CmUC03G066790 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTTCACTTCTTGCCCTTCATCCCACTGCATCTCTTCCCAACTCCCCAAAATTTCACCCATCGCCCATCTTCCACGCCCTCAATTCATGCTCATCAATGGCTGAGCTCAAGCAATTTCAGTCCCAAATCATTCGTTTTGGTCTCTCTACTGACAATGATGCCATCGGCCGTCTCATCAAATTTTGTGCTGTTTCCAAGTATGGAGATCTTCACTATGCTCTTCTTTTATTCAACTCAATACCTTACCCAGATGCTTTCATTTACAATACTTTAATTAGAGCTTACTTACAGTTCCAATCCCCTAAATCTTCCTTACTTTTGTATTTGCAAATGCTTCATAACTCTGTCTTTCCCAATAAATTCACATTCCCTTCTTTAATTCGTGCTTGCTGTATTGATAATGCTGTCAAAGAAGGGAAACAAATTCATGCCCATGTTGTTAAATTTGGTTTCACAACTGATAGATTTTCGAACAACAATTTAATTCATATGTATGCTAATTTTCAATCCTTGGAAGAAGCTAGAAGGGTGTTTGATTCTATTGAGTTACCTGATCTTGTAGCTTGGACTACTTTGGTTACTGGGTATTCTCAATTGGGATTTGTAGATGAAGCTTTACGAGTTTTCGAGTCGATGCCTGAACATAACTCTGTTTCTTGGAATGCTATGATTTCTTGTTTTGTTCAAAACAATAGATTTCATGAGGCATTTGGTTTGTTTAATAGGATGAGATTAGAGAAGGTTGTTTTGGACAAATATGTGGCTGCTAGTATGTTATCAGCTTGTACAGGATTAGGAGCACTCGAACAAGGGAAATGGATACATAGATACATTAAGAAAAATGGGATTGAATTGGATTCAAAACTTGCAACTACTTTGATTGATATGTATTGTAAATGTGGTTGTTTGGACTGTGCTTTTCAAGTGTTTACTCATTTACCTGAAAAGGGGATTTCTTCATGGAATTGTATGATTGGAGGGATGGCTATGCATGGGAAAGGAGCGGCAGCTATTGAACTTTTTAAAGAGATGGAAACCAAAATGGTGAAACCAGACAACATAACTTTCCTTAATGTACTAAGTGCTTGTGCTCACTCTGGGTTAGTCGAAAATGGTCAATACTATTTCTGTCGCTTTACTCAAGTTTACGGTATTGAACCCGGAACCGAGCATTATGGATGCATGGTTGATTTGTACGGACGAGCCGGGATGTTGGAGGAAGCAATGAAGGTCATAGATGAGATGCCCATGAGTCCTGATGTAGGTGCGTTAGGTGCCTTTGTTGGAGCTTGTAAAATTCATGGGAACATAGAGTTGGGAGAGGAAATAGGGAAGAGAGTAATAGAATTAGAGCCTACGAATAGTGGGCGTTACGTTCTACTGGGAAATCTATACGCCGAGGCAGGTAGATGGGAAAGTGTTGCAGAAGTAAGAAAGTTAATGAATGATAGAGAAGTGAAGAAGGCTGCTGGAGTTTCCATTATTGAATTGGAAGGTGTTGTGTATGAATTTATTGCAGGAGGAAGAGTTCATCCTGAAGCAAAGGAAATTTATGATAAACTTAATGAGATGTTAGAATGTATAAGAATTGAAGGATATGTAGCAGAGAATGAAACTGAAGAGGAAAAGGATAATCCTGTTTATTACCATAGTGAGAAACTGGCAATTGCTTTTGGGTTGCTCAAAACTAAAGCAGGGGAAATGCTTAGAATTACTAAGAATCTGAGGGTTTGTAAGGACTGTCACCAAGCTTTGAAGCTTGTTTCCAAGGTTTTCCAAAGAAAAATCATTGTAAGAGATAGAAATCGTTTCCATCATTTTGCTAATGGAGAGTGTTCTTGTAATGATTATTGGTAAAGAAAATATCAACTCATCTCCCCTTATCAATTCTTTGTGATTCTTTTAAGATTGCTAAGCTGTAAATGTTACCTATATTCTGTCAAACGTTGGAGTATTACTATTGACCTTTTCATAAACATTCAAAACTATCATTGAGTTGAAATTATTTAGAATTTGGAAATCAGGACTTGAAAGATGTGGTGGTGACCTAGAACGGTGTGGTGATTTAAATTTTCTTAGATCATCGCAATTTCTAAAAAATCTTAATAACACAAATCTTTTCGTAATTAGCTAAGTATGACAATGACAATACAATCCTTCGTCATTAATCTCTACTGCTCTCTTATCACTCTTGTGCATAATCGAACAGTAGTCTAACATGCGAGATCTTGCCTAAAATCCTCCCTTTTGAACAAGACAATAAATAATAAATCAATCACCATTTTAGATGTGGATTTAGAGACGATGGAATCTCTAAGATAAAAATTCAAAGAGAATTCAAAAACAACATATCTAATGACTTTTCAAACTCATGCGAATGAAACACTCTTTGAAAACTAAAAGTACTTCAATGATCAAACAACTTCAAATAAGCTAAATCAATATCGAGAACAAGCTTCAAAGCTCTCAAGACAAACAAGCTGAAAAACCCTTCGAGACAAGTTTACTTTGAGAGAGAGATTCAGAGGATAAATGTTAAAGATTGTACTACTCCTACATACAAAATCAATACAAATTCAAGTTCATTATACAAATTAAATTCCTTTGGTGAAATCTTGTGTGAGCAAACATGTTTGACATATTTAAAAAATTGATGGGCTTTGTAAACAAAAATTTGAAATTCAATAACTTTTGCGTCTAATATGTTAGTAAACTTTGTTTTTTAAAAAAAAGAAAAAAATTAGAGACTTTTTAGATTCAAAATCGAAAATTTGGAGACTTGACGCTTAGAAAGTGAGAGAATCAAATGTGTTTGGAATACATTTTCAAGTGTATAATTTTAAAAATAAGTCATTTTGGAAAAAAAAATGGAGTGTTTGGCAACCACCAAAAATGAATTTTGAAGTGTATTCTGAACGGTTTTTATCAAAAGAGTTTAAAAAAAAATGAGTTTTTTGAAAAATATATTTTTTTCTTAAATCAATCCAAACGAGCTTTATTTAACACCAACTATATATATATATATAGAACATTGATATTGATGAAATTTTTTCATTAAAAAAAAAATGATAATATATTGAATGTTTAACAAAAGTATACATTCAAAACTAACATCCACTTGCTTCAAAAAACAAAACAAAACATGCACCATAACTTTACATAAAAATAATAATATATTTTTAAAAATTTTAAAAAAAAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTGCATAGTAACTATGCGTTTGACTTTTGAAATGAATTGAGAGCTGTTCTGGATATTCCCATGTTTAAGTGAATATTCTGTTAATTCAATGAATTTTTTCCTATGTTTGGATTAAAAAAAAAAAAAAAACATATATATTCTTTCTTGCGCATTATTTTCATTAATTCTTCGTTCTTGTCAAGTTTTTTTGGTTGATATTGTATGTCTTTTTGCTTGGATTAAAAACCATATCTTGGTTGTGTGTTAGGCATAATTTTAATAATAGATCTATGATATTAATGGTGTTTGACATGCATTCATTCTCTTAAATAATTGATTCCACATCTCCATAATTGTTGTAAATCGATATCAATTGTTAAACCAAAAACATATATAACTCAGCTTTCTTACACTCAAAATTATCACAAAAACATCTATATACCTTTTCAACTACTTTATTTTTTTTTAGATTTATTTTGTTATGGATGAAATTCTCGAATAATTACATGTAGGAATTTGACAATATTATAAGAGCAAGAGCACTCCCATATAAAAAAAAGGGTTTAAAAAAGAGATGTAATTCAAGAACTATACAAAAGGAGATTAGGGTTTGGTTTCATATCATTCCCTTAGAAATACTTTAAGTTTTGATATCTTAAGTTTAGTTATTTTTTCAATATTATTATTATTATTATTATTTGTATTCTCTAGTCTTAGAGTACATGAAATAGTGCAAGTGGGTACAAAAGTTTTGAGAGAATGTTCTTGTGTAAATTTTTGTTTCACATTTTTTTAATTTCGTGATTTTTGCCTATTCCTAGGTAGAAGTGAGATTTTCTCAACAAGTGGTATCAGAAGTTTAGGTTTATAGTTTCTTGAATTTCTAAGTATGTATTATGGTTGCAATATTATTTAAATTTTCCTAGACCACCCGCTATACGATATTGTCCGCTTTGGGTTACCCCTCACGGTTTTGTTCTTGGTAGGGTTGCGCCTACCAAAAGGTCTCGTACATAGAAAGGTATCCACCCCCTTTTATAAGGAAAGCTTCGTTCTCCTTCCTAACCAATGTGGGACAATGTATAGCCAGGGTCAACGCCATAGCCCTTACAATCTCCCCCCTAACGAGTCAAGCGTCCCCGCTTGACCTACCTGAGGTTTTAACATCGATTCGGGCACCGACTCTGATATCATTTTTAACAGCCCAAACCACCCACTATACGATATTGTCCACTTTGTTATCAAGCTTTATGAGTCCAGTATAGTTTGATTGGAAGAAGTTTGGTGAAATGTTCAACTTTGACTTGGACAACTGCAAATCAAGAATATGTTAATGCAATATGAAATACACAATGTCTAGAAGGAAAGATCTAGCAATGGTATTCTTGAAGAGTTAAGCGGTGATGATAGTCTAATAGAGTATAGGAGTGATTCCAGTACATGTTTTTAAACATAGACTAAATGTTACTTGTAAATGAAGATATGGAATTAAGCCCAATCCTCACAAAATACGATTTGGGTTCATCCAATCCTTCAAAACTAGAAAATGGCAAAGCTTACCTTTTCATCAAGACGATGAAGTTAAAATTTGACATTATTGTTCAACTCGATCACAAGGAAAAACTAAAAGGAAGGCTAAAAGATAGAGAACGTAGAAGAGAGAATCTTGGAGGGGGCTAGAAGGTCAAGGAGTCTGGACTAAATTCGAAAAAGAAGTTTTTACATCAGTACATGACCATCATGATGCTACTAAAAGCATTAATCCTTAGCACCCTGCAAAGTCGAGCAA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MASLLALHPTASLPNSPKFHPSPIFHALNSCSSMAELKQFQSQIIRFGLSTDNDAIGRLIKFCAVSKYGDLHYALLLFNSIPYPDAFIYNTLIRAYLQFQSPKSSLLLYLQMLHNSVFPNKFTFPSLIRACCIDNAVKEGKQIHAHVVKFGFTTDRFSNNNLIHMYANFQSLEEARRVFDSIELPDLVAWTTLVTGYSQLGFVDEALRVFESMPEHNSVSWNAMISCFVQNNRFHEAFGLFNRMRLEKVVLDKYVAASMLSACTGLGALEQGKWIHRYIKKNGIELDSKLATTLIDMYCKCGCLDCAFQVFTHLPEKGISSWNCMIGGMAMHGKGAAAIELFKEMETKMVKPDNITFLNVLSACAHSGLVENGQYYFCRFTQVYGIEPGTEHYGCMVDLYGRAGMLEEAMKVIDEMPMSPDVGALGAFVGACKIHGNIELGEEIGKRVIELEPTNSGRYVLLGNLYAEAGRWESVAEVRKLMNDREVKKAAGVSIIELEGVVYEFIAGGRVHPEAKEIYDKLNEMLECIRIEGYVAENETEEEKDNPVYYHSEKLAIAFGLLKTKAGEMLRITKNLRVWGSDDGGSFVSDGTHGSSESHQHPQLKVPKKKRNLPGTPDPDADVVSLSPKTLMATNRFVCEICNKGFQRDQNLQLHRRGHNLPWKLKQRTSGSETKRRVYVCPEPSCVHHDPARALGDLTGIKKHFSRKHGEKKWKCEKCSKRYAVQSDLKAHSKTCGSKEYKCDCGTIFSRRDSFITHRAFCDALTEENNKLVSHQVATTMASTAINAPSFQPQPLQHLLSQTPVLSPPLTLPHDLMPIPPKPLNLSAGPMFSSSISSATDGHHFPSPSALMSATALLQKAAQMGAAVSSRGNSTPCLSSPMVHEKKGFVTTMAPSSFCGILGTNCLQKCQEENILSQLPSKGKAVDMEMIDNIPMLNGVLDDQPVVEAARKTMTLDLLGAEGGKGMKFQAQENVGFGGLVENMTYFRNQGAMGRQIWEI Homology
BLAST of CmUC03G066790 vs. NCBI nr
Match: XP_038880689.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1099.7 bits (2843), Expect = 0.0e+00 Identity = 535/578 (92.56%), Postives = 553/578 (95.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. NCBI nr
Match: TYK10244.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1089.7 bits (2817), Expect = 0.0e+00 Identity = 528/578 (91.35%), Postives = 551/578 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. NCBI nr
Match: KAE8653366.1 (hypothetical protein Csa_007505 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1086.2 bits (2808), Expect = 0.0e+00 Identity = 525/578 (90.83%), Postives = 552/578 (95.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. NCBI nr
Match: KAA0050892.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1084.3 bits (2803), Expect = 0.0e+00 Identity = 526/578 (91.00%), Postives = 549/578 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. NCBI nr
Match: XP_022138850.1 (uncharacterized protein LOC111009921 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 984.9 bits (2545), Expect = 5.0e-283 Identity = 478/578 (82.70%), Postives = 516/578 (89.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJY7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H61 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 480.3 bits (1235), Expect = 5.2e-134 Identity = 247/559 (44.19%), Postives = 349/559 (62.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FI80 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48910 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H38 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 460.3 bits (1183), Expect = 5.6e-128 Identity = 228/589 (38.71%), Postives = 356/589 (60.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN01 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 7.5e-125 Identity = 247/680 (36.32%), Postives = 365/680 (53.68%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82380 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g29760, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H33 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 440.7 bits (1132), Expect = 4.6e-122 Identity = 244/688 (35.47%), Postives = 370/688 (53.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FG16 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g06540 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H88 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 1.6e-119 Identity = 226/568 (39.79%), Postives = 340/568 (59.86%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CGC5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G003910 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1089.7 bits (2817), Expect = 0.0e+00 Identity = 528/578 (91.35%), Postives = 551/578 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LWF1 (DYW_deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G569490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1084.7 bits (2804), Expect = 0.0e+00 Identity = 524/577 (90.81%), Postives = 551/577 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U4W9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold761G00170 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1084.3 bits (2803), Expect = 0.0e+00 Identity = 526/578 (91.00%), Postives = 549/578 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CAN4 (uncharacterized protein LOC111009921 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009921 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 984.9 bits (2545), Expect = 2.4e-283 Identity = 478/578 (82.70%), Postives = 516/578 (89.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CAX3 (uncharacterized protein LOC111009921 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009921 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 984.9 bits (2545), Expect = 2.4e-283 Identity = 478/578 (82.70%), Postives = 516/578 (89.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. TAIR 10
Match: AT5G66520.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 480.3 bits (1235), Expect = 3.7e-135 Identity = 247/559 (44.19%), Postives = 349/559 (62.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. TAIR 10
Match: AT5G48910.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 460.3 bits (1183), Expect = 4.0e-129 Identity = 228/589 (38.71%), Postives = 356/589 (60.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. TAIR 10
Match: AT1G08070.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 5.3e-126 Identity = 247/680 (36.32%), Postives = 365/680 (53.68%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. TAIR 10
Match: AT2G29760.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 440.7 bits (1132), Expect = 3.2e-123 Identity = 244/688 (35.47%), Postives = 370/688 (53.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC03G066790 vs. TAIR 10
Match: AT5G06540.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 1.2e-120 Identity = 226/568 (39.79%), Postives = 340/568 (59.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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