CmUC02G033120 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC02G033120
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr02: 7693876 .. 7698049 (+)
RNA-Seq ExpressionCmUC02G033120
SyntenyCmUC02G033120
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGGTCATTCTAAGAGAAACAAGTTATTTGGGTATGTATGGATTAATAACCACTATGAAGGCTAATCTATATATAGGGTTGCTCATGGAAGTCTAAAGAGTACATGAAGGTCGATAGGTCGAACCTCATGATGGACGATATGCTTAAGTGTTTAAAAACAACTTAGTAGCTTGGGTTCGTTGATTCATAACGGTTAAGATAAATTAGTAACAATCAAATTAATTACCTCAGAGATTAGTTAGTCAAGTGACCGTTACAAAATCTTTTTTCCTATATAATGAAGAGGGCTCAAGACAATTGGGCCATGCTGAAAACACTCTAAATTCTCTATTCTCTAGCCCTCTCTAAATTGTTACTAACTTGATTGTCGGAGTGTCGATGGCCAAACACAACATTGGTGCAAGGTTTTTTCTATTTTGCATGACGATTGTTCGATTCCTCCCAAACATTACAAATTCACCGTTGGTACCAATTTTCATATCAACAAATGAAAATTATTAATTTAGACTCTTCATTATGATTACCTTTAATTTGAAGATCATTCATGCACTAATTCCCAAACGTGTATAGACTTCTTGAAATGTCGGTTTAACACAATGAATGTTTAGAGTAAATGCATGGATGATTCTCAAAAGAAATTCTCACTCAGAGTTTAAATTGATTCATTTTTTAAAAGTTTAGAGATTCAATTGATACAACTATAAGTTCGTACGATGTTTCTTCAAACATAACATAATAGAGGGTGTAAATTGATACACTTACAAAAGTTTAGAGTTTAAATTAATACTAACTCTAAAATTTATGGATATAAATTGATTTAAATTAAGAAAGAAACAACAAGGGACATTTTAATTTCCAACAACTTCTTATTCATTTATATTAGGTTAAACAACTATTTTGGTCATAAACTTTGAAGTTTGTCAACTTTTAGTCCTAATTTCATAAATCTTAAATTTAACCCCTCAAAGTTAATTTTTATCAAAATTGATTAAATAATAATAATAATTTTCATACAAATAGATAGAATATGTGAATAAGTTTTTAAAATTTATAGTAAAAATGCTAATAGATAATAAAAAGGTTTTAAAAAATCAACAATAAACTAGCATTAGAAACTAAATTTAAGATTTAATGAAAATAGATGGACTACGATTGAACAATTGAAAGTATAAAAACTTGAAATTGAACCAACTTCAAAGTGTAGGGACAAAAAATAGTATTATAACCATTATATTACAATAGAAACTCATTAGAAATCGTTTGATAACTATTTCCCTTTTTGGTTTCTATTTTTAAAAATTATATTTGCGTAGGATAAATTATCTTTAAAATGTTTTCAAAATTGACAAAATTTTAAAACTAAAGTTGAGAAGGGTTACATTTCAAATAATTGCTTTTGACTCTTCAATTTAGCTACTTGGTAAAAATTAACTAAACAAAGAGAACTAAAATGAGAACAATAGTTGTTATTTTTAACACCCTTAAATTTTATAATTTAAGAAATTATTTTATTTCACAATTCCAAAAACTTTACCATGAAACCCTATATTATTTATTGAGCACTTACAACTCTATACTTATACTTATGAGTAGTTTTTACATACCTTTCTTTTTGAAAAAATAAATTATCATCAAATAAGGTTTGTTTTTAAAACCATAAACCTATAAATAAAATTGGAGGCCTAAACTAGAACTATTGTTATAATTGTTGTGAAGGATGGAACTGATGAATTAATTAATTTCAATAAAAATGAAAAGTATCTTTCATTTATTTCGTTTAAGCCACTCAATAATACCTTTTTCAGCTTCTGAAAGTTCGTTCTTATTCTTCACTGATCCTTCAACAAACTCAAAATAATCTTTGTAATTTCTCTTGTAGTAACTCTCCAATCTCTGTTAAAATTACAATTTTTTGTATCCAATGATTAGTTGTACGACAAAAAAATATAAAAAATCGTTCTAATCATATATCTTACAGTTATAAGGGTGATAGTTACATGTCATAAACGATCACATTATCATTTTTCTAAAACACTAAAAAAAGACCAAAGTTAGCTTAGGTCAGCAGTAATTGGCATAACCTTATATCCTAGAGTTGAGTTTTAATTCCCCAATCTGACAATTGGTGTAACAACAATTTTTAACATTTTAATAAAATAAAATATAGGCGGTTACAAAAATTTTACCTCCTTCTCATTCTTTTCTTTGTTTTCTTCAGACTTCTTGAGGTACCCTAAAACAAAAGATATTTGGATTGAAAGGAAAGTAATTAGAGGAAAGTGTAGCATATAATTCATAGAAATTCAAATATGAAATTCATATACATAATAAGAAAAATAAAATGTAAATTAATCTTGATTAACTGTGACAATTTATACAATAAAATAAAATTAAAACATCCAATAATGTTATCAAGTCAATCCATTATCATAGGTTAAATTACAATTCCAATTACTAAATTTACAATTTTGTGTCTAAAATATCTCTAAATTTTATTAAGTGTCTAATAAGTCATGTACTCTTAATTTTGTTTTTAATAGGTCCCTAAACTTTTTTTTTTATGATAACATGCCTTGAACATACTAAAAAATTATCATAATGAAATTTATGTCTAAAGAACCCAAACTTTCAATTTTGTGTTAGTTTTGTGAATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTAGAATGGTTAATGATTTCTTAGACACAAAATTAAAAATTTTAAAAATCTATTAGATACTTTTCCAAGTTCATATACCTATATAGATACTTTCTAAAGTTTAAACACTAAAGAGGATGTTTGACCCACCAATTCATAAATTGGTATTAAATAACTCAACTCCACCAACTTCAACAGTGTTTATTATTGAAGTTTTCACATTTATTTAAGAACTTCATCTTTTTCTTTTTGCACATTTATCGATAAATTTTCTTTTCACACCTTTGGACTTCAAACATGACTTTCTAACTCTAATATATTAACTCCAGAGTTCATAACTCAACTCAACTCAACGACCCTAACACTCTCTAAATATATAAAGATTAAAAATATTGTAAACTAAACTTGTAATTTAACTAAAACTCTAAAAATTTTTACTAAAAAAGTCAATCAATTATTAGTCATTCTTATTCAATAATATGCAATGCTGACAAATTATTTATTTAAACAAAAAGAAACATTTTTTAACAAAATTACAAGTACATTATTATGATTTTTTGAATCTACTACCGTATGACTTTTCATAGGTAATATGTACATACCTAATTTAAAACTCAACTTTTATAAGAAATCATGAAACCGATTTGTAAGGTGGTAAAGATGGACGAAAATTATACGAAACTACATTTTCTTTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCATCCACACCCACTTATTCACTGAGTTATTTTTTAAAATAAATAAATAAATTTTGGTTTATCCACAACAGCTCCGATATTCTTGAAAAAAGGGAACAATTGGAATGGGATAACAAAAATAGATGAACTCATTGCGATACTTCTCTCAAAATTAATTAAAACTTTCTTTAATACCATTCAAAATTTTCAAAAGCAGAACTAATAAACTCTAAAAGAAAAAAAATCAAAATTTTGGGAAGAAAATTAAGATTTTTTTGAGTAAAAAAAATTATTATTTTAAATAACAAAATTATTAAAAATATTAAAAATATAGTAAAATGTTACGATCTATTAATTAGTGATAGACAATAATAAATTCAACGATAGATATTGATATCTGATAATATTTTTTATATTTGTAAATATTTTGACTTATTTTGTTATATTTAAAAGCAACTAGAAGATACAAATTTGAGGAAACGAAATTAAAACTCAAAAAAAAGAACAAAGAGAAGAATGCACCACTTTTTAGCAGCTCGGTTCTGGAGTCCACGGCTTCTTCGGGAGCGGCAGCCACGGCGGCAATGGCAGACAAGAGGAGGCCTCTTCTTCCATTTGCAGAACCGGCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGTGCGAGGCTTGTTGGCTTGGTTTCTCTGAACGGATTGAACGTTGGAGGAAGCGAATTTGTTGAGAGTGACGGCGAGGGCCATCAGAATGCTTTGGCCGATGGAACTCATCGGAGTGATAGTTTTGAGTTTGAGGATGAGGTTGAAGAATAG

mRNA sequence

ATGGACTTCTTGAGGTACCCTAAAACAAAAGATATTTGGATTGAAAGGAAACTCGGTTCTGGAGTCCACGGCTTCTTCGGGAGCGGCAGCCACGGCGGCAATGGCAGACAAGAGGAGGCCTCTTCTTCCATTTGCAGAACCGGCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGTGCGAGGCTTGTTGGCTTGGTTTCTCTGAACGGATTGAACGTTGGAGGAAGCGAATTTGTTGAGAGTGACGGCGAGGGCCATCAGAATGCTTTGGCCGATGGAACTCATCGGAGTGATAGTTTTGAGTTTGAGGATGAGGTTGAAGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACTTCTTGAGGTACCCTAAAACAAAAGATATTTGGATTGAAAGGAAACTCGGTTCTGGAGTCCACGGCTTCTTCGGGAGCGGCAGCCACGGCGGCAATGGCAGACAAGAGGAGGCCTCTTCTTCCATTTGCAGAACCGGCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGTGCGAGGCTTGTTGGCTTGGTTTCTCTGAACGGATTGAACGTTGGAGGAAGCGAATTTGTTGAGAGTGACGGCGAGGGCCATCAGAATGCTTTGGCCGATGGAACTCATCGGAGTGATAGTTTTGAGTTTGAGGATGAGGTTGAAGAATAG

Protein sequence

MDFLRYPKTKDIWIERKLGSGVHGFFGSGSHGGNGRQEEASSSICRTGGGSGGGGARLVGLVSLNGLNVGGSEFVESDGEGHQNALADGTHRSDSFEFEDEVEE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 34..48
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 74..104
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 26..49

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC02G033120.1CmUC02G033120.1mRNA