CmUC06G124590 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC06G124590
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr06: 28026942 .. 28031598 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC06G124590
SyntenyCmUC06G124590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGACGGTGAACGCCTCCGACAACCCAATCAGCGTCAATTGAGGGACCAACCAGAGCGCCGACATGGAAGAAACTGCACCCCTTCTCCCTGTTTCTTCGCACAACGGCTGTGTAAGGCCTAAATTCCTCCTCTTTTGTTCCACTAATGCTGAGATGAACATTGTTACAATGGCGATTCCCATTCCGAGGCCCATTTTTTGTAGGAGCGTAATGCCGCCTTCTCTGGCGGTGATTCGGCGGAGCGAAGGGACTAAGATTCGGTCGTAGAAAGGGATCCAGATTGTGAGGCCAATCATGGTGAAGATTGTGTAGGAAGCGGCTGGGATTTTGAAATAATGGGTGTTCCCGAAGAATAAGCGTCTATCGGATTGGAGTGCTTGAAATACAACGTATGTTTGTTGTTGTGTTGTAGCGACATGGTATAGTATGGCTGCACCCCATATTGGTATTACTCTCACTAAGCATTTTACTTCTTCTACTTGTTGTGTGCTGCAGAGTGTCCATGGATCGGCTGCTGATCCGTCTGACTTGAATTTGTCTTCTGGGGTTATGATTGCTGCCCTGTCTAAGAAGCTGCAAGCAATATAGGGGTTTTTGTTTTAGCTTTTAAGATTTTGTTAAAGACTTAAAAGCTTTGAAAATGGAAGTCTACCTGAATTGATCTGTGTAAGGAAGCTTGGAATTGATGGAGTTTGCGGGAATGTGGTTAAAAAGAGATGGCCATTGCTGGTCTGGCAATGGCAATTGTCTTTTCTTGAGAGCAGCCATTAGAACTCGCATTACACTGGTGAAAGGACTCCCATCAGGTTCTAATTTGACGTAAATCCAGGAACCCATGAAGAAAAGTGCACAGGATAGGAACATAAGGAAAGCAGGAATGGCTAATCCCCAAGCCCAGCTCACTTCAGTTTGGACATATACAATGATGGTTAAAGATATCATCATGGCAAATGTGAAGGTGAAGTAGTACCAATTGAAGAAGCTGTTTATTCCTAACTTCCCTGAGGCTGTGTTGGGATTGAATTGATCTGCTCCAAAAGCCAAGTTGCAGGGTCTGATTCCACCAGCTCCGATTACAAGCAGTCCTAATCCAAATAACAGAAATGCAATCTGCCATGGCGTTGCCTCCAGGCAAGGCCCGCCTGCACTGCCCTTTCCACAATCTGGTGGGTGCAACTTCTCAATTGATGCTGTCAGTGTTAGTACAACCATCCCCTGTGTGAGTGATCAGTGACATGAAAACAACCAATTTAGTGAATTTGTATATATATATATATATGCGCGCGCTCACATTTGAACGTTGTAAAGTCTCGTTTGGAATGACATTTTAAGTGCTTAAAAACATTTTAAGCATTTAAAATATCATTTCGAACCGACGTTAATTTAATTCATGCATGCATGTGCATGTGCATGGGGTGTCTGAATAAGCTGGCATTTGGTGTGAAACTCAAACAAATAGGAGCAGCCGTACCATTAATGAAGCAATGGAGGCATATCCTAAGGTCTTGTAACGTCCAAAATAAGTGTCACAAAGAAATGCTCCAAACAAAGTGGAAAAGTTGGTGCTGCCATGGAAAATGTTCATAAGAGTTGTGGCAGTGATATTTTTCATGTGAAATACATCTGTCAAATACACCAAAAGGTTTGAAGAAGTGCCTGTAGTCCCTAGCTTCTCAAAAGTTTCATTCCCTAAATAAACAAACCCACATATTAATTAACATTACAAATATTAAAACAAAACAAAAATGGAAGCTTGATTTGTGTTTGACCTCCCTAGGGACTTCTCTTACGAACCTACTACAAATGGCATGGCCTTGACTCCTTTATAATTGACCTTAGGCTCATCAAGATTGTGAACATCTTCATTATTTCTCTCCATGGCTCTCTCTCAGAACCACTCTCTGATCTTCTTATTAGTCTTTTCTACAACAAACCCTTTTATACTTTGATCCACTACTGAGTTTACTTATGCTTTCAATATTGCATTTGCTTATTTGGTTCAACAGGTTGTCGACTTTGGATGTGCTGTATCAGCATATGAAGTGTTAGATCGAGATAACTACTTTTTGTTAGCTTTCAAAGATTTGTGATGTGTTTTTCCCTGAATAGTAATAAGGACAAAGATGTAATGAGAAAGTGAAATGTGTGCAGGATGATCAAAGAAGTTTAATTAATATAGCTCAAAATGATATCAGAAGGAGGGATGTGAAATCTCACACATTAATTCTCAAAAAGAATAATTCTCATCTCTTCTTTTGGGTTTAACTAACTTGTTACTTAGTTTAAGTTCATTAAAGCATGGATTTATGGAATTTCGTTTCCTCTAGATAACATTAGCTCTCTTGTTTTCCAAATACTAAACATTATATTTGGTAATTGAAACTCATTTATGTGACTCCATAAACATAAACATACGCATATCTCAATCTGAGCCATCTTTATTTTACAATAATGTTTACATTTACAAACTTCTGCATTGTGATGTCAGCGTACCAAGCGATGGGACAAAGCATGTTGATTGTCCTTATCGAAAATGCTGTTTTGCAGGGAAACCAGTTAATGCCAAAGCCCTTCACTGTGAGGAAAGGTACAGCAGGCTGTGGAAATGCTATTCCTGGACTGAAAACACAGCAATTCATCGCTTCTCAAAGTTTCGAAAGTGCTGAATTAATGTGACAGCTTTGGTTAGTACAAAAATCACTGTTGTTTTTTCTTCTTCTTTTTGAAAACAGTTGCATGTAGCATTTAATTAGCTCATTGAAACTGCTTATAGATTAATGATATGTACAGCAGAATTCGAATTTGAGAGACTTCATAAATGCCTGCCTGAGTTTTGTGAAGCACATAAAGTGCCATATTTCCAAGAGGTTGGTTGATGGTCCCAAACAGAGAAATTGATAAATTGATCTAAAAAAGTGTCTATTGTTGTATGGATTGGCCTTGTTCATATTCACACTTCAATGATTATCATTCATGAGGTATATTTTCTTTAGTAACTTTCCCCTCAAGTCTACTGTGTGCCTGATTCTAGTGAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAGGTATACCAAGATGTAGCAGGCTTAGAGGGTGGGGTCTGGTATGGAATCTAGAGTTAGTTTCATATGTTAAAAGTCATAGTGAAGGATTCTTTAGAGATTGAACTTTTATGAGGAGGATATAATAGAATGATGTGACACTTAAACCAGTCACATTATTGGAGTATTCTTATTAATTGAGAGTTTGTTTTTCCAAAGGTTGGAAAATAAAATTCAACTTGAAAGTGACAAAATATTCCTTTCAATTACCATGCAAAAGTAAAATCATCTAAACCTAACTACATTTCTAGCTCTATCATTTGATTGGTATTATATTGGCTGAGATATTTATTTAGCTTAGTCAATATGAACACGTGAACTGAAAAATTGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTCCACATATATTGATATAATGGAGATCTTGTTTCCTTATATATTATGACTATGGGTCTATCATCCAAGTGGTACATTAGATTCAAATCTCAAACTTATGGTGTATATATATATTATTTATAGTTTTAATTTAAAAATTGAGTTGTTTCCGAATATAGGAAAATGAACCAAAATGTTTACAAATATAGTAAGATTTCAGTGTCTATTTGTGATAGATCGCGATAGGCTACTAGTTGTGTCTATCTATGTCGTGATAGACATAAATTGTAATCTATTACGATCTATTGCAATTTATTGTAAATAGACTGTTATATTTTGTTATTACTTAAAAATATTTTCAATAGTTTTGTCATTTAAGATAATTTTTCATAAAAATTATGGGCGAATCTTTGGTCCCATTTGGAATTAAGTTTGTGGGAGTAAAAACTAAATACGAGTATGGGAGAACCTTAACCGTTTGGGCCATTTGGTAAATCAGATTATTTAACTTCCCTATAAAACTTGTACCTTCTCTAACTAGTTTTATACAAATATATTATTCTCACATCTATTCACTTTTCAATTTTTAATAATAATTTTGTTTAATTTTTATCAAATAATTTAGATGGAAATGAACTTTTTAATTTAAGGCATATAAAACTTTTAAATAATTATTTTACCGTAAGTTTGATATAAAACATTAATATATAATTGAAATAACCCCTCTCTATGTCTTTTCAAGTATAAAATTAAAATTTACTTAACACTGTTTTTACTTCATGTCATAGTTGACTTTTCTCAAAGCATTGTTGCACGCAATTGTTTTGAAAACTAAACAATTGCATTTTGAAACACTGATCATATATATGAATCTTCATTCGCTAAATACACTTTTGGTCATGTAGGTGTCAATTTAGTCACAGAGGGACCAAATATACATCTACTTTATTTTGGCCTATATATATATGAAGCCCGTGAAGGCTAATTCAATGATTGATTTGATGATTAGAAATCATATTGAAGGCAATTTTGGTTGTTATTGCCGAAAGGTCTTCAAATAGAGACGTGTTTGAAACTGAAAGTTGTGAGATTGAATCAAAACACAAAGACAAAGTGGTCAAACAAGTTGAAGTTTGAGCAGTGAGATAGTTGAATTATCCAATGCTTCAAAACCATCTCAAATAATTAACCTTTTGTTTTGCTCAGTGAAGACAAAAATAAATGA

mRNA sequence

ATGACGAGTGTCCATGGATCGGCTGCTGATCCGTCTGACTTGAATTTGTCTTCTGGGGGTCTGATTCCACCAGCTCCGATTACAAGCAGTCCTAATCCAAATAACAGAAATGCAATCTGCCATGGCGTTGCCTCCAGGCAAGGCCCGCCTGCACTGCCCTTTCCACAATCTGGTGGGTGCAACTTCTCAATTGATGCTGTCAGTGGAAACCAGTTAATGCCAAAGCCCTTCACTGTGAGGAAAGGTACAGCAGGCTGTGGAAATGCTATTCCTGGACTGAAAACACAGCAATTCATCGCTTCTCAAAGTTTCGAAAGTGCTGAATTAATTGAAGACAAAAATAAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGACGAGTGTCCATGGATCGGCTGCTGATCCGTCTGACTTGAATTTGTCTTCTGGGGGTCTGATTCCACCAGCTCCGATTACAAGCAGTCCTAATCCAAATAACAGAAATGCAATCTGCCATGGCGTTGCCTCCAGGCAAGGCCCGCCTGCACTGCCCTTTCCACAATCTGGTGGGTGCAACTTCTCAATTGATGCTGTCAGTGGAAACCAGTTAATGCCAAAGCCCTTCACTGTGAGGAAAGGTACAGCAGGCTGTGGAAATGCTATTCCTGGACTGAAAACACAGCAATTCATCGCTTCTCAAAGTTTCGAAAGTGCTGAATTAATTGAAGACAAAAATAAATGA

Protein sequence

MTSVHGSAADPSDLNLSSGGLIPPAPITSSPNPNNRNAICHGVASRQGPPALPFPQSGGCNFSIDAVSGNQLMPKPFTVRKGTAGCGNAIPGLKTQQFIASQSFESAELIEDKNK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..56

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G124590.1CmUC06G124590.1mRNA