Clc11G13070 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTGAGTTGTAATAGGAAAAATAAAAATAAAATAAAAAAACGAAGCAATTCATTTGACAATCGATGGCGACTTCGACACTGGGCGGCACCATAGGCTTCTCCCAGCCCTCGTCTTCCTCGCATATCTCAGTTTATTGCATTCCCTTTTCAACCAGCAGATTCAGTTTCTCGAGGACCATTCTTTCTCCTCTGAAGCTTGAAAAACCACCATCTGGAAGAAGAGCCAGAGCTGTAATTGCTGTGAAAATGGCTGCTGAGTATGTTTACTTCTTCCCTCCTTTCTTTGCTGTGTGAGAAAATGGAGGACCTCATCTATGTGTGTGCTCAAAGAATTGATAAAAGAATTATTTCCCTCCTGTCTCTCATATGAATTGAGTTGACTGCACGAAAGAGGTGTATGTCCAAAAACTCTGGTGCATGAACTCGATGTAACAGGGTTGGTATGCATGAAAGTGATTTATACCTTGAGAGGCTCGGGGTGTATGAAAGAGATGCACGTTCAGTGGGTTATGTATATTTGAAACAAATGTATATTGAACTATGTGTACAGAAGAGGTGCACATCCCGAATTGTTAAAGAGGAGTGGAAAACAAGGAAGTAAATTTTAGGTACACCATAGTAATTCTTTGTATAGTCTTGCTGATTTAATATGTGAGGTCTCTTTCTGAGTATATTAATACTCACCCCATTTTTTCTAAATGTTGTTTCAAGTAAAAATAAAGCGAGCTAGGCGACCGGTGGGGTTTGTTCAAGGGGCCATGGAAGATTGTTTGTTTTTTATTTTTTATAATTTCGTTTTGAATTATTTCTTCTGCATTTAAATTCAAGTTTCTTTTTCTAGAAGTTCATCAATAAGTTAGTTAAGACTGTTGGATACTTTATGTTATTTTTGTCACCAATTTTGTTGCATGGTTGGTTTATGAACTAAGTCTTCCTTGGCTACAAATTTTGAGGTTTTTTGTTTAAAGGTGATGTATATTCTTCTACGACCATGTGTATGCATGTATGAAGATGATGGCCCGGCCTCTGAATCATAATATCCTGAATCAAAGGCTGGTTGCATCATTATCAAACTAGCATAACCAGTTTGGCTCTACGTCTGCGTCATAGGAGGCAAGCCCAAGTCCAATTTGTTAGGCCCAAGGGCCAGATACATGGACCAACCAAAGCCAAGCCCACAAAGCCTACCTGATAACTCTACGAAAAGAAGAGTTCTCTTCATTTGTGGGGTTTAGAAAATTTTACACTTCAAAGAGTCGAGAGAGAATTCTCCCTACTTCAAGAAATTCCTCCAACTTCAAGAAATCTCATGCGTTCCGCTTCTACACATGACTCCAACTTCAAGAAATTTCACGCGGAAAGCTAGTACGTAGTCATTTTTTTTTCTGCCCCCAATCACATTCCAGCCAACTACTCCTACCAAAGCGTCCATCTCTTGGTCTCTTCTTATCTTGCTTTCTCACAAGATTAAGTACGAGGCTTACAATAAGCATAGTACCATTAGAGAGCTTCTCACTACTGGTGCTGTTAAAATGGATCATATAAGTTATTAATCGTGCATTTTTATTACGAAAATCACTCCAAAAACCAGAGATAGCCCTAAGTTATTAATCAATTTCATTCTTGAATTATCTTACTCATGCAATGTTGTAAAAGGGTTATTCTAAACAACCTAAAATTTATAGACAAGCATGCTTTGAATTTGTTACTTTGCCATCAACACATTTGTACAAAATATATTATGCATTAATCCTTAGCTCAAGAGAAGTTAAAGCGCACCCAAAGCCTTGGATTTTGCTACTTGGTAATTAATACATTTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATAGTGATTTGGTCCTAATCAATGGAAAGGATTGAGTTTGCTCTTGAACTTGCAAAAAAAGTAGTGTAGTGGTTTGACTCTAAGCCATGGAAAGAGTCAAGGTTGCTAGTGACATACCCAAGAGGAGCTTGGAAAGTGGATGTAGCCGAATGTGCGTATAAAATCATTGTGTCATTTTCTCTATCCTTCTCCTAAGTTATTTTTGCAATTAATTTGATATTATATTTTATTGCATGAAATTAATTACAATTTTTAATTCTTGAAATCAATTACACATATTTGTTTATTTTAATTGGAAGTTCTTAAATTTTTATATATTTTACCAATCTTACTATTAGAATTAAATAGAATGCTATAAAGTATTAGTGTTAATTTATTGTCTATTTTAAAGTGAAATTATTTGCATAAAATCCTTGTTTAAATTACTTGTTATCAAAAAATTTGTTGATTTGTTTAATTGGGCCCACATTAGGAAAAAAATTGTAATTAGTTTGAATAAATCCTATTCACAACCCTCCTAGGGTTGCTATACCGATTCTACACATCTCTTTTCATTCTTTGATGACTTAGTTTTTATATTGAAAGGTCACAATGGTTTTCATAACTGATATGAGGCAACTGGGAAGTGTAACCTGTTTTCTAAAAATAATAAATAGAAAATAGAAAACCAAAAAACTAAGGCCCCCAACTTTTATAACTATTTAGTTTTTGGTTTTTGAATACTAACAAGCTTATAAACATTACTTCTACCAATAAGTTTCTATATTTTGTTATTCATTTTCTACTTATGTGATTTCAAAAACTAAGCTAAATTTTTTTAAAAAAAAGTTCTCCTAAAAAATTAGTTTTGATTTTTAGAATTTTACTTGGAATGAAAATGTTATCTTAAGATAGATGAAGATCATAATATATAAATTATGAAAAAATAAATAAGAAAATTCCAAAAACAGACAATGAAAAAAAAAAGTTATAAAATAGGACCTAATTAGTTACCCCAACTAACCTCTTAGCTATTTGTCTAGCTTCCCCTTTGTTTTATGGAAAAATAAGACAAGCATTGTGCCAAATTGGAAAAGTGTTAACTTGATGGGCTCTTTTTATATAGGTCCAAATCTAATATTCATGCTCTTTAGTTTTAATAAGTGAAAGAATAAATATTTGGTTTTTTTGGTTTCCTAGGTGCTTTCTCTGAATGCTTTTACATTGATTATCCATCTTTATTTTGTAGGGCTATTAAAACTCTCGGGATCTGAAGATTTTCTCTCTTCATCTCTTATCTCTATTTTGCTCGGGCGTTTTCAATGGTTGGAGTGTTTGATAGCTAGCCCAACTCCTTGACTTTGGTGCAGGCTAACCAAGATCTTATTCCCACTGAAGAGGTTACTTGGATGGTCCCTCCTCTGAGGTCTTTTAAGGTGAATTCTAACGCTGCTATTGGAAGCATGCAGTGATTCCAATGGTGAGACTTTCATGGTCATAGAAAAGTTCAAGCCTTTCTTTAGTTTTGTAGAGCTTGTTGAAGTTTTGGCTCTTCATGAGGTCATTTCCAAGATGTGGTGCGGGAGAGTCATTTCGAAATTCAAATTTCTTTTTTGACAATATGTGGGGCGGGAGAATCAAACCTTTGACTTCGAGATTGATAGTACAAGGATTATGCAAATTGAGCTATGATCATTTTGGTCAAAATTCAAAATTTATATTCATATAGGTTTGTAGAAAATTAGTGGTGGGCACCATCAATATTTGAAATATAACAAATACGATAGGCCTTTTCTAAAGGTCTTGACAGTCCCATTTCATTAAGGTATAACTTATATAGAATGCTATAAAAACATCAAGAGGCTAGATCAGGCTAGCAGGTGTGAAGCATGAAGGGATTGAATCCCAATGCGAAAGCGTACAAACGCCGATGCTACTGTAACTCAATTTTGAACAAACAGAAAAAATAGAGGAAATAAACATGTAAAAGGACAACATGCTTTTAGAATAAAAATTCAAAAGAGAAGTGGATTACCTTTGAAGAAAAATCTTCAAACTTCTCCTAATCCTGATCACGAACTCAACAACTTCTTCTTAGATCTTAACGAGTTTGATTCGAACACCACCACCAAGGTCTTCCTCGCTATTCTCCGGCAATGATCGAGTTTGTGGGAACCCTTTTAGGAAGTCTAAGGGAAGAAGGAAAACTTAGAGAAAACATTTTTCTCTTCTTTTCTCAAAGAGGAAGAGAGTTGGATTTACTTCTCATAGAATTGTTCTATGTTCATCTGTTAATATCACGTTAATACCAAATCTAAGAGAAGGGAAGTAATTAACTTTCCTCTAACCCACCTTTAACTCTCCTTAACCATGGGGAGTTAATCTTAACTAAAGTTAAACTAAATTTAATTAAATAAATATTAATTAATTAAATATCATATATTAATTAATATTACATTTGAATCATACTCAAATGTATTTCTCTCTCATAACTTATAGTTTAAATATGAATCTCATTCATATTAAATTTGACCTATAGTTTTAATATGAATCTCATTCATATTATTTAATGTTTAAATCTTATTCAAATATAAATACTCTCTCATATTATATAGTTTAATTTTGAATCTAATTCAAAATTAATTTTATAATATAATGTATTTAAACACATTATGTTAAATGTATCATATACAACCAACATTTAATTCCCTTATAATATGAATCTTATTCATATTAATTTAATATTTGAATCTTATTCAAACATTAACACTCTCATAATATAAAGTATAATTTTGAATATAATTCAAAGTTAACTTTATATTATAATGTATCTAAATACATTATATTAATTGTATCTAATACAATTAATGCACTTTTCCTTATTTAATTTTAACAATTTAAATTTTATCCAAAACTAATTAATCCTTGTTTTACCTTTAGTGAGCTAGCAAGGGGACCTAATAGACTTACAAATTAATAGCTCCAATGATTCAAGATTAATTAATTAAACTTTTTATTCATTAACTGTGAGTTACTCCACTAAAGACCCACACCTACTCTATTCGCACTCTATAAATATTTTTGTATCCATAGACCCACACCTAATGGACCTACCATTTTACCTCAGTAATTGTCTCATACTTCTTTAAGTACCATTGATCTCTCTAATGA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TTGAGTTGTAATAGGAAAAATAAAAATAAAATAAAAAAACGAAGCAATTCATTTGACAATCGATGGCGACTTCGACACTGGGCGGCACCATAGGCTTCTCCCAGCCCTCGTCTTCCTCGCATATCTCAGTTTATTGCATTCCCTTTTCAACCAGCAGATTCAGTTTCTCGAGGACCATTCTTTCTCCTCTGAAGCTTGAAAAACCACCATCTGGAAGAAGAGCCAGAGCTGTAATTGCTGTGAAAATGGCTGCTGAGTATGTTTACTTCTTCCCTCCTTTCTTTGCTGTGGTTGGTATGCATGAAAGTGATTTATACCTTGAGAGGCTCGGGGTGTATGAAAGAGATGCACGTTCAGCTAACCAAGATCTTATTCCCACTGAAGAGGTTACTTGGATGGTCCCTCCTCTGAGGGTTGCATCTATCTCGGTGCTGCTTCCTTGTAACGCCGGCAACGCCCATACGACGTCGTTTCTAGCAGAGATTTTCTTCCCTTTTGACGAGTCGATTTTGAGCTGA ATGGCGACTTCGACACTGGGCGGCACCATAGGCTTCTCCCAGCCCTCGTCTTCCTCGCATATCTCAGTTTATTGCATTCCCTTTTCAACCAGCAGATTCAGTTTCTCGAGGACCATTCTTTCTCCTCTGAAGCTTGAAAAACCACCATCTGGAAGAAGAGCCAGAGCTGTAATTGCTGTGAAAATGGCTGCTGAGTATGTTTACTTCTTCCCTCCTTTCTTTGCTGTGGTTGGTATGCATGAAAGTGATTTATACCTTGAGAGGCTCGGGGTGTATGAAAGAGATGCACGTTCAGCTAACCAAGATCTTATTCCCACTGAAGAGGTTACTTGGATGGTCCCTCCTCTGAGGGTTGCATCTATCTCGGTGCTGCTTCCTTGTAACGCCGGCAACGCCCATACGACGTCGTTTCTAGCAGAGATTTTCTTCCCTTTTGACGAGTCGATTTTGAGCTGA MATSTLGGTIGFSQPSSSSHISVYCIPFSTSRFSFSRTILSPLKLEKPPSGRRARAVIAVKMAAEYVYFFPPFFAVVGMHESDLYLERLGVYERDARSANQDLIPTEEVTWMVPPLRVASISVLLPCNAGNAHTTSFLAEIFFPFDESILS Homology
BLAST of Clc11G13070 vs. NCBI nr
Match: XP_038892871.1 (protein IN2-1 homolog B [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 2.0e-18 Identity = 55/65 (84.62%), Postives = 58/65 (89.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. NCBI nr
Match: XP_031742222.1 (protein IN2-1 homolog B isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 6.6e-14 Identity = 49/65 (75.38%), Postives = 53/65 (81.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. NCBI nr
Match: XP_004143598.1 (protein IN2-1 homolog B isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN50485.1 hypothetical protein Csa_000618 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 6.6e-14 Identity = 49/65 (75.38%), Postives = 53/65 (81.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. NCBI nr
Match: XP_031742223.1 (protein IN2-1 homolog B isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 6.6e-14 Identity = 49/65 (75.38%), Postives = 53/65 (81.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. NCBI nr
Match: XP_008445827.1 (PREDICTED: protein IN2-1 homolog B [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 7.3e-13 Identity = 47/65 (72.31%), Postives = 51/65 (78.46%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KLG0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G177050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 3.2e-14 Identity = 49/65 (75.38%), Postives = 53/65 (81.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SXP4 (Protein IN2-1-like protein B OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G00210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 3.5e-13 Identity = 47/65 (72.31%), Postives = 51/65 (78.46%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BDL2 (protein IN2-1 homolog B OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488732 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 3.5e-13 Identity = 47/65 (72.31%), Postives = 51/65 (78.46%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GXY4 (protein IN2-1 homolog B isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458219 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 5.7e-11 Identity = 45/74 (60.81%), Postives = 53/74 (71.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G13070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZ79 (protein IN2-1 homolog B isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458219 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 5.7e-11 Identity = 45/74 (60.81%), Postives = 53/74 (71.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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