
CmUC06G109060 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTGAGCCTGCCATCATTTATTCCTTCTCTACTTTTCTTTTTTCTCTGTAAGATTTTCCATTTCCATTTCTCACCATCCCCACAACCCATGTTCTTTGTTTAAACTTCTTCAAACATCTCCTCTTTGTTCCCTTCAAAAAATGGGGGTTTAAATTCCTCCAGAAATTCCCAATTTTTCTTTTCCTTTTTTCTTTTTTCATGGTGTTTTTGCAGAGAGGTGGAGTATTTGTTTGTGTCTTTTTGTGTAAATTGCTAAATGGGTTTGTAAGTGTAAGTCATTTTCTCATCTGGGTTGGTGAGTTTTCTTGTTTTTCCCTGTTCTATTCATAGCTGTACCCCTCTTTCTTTCTATTGATTCTTCATCGATTTTTGAGAGCCATTTTTTTGTTTAATTTCGTGGGTGGAACCATTACTGCTTGATTTCTACTTTTTTTTAGGAATCCCGTTTAGGTTCACTGGCTTTTCTCCTGATTTGAAATAAACTGTGTGTTCATTTTTGAGGTAGCAATTGGTGAAACCTACCAAATCTGAATCCTGTACTATGCATTTTATTTGCTGGAGTTTTGTTTGATTGAATTTATATTTGGTAAAGATTTTAATCTGGTTCTAAAGGGTATCTCCAATTTTTCCATTTTTGCAATTTCTCCTTCTTTTGATTTGGATCCCCACACTTCGCCATTGGCGCTGAAAGAAGAAACTCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTGAAAAAGGGGTTGAGATTTCTGGGGTCTTCTTCAAATACTGCCTGGTTTTCAGAGTGATGCCTTCTGAAGGTGTCCAACAATGGCGAATCTCGTTCCTGGAGTGCTTCTCAAACTACTGCAGCACATGAACACAGATGTGAAGGTTGCTGGAGAGCACAGGTCGACGTTGTTACAAGTTGTGAGCATAGTTCCGGCACTGGCCGGCGGCGATCTCTCACCGAATCAAGGTTTTTATCTCAAAGTCTCTGATTCTTCTCATGCCACATATGTCTCACTCCCTGATGAACATGGTGATCTGATTCTTAGTGACAAGATTCAATTGGGTCAGTTTATTCATGTCGAACGGCTTGAGGCTGCTTCACCAGTCCCCATTCTTCACGGAGTTCGACCGGTGCCCGGTCGACACCCTTGTGTGGGGAGCCCTGAAGATATTGTTGCTACTCATTCTCCTGGGTTTCTTAACAATAATCCTAATTTGAAACCTTTGGACAAATTGAAACCGACCCCAAAAGTTTTAGGCCTCAGCATTGGTGGGGAGAAGGAGAAATCTGCGCCTGTGAGACTCAATGGCAATGCCAAGGAGGATAAGATTGACAAGAGAGCCTCACCCTTGAGCAGATCCAAGTCTCAGGCGTCAAAATTGACAGTGAATGTAGATGTGAAGAAGGAGCCTCTGACGAGACTAAAGTCGATGAATTCACGGTCGATACCCTCATCTCCAACAAGCTGTTATTCATTGCCTTCTTCATTTGAGAAGTTTGCCAACAGCATTAAGCAGCAGGGGAAGGTTAAGGCGTTGGCTAATGGAGCGATAGGAGCAGTTGAAAAGTCGAATCCTGTTCGTTCAGCCAGTCCTGTCCCCAAGAAAATGGGAGTGGGACATCAGATCAAACATTTAGTTCAGGGCATTGAGGTTGGGGCCAAGGCTCTGAGGAAGAGCTGGGAAGGGAATATGGAGACCAAAAGAAGAGACAATTCGATATTAAGAGCAAGCAAACTTGATCTCAAGCCTGAAGCTCGGGTTACTGTAAGTTTTATCATATCCAATATGATCCTCGTTTTGAATTTGATTTGTAATTAATGTGGCAAATGTTCATTTGTCCTGCTAAAATGTCATATATATACATTTATGCTTGTAAGTTGTAACCATGAATCACTTTTGAGGTATTTGGAAAGCAAAATGATGTATGACATTCAAATCCTGCACTTCATGTGATGAGCTTAAAATATCCCGCTAAATCCACTGCCTTATTTCTCCTTTTCATATAATTTTGTATGTCTTCTATAAAGAGCAAATTAACATATTACATTGTTGGACTAATCACACTGTTAATTTGTTCACTAGCATCTTCCTCTCGACCTCTTCTCCTTTATCTTATGTATGCCAATAACTTATTTATATTTTTCAGACTCCTAGAAGAAGTACATCAAGTGAAAAGTTGCCATCAAGAGAGGAGAATAGGATTCAGGTGCCTGCAAACTCATCTAAAGATGATCATAGCTTGCACGCATCTTCAAAGAAGAATGCCGCTAGTGGAGCTTTAGATAATCAGGAAAGGTCAAATAGACAAAAATCTTCTAGTGGAAGGAAATCCTCCTCAAGTGATGCAGCCGGATTCCCCGGAAACTTGGTGAAGATTCCTCTTAGTCATAAAAGATTGAGTGAAGGGAGTATTTCATGGGCTTCACTTCCATCCTCTCTTGCCAAGCTTGGAAAGGTATGGAATCTCTGATCAGATATTTTGATAAGCAAAGATAGCTCTTTTAACTGGTAGTTACTTAATAAATCTTCTGCCGAATAGATAGTTTGGGAGTTTATATGAGCTTTATTTATTCTCTTTTCTTGTTGTTTCTTCAAAATTTTGACTCTATTGTACATTCCCCGGTCCAGTGGAAACTATCCATATTCTTGATGCTGTAACATATTTTCCTTTTCTTTCTCAAAATTACAAGTGTCAATAAGGTTTGCACAAGGGCGTGTCTGAAATTTAGAGCTCTTCTATATCCAATGACACCCCTAGTAGAGGGATACGGTAATAGTATAAGCAATGTAGTACAAAGTGCAAGTAGAACACATTTCTGCAATATAGAGCAATCACTATTTCATAATCTAGAAAAATCCTTTCTCATTTCTCTTAATGAAAACTCAGTTTCTTATACAAGAAAAGAAAAGGAGAAAAGTAAATGGATCTCCTTTTGCATTTCAAAGTAATGGCAAGTGTTACTTTATGTCTTCCGTTTGTCTTACTTCTTCCCATTGTTCTTCTGTGTCTGCCACAATAGGAAGTAATGAGGCATAGAGATGCTGCACAAGCAGCAGCTATAGAGGCTATTCAAGAAGCTTCGGTGGCAGAGAGCTGTCTACGATGTTTGAGGTATGAAAGCTTACCCAGTGCAAGACTTCTAGCTCTTTCTGATTTGTAGTTCTATAGTCGAAATGCAAGCAAAGGTTCTTTGGCTGAAAGCTGCAAGAGGTAATTATAGGACATTTGGTTAGAAAAGATTTGAAGAACGTAGCAGCGTTTATAGAGAGCTTTTGGATAACATAGTTTTGCCACCTCCCTTTGGAGCTCTTGCTCCAATGAGCTCTGTATTGTACCTCTCCCCATCACTTTATTTTTAAGAGAAAATATTTGTTTCTTATAGAATGAGGCACGAAAATACATTGGAACTAACTGAGTTATTTCATGTTTGGACATATTAGGCGTGAGTTGTAATTAACTTTGACTTGGCTTCCTGTTTTAAAAATTACTTTTAGGATTTTACCATTTACTTTCAGTCCCATAGGATGCATCATTATGTGTGTCTATTACCCAGCCTTTGATTAATTATGAGCTTGATTTGATCTTCTTGGACTGGAGTCCCTTTCTGTAATTAGTATGTGGACCCCTTTTTTAGACTTTTTTTTGTACGTCCTTGTATATTCTTTTATTTCTCTCCATGAAAGTCGGTTTCTTAAAAATAATTATAATAATAATGAATGAATGAATAAACTCAAAGGAGTTATCTGGTTAGTAATAATAATGAATGAATGAATAAATTCAAAGGAGTGTTATCTGGTTAGGGGTTACCAAGGCTTTAAAATTCTATCTTGTCTCACTCTTTTCAATTTTTCTATTCTGGTTGTTTACTGATATCAAAATGTCAATTTTATTGATATGGAAATACTTCACCAAATTTTTGTTCTCTGTACCCAAGAAATGGATGTGGAAAACTATGGAGAAGTATTTCTTTTATAAGTTGTTAGGAGGTGTAAGCAACCATTGTCAATTAGCAATGCCGATGGCAACAATAGTGGGGAGGTGAATGCTGGCTGTGTAATGAGCTATCTTAGTGAAGTATGGAAAATGTCTTTAGTATATCCTCAAATTTATGTGTAGTAACTCTATAATAATCCTGAAATACCATGAAATCAATTATGGAGATTAGAATAAAAGTTAAAAATAAGCAGAGTTAAATAATAATTTTTTAACAAAGGTTATCTGTCCGTCAAATTCTTTTTTCTTATTATTATATTTTTATCTTTATTTTTTATTGAACTAGGACATACAAAAAACCAAGCCCACACAAAGAAACCCACTAAAGAAAGGATCTCCAACTAAGTAAGATATTGTCTAGGGAATAATTACAAGAAGTCTTTGAAATCGAAGTCCAAAGAGTACATCGGATCTGCAACCCTTTACCAATTACGTGGTCAATTAAACTAGTGTCTCTGGTTAAACTCTGATTAAATTGCATAGTTAAAGCTATGCGCCAAGAGTTTTCTAGTTCCAACCTAAAGAACAACATGAATGTGCCCCAAGTTTCAGATCTGTATGCAAGTCTTTGTAGAATTTTACATTTGACTTTCAGAACACAGAGCCGCTTAGTTCAGGTTTCAGATGGTTGCCTGTTGGATTCCCTTGTTTCTTTGTACCTTTCTCGCTCAGTTCTTCCTTTTTTACCTCACTTTTTGGACATTGACATTAGCAGCTGTGCTACCTTTGTGTAATATACAGCAAAATGTACCTTTAAGACATTAGATGCTGGGCTTGTCATATGGTTTAACTGTAAGAACTTCTTTCGGATGGATGCTCAGTCTCTTGGCTGGACGTGTTGTGTGTCCATCTCCTTATATCTTTTCAATAAGAAGAAAATTCCGGGTAGATGGATGAGTCTGATTGTAAGCAATGAATCAGGCGCTTGAAAATGGGATACTTTCTCACTGCTTCTCACTATCTTAAGTTTTCTCTGTGATCTGTCAGCTGGGTTCAGTTTGTTTTT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MANLVPGVLLKLLQHMNTDVKVAGEHRSTLLQVVSIVPALAGGDLSPNQGFYLKVSDSSHATYVSLPDEHGDLILSDKIQLGQFIHVERLEAASPVPILHGVRPVPGRHPCVGSPEDIVATHSPGFLNNNPNLKPLDKLKPTPKVLGLSIGGEKEKSAPVRLNGNAKEDKIDKRASPLSRSKSQASKLTVNVDVKKEPLTRLKSMNSRSIPSSPTSCYSLPSSFEKFANSIKQQGKVKALANGAIGAVEKSNPVRSASPVPKKMGVGHQIKHLVQGIEVGAKALRKSWEGNMETKRRDNSILRASKLDLKPEARVTTPRRSTSSEKLPSREENRIQVPANSSKDDHSLHASSKKNAASGALDNQERSNRQKSSSGRKSSSSDAAGFPGNLVKIPLSHKRLSEGSISWASLPSSLAKLGKVCTRACLKFRALLYPMTPLVEGYGNSISNEVMRHRDAAQAAAIEAIQEASVAESCLRCLSIFSELNTAAKEDNPQPAVEQFLTLHASLTNAHMVAESLSKTSLSGSTNESEETASEETMKVTLMARKQASAWVQAALATNLSSFAVYSRDPSLALNPTPTLSLSQNQKSASANQPIVVLENASKNSSSKSQGKVRQTISSKPIGSGNQSRTKEGVTLGQKVQPQPPPEWVRGNGLDEAVDLAEMLRLQSQDWFLTFMERFLDAGVDTAALSDNGQLAGILTQLKSVNDWLDGIASTKDEGDTTHISTETIDRLRKKIYEYLLMHVESAAAALGGGSQPLPQQIQATETKARSFCIGSRHTVIDEKWPLLGGRYVMLVQTFREPKGEFSICFFVSIPMPLPPKLSRQLHRDSDVTEMPSNSLWVGNLSTDVTDADLMNLFAQFGALDSVTSYSSRSYAFIFFKHMEDAQAAKEALQGFFLRGNSIKIEFARPAKPCRNLWVGGISPAVSREQLEEEFSKFGKIDDFKFLRDRNTAFVEYVRLEDASQALRMMNGKRIGGDQIRVDFLRSQPVRRDQWPDTRDGHGQLQGRNVGMGDFQSGYKRPLHAQSSEMRRDGPPSKVLWIGYPPSVQIDEQMLHNAMILFGEIERITSFHSRHFAFVEFRSVDEARRAKEGLQGRLFNDPRITIMFSNSDPGPVKEHPGFYPGGKEARPDMFFNEHQIRPPQMDLLGHPHPLVQNKFPGPLPSSGILGPNTAVRPPPFGPPQGISGPPEFNDLATSHSFQDANSKNMMGPNWRRQSPPAPGILSSPATGIRPPPPVRSTPNSWDVLDVNQFQRDSKRSRIDGPASLDDASFPPRKLDNRGMGFDQQYGVGPISDGGSSVPYANAPAKAPAIPIGARAPVSGPGQSHAENDFIWRGIIAKGGTPVCHARCVPIGEGIGSELPEVVNCSARTGLDQLTKHYAEATGFDIVFFLPDSEDDFASYTEFLRYLGAKNRAGVAKFDDGTTMFLVPPSEFLRKVLKVSGPERLYGLVLKFPQVSISEPAPQQSYLPIPTSDYGERQHVLPSQTEYGSVPSKQEQLPPMDYSRVLHDETKEPPKPLLPTSEPPPLAVQPLPQEYSGNNNTAAISQAGLALTPELIATLVSLLPGKTQSSSLESAKQPAVSPQPPIPPVVSNKGATSEGWMVGHQSSDLTGQPFQQMGNHFNPQGQSLSQFQPYPPLHQTPNQLAPQAIGTSQIQDAAVSLPQQQQVPIPYRPLSTYSAPPENAQASGLALVNSQYQHDVSQISQRGYGSVNGVDTSGYGPPVMQQSTNTVTLSNQGQGSTTQSQPITQLASDRVNPPELPYQMQHLQSANLGTGSGTSDVEAGKDQRYRSTLQFAANLLLQIQQQQQQQQQQAGWGSGNQ Homology
BLAST of CmUC06G109060 vs. NCBI nr
Match: KAG6575374.1 (Flowering time control protein FPA, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2912.1 bits (7548), Expect = 0.0e+00 Identity = 1542/1834 (84.08%), Postives = 1628/1834 (88.77%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. NCBI nr
Match: KAG6592979.1 (Flowering time control protein FPA, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2890.5 bits (7492), Expect = 0.0e+00 Identity = 1523/1826 (83.41%), Postives = 1591/1826 (87.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. NCBI nr
Match: XP_038875816.1 (flowering time control protein FPA isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1944.1 bits (5035), Expect = 0.0e+00 Identity = 968/1009 (95.94%), Postives = 988/1009 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. NCBI nr
Match: XP_038875817.1 (flowering time control protein FPA isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1935.2 bits (5012), Expect = 0.0e+00 Identity = 966/1009 (95.74%), Postives = 986/1009 (97.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. NCBI nr
Match: XP_008460035.1 (PREDICTED: flowering time control protein FPA [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1917.1 bits (4965), Expect = 0.0e+00 Identity = 960/1013 (94.77%), Postives = 979/1013 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LPQ9 (Flowering time control protein FPA OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FPA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 1.8e-188 Identity = 435/1013 (42.94%), Postives = 571/1013 (56.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q01085 (Nucleolysin TIAR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIAL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 1.9e-17 Identity = 76/298 (25.50%), Postives = 134/298 (44.97%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P31483 (Nucleolysin TIA-1 isoform p40 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TIA1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 89.0 bits (219), Expect = 6.1e-16 Identity = 72/291 (24.74%), Postives = 128/291 (43.99%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52912 (Nucleolysin TIA-1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tia1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.4e-15 Identity = 91/385 (23.64%), Postives = 157/385 (40.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P70318 (Nucleolysin TIAR OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tial1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 3.1e-15 Identity = 74/313 (23.64%), Postives = 129/313 (41.21%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCU3 (flowering time control protein FPA OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498972 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1917.1 bits (4965), Expect = 0.0e+00 Identity = 960/1013 (94.77%), Postives = 979/1013 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TAF7 (Flowering time control protein FPA OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G001090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1912.9 bits (4954), Expect = 0.0e+00 Identity = 957/1013 (94.47%), Postives = 978/1013 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KEU8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G081470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1899.4 bits (4919), Expect = 0.0e+00 Identity = 951/1011 (94.07%), Postives = 971/1011 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVF4 (flowering time control protein FPA OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014648 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1835.8 bits (4754), Expect = 0.0e+00 Identity = 926/1012 (91.50%), Postives = 960/1012 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GNJ7 (flowering time control protein FPA-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456063 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1824.7 bits (4725), Expect = 0.0e+00 Identity = 925/1017 (90.95%), Postives = 957/1017 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. TAIR 10
Match: AT1G08760.1 (Plant protein of unknown function (DUF936) ) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 5.1e-191 Identity = 427/811 (52.65%), Postives = 543/811 (66.95%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. TAIR 10
Match: AT2G43410.2 (RNA binding ) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 1.2e-189 Identity = 435/1013 (42.94%), Postives = 571/1013 (56.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. TAIR 10
Match: AT2G43410.3 (RNA binding ) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 1.2e-189 Identity = 435/1013 (42.94%), Postives = 571/1013 (56.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. TAIR 10
Match: AT2G43410.4 (RNA binding ) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 1.2e-189 Identity = 435/1013 (42.94%), Postives = 571/1013 (56.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC06G109060 vs. TAIR 10
Match: AT2G43410.1 (RNA binding ) HSP 1 Score: 630.9 bits (1626), Expect = 3.1e-180 Identity = 420/1013 (41.46%), Postives = 550/1013 (54.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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