Clc10G06660 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc10G06660
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr10: 9162726 .. 9166960 (-)
RNA-Seq ExpressionClc10G06660
SyntenyClc10G06660
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGTTGCCACACCCTGCCGTTTCTTTTTTCACCATCTGTTGCATTTTAGGAAAAGGATCACACACTTTCCATTTCACATCAACATCCCCATTAATGTCGAGATTTTCGTCGCTGATTCCCTCCTGAATTTTTGAATCTCTCCTCCGCGTAACGCTGCATCGTCGCCGTCCTGAGAATACTCTTTGTAGCTGCCGGTCGGATAGTTTCCACACTGTTTCGTTCACTGTCAAGGTCAAGTGCCACCGTTTGCTTCTCCTTACTTTCATCCTCTCGATCTACCAGCCTTTTCTCATGAGGAGAGTTCCTTTGCGGTCTTCATCGAATTCATGTTGACTCCCTAGTTCTATCCTTCTATTTGATGAGGTACTACCAGATCTACCTCTACCCTGTCCTTGGTGAAGGCTTCTCGGCACCAAAACCTTGCGTTTCTTGATTTTTCTTTTGAATCAATCTTTGTTCACGGAGTTCAGGACTAAATCTAGGTTCCACCTCATCCTCCTCTATCTGGACTAAACAGTCTTTAATCGTGTGCCCTAGACACCCACAACCACAACAAAAATCTAGAAGCTCCTCATAAGTATTTGGGATCCATCGTTCTTTGGCCATGGAAGTTAGTTTGATTAGGTTACCCCTCTTTGAAGGTTTAACGGTGTCAATCAAAACTTGAATTCGAAGGGAACCGCCCCAACATCTTCCCTTCTCATCTGAATCAACTTTCTCAAACTTGCCTATAAGGTTCCCTAAACTCATAGCATATTTCCTGCAACAGAAACCAGAAGGGACATTATGTAAATGAATACAAAATGACGCATACCTGAATTGAAGTTCTGAGAAACTACAATTGGTTTTCAGCTCATTAAACACTAACAAGGAGTTCTCAAAGAACCAAGGACCATTGTTATAAGTCCACTATTTGTCCTTCAGAAATCTAAATTTGCACAGGTACATGTCTTTGCCCACACATTCAATTTGCACCTGGATGTTTCTCCATATCTTTGGCATCTTGTCTCTGAACATCTCCATATGAATCTATTTCACTGATTGAATTTTTTAAACAAAGGAGTTTGGAGATCCAGTCTCTAATTCTACACATTCATCATCATCTTATGAAAACACATTTGCTCGTTCTTATTCAGACAAATTCAACTACTCAATTTGAGAAGTCAAATTAGTTTCTGTCATCGTGGAGTACATAGATGGTGTCTCCCCCATGAAATTGAATTCCGTCCATCGACAGTTTCGACGCCACAATCTTGTCCTACAAGTGCCTCAGAGAGAACCGAGAGTCCTTCAATTGCAAAATACATCCCAATGTGGGTGGGATGATAGAGGGGTTATTTGTAGGGATGGTCGCTTTTGGGGACAAATGAAAAATGGGTACTTTTTTAAATTGAATGAAAAGTGGCATTTTGTTTGCCTAAGCATACTATAAATTTACCCATTTGATCTTGAAAGCCATACTATGAATTTACCCATTTGATACTGAAAGCCACCATATGTGCACAAAGTCACAAGTTTTCTTGAAACACAATATTTGCTCCTCAATGCTCGATGTTGGATGCTTGATGCTCTACGTTCTATGCTATATATTATATGCTAAGTAATGGACATGAAATGAATAAATCTGTTGCTTTTTTTTAAAAAAAAGGGGCACTTAGATTTTCAAAATGAACAAAAGGATGAGTTTGAACTTTGTAGGTAGATGTGAGAAGAATTTACAGAGAAAGCTCCCTTCCTGATAAGTTTGAACTTAACGAGAAGGAATTAACTCTCTATGACTTTTCTCGTAAAGTGCTGATTAGAACTTTACGAAAAAAGTGAATTAGTTTTTTGTGACTTTTTCTGTAAAATTTTGATAAGTGTAATTTAAACTTTGTCTCAATTTATTCATCAAATTGTCATTACACTTCGTTTCTAACAAAAAAGCATAAATTGGGGTTTATTCGTTTTATTTCATCACGGATTTCCTGAAATGCCCATAAGCTCCCCCACTCTACGGACATTCCAACAAAATGTTTCCATTCTTCATGACAAGATTGTCCAGTAGTCTCTACCGATCCTAATTCAGAATTTTGTGCCATGTTGTAGAAACCCTCCACTTTTGGCTTTCTGGGCTCCAAATTTGGAATTAGAGAAGACCCCTCTTTCCTTTCTTCCAAAGTAATAGCAACACTAGAATTTGAATTGCCTGATCACCACAAGCTCGCTTTTTCCAAGCCATAACTTTTGGTGTGTTTTTTTTTTTTCCCTTTTGAAATGACCTGGTTTTCGTGATTGAGTTGGAACACTTACTCGTCCCAAGTTTAGCTCTGTAGGATGGACGAGAAAACAAGACTCTATGTTGATATTGTTTGCTAAAATGTGCATTATTTTCCCTTGATTTAGGATGGTTTTTAAGTTAATTCTATAAGATTTGATATTGTTTGCTAGTGATTTTAGGGATTTGTTATAGAATGAGATTCACTGTCAAAATGAGATGAGAAGGACACAAATATGCCCTAAAAGGTCAAAGCCGACCAAAGGTGTGACGTCCCAAATTTTTGGATACTTTTTTTCTTAAAAAAATTGATTATCTTGAATTATTTGGTTAGTTGTTTAAATTTTAAGGCTTTAATTGGATTATCTTGAGAAAATAATTCAATTTAAAGTAATCATGATAAAAGATTTTGATTTAATTCAATTAATGAAAAATTGAATATATTTTGGGAGATTTAAAAGTTGAATTTAACATGAAAGATTTGAAATTAGGTGAGATTTAAGAACTTAATTAATTTAATAAAATATAAGGATAAGTTGAAATTGAATTTAAGTTGGGGAATTGATTTATTAGGAGATATTTTGGTTAAATAAATTACTAGTTGAGGAATATTATATTAAATAAGTTGGGTATGTTTTGGGAAAAGTAAAAGGGAAATTTAAATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAAGCCAATCTTAGATTTTAGTGGGATTTGATTCGCCATGCAAAGCTGCTGCACAACTGATTTTTCCGTTCAGCTTCGCTCGTATCATCTCTTTTCATGGGTTATGCTGCGATTTCAAGATTTGGTTAGGTCATGATGGTTTTGATTCAAATTTTGAATTTTGAAACTCGGAAGAGGAGTTGTCCAAGCGGGTTAAAGGGTCCATTTTGGTTGGACCCATTGTTTAAAGTATGGAAGATAACTGTGACAATTGCACTTTTGGTAAGAGATTTGATCCACTTGTTGATTTCTCTTATGTACCTATTTTGTTGGTGTAGTCTGTGATACCCTTGTGTTGATGCTTAGATTTGTTTTCGAAGGGGCTTTGGATAAGGTCGAGATTGGACGAGCTAGTGGTTGGGAATCTGGAATTGGGTGTTTTGGTTGGCGTTGGCTTAGGTCGCTTTTAGGCGTATCCTGAGGTAAGGGACTTACTACTAAGTCTATGCAGACGCTCATGGCTACTTATTGACTGATTATTGCATTGGCTGGTTATGATTATGGTGTCTACTAGTATGATGGTTAATTATCTTATTACTATGGACTGGAAACTCTAGTTGATTATGATAGTAATGATTGATTATGTTCGTGATGATTGCAATGTCATAGTGATTGTTATCCTATTTATCATGCCTTGTACCACTATTGACGCGAACCTTTGGGTACACTGATTATGATTATGATTACGACCGGGTGTCCCTCGAGATCACCACCTATGTTTATGTTTATGACTGACCTTCGAGATCACTGCGTGCCTCCGAGTTTGCTACTTATGCCTATGTCTATGCTTATGTTGGATACACTAGTGCACATGATAAAAGGATAACAACCTCACCTAGTAGGCCCAGTAGTGGGTCACTTACTAAGTATTTTGTACTCATTCTTTTCATGTTATGTTTTTCAGATAAAGGAAAGGACACCTTGGCGAATGATGAAATAAAACCTTGGTCGTTCCACTGGGACTAGTCAGATGCTTTCGCACAAGAGATTTCCTGTTTTCATCTTTAAGAATTTTGGTTATGTCATTTGAATTCAGAACTTTATTTTTTTTTTCTTTTAAAATTCTCATGGTCAGATGTTTTATGTGAGTTCCTTGTTTTATTAAAATTGTAAAGGGATACCCCGATCAAAGATTTTCAGTTATTTGAATTTTGCAAAAGATATCTAATTTAATCAAAAAGTTATTTTGATTTTTTTGTAAAATTATGAAAATTAGTCGTTTT

mRNA sequence

AGTTGCCACACCCTGCCGTTTCTTTTTTCACCATCTGTTGCATTTTAGGAAAAGGATCACACACTTTCCATTTCACATCAACATCCCCATTAATGTCGAGATTTTCGTCGCTGATTCCCTCCTGAATTTTTGAATCTCTCCTCCGCGTAACGCTGCATCGTCGCCGTCCTGAGAATACTCTTTGTAGCTGCCGGTCGGATAGTTTCCACACTGTTTCGTTCACTGTCAAGGTCAAGTGCCACCGTTTGCTTCTCCTTACTTTCATCCTCTCGATCTACCAGCCTTTTCTCATGAGGAGAGTTCCTTTGCGGTCTTCATCGAATTCATGTTGACTCCCTAGTTCTATCCTTCTATTTGATGAGGTACTACCAGATCTACCTCTACCCTGTCCTTGGTGAAGGCTTCTCGGCACCAAAACCTTGCGTTTCTTGATTTTTCTTTTGAATCAATCTTTGTTCACGGAGTTCAGGACTAAATCTAGGTTCCACCTCATCCTCCTCTATCTGGACTAAACAGTCTTTAATCGTGTGCCCTAGACACCCACAACCACAACAAAAATCTAGAAGCTCCTCATAAGTATTTGGGATCCATCGTTCTTTGGCCATGGAAGTTAGTTTGATTAGGTTACCCCTCTTTGAAGGTTTAACGGTGTCAATCAAAACTTGAATTCGAAGGGAACCGCCCCAACATCTTCCCTTCTCATCTGAATCAACTTTCTCAAACTTGCCTATAAGGTTCCCTAAACTCATAGCATATTTCCTGCAACAGAAACCAGAAGGGACATTATGTAAATGAATACAAAATGACGCATACCTGAATTGAAGTTCTGAGAAACTACAATTGGTTTTCAGCTCATTAAACACTAACAAGGAGTTCTCAAAGAACCAAGGACCATTGTTATAAGTCCACTATTTGTCCTTCAGAAATCTAAATTTGCACAGGGATTTGTTATAGAATGAGATTCACTGTCAAAATGAGATGAGAAGGACACAAATATGCCCTAAAAGGTCAAAGCCGACCAAAGGGGCTTTGGATAAGGTCGAGATTGGACGAGCTAGTGGTTGGGAATCTGGAATTGGGTGTTTTGGTTGGCGTTGGCTTAGGTCGCTTTTAGGCGTATCCTGAGATAAAGGAAAGGACACCTTGGCGAATGATGAAATAAAACCTTGGTCGTTCCACTGGGACTAGTCAGATGCTTTCGCACAAGAGATTTCCTGTTTTCATCTTTAAGAATTTTGGTTATGTCATTTGAATTCAGAACTTTATTTTTTTTTTCTTTTAAAATTCTCATGGTCAGATGTTTTATGTGAGTTCCTTGTTTTATTAAAATTGTAAAGGGATACCCCGATCAAAGATTTTCAGTTATTTGAATTTTGCAAAAGATATCTAATTTAATCAAAAAGTTATTTTGATTTTTTTGTAAAATTATGAAAATTAGTCGTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGAGAAGGACACAAATATGCCCTAAAAGGTCAAAGCCGACCAAAGGGGCTTTGGATAAGGTCGAGATTGGACGAGCTAGTGGTTGGGAATCTGGAATTGGGTGTTTTGGTTGGCGTTGGCTTAGGTCGCTTTTAGGCGTATCCTGA

Protein sequence

MRRTQICPKRSKPTKGALDKVEIGRASGWESGIGCFGWRWLRSLLGVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc10G06660.1Clc10G06660.1mRNA