
CmUC06G116290 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGCAGCCTCTTTGCTGCATATCTCACGAGTTTCAAAGAGTTGCATCATTATATCCTGAAAAAATCGCTGTAATTCATGCCTCCGGTGGAGTTCAGCTTTTCCGCCAGTTACACGGCGGCGGCGGCGGCGAAGCTGATGATTTCTTCAAGGGGCGGGCCATATCCGCTTTCCCTCCCATGTACGAAGGGGACCGGTGCTTCACTTACTCGCAGCTGTTGGCCTCCGTTGATTCTCTCAGCGCCCGCCTTCTTGCAATCCTTCGTGATCCTCAATTAAACGCGCCCAATGCTCCTCACCCAGGTCATTCTTCAATTCTACTGATTTTTGTTCTTAATTCTCTCGTAATCATCTTCTTCGTTATGAGTTTATGACTCACACAATTCACTTCATTCGACTGAAATTTGAATAATCTGGTATTCCGCATCTATAATGTCGAGGTGCTGCCAATTTCAATTGTTTATCTGTTTGGCAAGGAAGCTCTAAGGTTGGCTGCAATATTAGTGGGTAATCAATTTGATGGCGAATGAGAAGCTAGACTTCGCTTTTGAACATGTAATTCTGTAAAACAGTGTAGTGCTTTCCCGTTAATATGCAAGCATACAACGAAGCGTTCTTATTAACATGGAAATTAATCTCTACAACTTTTCAGAGAATGATCAGCTGGCAAAGACTGGTCCAGCGGCTAGCGAATTATCTGAAGCATCAACTGAGCTTGAGAGCAGTAACATACCGAAAATATTTGGAATATATATGCCACCTTCAGTTGAATACATAATTTCTGTTCTTTCTGTACTGAGATGCGGAGGGGCTTTTATGCCATTGGATCCTGCGTGGCCTAAAAGGAGGATTCTGTCAGTTGTTTCTTCGTTGAAAATTGATCTTATTATCTACTCTGGGTCTTCATTTTGTGAAGATGGCTATCATGTGACGGAGGGATTTCGTTGGCTTGAGCAAATCAGTGATTATTCAACCCTTTGTTTTACTATGGAAGAAAGTTCTGTTCGAGAGCATAGTAGTGAGGTTGATTTAGTTTTTCCATGTGAGCATGAGAAAGGGAGGCTGTTTTGTTACGTTATGTATACATCTGGATCTACTGGAAACCCCAAAGGCATATGTGGCACTGAACAAGGTATGATGTTACTGAGGGTTAAGATATCGTTACCCGTGGATATGTCGAGATCTCAATTTAATGAAAATTTCAATGGATTTAACAATAAAATGTTGGATTCTTGAAAACCAATGAACTTAGAAAAATTATTTCAATTCATAAATAGGTTATTTACCTGTGCCCTTCACAAGTAAGGTGTTATTTTAATCAATCTTGGTTGGAGGTGCTATGTATGACAATGTTTTCTTGGTGGGGCTTTGTTACCCATTATTTTTAAATTTTTTTAAAAATATATTCTGTTTCTATATTAAAAATAATCCGTTTATTTGAAATTTTCCTGCTTTCTTATGCGAGTATAATATACAACATATAAGCATGATCTGTGGCTTCTCCACTCTTTGTAATACTCACAATGTATACTAGAGTGCTGTTTCTTTAACAAAATGGTTTAACTTTTGTAGGTCTTCTAAATCGCTTTCAATGGATGCAAGAAAAATTTCCTCCTAGTGGAGAGGAACTTTTATTGTTCAAGACATCTATTAGCTTTATTGATCACATCCAAGAATTTCTTAGTGCCATATTAACATCTTCTGCCTTGGTTATACCTCCAATGAAAGAGCTGAAAGAAAATTTGTGTTCTGTTGTCAATTTTATTCAGGTAGGCTCAGTAGGGCACTTTTGGTTTTGAGTTCTGCTTTATAAATTAGGATGTTTTGTGTGGTATCTGTATCTTCTGCCATTGTTACTCTGTATAGTTGATATCAGCTCATAATACGTGCTGCATTTTTTTTTAATGGATGACCAAATATAATTTCTTTCTGTGAAGGCGTATTCTATTAGTAAGCTTACTGCTGTTCCATCACTAACGAGGGCGCTCCTTCCTGCATTGCAAAGACTGTGTATGCAGAACAAATGTTCCCTAAGGTTGTTAATTCTGAGTGGTGAAAGTCTGTCAATACTGTTGTGGAATGCTCTTGTCAAGCTATTACCAGAAACCACTATTTTGAATTTGTATGGTAGTACTGAGGTTAGGATTCAATCCTTACCAGCATTATGCACTCAATTTATGCAAAAACATTCCCAATCTATCATATTTTCCATTTTGGAATGTTGTTTCATTTTCCTGTTCTTTTTCTGTCTGTGTAACAACTGGTTCTATTTACAATGCTAATTTGTTACTGAACAATATAAGGAAAGATGCTTGGACGTGTTTCTCTTATAGCTCCATCTCTGCTACTCTCCTCGTAAATAATTTTTGTTGGACGTAGTGCTGTCTTCCTGCTTTAGAGTAGTGAATGGTGGCAGAGTTACAAGCAACCATGTTATGGAAGTGTTAAATAAATTGTATCATGATATGTCAGGATGGCTATTGAATATAAGAAGCTTAGTCATTGGGTGTATCTTACAATCCTTGAGATTGTTCAACAATGAAATCTTTTTTGGACAGCAACTCATGAAGAGTCTTGAAATCATTTTTATTTTCTAACGTTGAAGCTGCAACTCCTTTTTCATGCATGGTTTGAGTTTCATAATTAGATTCATGTCAAGATGGTGATTAGAGGTGCCACTATTCACTTGTACTTTGTACTCTAATTCAGTGATCTGGAATATGTTAAGCCACCTTTTTTCCTATCACTCAAATCTATTGGCTGATAATTTAGTATCTCAATTTCTGAACTAAAAGGTATCTGGCGATTGTACATATTTCGATTGCAAGAGAATGCCAATGATTTTGGAGACAGAAGCAATCAAAACTGTTCCAATTGGTGCGCCGATTTCTCACTGTGATGTTGTGGTTGTTGGTGACAATGATGGACTGGACCAGGGGGAACTGTGTGTTGGTGGTCCCTGTGTATGCAGTGGATATTATTCAGATTCTGCTTTTATCCCTTTGGATGGTATAAAGTTTTCTCAGGACCTTGTTCATGGAGGTTCACCCAATGCAAACTGTAGTCAAATTTATATCAGGACCGGTGATTTTGTCCGACAGCTTCAAAGTGGTGACTTGGTGTTCTTGGGGAGAAAAGATCGTAGTATCAAAGTTAATGGGCAACGTATTATTTTAGAACAGATTGAGGATGCTTTAAGGGAACATCCAGATGTAGTAGATGCAGCTGTTGTTTCCAGGAGAAGTGATTGGGAACTTGAGTATCTCGTGGCATTTCTAGTCTTAAAAGATAACAAGAAAAGTGAAGTATTCAGATCCACTGTCAGAAGTTGGATGGTGGAAAAAGTTCCATTGGCTATGATTCCAAACAGCTTTTTCTTCATTGATTCAATTCCTATGTCATCCAGTGGAAAAGTTGATTATGAGATCTTGACGCATTCAAGACCTCTTCAGGAGCATGTGCATGAAAATGTTGATGAAACTTGGGCAAATGACTTCATTCAAGTCATAAAAAAGGTGTGACCCCCACCATCTTAATATTTCGAGACTCGTTGCTTCATTTATAGCATCTTGTGAAATGGACATCGGAGTATGTTCTCTATATAATGCACACTTTTTTCAACATCTATTCTCTTGTATTGCAGGCCTTCTCTGATGCTTTAATGGTTGAAGAGATCTCTAGTGATGATGACTTCTTTACGATGGGTGGTAACTCTATAACTGCAGCGCATGTTTCACATAGATTAGGGGTTGATATGAGATGGCTGTATCACTATCCAAGTCCAGCTAAGCTTCTTATGGTTCTTCTAGAGAAGAAAGGATCACATATCATAGATATAAATGGGGATGCTGACACAAGAAAGAACCTCAAACCTGGCAGGTGGAACAAGTATTCTTTGGATGATTCTGAGTTTCTGAACCCTTTTGATCTTAAAGAGGGTGGGAATTCTGGAAAAAGGAAACAAGTTCAACCAAATGATGGTTTTTCAAGGGCAGTCACACCAAGGAATGACAATTCTTCAGTGTCAAAACACTATAAGGTGGCTTCTGATTTTTTTATCAATTTGGAAGATATAAATCAAGTTGGTGGGCACCTATGGAATTCTGCTTTAACATCTGTGTCGTGTGCACTCAGTCGATGCAACAAGGTTGTGTATGAACACAAGTATGTTGGTGATACTGAATGGGCAGAAAATTTGTCGGTAAAGTCCCCAAGAGGTGCAAAAGGTTCTATGAAAAAACTATGGCAAGTTCATATGGAGTCTTGCGTGGATGCTTCACCACTTCTTGTGTTTAAACACCCCTATGTCTACTTGTTTATTGGTTCCCACTCACATAAGTTTGTCTGCGTGGATGCAAAAAAGTAAGCAGCATTAAGGAATCAGCACATGTGTATGCGCTTTAATGTAGTAAGCCAGAGTATTCCTTCTATGTTATGAATACAGATGCCTTTTTTCCAATGAACTTTTATGTCTGGCCCCTTTTCACTGTGTATATATATTTGTACATATGTTAAGCGTTCCTCTTTTCTTTGTACTTCACATACATCTTCAATAACAATTCCTATTTTCCTTTTATGAAAGAGTGCACACTCTATAATTACTAGTTCATTTTTATTTGATTTACTGAAGTTAAACTTTTATTGCATAACTGTCTATAGTGCTTCTCTTCAATGGGAGATAAGGCTAGAAGGACGAATTGAATGTTCCACGGCAATTGTTGGGGATTTTTCTCAGGTTATCTCACTATTGTGATACGGTCACTAGGCATAATATTTAATTAAGCTTTTATCTTAGAAGGAATGTATATGTTTATTTACTATTCTTGGACACTTTTTAGGTTGTAGTAGGATGCTACAAAGGGAAGATATATTTTCTCGAGTTTTCCACTGGCATTATCCAATGGACATTCCAAACGTGTGGCGAGGTAAGGAAATTTATTTACATTGACAAACTGGTCAATGATCAAGCACGACAGTTCTGTCAAAGATATTA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Homology
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BLAST of CmUC06G116290 vs. NCBI nr
Match: XP_038907107.1 (putative acyl-activating enzyme 19 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2177.5 bits (5641), Expect = 0.0e+00 Identity = 1073/1202 (89.27%), Postives = 1110/1202 (92.35%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. NCBI nr
Match: XP_008457167.1 (PREDICTED: putative acyl-activating enzyme 19 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2164.4 bits (5607), Expect = 0.0e+00 Identity = 1058/1200 (88.17%), Postives = 1111/1200 (92.58%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. NCBI nr
Match: XP_011649066.1 (putative acyl-activating enzyme 19 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61446.2 hypothetical protein Csa_006655 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2153.6 bits (5579), Expect = 0.0e+00 Identity = 1053/1199 (87.82%), Postives = 1109/1199 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. NCBI nr
Match: KAA0039622.1 (putative acyl-activating enzyme 19 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2124.0 bits (5502), Expect = 0.0e+00 Identity = 1042/1200 (86.83%), Postives = 1095/1200 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4K1G2 (Putative acyl-activating enzyme 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g35930 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1076.6 bits (2783), Expect = 0.0e+00 Identity = 547/1071 (51.07%), Postives = 719/1071 (67.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RG49 (Beta-alanine-activating enzyme OS=Danio rerio OX=7955 GN=aasdh PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 300.4 bits (768), Expect = 8.9e-80 Identity = 288/1160 (24.83%), Postives = 504/1160 (43.45%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80WC9 (Beta-alanine-activating enzyme OS=Mus musculus OX=10090 GN=Aasdh PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 283.1 bits (723), Expect = 1.5e-74 Identity = 301/1148 (26.22%), Postives = 486/1148 (42.33%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4L235 (Beta-alanine-activating enzyme OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AASDH PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 282.3 bits (721), Expect = 2.5e-74 Identity = 297/1143 (25.98%), Postives = 502/1143 (43.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O30409 (Tyrocidine synthase 3 OS=Brevibacillus parabrevis OX=54914 GN=tycC PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 2.4e-53 Identity = 164/582 (28.18%), Postives = 280/582 (48.11%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5K0 (putative acyl-activating enzyme 19 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496907 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2164.4 bits (5607), Expect = 0.0e+00 Identity = 1058/1200 (88.17%), Postives = 1111/1200 (92.58%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T829 (Putative acyl-activating enzyme 19 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold744G001020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2124.0 bits (5502), Expect = 0.0e+00 Identity = 1042/1200 (86.83%), Postives = 1095/1200 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C662 (putative acyl-activating enzyme 19 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496907 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2116.7 bits (5483), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1200 (86.58%), Postives = 1091/1200 (90.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5U9 (putative acyl-activating enzyme 19 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460304 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2091.2 bits (5417), Expect = 0.0e+00 Identity = 1032/1201 (85.93%), Postives = 1092/1201 (90.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZG8 (putative acyl-activating enzyme 19 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498993 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2087.0 bits (5406), Expect = 0.0e+00 Identity = 1027/1201 (85.51%), Postives = 1092/1201 (90.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. TAIR 10
Match: AT5G35930.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 1076.6 bits (2783), Expect = 0.0e+00 Identity = 547/1071 (51.07%), Postives = 719/1071 (67.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. TAIR 10
Match: AT3G21230.1 (4-coumarate:CoA ligase 5 ) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 6.4e-17 Identity = 117/494 (23.68%), Postives = 201/494 (40.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. TAIR 10
Match: AT4G19010.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 3.2e-16 Identity = 113/492 (22.97%), Postives = 204/492 (41.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. TAIR 10
Match: AT3G16170.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 1.6e-15 Identity = 118/525 (22.48%), Postives = 206/525 (39.24%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G116290 vs. TAIR 10
Match: AT1G20510.1 (OPC-8:0 CoA ligase1 ) HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 3.9e-14 Identity = 82/365 (22.47%), Postives = 154/365 (42.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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