CmUC06G117760 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview


Name	CmUC06G117760
Type	gene
Organism	Citrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
Description	Unknown protein
Location	CmU531Chr06: 15017720 .. 15023809 (+)
RNA-Seq Expression	CmUC06G117760
Synteny	CmUC06G117760

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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ATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCAGCTTACGAGTAGGTCTGGAACAGCGGCAGCGACGAACAGGTGTGCGACGACGGCAGCGGACATCCCTAGAGGTGGTAGCATCTGGTACGCAATGGTGAAGAAAAAAATTAGGGGGAGATTGGGAGAAGAAGAGAAAACAAAAAATAGAGGGAGTGTTTTAGAGGGAAATTAAAAAGATGGGGGAAGTAAAATAAAAAAAATGTGAGAAAAATAAAGTGGGGGATGATTTTAAGAAAGTGTGGGAAAAACTAAAATGTGAGATTTAAGTCATTTTTACTCACAAATTTGAACTTCCCTACTTTTCTCAAAATTTGAAATGTTAAAAAATATTAATGACTATTAAATTTGTTCTTTCTAATGACTGTTAATTGTAGTCATAATTTGGTGACACAAAAAAATGACAAAATAGTAAAAAAAAAATCTGAAAATTCACGTCTTTTCCCGCCAAAACCGTATTTTTCATTTTCTTACATTTAATGACTGTTTTTTTTAGTCATTAATTAATAACACAAAAAAACAGTCATCAATTCCAACAAATCCGAAAAACTCCGTTTTTTCCCGCAAAAAACGCGTGATTTTGGCTTTAATGACTGTTTTTTCTCTTTCTCCTCTATTTCTGCTACTGTACAAGAGTCATGAAAGGTAAAAATTGTTGTAGTGTGGTGTGATTAGGATTGCTGGAAACCCTCCAATTTATAGAGTTGGCCACCCAAAATTCTTTCCAAAATTGTTGATTCTTCAAATAAGGAAAACTTCAACGCCGCTATGCTGACCGACAAAATGGTGTCGCCGCGCTATGAGATGGCGTCGCGGCACTGTGCTTCATTAAATCCTAGCCTCGACGTCGTGCCGCAATGCCGCATCGGTGCTGCTGCGCTATGCTTGAATGATGCTCTCCGGAAAAAACGTCGTGGCAGCGCCGAGCTCTACGCAGTGCTGTCCTGTTTTTGACAATTTTGTGATTCTTTCTTCTTTTTCACTTGATTTTGGCTCGGTTTAGTTCTTTTGGCTTTCGATTCTTGTTTTCTTTATATTGTCCTAAAAACCACTAACAAACAAGTGAAATCTAATATAAACTCCCTTAATTTAGGATAATAAAAAGCACTTTTTAAGCGCTTTTCAGTGGTTAATGAGTTTAGCCGATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCAGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCCTTCCTAGCTCGTAAAGAGTGATGAGGTATTTATGTCTTGAGTGAAATTTGAAATGATCAAATTTACTTGGAGAAATAATATCATGTATGATGATACATTATAATATAAAATTTAATTTAACCTTTATAATATAAATTTAATTTTGAATATGATACAAAATTAATTTTTGAGAGAATTAAATATTTGAAGGAGTTCAAATAATAATATGAATTAGATTTATATTAAAACTATAGGTTAAAATTAATGTGTATTAGATGCACATTAAAACTATAAGTTATGAGAGAATAACAATTGAATATGATTCAAATGTAGGTTAAATTAAATATTAGATATTTAATTTGAAAATGAATTAATTTTCTTAATTTATTTAAATTAAATTTGATTTAATTAAATTAAATGAATTAAAACTATAGGTTATATGGGAGATGTTCATTTAAATATGATTTAAATGAAATAATTAACTAAATTAGATTTAATTAATTATTATTTATTATTATTTATTTGTTAAATTAAATAATTTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAAAAAGGTAACTCCCATACATGGAAGTTACGCTTTACGTGGTTTTCCCACGTCTCCTACTCTCTCTCCCTAAATAGGCTTGCAAAGAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTATTCTCTCGTTCGATAAACTTTTTTCTCTCTAGTGCTGTCTTTTTTTCCCAAAAGATCAAGATCAAGGATCCACAATCCTTACCTCTTCCCTCAGAGAATAGGAGAGGTTTGTGGTGGACGTGTTTAGAGTCGACAACGAAAGTAAGATTCTATCTCTAATTCATCCTTAGCCTAGAATTAAACAGTAGGTTTTCTGTATTTTTTTTTCAATGTATAGGTATTTCAAAATCCCAATTTATTTCGAATTTGGTTTTGTTATTGCTTCCGCTGTGTTATGGATTTCAACCCTTTTACGTCCAACCCCTCTCTTTCCTTCCTTAGGATTGCTTCTCAACTCTCCAAATCATTCAACACTTAGCCAATTCTTCCTAGGAGTTTGGCTCATGTGTCCAACCCTAGGTATGGTGAAGTTTCTTCTTCAACTTTGCACCATATGGTCATTCTTCTCTCCCAACACCTAGGTTTCCTTTCAACACCTCCACACTTAACCAAAATTCTTCCAAAATTGTTTCACCATGCGTTGAGCTTGCCCAACCATGCATCCAACATGGTGGCTTCTTCCCCTAAGGATGTGTTCAACTCTCAACTATCTCTCAACTATGCTTCCAACTCTTCCTTCTTTAACACTTAGTGAAATTTCCTTCCCTTCCCTAGGCTATGTGTCTAAGCTTGAGTTTTTCAAGCATATTTGAGTTCTCCAAGCATAGTTGTGACACTTAGAAGATTTCCTTAACTCATTTGCCATCTTTTGGTCCAAGACTCGAAAATTGCTTACCGTGGTTTTCTCCCAAACTCACCTAAGACTCATTCTCATCCCAAAACTCAAGTTGACACAAACACTTGTCTCTCCACATAATTCTCAATGCATAGTATCCCCTTTACGAAGCCAAAATTTGACTAACTTCACAAGTCCAGATTTTCTGGCTCAAAATTTTTCTAACTCCACAGGCTTGTGTTCCAAGTTTCCTTCACTTTTCCTAATTTTCTTTCTTTAAGCCACTTAAACTACTAGGTTAAAGTTTAGGGTCTCACAATAGATATGCTTGAATGTCTCTACTGAAGATCGGATATGTTTCTCTGTGGCATGAATCAATAGCACGCTTATTTTGAACTTCCCTATGTTTAGTTCTTCTCTTTATTCAAGACTAGCAAATTTCTAAGTTTGGGGTGGTGAAAAGCACCTAAAAAGTGCCTTTGATTTAGGAATACTTTTATTAGATTTAATGTGTTTGCTAGTGATTTTAGGTGACAATGAAGAAAATAAGGTTCAAAGGCCAAAAGAACTAAACCGAGCCAAAACCGGAAGAAGAAGTGACATAGAAAACAGGGCAGCGCAGTCTAGAGTGTCGATGCGTTGCCCCGCTATGCTCTAGACCCGAGAGCACCTAAATTGGGAAATTGTTGGAGTGTAACTGCGGTGTGGAGAAAGCGTCGCAGCGCTACACTTAGAACCAGGCAACGATGACGGACAACGTCATTACGCTACCCCTTTTATGACGAACAACATCTCTGCGCTTTCCACGCTAGCTTTCTTAAATTGAAAAATCTTTATTATTGGAAAGGATTTTAGGCGGCCACTTCTATATATTGCGTAGTTCTCAGCAACCCTAAACATCAAGAAAGACACAAAAAAAATACATAAGAGAGTCCCAAAAGAAGGCACACGAAATTAGAGAGAAAAGAGAGACCAAAAGGTGCGAGTTTGCTATAATCGGTGGTGATTGAAAGAGTGCAACATCGAGAAGCAATTCGGGAGTTCTTCTTCCTAAGTTTCTCTTTCCCTTTTACTTTCATGCTTGAGAATTCGTAGGCAAATATGTATTTGATGGCTATATGTGGCTAAACTCATTGTTTTAGGGTGTTGGATGATTTAATTATGGATTTATGTTGATGGTTTAGTGTTTTTCATAGATGTTGTTGAATGATATGTTTTTCAATGCTATTGTGTTTATTCTTTATTGATTGATCATCAATAAATCTTAGGTTAGATGTATGATTGAGTGATTGTATGTTTAATTGGATCTCTAGCATTGAAATCTCGACTAATCTTTTATGAAAATAACTAGGTTATTAGAGAAAGTTGATCATGACTAATCAATTTTAATGCTATGCTTATTAACTTGGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATTAGGTTGCATAAGAAATTATTATTTTTTAGAGAAAGTAATCCAGATATTAGTTTTTAGACTTAAACATATTGTTTGCACATCATTCCATGAAAACCTAAAGCATGAGTTAAGGAAGTAATTAATGACATTTACACCCTAGAACACTCTTATCCCTTGAAGTTTCACTTGTTCTTGTTCTCTTGTTCTCTTGTTTTCAAGATCCAAAGTCAATTTCCATTCCTTAGATAAAATCAATTCAATTCTTGAATAGCTAAGTGAATATATCCAATTCAATCCCCAATTGATACGATTCTCAGACTTAAACCGTTTTATATTATAACTTGATCTGTGCACTTGCGAAATCGTGCATCAAGTTTTACGCATCACATATATACATAGGTTTCTTGCTTTAAACTTTGATGAGGCCCATGAAACAACTTATATATTAAGGCATGTTTGAATTGACTAGAAAAAAAATATTTTTCAAAACATAATTTTCATTTAAAAATTGTTTAAAATAATATAAAATTGCTTAAAATAAAAACACAGTTTTATAAAAATTATTTGAAATAAAAGCAATCATGTGTTTTGTTACATTTTCTCAAAAGTTCTTTTATACAGAAAGTTTGTTTGGTTTGCCATACACTCAGGGTGTTTGGAGTGAGGAGATGAGACAAGTTGTGTTGAGATATGAACTCAACTCATTCTTTGGGAGACCAACTTCTTATGTCACCAACATTTTATACTATGTCTACCAACAATGCACACAATTCTCATCACCATAGATACCTTGTTGCTCAACTCTAGCAACCACCTTTGTCAGCCAACTCGATGCTAGATGACAGTTTACTTAGACAATCATCAAAATTACAGATCAAACAAAACTTGTTGCTTCCATCGACCCTTGATCTTCGAATCAATCCACAAGCATGATTGCAATTGATCAAGTTAAGCTTGAATGATTCTGAAAATGCAATCTAAACACCCTAAAATTGTAAAGGAAACATAGCTCAAGGTTAAAAGAAAACTCAAAGGTTGTTTTTACTATATTTTCCAAGTCTCCCTTTTTCAATACATGTTACATGACATTACATAGCCTTTAAAATAAAACCCTAGATATTCTATGAGGCATTTCAAGTGTTGTAACATTCATAATTTATGACCATTATAAGCCACCGTTGAAATGTAAGATAAAATGACTTAAAACTAAAAAAATACATTAAATAAATACAATGAATCTGAGAAAATGTGCTATCTAGCTCCACTTACTTCGAAATCGTTACTTGGTTTTATATATTTATTTAGTGATTTTATAGATATCGAGCACTAAGAGGTCGAGTCGGGCGTTAGAGTTGAAATGGAGCTAAAACAGGCTAAAATAGAGCTAAAACAGGCCAAAATAGAGCTTAATTGCATCGACTGAGAAAGAGAGAGTCAAAATTATTATGTTGCCCTTGGACCCACAACGCAGCAGTGCCACCCCGGTGCAAGCGTTGAGCAAATTCCCAAGATCTATTAATTTGAGAAGATGTCACGGCGCAGTAGCGCTACCCTTGGTGTACTAAAATTAGAATAACATTTGTTCATTTCAAATTTATATAACAATTATCTTCTATCATTTTATAATATAATTTTAACAAATAACAAAATAACATATAAACAATTAAAATAATATGTCCAATTTATCTAATATATGTAATTTTCACTGCAAAATTTGGTTTGAACTAAATGTTGTCACCTGCCTTTTTTATGTTTACAATTAAGATTTATCAAACACTAATCTGTTTTATATATAGTGATTTTTTTAAAAGCAAAGTTATGGAGCTATTACCGTAATTAGTCTCAAAGAAGTCTAAATTCTCTTGCTTCTTCCACAAATTTTATATTTCTTTGTGACATATATATGTATATATATTTATTTTGTGAGATGTTTGTTAGTTGACCCATGACTTCTCTAGGGTATGGTGGACAGAAAACATGGATGACTTTTGGCTGGGCAAGTGTAAGAACTGTTCTATAAGTATCTCAAGTATTTTCAGAGGTCTAGATGATGCTTGGCCAACTTCCATGGAATAA

mRNA sequence

ATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCAGCTTACGAGTAGGTCTGGAACAGCGGCAGCGACGAACAGGTGTGCGACGACGGCAGCGGACATCCCTAGAGGTGGTAGCATCTGGGTATGGTGGACAGAAAACATGGATGACTTTTGGCTGGGCAAGTGTAAGAACTGTTCTATAAGTATCTCAAGTATTTTCAGAGGTCTAGATGATGCTTGGCCAACTTCCATGGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCAGCTTACGAGTAGGTCTGGAACAGCGGCAGCGACGAACAGGTGTGCGACGACGGCAGCGGACATCCCTAGAGGTGGTAGCATCTGGGTATGGTGGACAGAAAACATGGATGACTTTTGGCTGGGCAAGTGTAAGAACTGTTCTATAAGTATCTCAAGTATTTTCAGAGGTCTAGATGATGCTTGGCCAACTTCCATGGAATAA

Protein sequence

MEADSVRHRRRQLTSRSGTAAATNRCATTAADIPRGGSIWVWWTENMDDFWLGKCKNCSISISSIFRGLDDAWPTSME

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmUC06G117760 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC06G117760 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC06G117760 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC06G117760 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC06G117760.1	CmUC06G117760.1	mRNA