CmUC11G204010 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGCTAGGCTTTTGAAGCAACCCCCTAATTCCAACTCACTGGCCAAACGCCCCCCCCAAAATTTGGAAGGGCATTATCGTCCAAAATATTCATTAGGTTTAAACTCCACATGCTGTGTGCAAAAATACCATAGCCGCCGTAAACAAGCTGCATATGCTGTACGCTAAAATCTGGAAGGCGAATCTTCTCATTCCCTTTCATAGCCGCCGTAAAACATTTTCATCCTCCAATCACTTCCTCTCTTCAACTTTCCTCCGCCTCCTGCACAACCAACTCCACAACACTCAAACTGCTCCCATGGCGTTGAAACACCCCAAAGACGAGGCCTACCTCAGTACCACCATTCCCAAACGCATTCAACTTTTTCAGTCAATACAAGCACAGCTGCTCGCCGATCGTTGTTCTCTTCCCTCTCATCCAATCAAGTTAGTTTGTAATTGCAATATGTGGAAATGTCTTGACTATGCTTGGATTTATCAAATCCGAATCCTATATTTGATTCTTTTTTTAGGATCACCTTGCCGGATGGGACGGTGAAGGAGGGTCAGAAATGGAAAACGGCACCGTTAGACGTGGCAAAAGAAATCTCCAAGAGTTTAGCTGCAAACGCTTTGATCGCTCAAGTTGATGGAGTTTTATGGGACATGAGCAGGCCGCTAGAGAACGATTGTGAGCTTAAACTGTTCACCTTCGACAGTGACGAAGGGCGTGATACTTTCTGGCATTCAAGCGCTCATATACTCGGACAGGTTGATAGTCCAATCTATACTCATGCATTCAATCTGAACTCATTAACTACAATCGTAACACTGCTTTATTTGTTTTCTTTTTCCTGCCTTTAGTCGCTTGAGATGGAGTATGGTTGCAAGCTCTGCATTGGACCCTGTACCACTAGAGGAGAGGTAAGTACGTTTTTTTCTCTCGTGACAATCAACATTTCATTAGCCAAAGAATTAAGCAATAGAAATGGATGAAAGAAGCCAAACCTGAGCATATATCTCAAGTCGTCAATGCATATCCACTTGACCAAGAGGTCAGTGGATGCTATTGAACAATACAAAAGAATAGAAATGGAAGAATTATATTCTCCCATGGAAAAAAGGGGTCACAAGAAGGAATTATACAATTGGCTTTAAATATCAAATTTAGTAACTTCAGAAGTATTTTAGACAGAGGCCTGCAACTAAAAGTGAAGGAAACAAGAGTATCTAGTCCTTTTACTCCAGACTATGAACACCCAATTGGATATGTCGAGTCGGCTACAATTCTTGAACCGACCAAAAATATGAGCTCTTAAACTTTTGTTTTTCATGGAAAGCAGAGAAATTTTCTTTTAAATTATATCAAGAAAGTTGACCTAGTTGTTTGCCAGGAACCAGCAAAATAATCTCGCTTCTTTAAGAATTTTATAAAATTTTGAATATCATGGGCCAAAACAAGGGTGAAGGACCTTGACCTTCTCCTCAGACGAAAATCCACATCTTTGGAAGAAAAGTTGTAGAACTCTTGAGGGACCTCACAATCAATCTTATTCTCTTTGATTTAGATGAACCCTCGTTTGTTGTGTTTCTAGCTAGTAGTGATGTAGTGTAACCGTTGAAATTTGAACTGAGCCATATATCTTACAAGAATCATGTCTTGTACCATCCCCCTCTTTAAGGATCAACCATCCACAAATATAACTTAGTCTAGGGAAGTCTAGCACTACGCAGCTGACCACATTTAATGAACCAACCAAAATATGCCACCCTATATTTACTTGTAGCAACTCTATACCTCAGGCTTTTAGTTTCTAAAGGATAAAACAGAGCCACTTAGAAATTATGGCCAAATTCCTCAATCAAACATTGCCAATATCAAGATTTCCATTTTATTTCTGAAGAGTAATGAAAGAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGTACTGTCTTGATCATTATCATTATTCAATTTCTTAAAAGAAAAGAAATGTGCATGAAATAAGAGGCTTGCTGGGAGATGGCAGGGCACCTTCTTCATCCCCCACCCTCCTTCACCATAGATAGACAATTTTTTTCCTTAGAGATTTCGCATGGAGTTCAAACCGGAGCTTCTAAAGACAAATCCTTTACCCTCTCTCTTAATAAGGAATCCCTCTCTTGGTTACGCAAAACTTTCTCTTCTTTGATTGAAGCTTCTTTGAACCAAAAGTTCTTCGACAAGTCTAGATTGGTGGATTATGATCTTTGGTTGGAAAAAATCACTAACTGGAAAGGACATTTTGTAGAGATCACCAAGCTTGGAGTTAATGGTAGGTTAAACAAATTTATCTTACCCGGTGACAACAACAAAGATGGTTGGAAAGGCTTCCTTCTCTCTTCTTAATGTACCAACCAACCAATCCATCAACAAGCATAAACTCGACTTTGTATCCTCATCTATCTCTTACAAAATGCTTTCCATAATCATAAGATAACGAGTATTCAACCCCAAATCCCCCATTCACAACAACCCTTTTCTACTCCTTGCCAATGGAGTTATCTTGCAGCTTTCTACCTATACACTTCCATCATCATCATTCGACAAAACTTAGATGATTATTGGTTTGAAATTCTTTGAACTTTACAAAGGGAAGTGTCTGACTTCGGCTCTATAAGCCCATTACAACCCAACAAGGCCATCTTGGTGGTCCAAAATAGGGAACGTAGTTTAATCCTTAGCAATATCTGTGATTGGTACAAGGTTGGATCTTTCATGGTGAAATTTGAGCCTTGGAGCATTGAGGCTTTCTAAAGAAATCAAATGATACCCTCTTATGGAGGATGGATGAAAGTTAGTAATCTCCCCATTGATAGATGGTCCCTTGAATCCTTCAAATTTATTGAATCCTTCTTTGTCCCTCTAATCCATTTCAACCTCCAATTTCAGATCCTTTTCTTACTTCTCCTCCCACCATAAGCCCATCCTCCCCCCTCCAAATCCCTCTCCAAGCTCCACCAACCACCTTCTCCACTCCCCTCTGAAAATCCATCTTCCCTTTACCCCTCAAACATCATCTCCACCCATCTCAACAGCCCTTATCTCTCCTCCTCCACCTGACCTTCAACGAGCTCCACCAATATCATTCCTCCCTCTTCTACCAACCTAATATCTTTCGCCCTTATATTAAGCATTCCACTGCTATCATTGCTTTGCCATCAAATGCTATCATTGCTTTGCCATCAAATGCCAACACTGAAGCATACCTTTTTAGCCCCATTCTCTCATCACTGGTTTCTCCCCATCACATGGAAGATGAATGGTACGATTTTTTCCCTCCATCTTTTGCCGTTTCTTTCAACCCTACTATGCATTTGGTGGCTTTGGCTCCTTGGTTTATAGATCTTGGTCTTTCCATTAAGGCAATCCCTACTAAAAACCATCCCCACAGGTTATCAACAAAGAAAAAAGAGGCTTGAGAGAATTACGGAATCTAGGAAGCTTCATATCAAATGTCAAAAAAGCTCAAGCTCTACATACAGAGCAGTCTTTATCAACTTGACATCAGATCTTTGTGACTTCGCTTTGTTTTGGGATGTAGGTTGAGTTCATGATTGGTTCTCTTACACTTATAAATGCTGTTGTGTTTTTGGGTCCAATCGGTTCTTTATGTTCATCATCAATTATTGATCGGCTTGTACTTCTTCATCTCTCCTTCCCTTGTTATCTTTTGGTTGTATCTTCATTATTTGGGTTCTGCCATTGGTTGTATTTGGGCGTTTCTCCCTTTTGGGTTTATCCCTTCTGTTCTCCTTGGATATTTCATTCATCAATGAACTTATTGAAAAAGGGAGAGAGAGAAAGGAATACTGTCTTCTACTTCACTATATAGTTTACAGCCCTTGCAATCTGCCCCCTTCCATCAAAGTTGTCTACAGAATTTGTCAATGGAACCTGCTAGCATTCCCAGAATTCCATAAAGGACATTAGAAATGGTGGTAGATGTCCAAGAGCAATAACTAAGAGGGCAAGTCACCACCATTGGATGAGTTGGTTCTCGTTCATTTTTTTAAGTTTGCCTTGAATCTTTTCTACTTCTAGTTTTGAGAAATTACCTTCCTCCAGGTTTTCCCTAAAGGCTATACCTTTCTCGACCTTTGGCTAAGATGAAGTGTAGGTTCCCCGAAGGCTAGATCCAAGTATCTCAGCAGCCCAGGAGCTTTAGAATTAGAAGAAATCTGTACTGTATTGTCAATTCCCTCTTCACAAGAAGTAAGTTACACTGCTGTAATTTGATGCGATGAATGTGGCAGTTAGGATAAACGATTTCTTGCACTGCCTATGTTGACTTTTGTAAGGGTGATTTGCCTTAGCTTTTATGCTTGTAGTGAAGTTTCCTTACAGATTAATTGGATTTCGATGACAGGGGTTCTATTATGATGCATTTTATGATGATTTAGGCTTGAATGATGACCACTTCAAGCAAATTGAGTCTGGTGCCCTGAAAGCTGTATCGGTATTGTTCTTTCTCTATTCTCTTGTCAGGAATCTGAACCACATATTTGTATAATATAGTTAAATTTTGGTTCTTCTATATGTTTTTTCCTTGCGTATTTCCATGTAGATGATGGATGTTAACAGTAAGATGTTAGGAAGTGGAATGGTGTTGCTTGTAACCTCATTTTCTTTTTCATTTGTGAAAGGCCTAATGATTAAGGTTTTAGGACCAATTTTTTAATCCTGTGATGCTAATGTTTGCACATACTAGTTTATAATCATGTGTGATGTAAATTGTATTTTTTCTTTATTTTACTTCAAATCACTAGTAGGGAGACACCTGTGATACATGTGTGTGAACATGGCTTAAAATGTTGATGACATAATTTTTATGATAAAATTTAGGGAAAAATTACCTTCATGGTCTCTAGGATTTGAGTCAAGTTTCCATTTGGTTCCTAGGTTTCGAAATGTTGCAAATCTAGTCCAAAAGTTTTGTGTTTTTAATTTAGTCCATAGGTTTCAAAATGTTACAAATTTA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ATGCTGTACGCTAAAATCTGGAAGGCGAATCTTCTCATTCCCTTTCATAGCCGCCGTAAAACATTTTCATCCTCCAATCACTTCCTCTCTTCAACTTTCCTCCGCCTCCTGCACAACCAACTCCACAACACTCAAACTGCTCCCATGGCGTTGAAACACCCCAAAGACGAGGCCTACCTCAGTACCACCATTCCCAAACGCATTCAACTTTTTCAGTCAATACAAGCACAGCTGCTCGCCGATCGTTGTTCTCTTCCCTCTCATCCAATCAAGATCACCTTGCCGGATGGGACGGTGAAGGAGGGTCAGAAATGGAAAACGGCACCGTTAGACGTGGCAAAAGAAATCTCCAAGAGTTTAGCTGCAAACGCTTTGATCGCTCAAGTTGATGGAGTTTTATGGGACATGAGCAGGCCGCTAGAGAACGATTGTGAGCTTAAACTGTTCACCTTCGACAGTGACGAAGGGCGTGATACTTTCTGGCATTCAAGCGCTCATATACTCGGACAGTCGCTTGAGATGGAGTATGGTTGCAAGCTCTGCATTGGACCCTGTACCACTAGAGGAGAGGGGTTCTATTATGATGCATTTTATGATGATTTAGGCTTGAATGATGACCACTTCAAGCAAATTGAGTCTGGTGCCCTGAAAGCTGTATCGGAGAAGCAACCTTTTGAGCGCATTGAAGTTACAAGACAACAGGCTCTTGAAATGTTTTCCGACAACAAATTCAAGGTTGAAATCATCAATGACTTGCCAGAAGATAAGACTATCACTGTATACAGATGTGGTCCCTTGGTTGACTTATGTCGTGGTCCCCACATACCAAATACATCATTTGTCAAAGCATTTGCGTGTCTTAAGGCATCATCGGCCTACTGGAGGGGAAATAAAGATCGTGAAAGCCTACAAAGAGTTTATGGGATATCTTATCCTGATCAAAAGCGTTTAAAGGAATACATTCATTTGCTTGAGGAGGCAAAGAAGTATGATCACAGATTGTTGGGTACAAAACAGGAACTTTTCTTTTGTCATCCACTCAGCCCAGGAAGCTGGTTCTTCCTCCCTCATGGGGCTCGGATCTACAATAAACTGATGGACTTCATGAGAGCTCAATATAGGGATCGCGGTTATGAGGAGGTTTTGTCACCAAATATGTACAATATGCAACTATGGGAAACTTCTGGTCATGCTGCAAATTACAAGGAGAATATGTTTGTATTTGAGATAGAAAAGCAGGAATTTGGATTGAAACCAATGAATTGTCCTGGTCACTGTTTGATGTTCCAGCATAGAGTTCGTTCATATAGAGAACTTCCTCTTCGTTTGGCTGATTTTGGAGTTTTGCATCGCAATGAGGCTAGTGGGGCATTGACTGGATTGACTCGTGTGAGAAGATTTCAACAGGATGACGCTCACATCTTTTGCAGGGAGTCCCAGATAAAAGATGAAGTAAGGGCCGTCTTAGAATTCATCAAATATGCTTATAACATTTTTGGGTTCACATTTGAGCTCAAGCTATCAACGAGGCCAGAGAAATACCTGGGAGATTTGGAAACATGGGAGAAAGCTGAAGCAGCACTTACAGAAGCACTGGATGAATTTGGGAAGCCGTGGCAGATCGATGAAGGAGATGGTGCATTTTATGGACCGAAGATAGATATTAGTGTATCTGATGCATTGAAAAGGAAATTCCAGTGTGCAACCCTCCAGCTGGACTTCCAACTTCCGGCACGTTTTGAATTGTATTACTCTGCAGAGGACGAGGCCAAGAGGGAACGTCCTGTTATGATTCACAGAGCTATCTTAGGTTCCGTTGAGCGGATGTTTGCTATCTTGTTGGAGCACTACAAGGGGAAGTGGCCTTTTTGGCTTAGTCCTCGTCAAGCAATTGTTTGCCCTGTATCAGAGAAATCCCAGTCCTATGCACTGAAGGTGCGTGATCTAATTCATCATGCTGGTTATTTTGTTGACGTGGATGTAACAGACAGAAAGATTCAGAAGAAAGTACGAGAAGCCCAGTTGGCACAATATAACTACATACTGGTTGTTGGTGAGGAGGAGGCCAACACTGGACAGGTGAGTGTACGGGTGAGAGATAAGGGTGATCATTCAGTGATGAGTATTGAGAGCTTGCTCGACCACTTCAAGGAAGAAGTTGCAGCTTTTCATTAA MLYAKIWKANLLIPFHSRRKTFSSSNHFLSSTFLRLLHNQLHNTQTAPMALKHPKDEAYLSTTIPKRIQLFQSIQAQLLADRCSLPSHPIKITLPDGTVKEGQKWKTAPLDVAKEISKSLAANALIAQVDGVLWDMSRPLENDCELKLFTFDSDEGRDTFWHSSAHILGQSLEMEYGCKLCIGPCTTRGEGFYYDAFYDDLGLNDDHFKQIESGALKAVSEKQPFERIEVTRQQALEMFSDNKFKVEIINDLPEDKTITVYRCGPLVDLCRGPHIPNTSFVKAFACLKASSAYWRGNKDRESLQRVYGISYPDQKRLKEYIHLLEEAKKYDHRLLGTKQELFFCHPLSPGSWFFLPHGARIYNKLMDFMRAQYRDRGYEEVLSPNMYNMQLWETSGHAANYKENMFVFEIEKQEFGLKPMNCPGHCLMFQHRVRSYRELPLRLADFGVLHRNEASGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCRESQIKDEVRAVLEFIKYAYNIFGFTFELKLSTRPEKYLGDLETWEKAEAALTEALDEFGKPWQIDEGDGAFYGPKIDISVSDALKRKFQCATLQLDFQLPARFELYYSAEDEAKRERPVMIHRAILGSVERMFAILLEHYKGKWPFWLSPRQAIVCPVSEKSQSYALKVRDLIHHAGYFVDVDVTDRKIQKKVREAQLAQYNYILVVGEEEANTGQVSVRVRDKGDHSVMSIESLLDHFKEEVAAFH Homology
BLAST of CmUC11G204010 vs. NCBI nr
Match: XP_038891995.1 (threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1450.3 bits (3753), Expect = 0.0e+00 Identity = 706/724 (97.51%), Postives = 711/724 (98.20%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. NCBI nr
Match: XP_004142299.1 (threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1 [Cucumis sativus] >KAE8648246.1 hypothetical protein Csa_018476 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1439.1 bits (3724), Expect = 0.0e+00 Identity = 700/724 (96.69%), Postives = 708/724 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. NCBI nr
Match: XP_008460557.1 (PREDICTED: threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1437.6 bits (3720), Expect = 0.0e+00 Identity = 695/724 (95.99%), Postives = 706/724 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. NCBI nr
Match: KAG6601661.1 (Threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1420.6 bits (3676), Expect = 0.0e+00 Identity = 691/724 (95.44%), Postives = 707/724 (97.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. NCBI nr
Match: XP_022933059.1 (threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1420.2 bits (3675), Expect = 0.0e+00 Identity = 691/724 (95.44%), Postives = 706/724 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04630 (Threonine--tRNA ligase, mitochondrial 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THRRS PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 1107.4 bits (2863), Expect = 0.0e+00 Identity = 528/694 (76.08%), Postives = 595/694 (85.73%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54J66 (Probable threonine--tRNA ligase 1, cytoplasmic OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=thrS1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 798.1 bits (2060), Expect = 8.2e-230 Identity = 380/662 (57.40%), Postives = 493/662 (74.47%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XHY5 (Threonine--tRNA ligase 1, cytoplasmic OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Tars1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 774.6 bits (1999), Expect = 9.7e-223 Identity = 361/659 (54.78%), Postives = 476/659 (72.23%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52709 (Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=tars-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 773.5 bits (1996), Expect = 2.1e-222 Identity = 371/668 (55.54%), Postives = 485/668 (72.60%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D0R2 (Threonine--tRNA ligase 1, cytoplasmic OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tars1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 773.5 bits (1996), Expect = 2.1e-222 Identity = 361/659 (54.78%), Postives = 474/659 (71.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDY8 (Threonyl-tRNA synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499347 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1437.6 bits (3720), Expect = 0.0e+00 Identity = 695/724 (95.99%), Postives = 706/724 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYP1 (Threonyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439766 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1420.2 bits (3675), Expect = 0.0e+00 Identity = 691/724 (95.44%), Postives = 706/724 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7J6 (Threonyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1417.5 bits (3668), Expect = 0.0e+00 Identity = 691/724 (95.44%), Postives = 703/724 (97.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DR46 (Threonyl-tRNA synthetase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023566 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1390.2 bits (3597), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/724 (93.65%), Postives = 697/724 (96.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F237 (Threonyl-tRNA synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439084 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1334.3 bits (3452), Expect = 0.0e+00 Identity = 646/717 (90.10%), Postives = 681/717 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. TAIR 10
Match: AT5G26830.1 (Threonyl-tRNA synthetase ) HSP 1 Score: 1107.4 bits (2863), Expect = 0.0e+00 Identity = 528/694 (76.08%), Postives = 595/694 (85.73%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. TAIR 10
Match: AT1G17960.1 (Threonyl-tRNA synthetase ) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 1.9e-149 Identity = 299/677 (44.17%), Postives = 367/677 (54.21%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. TAIR 10
Match: AT2G04842.1 (threonyl-tRNA synthetase, putative / threonine--tRNA ligase, putative ) HSP 1 Score: 433.3 bits (1113), Expect = 3.7e-121 Identity = 229/562 (40.75%), Postives = 351/562 (62.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G204010 vs. TAIR 10
Match: AT1G18130.1 (Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein ) HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 7.7e-50 Identity = 101/152 (66.45%), Postives = 120/152 (78.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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