
Clc06G10902 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGATGGAGATTGAGAGCAGGGATGAAGATTTGAAGTCCATGTTGCCCTTTCTGCCGCTGGCACTGAGGTCATCGACTTTATTCTGGCCCTCCCAAGTAGTGGAAACTCTCAAGTCTATGGCAGCAGGCCCTGATCAGAGCGGTGTAAATTCTGGTGAAGCCCTCTTCTACTCCATCTCTAACATCAGGCACTCTCTCTCTCTCTCCAACCAACGCCTCGCTTCTTCTGCCCAACATGGCTATGTTCTTTTCTTCGACAAGGTACTTCGCTTTTCCTGCTTCTTGTTCCTATTCACAATTCCGCTTTTCACATGCAAATACTGGTACCATTTTGTGAAGTGAAGTAATATCAAAAGGGAATTGAGTATCTGTTATTTTAATTTGGACAATAACACTCGTTGCAGAACAATTTGATCCGTACTTCCCTTGAAAAAAATCCTAGTTCTAGTACACTAGGACAATGATTAGAGTTGAAGGGCACCCTTGCAATCAAGGCAAACGGTTCCCCACGTTTTCCTACCATTATTTTACGTCTACTTGAACTACATATGGATTTGATCTTCGACACTTCTGTTACGAAGCACACACTAATCAGGTAAAAAGTGAGATTTCAGGATTCTTGTGAATTACGTCTAAAGTGTTGTTAATGATTCTGCCACTGGATATGGACCGAACGAAGAGAACATACCTTTTCAGGGACTTCAAGATTTCACAACTTTGTAGCAATTAACTCTTTTGTTTTCCTTCTGAATGAAAAATCCGACCTTTCATTAAGAAAGAAAATGAAAGAATAAAATACAGGGCATTCAGGAAAAAAAAGCCCACGAAAGGAAATCTGCTATAGAAATGGACTCCAATTGAGTAACAAAAGACCTAAAAAATAATTACTAAAAGACTTTTGAGCCCATAGAGAAACATGAAGCCTAACAAGGGACTAAACATCCCAAGGTCACTCTTCCCCTACTCTAAGGATTCTATTTGTTCCTTTGCTCCCACATTCCCCATAATAAAGCATGCACCTCTCGACTTGCCTCAAAAACCTCCCCTTCTTAGGAAAATGCAGATGGAAGAGGAACTCTTGGATCGTCTCCTTGTATTCTCTGTGTGAAAGGAGGCCACCTCAAAACCAAAGGCGTCATAAAAATAACTCCAAATTTACTGCAAAAGATCACAATTCCGAAGTATATGATCTAAGTCTTTGCTGAAAATAGTTTATTTCTCTCTTATTTTCTTTGTTAGACAAGGGTTTTCTTAAATAAAAGAAAACCTATTACAAATAAGGAAAAAATAAATATAGCAAATATCTTTACAATAAATACAAAGGGAGAATATAAACAAAAAAGGAAATAATCAACACTCCCCTGGTTTGAAGATATCACTCATGGCCAACTTGTCTGTTAACTTGTTGAATTGTAACTTAGGAAGACCTTTAGTTAATACATCTGCAATTTGTTCTGTTGTTGGGAGGTAGGGAATGCATATCACTCCTGCATCAATCTTTTCTTTTATGAAATGTTTATCGACTTGAATGTGTTTTGTCCGATCATGAAGGACTGGATTATGGGCAATGGAGATTGCTGCCTTGTTATCACAATAAATGCGTATGGGCATTGTCTGAGCGAATTTCAATTCTTCCAGCAGCCTTTTTATCCATATGCCTTCACAAATACCATGGGCCAATGCCCTAAATTCTGCTTCAGCACTACTTCTTGCAACGACTCTCTGTTTTTTGCTACGCCAAGTAACTAAGTTTCCTCCAACAAAGGAGCAATACTTAGAAGTCAATCTCCTATCTGTCGTGCTATCTGGCCAATCAACATCAGTATAAATTTCAACTTGTAGGTGGCCATGTTTTTTGAAAAGTATCCCTTTTCCTGGAGTACCTTTCAAATGTCTCAGGATTCTAAAGACAATTTCAAAATGAGCTGGCCCGGGGGCATTCATGAATTGGCTTATCATACTAACTGCAAAGGCAATGTTGGGACGTGTGTGAGAGAGGTATATTAGTCTTCCCACAAGTCTCTGGTACTTCCCGTTTTCTTTTACATCATTTTCTATTGCAGCTTCCAATTTTAAGTTCTGCTCAATGGGAGTTTCTACAATTCGGCAACCAAGTAAACCTGTCTCTTTGAGTAGATCAAGGATATACTTTCTTTGATTGACAAGAATACCACTTTTAGACCTAGCAAACTCCATGCCAAGGAAGTACTTTACGGATCCTAGGTCTTTGATCTTGAAATCATTTGCCAATTTTTCCTTTACAATAGACATTCCTGTCTCATCATTGCCTGTAAGAATGATATCATCGACATACACTATCAGAACAACAACCTTGTCATTTCCCGTATACTTGTAGAACATAGTGTGATCGGCTTGACTTTGGCTGAATCTATAGCTTGTGACTGCCTTTCCAAAACGTTCAAACCAAGCTCTAGGAGACTGTTTTAAGGCCGTATAGTGATTTTTTTTTAATTTACATAACTTGTTAATCCCAAGGTCAGCTTCAACACCAGGTGGTAAGTCTATAAATACTTCTTCTTCAAGTTCCCCATTAAGAAACACATTTTTAACATCAAGTTGATAAAGTGGCCAATCAAAATTAATTGCAACAGAGAGCAAAATTCTAATTGAGTCAATTTTAGCTACAGGAGCAAATGTCTCTTGATAATCAATTCCATAGGTCTGGGTGAATCCCTTAGCCACTAATCTGGCCTTGTACCTTTCGATACTACCATCAACATTACATTTTATTGTGAAAACCCACTTACATTCCACTGCTTTCTTGTCTTTTGGTAGATCAACTATGTCCCAAGTACCACTTTGTTTCAGCGCGTTCATCTCTTCCATCACTGCTAATTTCCAATTCAAATCATTTAGGGCTTCCTGTATATTCTTTGGAACAAATAGGCTGGTTATTTTGGATGTGAAAACTCTATGACTATCAGATAATCTATGATAGGAGAGATAGTTCGCAATGGGATATTTTGTACATTGGCGGGTACCTTTTCTCTGGGCAATTGGAATATCAAAATCAGAGACATCAGGCAACATATTATGAGAGGAAGGACTAAGAGACATACCTAGATTTTCAGGATCATTCATTGGAGTATCAGATTGGTCTTGTGTTAGCTTGACTGTCTGATTTCTATCCCTCTGAGTTATGTTTCTTCTAGTATAAAACTGAAGTTCAGGATTTCGACCTGTCAGATCTGTTTGTAGTGTTTCTCCCCTTGTCGGAGAATTTCCCACACTTGAGATCGGAGGACTAGGGCTCATAATTTCAGGACTAATGATGTTTGGGAGAGGTGAAGTGTCCCAAAAATTCTCTTCAAGGAGATGACTCCCCCTAAAGAGAAGTTGGGCTAAAAAAAGATTGATTTTCTATGAAGGACACATCCATACTCTCAAAATACTTGTTAGTTAGGGGGTCAAAACATTTGTACGCCTTCTTAAGGGGAACATAGCCTACAAAAACACATTTAATGGCCCGAGAGTCCAATGTAGTTTGGGAAAGGAGGGTTCGATGAACATAAGTAGTACTCCCAAAAACTTTTAAAGGTAACTTTGAGAACAGTCGGGCAGTAGGAAAAAACTCTTTGAGGTGTTGCAGTGGAGTTTTAAAATTCAACACCTTAGTAGGCATTCTATTGATTAGGTAAGCAGCGGTTAGAACAGCATCTCCCCACAAATATTTTGGAACATGCATAGAAAACATAAGGGCACGAGCAACTTCAAGCAAATGTCGATTTTTCCGTTCAGCAACACCATTTTGCTGAGGAGTATCACGACATGTAGCTTGATGAACGATGCCTTTATCATTTTAAAAGATGGTTAGTGGTTCGTTAAAAAATTCAGTTCCATTATTAGAGTGAAGAATGCGAATTTTAGCTTGAAACTAAGTCTCAATCATTTTATAAAAACGAACAAAGACCTCTTTTACATTTGACTTTTTTGTTAGCAAGTAAAACCAAGTTAAACGGGTGTGATCATCGATAAAGGTAACAAACCAACGCTTGCCATTTTTTGTCAAAACCTTAGACGGACCCCAAACATTAGTATGAATTAAGTAAAAGGTGATGAAGATTTATAAGATTTGGGTGAAAAGGTAGATCGATGATGTTTGGCAAAAATGCAGTCTTCGCATTGAAAAATAGAACAATCAATTCCTTCAAATAAATCAGGAAACAAGTACTTTAAATAAACGAAATTAGGATGTCCTAATCTACGATGCCAAAGCATAATAGTTTCTTGAACAGAAAGAGAACTGACACTATTCAAGCCCTGAATCTTTTTATGACTAGTTGAAACTTCATCAAAGTAATAGAGACCATCAATCATCCTAGCACGTCCAATCGTCTCCCCCGAGTCTTGATCCTGAAAGAGACAATGAGTTTGACAAAAGATAACACGACAGTTAGCATCTTTAGATATTTTGCTCACAAATAATAAATTACACGCTAGTTGAGGAACATGAAGGACAAAACGTAGTATGAGTTTTGTACTTGGGGGAATAGTTCCTTTGCCTGCAATAGATGTAAAACTACCATCGGCAATATGGACTTTTTCTTTACAATAAACAGTGGGGTATGACTCAAATAAACACGAGAAACTAGTCATATGATCAGCAGCTCCGGAATCGATGATCCACAGAGAGGAATTTAGACATGAGAGGGCTTGAGGGGAATTACCCGATCAATTGGATTTTAGTAGCTTCAGGATTTGATCAATTTGCTCTTTGAGTGGACTGGAATCAACAATGTTTGCATTGGAGGCATGCTGATGAGAATTTCTCTCAAATTGCTTAAAGCTCTTCCAATTTGCAGGTTTGCCATGTAGTTTCTAACAAGTTTCCCTCGTATGACGGGGTTTGTTGTAGTGATCACACCAGACACGAGGCTTGTCATGAGTTTTGTTGGATTGATCAGAAGCTTTTATTGTAGTATTTTCAAACACTAATGCGGAACTTTCAACTGAGTCAACTGCCTTCTTTC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Match: XP_016899507.1 (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 697.2 bits (1798), Expect = 1.1e-196 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 361/381 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. NCBI nr
Match: XP_008441668.1 (PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441669.1 PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441670.1 PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441671.1 PREDICTED: poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 697.2 bits (1798), Expect = 1.1e-196 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 361/381 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. NCBI nr
Match: KAE8651763.1 (hypothetical protein Csa_006527 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 9.6e-196 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 359/381 (94.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. NCBI nr
Match: XP_004138946.1 (poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 9.6e-196 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 359/381 (94.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKB3 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PARG1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 436.8 bits (1122), Expect = 3.6e-121 Identity = 233/397 (58.69%), Postives = 279/397 (70.28%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VYA1 (Probable poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PARG2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 9.3e-109 Identity = 208/371 (56.06%), Postives = 256/371 (69.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O46043 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Parg PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 184.5 bits (467), Expect = 3.3e-45 Identity = 119/310 (38.39%), Postives = 165/310 (53.23%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q86W56 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PARG PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.7e-41 Identity = 105/285 (36.84%), Postives = 152/285 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O88622 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Mus musculus OX=10090 GN=Parg PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 169.5 bits (428), Expect = 1.1e-40 Identity = 105/285 (36.84%), Postives = 151/285 (52.98%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4L4 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485752 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 697.2 bits (1798), Expect = 5.5e-197 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 361/381 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DU34 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485752 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 697.2 bits (1798), Expect = 5.5e-197 Identity = 345/381 (90.55%), Postives = 361/381 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ELT0 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435589 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 693.0 bits (1787), Expect = 1.0e-195 Identity = 343/379 (90.50%), Postives = 359/379 (94.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HZ54 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468979 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 687.6 bits (1773), Expect = 4.4e-194 Identity = 341/379 (89.97%), Postives = 359/379 (94.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM30 (Poly(ADP-ribose) glycohydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021818 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 644.0 bits (1660), Expect = 5.5e-181 Identity = 322/377 (85.41%), Postives = 342/377 (90.72%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. TAIR 10
Match: AT2G31870.2 (Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) ) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 1.4e-123 Identity = 241/445 (54.16%), Postives = 296/445 (66.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. TAIR 10
Match: AT2G31870.1 (Poly (ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) ) HSP 1 Score: 436.8 bits (1122), Expect = 2.6e-122 Identity = 233/397 (58.69%), Postives = 279/397 (70.28%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. TAIR 10
Match: AT2G31865.1 (poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2 ) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 6.6e-110 Identity = 208/371 (56.06%), Postives = 256/371 (69.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G10902 vs. TAIR 10
Match: AT2G31865.2 (poly(ADP-ribose) glycohydrolase 2 ) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 6.6e-110 Identity = 208/371 (56.06%), Postives = 256/371 (69.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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