Clc11G00080 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc11G00080
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr11: 103146 .. 107954 (-)
RNA-Seq ExpressionClc11G00080
SyntenyClc11G00080
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCAGTTCCACAGACGCTACTTTCCACGCGTTTATTGGCTGAATAGCGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTAAAGTTTCATGGTTAAATTTGATATAATTTGTTTCGGATTGAATTTTAGTGTTTGAATTTGATTCTATTGCTTGTAGCTCTTCTGTTTTAGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGGTAAGATTTGGGCGGTAACGGTGCTTTGAGACTCTTTTGGACTCAGATGAAATGATTTAGATTAATGTCTAACCCTAGGGAATTCGTGGTTGTAGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAAGGTTTAAGGTCGTGTTTTGGTACGCCCCTCTTGAATACTCTTTTCAACTCAATTCAAACGGCTAAGTATTGCCCTTTTTGTTTAGGACTCTTTTGGGCTTAGGAGCACTGTAGGCAAGTAGAGTTTTACTTGTTGGGTCTGTATGTTGTTTGCTATTTTCCTGTGCTTTATTTGTGCTATTATTCTTTATGATGTAAATACTTGACGGTCTTAAACCTTTAGGTGCTTTGGATGTTTAAGCTTGCAGGAATGTTGTAATGATGTTGTGACGACTAACATGCTGGGGAGTGGTTGTATGACCTTGTGTTATAAGCATGTGCTACTATTGAAAATGTCTGATTAAGCATATGATTTCTGTTGAGGGTACACTATTGTTTCATGTGGTTTTTACATATAGAAGGGTTAGAATCATATTGTAGGACTCATACATTCAAATGATTGTGTGAGAAAGAAGTTTAGGGTAATTCGTGCATTTATAAAGGAAAGTGGGTGCATATCGGTGTGCCTTAGGTAAAAATGGTCATGGGGTGATATGTCGTTGTTGGTGGCATTGATGCCTTGGGTAAAAATGATCAAGGGTCTACGTAGAGGGTCTACAAAGGCAAATATTGGGGCTCTTAAGAAAGAGGTACAATATGTTGCTTATTCATTGAGACATTGGATAAAAATGGTCAAGGGTCAATAGTTGAGCGTCGCAGAGAACGTTGAGGCCCAAGATAAAAATTATAAGGGGTTGCCGCATCTTGAAGGAATCAGTCTCAGAGAGCTTTGGGAGGGCTAATATGAGTGTTGAGTAGTTGAGTTGAGTGAGCTCGTGAAGCTAGCGTAGAGGTTGAGTGTGTGTTACATGGCGTGTTGAGTAAAAATCATCAGCACCTATAAAGTTTGGTTGTGGCTCGGTACATAACGCATATTGAGTAAGTAGCTCACACTTGAGGAGCCACCAAATAGCATACAAGGCAAACATCATGCTATTCACAACAATTTTATTAGATTTTTACATCCATCCTCAAGGTTTTGATTTTCTGTTCAATGTTTGATTTGCCTTATCTTTGAGCTACCAAACAGCGAACCTCACCTATGATTGAGGGTTGAGGGAGTTTTATTCTTATCGTCTATTTTCACAACCTAACTTTATCCTTTTTTAAAAAGAGAACAATAAATTCTGCATATCTGTTGTGCTTCTCACGTCCTTATGCTATAATACTCACATCATGTTTTGAATTATGTAGGTGACTTTGTTAAGTGTCACTAGGAAATGAGGAAAAAACCTATTTTAAATTTCATATGCATGGTCAAGCTAGATAACAATTGATATAGCTGTATATCACAAAATTAAACTATTTCATTCATAATGCAGCAATCATTCAGTCTCTATCCCGCACTGGCTTGAGGAACATAGCCAACTGGTGTAGTTTATAATTTGAACAGAAAAAGGAAAAGGAAATGCTACGAAGACGACTGTGTTACTTACTATCTAGCTCACTTGGCTCTGTGCGTTCTAAACCCCCACCTGCTATTGTAATAAACCAAGCATTATCGTGTCCGTTACTAGAGTTCCAGCAAACCCCTAGCCTTGATCGGAGAGTAGGTTTCCCTCTTTCGGGAAATATCTTTGGTTTTCGAGCTTACAGCCTTTTGAGCTTAAATGATCTGAGAGACAAAGTTCCAAGGAAACAGAAGACACGAAAGGGTCGTGGTATTGGTTCTGGGAAGGGGAAGACGGCTGGGAGAGGTCACAAGGGCCAAAGAGCAAGAGGCTCTGGGAAGCTTGGGTTTGAAGGGGGTCAAACCCCACTTCGTCGTAGGCTTCCTAAAAGAGGCTTTAAAAATCCTTTCAGCCTCACATTTCAGGTATTTGATTTATGTTCTCATCTTATTGCTTTGTTGTTTGTGATCTGTGTTTTAAAAAGCCCACAGCCCACTGAGGCATGCACCTGGCACAACCTTTGTGTGACTGCGTCTCACTTCAAAGTAGCGTGCCTCAAGTTTGATTTCTTACCTTTATTTTTTCTTCTAATTTTGAAGAAATAATTATGTTAATATTCTTACCATCTTGAATAAAAGCTCTACTTTCTTGAGCTTTTTATTATTATTCATCATACTAATTTCCTTCAAACTTTGTTTACATTATCCCTTATTAAAAAAACCTGTGCTTAAGCCCATGGAAGACTATTATGCTGTAGTGCACCTCCAGCATTGTTTATTTATTTTGAAAACTTTTTGCAATGGTTTGATGCAGAATTCTATAAATATAATGCGTCCCATTTTCATCTGGAAGAAAGCAGTCTTTAATATCCATATCTACTAGTAAATTTTTTTCCCTATGCGATGTTATAGGCAATTCATATTGCTTGATCTCTAAAGATTTACCTTCTGCATTTTGCATTACTTAATGCACAGCATATTTGGTATCTTCTGATGTTCAATCTCGAGCAATATTATTTTTGATAGTGTAAAAGACAAATATTTGTTTTGGCAGAATAATTTTTCCTTGAGTATTATGCTATTTCTTTTGTTTGATTCTTTCTTTGGTTTAATGACAGCCGGTTGGTTTGGGAAAGATTGCTAAACTTATTAATGCTGGGAAAATTGATTCCTCTGAATTAATCACTATGAAAACTCTCAAGGTATTATATGACTTCTATCTCAATTAGTATATCAAAAGCCTGAAGTACTTGTTTTTTTGATATTGTGTCATATTATTATGCTTACCAATATGAAAATAGGATACAGGTGCAATTGGAAAACAAATAGAGGATGGAGTAAGATTGATGGGACGTGGTGCCGAACAGATTAAGTGGCCAATTCACCTAGAGGTAAATCTTCAACTAAAAATGTTTTTCTTTTTCCCTTCTGAGGTTGACTTCAATACCTATATGCTCCTTAGTTAAGCTGATGTTCTGTATAGATTATTCATAAATCTGGGGTATTGTCATGCTACTAATTTGAATTGAAGCTAGTGTACTCTTCTCAAAGAAGGGTCTAGTGTTGCAGATATTCTTCCAAGGATTGCATCTTGCTTTCTCTGTAATCTGGTTTGGGATCCAATTGCATTCAGATTACAGATTACCCGAATTTGGTATAACCAAAGGAATATGTTAGGTTTCAATACCCTGCACTCAACATTAAGCAACAAAGAACAGAGCAATATTTACTCTGTTTTACGATATATTTCCAACTAGAAGTTCCCAAGCAACTTGTAACTGAATTCTTTAACTCGCATCCCGAAGTTTCCTTATTACCCCTTCGAGAGATGTATAAAGGATTGGGGGTCTCACAGAATATTCCATGTTTGTGTAGCTTTTCAGACATTCTTATTTGCCTGTGATTGACGTGCTTAGTTTAGGTAGTATTAGCTAAAATACAAAGAGATCGCAAAAAATTTATTTCCAAGTTTTGTCATTCTCAGGTCTTTAACCAAGTGGATCGGGTCCAATAGCCTCTGATTTAGCTAGCAAGAGCTTCTTGCACATGGAACTATTCTTACGAGCCAAATGTTTTTCAAAAGCTTTCAAAATCAATTTTGAGTGGTTGTCAAATACTTTTATTTATTGCAAAATGACTTATTTTTTTAAATTAAACACTTGAAAGAGTATTCTAAACACACCCTAAATGTATGATGTTTTCAGGTGTCGAGGGTCACTGCTAGGGCGAAGGAAGCTGTCGAAGCTGCCGGTGGGACTGTTCGGAGAGTGTATTACAACAAATTAGGCTTTCGGGCGCTTCTCAAGCCTGAGTGGTTTGAAAAGAAAGGCAGAATCCTGCCACGAGCAGCAAGGCCACCGCCAAAGCAGCAAGACAAAGTCGACAGCATTGGCCGCTTGCCTGCTCCAACTAAAACCATTCCTTTTTCAGTTGAAGATGTAGATGGAGGGAGGGCAGCTTCCAATATGTCTACCTAATCATAGCCGTTCGACTTCGAATTAAGGAATTTAAGTTTTGGTTGCCTTTCTTAAATGCATTTTCTGTAGTAACCTGGTCATGATTTTGTCCCTATTAGTGTTTACACATTTCTTAGGATTAATGATGGACGTTGGCCACTTTTCAGCTGAGATTTTAAGGATTCGGGATGGTAATAAAGATCACGTCATGTTATCTATTATCAAGTCCAAGTATGTGTATAACTCTTAGATGTATACTTTTTTTTTTT

mRNA sequence

ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCACGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAAGGTTTAAGGTCGTGTTTTGCAATCATTCAGTCTCTATCCCGCACTGGCTTGAGGAACATAGCCAACTGGTGTAGTTTATAATTTGAACAGAAAAAGGAAAAGGAAATGCTACGAAGACGACTGTGTTACTTACTATCTAGCTCACTTGGCTCTGTGCGTTCTAAACCCCCACCTGCTATTGTAATAAACCAAGCATTATCGTGTCCGTTACTAGAGTTCCAGCAAACCCCTAGCCTTGATCGGAGAGTAGGTTTCCCTCTTTCGGGAAATATCTTTGGTTTTCGAGCTTACAGCCTTTTGAGCTTAAATGATCTGAGAGACAAAGTTCCAAGGAAACAGAAGACACGAAAGGGTCGTGGTATTGGTTCTGGGAAGGGGAAGACGGCTGGGAGAGGTCACAAGGGCCAAAGAGCAAGAGGCTCTGGGAAGCTTGGGTTTGAAGGGGGTCAAACCCCACTTCGTCGTAGGCTTCCTAAAAGAGGCTTTAAAAATCCTTTCAGCCTCACATTTCAGCCGGTTGGTTTGGGAAAGATTGCTAAACTTATTAATGCTGGGAAAATTGATTCCTCTGAATTAATCACTATGAAAACTCTCAAGGATACAGGTGCAATTGGAAAACAAATAGAGGATGGAGTAAGATTGATGGGACGTGGTGCCGAACAGATTAAGTGGCCAATTCACCTAGAGGTGTCGAGGGTCACTGCTAGGGCGAAGGAAGCTGTCGAAGCTGCCGGTGGGACTGTTCGGAGAGTGTATTACAACAAATTAGGCTTTCGGGCGCTTCTCAAGCCTGAGTGGTTTGAAAAGAAAGGCAGAATCCTGCCACGAGCAGCAAGGCCACCGCCAAAGCAGCAAGACAAAGTCGACAGCATTGGCCGCTTGCCTGCTCCAACTAAAACCATTCCTTTTTCAGTTGAAGATGTAGATGGAGGGAGGGCAGCTTCCAATATGTCTACCTAATCATAGCCGTTCGACTTCGAATTAAGGAATTTAAGTTTTGGTTGCCTTTCTTAAATGCATTTTCTGTAGTAACCTGGTCATGATTTTGTCCCTATTAGTGTTTACACATTTCTTAGGATTAATGATGGACGTTGGCCACTTTTCAGCTGAGATTTTAAGGATTCGGGATGGTAATAAAGATCACGTCATGTTATCTATTATCAAGTCCAAGTATGTGTATAACTCTTAGATGTATACTTTTTTTTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCACGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAA

Protein sequence

MGNPDFPLLTQLAPFLRLPSTRGVCRRAQPTTHLWRALAARALVLGWQRPLTADPHNLDGVSLHATAATSTSTTFSSNPLLNRLRFSLPVFPRGHICDFQLDHVSAKIRVLSVLTSFQLLRTPFSKDPSSFLIQTHSGSSY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc11G00080.2Clc11G00080.2mRNA