGTGGCTGTTAATCACAAGGTCAAAGGTTCAAACCCTCCTTCTAGTGAGCCATCTTAATTAGTGTCAAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACCATGGAATAACTCATTGAAAGTGTTCGAAAATGACCACAAGGTCGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTTGGGTGCCTTCTTAATGTCATCAAATTGTTACTCATTTTGTTAAACCAAAGAATAACTTATTGAAAGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAAATGATAACCCAAAGTTAAGTGTCGTATTAAGCACTAAAAAGAGGCTAGACCGTGAAGTTTGCAACCCCCCTCGGAATAACTCAGTTAGTTAGAGCATGTGGCTGTTAACCACAAGGTAAGAAGTTCACGATCCCTCAGCATAGCGCAGTTAGTTAGAGCGTGTGACTGTTAACCACAAGGTTAGAAGTTCCCAACCCCTCGGAATAGTTAGTACCACAAGGTCGGAAGTTCACAACCCCTCTGAGCCCTCTTAATTGTCATCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCCTAAAAATGATGCTGGAATAACTTCGATTTAAAGTGCCTAAAAATGACATGAATCACAACTTGAGATAACATAAAGTTAAGTGCTGAAATTCATTAAACACCTAAAAGGGGTTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAACATGTGGACCTTACCACAAGGTCAGAGGTTCAACCTCTCCTTCTAGCACGCCCTCTTATTTTCTTTCATTTTGTTTTGTACCTAATAACAAAAGGTTAAGTACTGAAATACATTATCACAAGGTCAACGTGAGATAACACAAAGTTAATGCTGAAATACATTATGCACCAAAAGAGGCTGGAATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGTGTGGCTGTTAACCACAAGGTCGGAGGTTCAACCCCTCCTTCTAGCGTCCTTTTTAACATTTTGTAAACCATAACTCATTGAATGTGCCTAAGAATGACATGAACGAAAACAGTCCTAAACTATCCATCACCTGGAATAAACTTCGGTTTGAGGTGCCTAAAGGTGACATGAAAACAGTCCTAAACTATCCATCACCTAAGGTGACATGAAAACAGTCCTAAACTATCCATCACCTGGAATAAACTTCGGTTTGAGGTGCCTAAAGGTGACATGAATTCTGTTAAAACAGACCTAAAAGTTATAGCTTGTGGTTGTTAATGTGTTGTTAATGTCATCAAATTCCGTTTCATTTTGTTTACCAAATGAAACCATGTAATAACTAACTCATTGAAAGCGCCTAAAAATGACATGAAAGAAAACCGTCTTTAGGCTGACATGAATCACAAACTTATACCTCCTAGAATGACATGAAAGAAAACCGTCTTTAGGCTCACATGAATCACAAACTTGTACCTCCT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mRNA sequence

ATGCACAGGTTCTTTACAAAACCAGATGAGCCACTTCTTGATCTACAAGAGGACTTGACTGGGACTGTTATGGGGACGGTGCTGAGAGGAATTCTTCCCAGGAGTTACAGGATTCATCCTCTCCGTTCTTTGCGATTCTCTCAAACACCAAGCAGCAGAGGAATGACCAACGACTTCGACGAGAGCCTAGCCAATAGATTCAGTTCTACAAATTTATTGATTGAGGAAGCAAGAGAACAGAGAATACAAACCGATGACTCGATCCTAGCTTTCATAGAAGCTGGAATCGTTGAAGCGAGAGTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCACAGGTTCTTTACAAAACCAGATGAGCCACTTCTTGATCTACAAGAGGACTTGACTGGGACTGTTATGGGGACGGTGCTGAGAGGAATTCTTCCCAGGAGTTACAGGATTCATCCTCTCCGTTCTTTGCGATTCTCTCAAACACCAAGCAGCAGAGGAATGACCAACGACTTCGACGAGAGCCTAGCCAATAGATTCAGTTCTACAAATTTATTGATTGAGGAAGCAAGAGAACAGAGAATACAAACCGATGACTCGATCCTAGCTTTCATAGAAGCTGGAATCGTTGAAGCGAGAGTTTAG

Protein sequence

MHRFFTKPDEPLLDLQEDLTGTVMGTVLRGILPRSYRIHPLRSLRFSQTPSSRGMTNDFDESLANRFSSTNLLIEEAREQRIQTDDSILAFIEAGIVEARV
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh01G014250 vs. NCBI nr
Match: XP_023524780.1 (uncharacterized protein LOC111788614 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 182.6 bits (462), Expect = 1.7e-42
Identity = 95/105 (90.48%), Postives = 98/105 (93.33%), Query Frame = 0 

Query: 1   MHRFFTKPDEPLLDLQEDLTGTVMGTVLRGILPRSYRIHPLRSLRFSQTPSSRGMTNDFD 60
           MHRFFTKPDEPLLDLQEDLTGTVMGTVLRGILPRSYRIHPLRSLRFSQTPSSRG+TNDFD
Sbjct: 1   MHRFFTKPDEPLLDLQEDLTGTVMGTVLRGILPRSYRIHPLRSLRFSQTPSSRGITNDFD 60

Query: 61  ESLANRFSSTNLLIEEAREQRIQTDDSILAFI----EAGIVEARV 102
           + LANRFSST LLIEEAREQRIQTD SILAFI    EAGIV+ARV
Sbjct: 61  KRLANRFSSTTLLIEEAREQRIQTDGSILAFIEAAEEAGIVKARV 105

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh01G014250 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G014250 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G014250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023524780.11.7e-4290.48uncharacterized protein LOC111788614 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
BLAST of CmaCh01G014250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh01G014250.1CmaCh01G014250.1mRNA