
CmUC10G189980 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGCTGAAGTATCCAATCTCACTTTTGCCAGAAACAACAGTGACCACTATTAATAAATTGGTTGGCCCAGCGCTAAACGTTCATTGTAGATCAAAAGACGATGACTTGGGAGTCCATATCATAGAGTTTGAACGTAGCTACTCATTTACCTTTAGACCTCATGTTTGGGGCACAACGCAATTTTCTTGTAGCTTTCAATGGGTGCAAGGAGAGATCCACAACTTCTCAATCTACAAATTTCATAGATGCAAATCATTGCACTGACTGCAGGTGGAAAAATTATCGAGATGGCCCTTGCTTGATGCACCCAAAAGACATTGGAACTTATAATATGTGCTTTCCTTGGAACTAGAAAAAATATTAAAAAGAAACGAAATATTATTGCATGACTTAGTTGAAGCATGCAATGGCATGCTGTTGAATGAGAAATTTTCGCCCAATCACAAATAGACATGTCATTTCTACAAAATTACAATAATCGAATTTGGGACCAATTAAAAGTTGACATATGCCCCAAATTGAAAATGGTGAAGCAGCTAACCGATTCCAACGCTCAGATCCAACACACCCAAGAGCAGTTTATCCAGTCCACCACCTCCCATATTTAGAGTATGGCCAACTAGCTCTCCCAACTAGCTGATGTTGTGACCAGGCTGGACATCCAACAGGGGAAGCTTCCTTCTCAGCCCACACCGAACGTCCGGAATGTGAGTGCCATCTCTGTCAGCTGTGGGATGGACCCCTTGCCTAATGAGCCAGTGGGTGAACCAGTGGAGACAACGAGCTCACCAAGGAAACGTGGGATAAGATTCGACCCACCTCTCAATTTTTCCACTAATGTTCTCCGTGCTCCCTTCCCTAGCAGGTTGGCTATCGCTCAGGGAGGATCACGCAAACAGGAGGTGAGGTATGCTCTGTCTCCCAAAATTCAAAAGCCTGCTATTGAGAGCAAAAAGGTGTGGACCGAAATCCGTCAAGAGGAAAGAAAGGAAGAAAATAAACAGGAAGATGAAGTCCGCCAAGAGGTTGTTCTTCCAAGTAATTTTCCTGTTAAACAGGAGAACCCAAGTACATTTTCTATTCCTTGTCAGAGAGAAAATAGAAAATTTGAGTATGTCATGTTAGACTTAGGGTCCGCAATCAATATCATGCCTGCTCCTATTTATTATGATTTTCAATCTCATATCCTACACCTGGCTGATATTGTAGTACAATTATCTGATCATTCTCTTGTTAGGCCAATTGGTATAGTTATAAACATGCTAGTTAGAGTCAATGACCTGATTTTCCCTACTGATTTTTACGTGATCAATATGAACGTTAATTCTACTTCTTCTGCTTCTCCCTTGTCTGTGTTCTTAGGGAGACCCTTGTTAAAGACCACGAAGGCGGTGATTGATGTGGATGAAGGGTCCCTTTCTTTAAGGCACAAAGAAAAAATTGAAAAATTCTTTATTTCTCATGATTCATCCACCACTAATCCTGTGTGTTTTAGCTTTGTGATTTTTTAGGATTGTGGTACACCCTAAGTTGGGGGTGTTGGATGGGGACTCGGCTTTCCCGGAGGGATACGGATGATGAAGCAGAGTACAGTTGAGCATAACGACCTTAAAAAATTGCGCTACCTGGAGGAAGCCAAGATTTATATTTCTGTTATTTCCTTTTCTTGTTTTTATTTTTATTGAGCTTAATGCTTCCTACTTTTTTTTATCTTTTAGGTTTTTCTTGCTTGAAGGGAGTTGGAAAGGAGATTACCTTTACGAGCCAGACGTCATCGCCCTCCTTCGTGCCAAATTTCAGGGAAGTTTTTTGTTTCCCTTTTCATTTGTCCCTTGTTTTTCTTTTATTTTCTCACATTGGGGACAATGTTAGATTTTAAGTTTGGGATGGGGAATGTCTGTGTTCTGATTGGAGTTCTTGAGCATTTGAGCTCGGACTAAATATTGTGTGTTTCATGCTTGCTTGCTCATCTGTGCTTAGTTCGTTATGATGACTGGTTGATGACGCACTCTTTTCGATTCTTTTGCCTGATGCAATGTTTGAAGTGATTGATCATGATTTTTAGTCATTTAAAAAAAAAAATCTGACTTCACAGGCACACTTAAGTTTTTTGTCTACCTATATTAGGTCCTGCATGCTTGGAATCATATTAGTTAGTTTGTATTTTTGTTGTTACCTCGATAGGCCCCACTAATTGGATAGTATTTTTTATGATGGGTTGTAATGTAACATTAAGGAAGAAAAAATATTTATATGCCTGCTAAAAAAGAATGTTGTGCTTTAAAGAAATATCATATAAAAAAAGCATGAAAAAGAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAACTTGTAACGATATACATGACTAAGAGTAGAAAGAGCTGCCTTTGTTGTGATTAGTTAGGACACTTGTGAGAAAAGAGTGTGAGCACAGTTCCCTGCGGTAAATGTGTGAAAGCTAATGCCCCTAGGTAAAATAAATGCAAGTTTAGGGCCCTAGAGTTTGAATTCAGGCACCTCAGTTGAAATATTGCCGCTTTGATTTTTTTTGGACACTTGATGATTTGTGCATCAGTCACCATGGGGGAAAAACAAATTGAGAGTGATTTAATGCAATTTCGGGGTGCTAGGAACTTAATTAGAAGGGCTTTGAACTCACCCCTACATGAGCTAGTCTAGAATTAGTTTTAATGTGTGCTTTATTGATTGATTATGAACTGATATCATCATGAATGCAAGTTGAATCTTAGTGGACTGTTGAGACTCAAGTAACGAACCTTGCGTGATTGAGTGAGCATAATTTTGTTTGACTGTATGCATTATTCTACCTTGCTCGAGGACAATCAAGAATTAAGTTGGGGGTGTTTGATAGCATCTAAAATGTGTTATCTTCCTCAGCTTAACTCGGGATCGTTGTGCTGTTTAATGTGTCTATTGTATTATTTTGTAGGTTTTGAGCACTTAACAGGTAGAACGAGGTGTTAGCAACAAAACCAAGCTAAAACAAACCAAAACAAAGTTCCACGGCGTCACCCTAGAAATAAAACTCCAAAATTACCAAAATGCCCCTAAAGCCACGGCACAGCAGCGTTGCCTAGGTGTCGCTACGGTGCTTTTTTCTGAGACATTCTGTTGGTGAAGTGCAGCAAGTGCCGCGACGTTCCAAAAATTTCACACGTACAGATTAGCGTAACGCCGCTGCGCCAGTTCAATTTTGGCATAAAATGCCTTAGCCGCCAACCATTCGGGAAAATATAGCAGCACGAGTCTCAAGTCTGTTTTTAGAGTTTTTCATTGCATTTTTCCTTCTTTTTATCTTGAGGAGAGTTTCTTTGAACAATTATTGGGTGAACAAGCATGTATCGAGGCTAAGGTAACGTTTTCTAGCTTGGGTATTAAGGATTTTCCATTGTAATTGATGTTCTTTTGAGGTTTTGAACTTAATTCAAGTGTATGCATGATTTAATTTCGAGTTTTCAAGAATTACGATCAATTTGTAACGTTGGTGTTTATTTTGATTATTGCTTTGGTTGTATTACAATTCGTGACAATTTGTTGTATGTCAATCATAGGAAGCAATAGGTTAGGTTAGCTTGCAAATCTAGATGGTGATGTGTCACACCCTACTTTTCAAATAAACGATGCGTTGAAGAATTTATGAATAAAAGAGGTAAAAGACCATGTTGGACGCATGGTCAGGGCTAAGTAACGCATGGAAAGGGTGGACGCATGGAAGTAAACCGAGAAGGGAAAGAAGTGGAACGTATAAGAGAAATATGCATTGACGATGGTAAGATGCTTAAACAAGGAAGGAATGAAGTTATGTTGTGAAGTGTTGAAAGAGATTTAAGTCTCGGAAAGATAGAATACTACAACAAATTGAGTAACGCATAGACTTATAACAAGGAATGTCCAAGAATAGGAAGATGGTAATGGACCCAGGATGAAGGTAAACGCAATAGGACAACGCATAGAGGAAGAACTGGAGAAGGAATTATTTGTTATGAATATGAGAGTTGGACGCATGGTATGATGCGATGAGGTATAAATGCATAGTACTGCACGTTTGTTATTAACGCCTAATGGCATATGTAAACACTGGTTTATAATAGTACGGTTATGCGTTAAGGGTGAAATCACGAATGGTGGTGTAAGCTGAAGAAGTCGCCGCGTTGGCGGGGGAAGGAACGTACTTGGCTTATCAATACCATGCGCTGGTAAGGTTGTCATGCGTTGAGGTCCCTATGCGTTGAAGACATAAGTTATCTTTATGCGTCAAAGAATAGTATAGTTGGCAGAGAGCTAGAAGAGTGAGTAGTGAAGCTCAAACATTAAAGGGGAATTAACAAACGCATGAGGGCGTTGTGTTGAACGAATGGAAATCTATTGGAAAATGTTGGACGCATAAGATAAGCTTATAAAGGTCAGGTGGCTTTGTGTAGATTTGATACCTTATCAGTAGGAGGTGTTAAAGGTATGTTAAGGGTTCATGCAAGGTGACACCTGGGCTAATGCATGGTTAACTAAGCATGCAGCGTGACATGTGGCAAACAAGTGGCAAAAGAAGAGGAAAAGGTGGATGGCAAGCTCCCTATAAATAGAACTTTGAGAGAAAAGGAGGGACTGATGACTCTCAAAGGAGAAATCTGGAGAGAAAAGAGAAGAAGAAGGCAGCAAGGACGTCCATAGTAGAAGTATGCGGCCAAGAAAGAAGGTATTTGACAACTTAGTTAATTAGGAAAAGAAGTTGTCTTGTGTTAAAAGAGGTCGGCCATGCGTTGAGGACAAACATGATGTCCAAGGTGAACGCGGCATCCAAGTTAGATGATGCGTCCATGATGGACCTTGCGTGCAAGAGAGGGCAACGCATCCGAAAGGGAAGTAAGAAGAGTCAGGATGCATTTGAGAGAAATAATCAGCCTTGCGTTACCAACCTTGCGTTGAAAGGGCAGGGTTGCGTTCAACCGAGCTGACAGAAGAAAATGGAGCCTTGCGTTCCAG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ATGATGCTGAAGTATCCAATCTCACTTTTGCCAGAAACAACAGTGACCACTATTAATAAATTGGTTGGCCCAGCGCTAAACGTTCATTGTAGATCAAAAGACGATGACTTGGGAGTCCATATCATAGAGTTTGAACGTAGCTACTCATTTACCTTTAGACCTCATCGTACGGAAGCGAAGGCATTATTGAACGAAAGAGATGTCGGTCGGTCAATTGCATTAGGACTTTTACATCCTCAAGCCATTGTTGATGTAACATACGAAGCTTGCTTGTCTCTTCTCTCTGACTCTGAAGTTTTTAAGTTGTTGGACCTTCCATTTCCTCTACCACGCCACGTTCACCTCTTCTTCCACAAGATCTCCCTCCTGAAGAGCTTGAAGTGTTTCCAATCGTACCAATTTTACTTTTCTTCTCCTTCATACCAACTCTGCAATGCATTCCATCCTGCTTTAACAGTCGAGATTCCTGATATTCTCACAAAGATATTTTTATCTACAGTTTTTTCCCTCGAAAAGAGGAAGTTGAGGCTCCAACGTGTTGTTTGA MMLKYPISLLPETTVTTINKLVGPALNVHCRSKDDDLGVHIIEFERSYSFTFRPHRTEAKALLNERDVGRSIALGLLHPQAIVDVTYEACLSLLSDSEVFKLLDLPFPLPRHVHLFFHKISLLKSLKCFQSYQFYFSSPSYQLCNAFHPALTVEIPDILTKIFLSTVFSLEKRKLRLQRVV Homology
BLAST of CmUC10G189980 vs. NCBI nr
Match: ABY56091.1 (self-incompatibility protein 1 [Cucumis melo] >ABY56095.1 self-incompatibility protein 3 [Cucumis melo] >ABY56096.1 self-incompatibility protein 4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.5e-09 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. NCBI nr
Match: ABY56092.1 (self-incompatibility protein 2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.5e-09 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. NCBI nr
Match: KAA0046284.1 (self-incompatibility protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.5e-09 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. NCBI nr
Match: KAA0046095.1 (self-incompatibility protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 6.5e-08 Identity = 29/49 (59.18%), Postives = 39/49 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. NCBI nr
Match: XP_013603996.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC106311341 [Brassica oleracea var. oleracea] >CAF2105300.1 unnamed protein product [Brassica napus]) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 1.4e-07 Identity = 27/45 (60.00%), Postives = 35/45 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23020 (S-protein homolog 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 2.6e-07 Identity = 21/43 (48.84%), Postives = 31/43 (72.09%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B0F817 (S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 7.5e-10 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TT98 (S-protein homolog OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold384G00010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 7.5e-10 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B0F818 (S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 7.5e-10 Identity = 31/49 (63.27%), Postives = 41/49 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TXE8 (S-protein homolog OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold157G00180 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 3.1e-08 Identity = 29/49 (59.18%), Postives = 39/49 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TR91 (S-protein homolog OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold157G00040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 7.0e-08 Identity = 29/49 (59.18%), Postives = 39/49 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. TAIR 10
Match: AT1G04645.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.8e-08 Identity = 21/43 (48.84%), Postives = 31/43 (72.09%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. TAIR 10
Match: AT5G04350.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 1.9e-05 Identity = 24/59 (40.68%), Postives = 33/59 (55.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC10G189980 vs. TAIR 10
Match: AT5G12070.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 2.1e-04 Identity = 21/44 (47.73%), Postives = 29/44 (65.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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