
CmUC06G122520 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACCAATCATCTGTTGCATCCTCATATCTGATTTCAGCCATTGCAGCTTCGAAGGTTCATATTCTTCCACTTCTTCCCCCTGCAATTGGTTTGATTCATTTCCTCTAATCTCTGTAATCTTAGAGCTTTCAGCTGTAATCACTCGTCCTCTGATACGTGACAAGCGTTCCGGTTTGTCCTCATAAAACCGGGTATGTTCACTTTGCGGCATCATCTCATCCATGTCTCGTCCTCCATTGCATTTCGATTTTTAATGCTCGAAACTGTTAGGTTTTCGTTACTCACTGATTTCTTGAAGGTTTTCATGTGGCGAATGATGCAGGAATGGCTATTTTCACTCATGGATGCTCCAATTCCAGAGTTTTCTGTGAAAGGGAGGGGACCTTAATTTTAGGTATTTCGGCTGCTCCAGTTTTGCCTCAGAGGGCGAGAGTTTACGGTCATTTTGCGAGAGGTTAGTCAATTTTAGGCGTCTTTTACTTGAAAGATGTAATACTTATGGATTGTTTATGATGAGATATTTCATTTACATAAACTTGTAAGCCCTTGCAATTTTGAAATGGTTAGTCAGTTAATTAGTTAGTGTATTTTTTATTTTATTTTATTTTGCATGGTATTGAATTGGAAAATTTGAGAAGTTGAATTTTCCTTGCACTATTTGCTAATTGTTTATTGTGGAAGTAAGAGTTTCAACCTCTCTGCTGTTTTTTTCCCCACCAATAACGCTGTCAGATAGGGAATGTAAAGAAAGATAGAGTCTCACAAGTTATAGTATTACTTTAAACACAAGTTGGTGGAAAAATAATAGTGAATAATGTAGATTGCTTGTAATCTTTCCTCACAATGACATGTACCCTCAACATAAACTTGTCCCCATGCAGAAGGGCCATATTTTTGTGGACATGATTTTGAGAAACAGCTAACTAAATCTTTAATATATATTCTAACAACTAATGTTTTTAAGTCAATATTCCCCTGGAACCACCCTGTAAAGTTGATTTATGCAGTTTAAAGAATGTTGGTACATTGCCGTCCGGTTTTTAATATTAAAGAAAAAGAGAGATTTGATATAAATTACGAGCAAGAGAATATGTACAGAAACAAAGATGGTCTTTCTTTTTCCTGTTTGACTTGGTGAGATAATATTAAATGAGCTCATGATGTTATTATGGTTAAACTTCACTAGTGCCTTCTTTCCTCACTTGGTTTCAATTCTCCTCTTTTTTAATAACTATAATCTCTCACATCACTACCCATTGGAAATGTTTTTTCTGTAATCTTATGGCTCTCTGCACTTTTTTAATTTCATTTCTTCAATGAAATGATAGTATGTCTATTTCTATTTTAAAAAAGAAAAGATTATGATGGATACCTTCAGATATAACAAAAAGATACATGTACTAGACTACTAGCATTTCTTCCTCCATTTTTTCTATCTTCATTATTTTCTGGGTTTATTATTTTTCACGTTGCACAATTCTGAGACAGTTTATTACTCCAACTGACTTAGATAAAAAAAGAAAAGAAAAGAACAATTATAACAAATTTTCCAGTTGGAAGCTACATAAAGTAGCTATATCTAGAAATGCTTCAAAACCTCTACGGTAATAATTGAAAATCCTTCTAATGGGATACTTTTATTTATTCCTAATTTTTACACGTTATGCACCAATAAGTAAACTAATGGATGAACGGTAACTTTTTGCGCATGTCTATTGTGTTCAACTTTTCCACCCACAGAATCCAAATATATAATTTGGTTTTCCTTGGAATTTTCCTCATCAAAATATTGCTTGATAGGTATCTATTAGGTTTTAGATCAGAGGCTGAAAGGTGTAGGGTTTGGATTTGCAAGAGAGCTCTCCTACAGTTGAATATAGTCAAACTCTTTTGTCTTCGACCTATGAGGTTTCAAAGCTGCAGTCCTTCCCAGAAAGTTTGTTAAAGCTCAGATTTCTCGTCATTTAGAGTTTTTTTTAAAGAAGCTTGGGTTTGATGCGCTTTCTTTGTCCCAACAATCATTACTTTTACAGTTCTTATTTATTCTGGATTAGGCTATAAAGAGCTAGAAAGACAGCTGCAATATATTGCTTTCTATCTAAGTTTCTTCCCAATTTTGAATTTTTGACCACGTCCTGCCTTAAAAATGAGATGTGAATTTAGCAGATACTGTCTCTTTCTTATGCAATGCCATGGGATAATAGAGCTTAGCATTGTGATTGAAGAGGGGCATCCAGACGGCTGGATGATCTTCTTAAGCCACTATTTTATTAGTCATTTTCGTAGAGTTATAAATTATACCCCCCCCCCCCCCATGTTTCTAGTGTAATTTTTTAGATGAATAAAACCAGCACTTTTGCAAGGTTATCTTCACGTTGATTGTAACCAGTTAAGTTGATCTGCCATAAGAGCCATTCATTTATCATGTGGTTACTATATATTTTTCTTCAGAGAGAGGAACTAGTCAACGATTGTCAAAAAAGGAACAACTTGATTTCCCAAGGAAAGGATTCTTTGCCACAAGGAAAGTTGTCCTCACAGTCCCTAGGGACAGTAGCTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAAGGACAATACTACAAATCAATCCGAGGCAAGGAAACTATCAGTCATGCTTCTTTTTTCCTCCATTCCAATGAATCTTCTTTTTGTGATTTTACTGGAGCAGACATATATGTGTTATCTTCCTCTTGAGTAAATGGTGAATGCATTTATATAATGCTTATCAGAGAAGATTTCAGCTGATTTACATGACTTGTATGCAGTTTTATTGTACCTACAAAAGCATCTGTGTAATGATATTTCCATCTTTCTGTTGGGGTTGGCGGTGGGGGGTGACATATTTTAGTAGGAATCATGTAGAAATTTTGATCGTAGAAGGAAAAAGAGTACTTGCATAAATCTTGATGATAAAGGAGAGATTTTATTGGCTCATGGCAACGATAATATAATGGCTTTAAGTTACATTTGTAGGTTTCCTCTGAATGTTCATGAACAAGTGAAGTAGCTTTTCTGTTCTCATGAGCAGCACTCATTGAGGACTTAGACATGACGAAAACGTTTTGAATCAATAGTAGATCAAAGGCTCGGCTTTAGATGATTTTTTTTGAGCTTACGTGATTTACCTATGTATTATAAAATATTACTAACCAGCTCAGATGATTATGCCTATCGCCCGGGATTCAAAGTGTTTTGTTTTGCATTAGTCTCTATTTGAAATGTTTTGTTTTGCATTAATCTGATTTAACCTTATAGCTAGCAATATCATTGAGGATTATCCGTAAATGCAAATAAGTTCTGTTTCACTTTTTTCTTTCTGCAGCAAACACCTTTTGGTTACACGAGGAAGGATGTTTTATTAATTGGTTTAGGTGTCACAGTTCTTGGATTTGGATTGAAAAGTGGATTAGAGGTAAGATAATTCACTTTTCCTTTAATAACTAATTGTTCCTCTCGCAAGCGATCATTTGTTTATGTATTTATAGAATTCCAAGGGGGGACTTTCTCCCCTCTTATATACTTCATTAATTTTCTAGCTATTTGTTTATATTGCAAGCTGAGGAGAAAAAGTCTGCAGTTGCTCCTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTCCCAATCTTATTGATCCAAAAAAGTACATCAATTACCTTTAGCATTGCACTTTTTGTTGCGTGAAATGAAATTCATGCTGTTCACTCTTGTTTGTCTAATGTGCAATCGCATTTTTTCCTGTCCTGGTGTCTTGTGCAGTATGCTGGGTATGATCCTATGCAAGCAGGCAACGTCGTTCAGCTTGTTCTAGTTTTGGGTTTAACGCTAGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAGCAAGGATATGACATATGCTCAACAACTACGCGACTATGAAGACAAAGTCATGCAGGTATAACGTGATATAACATAATGAAGGTATTTAAGGAGGAGCAAAGCCATCATGTTTGAGAGTGATTTAAAAACACGTTTGAGAAAAGTTAAAACCATTTGTTGAATGCTTTTGATACAAGTGCCGGTAACTTCGGGATAATAAGGTTAAAAAACACTTTTGGTCCTTGAACTTTCTCGAAAAGTAACAATTTAGTCCCTAAACTATAATTGATAACGATTTCGTCCCTGTACTCAAATTTGTAATAATTTAGTCTTTGTCATCAAAATCTCATCAAAATTAAGTATTGATTTTTATTACATAATAACTCTTTATGTAGGTTATAAAAAAATTGATCTTGGATTAGTTTATTGATCTACATATATTAAATTTTTTTAATTAAATCCTACCAAAATTTTCATGATAGGGACTGAAGACTAAATCATTGCTTATTAAAATTCAGGGACCAAAAGTATTTGTTAACCTTAAAATGATTAGTCACACAATTAAAGTTCTCTTTTGTTCTTGATTGTCATGACAGTTTTTTCCCCTTTAACTTCCAATAACTCTTTTACCATCCTCCCTACCCTATCAATTTGCTGTCTGTAGAAACGCCTTGAAAGCCTTACAGAAGCAGAGCTCGTAGCATTGCTCGAACAAGTCGAGGAAGAAAAGAGCCAATCAGCTAGCGGCGAACAGGTTAATTGAAGTCATTTCTATACCTATTTATTAGAAGTTCTCGGCCTAGAATTTGAGGAGCAGGGTCTTGTGCATATGGTATTCTATATGGGGCAGTGTAGAATTAGTTTCTGTTGCTTAAATAATGCATTTAGATAGCTGTAAGAAAATACAAAACACTGTACTTTATTCTCTCAGGGAATTGAATCAAAACTACCTGGTGATGAATCTTCTTTCTAAAACAGTTATAGGGAACTGAAATTGTAATACAGAGATGTAAAGCTTTGAGAATAAGGATTAAATCTTAGCATGATTAATTGAAAACTGTAGAATACAGTTTAAGTTTAAAAGTTTAGGAACTAAATAGTAATATTTAGTACA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Homology
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Match: XP_038880024.1 (uncharacterized protein LOC120071716 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1954.9 bits (5063), Expect = 0.0e+00 Identity = 1006/1096 (91.79%), Postives = 1033/1096 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. NCBI nr
Match: XP_004137356.1 (uncharacterized protein LOC101203626 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN63894.2 hypothetical protein Csa_013895 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1937.5 bits (5018), Expect = 0.0e+00 Identity = 984/1086 (90.61%), Postives = 1025/1086 (94.38%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. NCBI nr
Match: XP_008453501.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494195 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0058152.1 Leucine rich repeat 4 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1911.3 bits (4950), Expect = 0.0e+00 Identity = 982/1087 (90.34%), Postives = 1018/1087 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P4K6 (Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=stk11ip PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 2.7e-27 Identity = 99/321 (30.84%), Postives = 163/321 (50.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3TAA7 (Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Stk11ip PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 3.9e-26 Identity = 97/299 (32.44%), Postives = 146/299 (48.83%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8N1F8 (Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STK11IP PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 114.8 bits (286), Expect = 8.2e-24 Identity = 96/300 (32.00%), Postives = 140/300 (46.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6IRN0 (Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=stk11ip PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 7.0e-23 Identity = 105/375 (28.00%), Postives = 174/375 (46.40%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5F479 (Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein OS=Gallus gallus OX=9031 GN=STK11IP PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 3.2e-20 Identity = 73/218 (33.49%), Postives = 120/218 (55.05%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UQK5 (Leucine rich repeat 4 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold274G004690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1911.3 bits (4950), Expect = 0.0e+00 Identity = 982/1087 (90.34%), Postives = 1018/1087 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXK1 (uncharacterized protein LOC103494195 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494195 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1911.3 bits (4950), Expect = 0.0e+00 Identity = 982/1087 (90.34%), Postives = 1018/1087 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DY55 (Leucine rich repeat 4 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold629G001500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1890.2 bits (4895), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1139 (86.30%), Postives = 1019/1139 (89.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7W6 (uncharacterized protein LOC111472125 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472125 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1817.0 bits (4705), Expect = 0.0e+00 Identity = 933/1088 (85.75%), Postives = 990/1088 (90.99%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1A1 (uncharacterized protein LOC111441231 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441231 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1805.0 bits (4674), Expect = 0.0e+00 Identity = 932/1088 (85.66%), Postives = 987/1088 (90.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. TAIR 10
Match: AT1G48540.1 (Outer arm dynein light chain 1 protein ) HSP 1 Score: 846.3 bits (2185), Expect = 3.7e-245 Identity = 510/1107 (46.07%), Postives = 677/1107 (61.16%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. TAIR 10
Match: AT3G17920.1 (Outer arm dynein light chain 1 protein ) HSP 1 Score: 839.7 bits (2168), Expect = 3.4e-243 Identity = 512/1110 (46.13%), Postives = 662/1110 (59.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. TAIR 10
Match: AT1G48540.2 (Outer arm dynein light chain 1 protein ) HSP 1 Score: 839.3 bits (2167), Expect = 4.5e-243 Identity = 508/1107 (45.89%), Postives = 668/1107 (60.34%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. TAIR 10
Match: AT3G17920.2 (Outer arm dynein light chain 1 protein ) HSP 1 Score: 610.1 bits (1572), Expect = 4.4e-174 Identity = 393/963 (40.81%), Postives = 531/963 (55.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G122520 vs. TAIR 10
Match: AT3G17930.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3007 (InterPro:IPR021562); Has 236 Blast hits to 236 proteins in 83 species: Archae - 0; Bacteria - 117; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 80 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 2.4e-42 Identity = 95/156 (60.90%), Postives = 112/156 (71.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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