Clc07G05880 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTATCTTCCCTTCTCCTTAATTCAATTCACTCCCAACAAAAACAAAACAAGTTCCTTTTTCTTTCTATATCTTTGAGAAGTCTTTCTTTTCTTTCGATCTCCCAAAGCTCAACAATGGCATCCGCCACATTGAGCACTTCAATACCAACAAGAGGAGACTCATTTTCAAATTTGATTTCAAACGGACTCTTAAATTCCAAAGTGATTAATTTTTCCTTTCTACAACGTGTCGCCCCACGAGGGGTGGCGGCAACGGTTAGGTCGACGTGGAGGACGGCGGAGCACGGTGGAGCATTGGCGACGGAGGAGGATGAGGAGATGGGCAGGATCCGGCGGCTGCAGAACGGGTCGGACGTGAGAGGGGTGGCGATCGAGGGGGAGAAAGGGAGGGCGGTGGATTTGACGGCGGCGGCGGTGGAGGCAATAGCAGAGAGTTTCGCGGAGTGGGTGATTGAGGGGTTGGAAACAGGGCGGCGCGTGAGTGTGTCGGTGGGGAGAGACCCTAGAATTTCCGGCGGTGCTTTGAGTGTTGCAGTGTTCGCGGGAGTTAGTAGGGCGGGGTGTTTGGTGTTTGATATGGGACTTGCCACAACGCCGGCGTGCTTCATGAGCACCGTTTTGCCTCCTTTTTCTTATGATGCTTCCATCATGGTTGGTTTATAGAGCTACATTAATGTAAAAATACCTTAACTATTAAATTCCAAAATTATTTTCCTACACAGTTAGTGATATATTTTATTTTCTATTATAAGTAAAATTATTACATTTTTTAATGTATCTTTTGATTTATGATTTAGAGTTTAGAGATTGTATGGGTTGCTCTTTTTTAAGTGTTTAAAATATACTTTTAAAATAAAATTTAAATATTTAAATATTTGAAAAGTTAATTCAAATGTAATACTCTAAACTTAGGTTAATACAAATATGTCAAATTAGAAAGTAATACAAAATTCTAATTATTGTTTATAGAAGTATTGTTGGAATTTTTTTGTCTTTTTTTTTCCTTAAAACCCAATCAATTTTTGCCAAGTTGCATTGGGATGACCTTGTTTGGACTTTGCGTTTTTCTTTTCTTAAGTTTCTAACTTATTCTAATTTAACTTTGGATGCTTAGTTAAAAAAATGTTTTTGGGTATATCTACAATTACTTTATTTTAGTATATAAGTTTTTAATATGTACCAGTTTTAATTGTTAATAGTGATTTTAATTTTCACCCTGACGTTTCATTAACATGGTGATGTGTGCACTCGAAATATCTATTTCATGTGGCTTTACAATATATGTCCAACATTCGCATATTGATGTATTCGTATTTGAAGTCGTGTGATATGTCTGTCAAAACAATTGACGACGTAATAATAGTGTGTTGATAGAGCAAAACAAACCTAAATTGAGAGACAAATTTAGAATAAATCAAAAAGCTCCAAAAATTGAACTTAATTTTATTTTTTATTTTTTAAAAAAACTTAAAAGGAATAATCACTTTAACATAATTAAATTATTCAATAATTAACACAAACAATTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTGTGTTGTAGTTAACAGCATCGCACTTACCTTATACACGAAATGGGATGAAGTTCTTCACGAAGAGTGGAGGGCTAAGCTCGCCGGAGGTCGAGGAGATATGCGACAGAGCCGCCGTGAAGTACGCTAACAGAGTGGTCAAAGTCTCCACTCTTCTCCGAACGCCGCCGTCCAAGGTGGATTTCATGGCGGCTTATTCACAGCATCTCAGAGATATCATTAAGCAAAGAATCAATCATCCTTTGCATCATGATACTCCTCTCAAAGGATTTCAGGTTCTTTCTTTTTCTCTCTTGTTTTTTTCCCAACTCATGGGTCGATAGGAAATTCATCTCATCTACAACTAAGTTTTTTTATACGTGTTTATCTTTTTGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAACAAATCCCTCTCCCCTCTCCTAACCGTCAAAAGTTTATAAATTTATCCTTTTGATAAATAGTGAATAAAAGAGTATCCTTGCTCTAGTAGTACAAGAAATTTACACCTACCACAATAGCATCAAAAATCAATAACATATAAGGGTAGTGTATTTATGAAATTTAAATTAGAGAAAATTACATTTTTAGTCACTAATTTTTTAGTCTAGTTTTCATATCATCTCCCTAATTTTTAAAATGTTACATTTAACCTTGTGTTTTGAGCTTAGTACTCATTTTCCTCCTTCAATTTCAATATTTTACACTTTTACTCTTGAATTTTTTTTAATTTATTTTTTATGTTAACTTTCAATTAATTAAGTGATAGGAAGTTGTTCAAAAAAATGAATAGTGATTATTGTAAATTTTTTTTAGGATCAAGGGATAAGTAGATGCACTAGAATATCTTAACTAGATTGACACATTTTTAGTATCCTCATCATATCAAAAGTCAGTACATAATTCTTTTATGTCAATCAATAGACATTCCCACTGTGGATAAGAAATGTGTAAAGTTTTAAAAATCAAAATTCTAAGTGTAAGTCTTGTAAATTAGAAACCAAGTGGAAACAAAACTTAAAACTCAAGGATAAAAATTGTAATATTTTAAAGTCTAATGATGAAATTCAAAACAAAATTTAGTGTAACATTTTAGAAAACAAAATTTAAAAAAGTGTAACATTTTAGCATGGAGAGACAAAATAAAAATTAAAGTCCATAGTGAAGAAAAAAAAAAAAAAAGGTTATTATATCACCGGTGTGGTCCAATTGTAAATGGAAGTAAGAGTGTAAATTTTCTAGTGGAGAGAGAAATAGAGAGCTGGGGAATCTAGTTTTTGTGTTGCATGGCGTTTCCCTTATCTCTTGCTCTTCGGACTTTGCGTGTGCTCGTGAACTGCGTTTGTGGTGTTTATTGCTTTATCTAAAACCACCATTTGCTCATGTTCTTATGACTACTTTTTTTTGGACCTTATTACGTAGGGAATGGGAGGATATATATATTTTTATATGGTCAAAATATTTGATTGTTATATTATACTTTAAATCATTTTTGTCTAAAACTATTTAGTCTCTATACTTTCAAATTTATAATAACTTAATCCTTGTAATATACCATTTGTAACAATTTAATTCTTATCGTAAAAGTACCGTTAAGATTTAAAGAAATTTTATAGGCACATAGTTTTAATACATTTACTCAAGTTGTACTTTTGTTAATTAATTGATTTCAATATCTCTAATTCTCTCTTCAGTTCATGTATCTTCTAATTTCTTTATTAAAACAAAAATACTTCTAAACTAAAGTGAATTTTTTTTAGTATAACAATTGTAAGAAAACAATCTCTACACAGAAATGTCATGTCAATTACTATCGAACTAAGTTCACATGAGTAACTATCAAAATTAAATAATAAAATAATTTATTAATCATCATAATTTAGACACATGGTCAGAAATGCAGTAATTTAAAACTATAGTTTAATCAATATTTTTAATTAACTATTTTTATAAGAAAATCTAACTAATTATATAAACCAAAAAATATTAGTAAAATAAAATAAGAAAATTATTTTAAATAACAAAATTGCTGAAAATATTTATACAAAAAAGTAAAATATCACAGTCTATCGTACGATAATAAAATTTTGTTATGTTTATAAATATTTTAATTCATTTTTCTATATTTGAAAATAGTCTAATAAAATAATTATTAAAGTCACGATTAATTAAATTTATAGATGTAACTTCAAATAACTTGAAAACTCAAAAAAAGAAAAAAAAAAACTCAAAATAGCTTGTTGATATGACATCTATTACCCTCCTAAAGATCGATCAATATGATTCAATGATACAGTCAGTTATCAACTTAAAGAAATAAAGGAGCATTTGCATAAATAACAATCAAGTCCAAAGTGTTAGTAGATACAACAAAATGTTAAGAAATTTATAGATATAGCAAATTTTAGATCCAACTTTCATAGTCAAATGGAGGTAGACTATATCGCTAATATAGTCTATCACTAATATCTATCAACGATAGAGTTTATAACTATAGATATTGTTATATTTTTAATTTTTCTATAAATATGATTATACACTTAATTATTAGCCTTTACTACTCATAATTACAATAACGCGAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTTTTTAAAAATAAAAATATGTAATTTTAATTATTCCTTCTAAATTTGCAGATAATAGTGAACGCGGGCAACGGATCGGGAGGCTTCTTCACATGGGATGTCTTGGACAAGCTGGGCGCAGACACCTTTGGCTCTCTTCATCTCAACCCAGACGGCATGTTCCCCAACCACATCCCTAATCCAGAAGACAAAACCGCCATGTCACTCACTCGAGCCGCCGTCCTCGAACATGGAGCCGACCTTGGTGTCGTCTTCGACACTGACGTTGACCGCAGTGGCGTCGTCGATCATGAGGGCAACCCAATCAACGGCGACAAGCTCATTGCCCTAATGTCGGCCATCGTACTCCGAGAGCACCCTGGCACGACCATCGTCACCGACGCCCGCACCAGCATCGCCCTCACAAAGTTCATCACCAACCGAGGTGGGCAACATTGTCTCTACCGCGTCGGGTATCGGAATGTCATCGACAAAGGAATCCAACTCGACGCGGACGGAATCGAGACGCATCTCATGATGGAGACGTCGGGGCACGGGGCACTTAAGGAGAATTATTTTTTGGATGATGGAGCTTACATGGTAGTGAAGATTATCATTGAAATGGTGAGAATGAAGTTAGAGGGATCAGATGAAGGAATTGGGAGTCTTATAAAAGATCTTGAAGACCCATTGGAGTCTGTGGAATTGAGATTGAATGTGATCTCTGAGCCAAGTTTTGCAAAAGAGAAGGCTGTGGAGGCCATTGAGACATTCAGAAACTTTGTCCAGGTATTTCTTTTTTTTACCAATTTTTATATG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MASATLSTSIPTRGDSFSNLISNGLLNSKVINFSFLQRVAPRGVAATVRSTWRTAEHGGALATEEDEEMGRIRRLQNGSDVRGVAIEGEKGRAVDLTAAAVEAIAESFAEWVIEGLETGRRVSVSVGRDPRISGGALSVAVFAGVSRAGCLVFDMGLATTPACFMSTVLPPFSYDASIMLTASHLPYTRNGMKFFTKSGGLSSPEVEEICDRAAVKYANRVVKVSTLLRTPPSKVDFMAAYSQHLRDIIKQRINHPLHHDTPLKGFQIIVNAGNGSGGFFTWDVLDKLGADTFGSLHLNPDGMFPNHIPNPEDKTAMSLTRAAVLEHGADLGVVFDTDVDRSGVVDHEGNPINGDKLIALMSAIVLREHPGTTIVTDARTSIALTKFITNRGGQHCLYRVGYRNVIDKGIQLDADGIETHLMMETSGHGALKENYFLDDGAYMVVKIIIEMVRMKLEGSDEGIGSLIKDLEDPLESVELRLNVISEPSFAKEKAVEAIETFRNFVQEGKLEGWELDSCGDCWVHEGCLVDLNDHPKPIDAQMYRVKVYDKENGEVGWVHLRQSIHNPNLALNMQSSLPGGCLQITRDFRDKFLVASGCDRFLDVDQVDKFVNTGLAR Homology
BLAST of Clc07G05880 vs. NCBI nr
Match: XP_038892684.1 (phosphomannomutase/phosphoglucomutase [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1162.1 bits (3005), Expect = 0.0e+00 Identity = 578/619 (93.38%), Postives = 597/619 (96.45%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. NCBI nr
Match: XP_004151147.1 (uncharacterized protein LOC101207539 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49625.1 hypothetical protein Csa_018525 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/618 (91.59%), Postives = 588/618 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. NCBI nr
Match: XP_008464699.1 (PREDICTED: phosphomannomutase/phosphoglucomutase isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1119.4 bits (2894), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/618 (90.29%), Postives = 584/618 (94.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. NCBI nr
Match: XP_023528425.1 (uncharacterized protein LOC111791358 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1082.8 bits (2799), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/628 (86.46%), Postives = 576/628 (91.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. NCBI nr
Match: XP_022941736.1 (uncharacterized protein LOC111447014 isoform X1 [Cucurbita moschata] >KAG6599903.1 hypothetical protein SDJN03_05136, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1080.9 bits (2794), Expect = 0.0e+00 Identity = 541/628 (86.15%), Postives = 576/628 (91.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q88BD4 (Phosphomannomutase/phosphoglucomutase OS=Pseudomonas syringae pv. tomato (strain ATCC BAA-871 / DC3000) OX=223283 GN=algC PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 1.1e-36 Identity = 114/410 (27.80%), Postives = 199/410 (48.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q88C93 (Phosphomannomutase/phosphoglucomutase OS=Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / NCIMB 11950 / KT2440) OX=160488 GN=algC PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 149.8 bits (377), Expect = 9.9e-35 Identity = 115/405 (28.40%), Postives = 187/405 (46.17%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q02E40 (Phosphomannomutase/phosphoglucomutase OS=Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14) OX=208963 GN=algC PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 5.4e-33 Identity = 112/411 (27.25%), Postives = 186/411 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P26276 (Phosphomannomutase/phosphoglucomutase OS=Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) OX=208964 GN=algC PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 5.4e-33 Identity = 112/411 (27.25%), Postives = 186/411 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P45632 (Phosphomannomutase OS=Azospirillum brasilense OX=192 GN=exoC PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 1.5e-30 Identity = 119/419 (28.40%), Postives = 181/419 (43.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KIT0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G031450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/618 (91.59%), Postives = 588/618 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CMK3 (phosphomannomutase/phosphoglucomutase isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502521 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1119.4 bits (2894), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/618 (90.29%), Postives = 584/618 (94.50%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FLX7 (uncharacterized protein LOC111447014 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447014 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1080.9 bits (2794), Expect = 0.0e+00 Identity = 541/628 (86.15%), Postives = 576/628 (91.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSU0 (uncharacterized protein LOC111489452 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489452 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1077.4 bits (2785), Expect = 0.0e+00 Identity = 540/628 (85.99%), Postives = 574/628 (91.40%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQ13 (uncharacterized protein LOC111022497 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022497 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1010.0 bits (2610), Expect = 4.3e-291 Identity = 512/619 (82.71%), Postives = 550/619 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. TAIR 10
Match: AT1G70820.1 (phosphoglucomutase, putative / glucose phosphomutase, putative ) HSP 1 Score: 888.3 bits (2294), Expect = 3.6e-258 Identity = 427/548 (77.92%), Postives = 487/548 (88.87%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. TAIR 10
Match: AT5G17530.1 (phosphoglucosamine mutase family protein ) HSP 1 Score: 386.0 bits (990), Expect = 5.8e-107 Identity = 227/517 (43.91%), Postives = 314/517 (60.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. TAIR 10
Match: AT5G17530.2 (phosphoglucosamine mutase family protein ) HSP 1 Score: 386.0 bits (990), Expect = 5.8e-107 Identity = 227/517 (43.91%), Postives = 314/517 (60.74%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05880 vs. TAIR 10
Match: AT5G17530.3 (phosphoglucosamine mutase family protein ) HSP 1 Score: 386.0 bits (990), Expect = 5.8e-107 Identity = 227/517 (43.91%), Postives = 314/517 (60.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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