
Clc06G09960 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCAATCCAGGGCAATGCCGAGCATCACAAATATCTGCCACGTCACCATTTCACACCCGGCCGCTCCCACAACCACAACAACATCATATACATCTCCTCCAGAAAAAGAAAACTCATCGTTCCCACCAAAATTAAATTGGAAAAAGAAAAATCTTTAATCCATTTTATCTTCTCTTCAAAATTCCTCCAAATTCCAGTCTCAATCGTCCAAAATCCATGGTTTCAGCTTCCTTGCTCGAACCGCATCCATTGAAATGGAACACAAAGTTCCCAGTTCATTTCGCCCCCTCTCCTTCTCCATCAACAAGTGGTCGTTATCATCTCTACAGACCCTTTATCTTAACCAGAAATTTGAGAATACAAGATTCTAGCTCTGTCAAATCCGGTGTTAGATGCTTCTTTGCCGTGAAAGGAAAGAGTTCAACGACTTCGAGTTCAAATTCTAGTTCGGTGGAATTGGTTAATGGGGATAAACCCAAAAGCCCAATGGAGGTAATTGGAAATTTGATTACGAATGCCCTCAAGGCGTTGCGGAAGCCTGCAATTGCTGCGGTGTTGTTGGGATTGCTGTTGATGTACGATCCTAATACTGCATTGGCCGCGTCTGGTGGACGAGTTGGAGGAAGTGCGTTTTCGTCCCGCTCCTCCTCGTCTTCGAGGAGTTACTCGACTCCGAGAATGAATTCGGGGTTTTCGTATTCTGCACCGTACAGTTCTCCGTCGGTGTTTGGCGGCGGCGGGATTTACGTTGGACCAGCAGTTGGGGTCGGAGTCGGTGCTGGCTCGAGTTTTTTCTTCATATTGGCGGGTTTTGCGGCGTTTCTTTTGGTCTCGGGATTTCTCTCTGATCGTTCCGATAGTAGTGTTCTTACTGCTTCTGAAAAAACTAGCGTACTTAAACTCCAAGTATGATAAGCCACTATCTCTCTCTGTGTTCTGATATATGTGTTATTGTGTTACTGTTTATTCTCATTCTTCTTTAGAATTAACACGCGTAAAATGAGGAGACAGAATTTTATTATGCAGAATGAAACTCTGCAGAAAATACATCAGCCTCCTTATCTACAAATACAAGTGGGAAATACCAGAAAATACCCAATAACAGATTTAAGTAATAAATACAACTGAAGAAGATAGTTACAACAAATCTAATCTATCTATACTCGCCCTCAAGTTGGAACATGGATGTCAATAATGCCCAACTTGCCCAAAACAAAGTATAAAACAGAGGTTGGTAATGCTTTGGTGAACATATCAGCCAATTGAGAGGACGGCCAAACATGTAATAGCTTGAGAAACCCATCAATAAAATATTAGAAGACTTATGTTGCACATAAAATATGAATACATATGAATATATCTTTTACCCTCTTAAAATCAAGAAAGACCGAATGCAATGATGGGTTTATCTGGATCCAAAAGATTACTAACAAAAGAGGGTCCTTTATAGAGATTACTAAGGTCCATAGCTCGGGTGGTAAGAGGAATCTTGTTAAAAGGGATCCACAAAAAGAAAGGAAGGTTTTACTGGCCCCCTTTACAGAGGAGGAGCAGGGTTTTCACCCCATAGAAGTGGATCTAAAGGCGGTTAGGCGATTTAAGTGGGACAAGTCGCTAGTGATTACTATAAGAGACTTTCGTGATGATTGGGAAGAATCTTGGAAACCCTAAAAAAAACAGTTGGAATAATCCTTCACCATTAATCCTTTCCTTCCTGACAAAGTTCTTTTGCTATGTCACTCAAAGGATCGTGCAAGACTATTTGCCATGAATATGGGGTGCGTCACTCTCAAAGCTTTTACCTTGATGTTAGAGAGATGGGACCCAATGAAACATGGGAGAAGTACCGGCCTTCCCTCTTATGGGGGATGAATAAAATTAAAAAATCATTTTCATTAATGGAGATCGGCCACATTTAAGGCGATAGGTGATTGTTTTGGTGATTTTGTGAATTATACAGATCAAAACTCTTACCTCATTGACTGGTTGAAAGTTGCATTTAAGGTGCAACAGTACTATTGTTGTTCATTCCTGTGGAAGTTAGAATCTTTGACAGAGATCACCCATTTTTTTCTTGTTCTGCCCAGGTGTGAACGCCCCAAGAAGGGTGGATGCTGGCTGAGAAGAATGTTGAAGTTCACGATGGCCTTTCCCTGGAGGCAGCCACAAGATTTTACAGTAACGATGTTGGGTCGGGTCCTAAACCAATAGATTTGTGGACGTTGAAGGATGGGTTCTTTTACAAACACTTACTTTCTTTTACCCAGATAATATTTTCCCCCGGAAGTTGGGTTTGGGCGTAGCATAAATATGTGTCACATGCCTGAGACCACTAACTTGAGGCCACACTTTTTGATCATAGCCTTCCCTTGAGTTCCATGGAGCTACAGGTTTCTTGTATTGGTGGTTCATACAATAGAGTCCTATCCCAGATTTGTGCTCCAAAATTAAAAAATAGACGAAGGAGGAAAGGGTAAATCGGTCATGTTTGTGGAAGACTTAGAAAATGGTTCTAGCTAGAGCTAGGGTTGATCTCTCCAACATAATTTCTGACAGAACAGAAAATCTAGATGTAGAAAGTGACATGCTCTTTGAGGCATCAATTTCTAGTCAAGAAAGTTTGCACTTGGACCAAGAGGAAGAGTAAAAAGGGGCCGTGCTTAGTGGAGAGATCCTTGAGGAGTATAAGATGTGTTTCCGGGGAAAGGAGGATCCTCTATTAGTTTAGAGGCAGAGGCAATCTTGGCTTTTGAGGAAGTCAAGAAAGGGAGAGTGATGGTATTATGGTAGTAGTTAATCCGAAATTCAAGAAGCTGATGGGTGCAGGAAAAAAAAGTTAAGAAGGGAGTAATAACCCTTTCTGTTCTGGTAGCCAAAGCTTAGTCAAGGTTTTGATGAAATGAACTTGTGAGAGGGTATAAGATGATATAATTAAATTTGCTTTCACCCATCAGCTAAAGCTCTTGGGTCTATTGGCGATTTAAGACTATCTATTAGATAACATGGAGTTCCATCTCAAACCCAATTGACAATAGCAGTAACCAATGTATCTTACAAATATTGTGAGATCACTTGATTTTTCCAATGTGGAATCCTCAACATACTCCCTCAAGATGGTATCTCTTTGGGATCATCATTCTTGGATCGGATCCCAATTTTGTTTATGAACTGAGTACCCGTTTGGGACTTTATGGAATTTGGTACCATATTATATAACACTTATTCTTTTATTGTTATTATCGTCTTGCTTGCTGGAAGAAGCTTCAGTCTATTTTTCATCTTCATTGGGTTTTTGGAGTCTCCTTTAAAGAAAACATTCTTCAAATATTGACTGGTCCTTCTTTGAAGCCTCAATCTGAATTATTATGGGTTAATGCTGACAAAGCACTGCTTGCTGAAATTTGATTTGAAAGAAACCAAAAGGCGTTCTATGATAAATTCCTTGAGTGGTCAAATTGTTTTGAAATTGCAAGGATCAATGCGTCTACCTAGTGCTCTCTCTCTAAGCTCTTCAGGAATTTTTCCATCCAAGATATTCTTTGACTTTGGGGACATTTGTATTTTCAGCATAGCTTATTTGATGTTTTAAGTCTTTGAATGTTGTTCTCATTAATATGTTCGTCTCATGATTTCCTTTGAATTTTTTGTTTCCTTGTATTTGGAGCATTAATCTCTTTTCATTAATTCAATGAAAAGTTGTTTTCTTGAAAGAAAAAAAAATGTCATATTAGGTAACATGAAGTTATATCTCAAAACCAATTGACAGTTGGAGGAGTAACCCATGTATTTTATAAAAAGTGTAAGGTCCCTTGATTGTTCCAATGTGGGATCCTCAACTATATCACATTGCATTTTTTGTATTTTTTTGGGAGTGGGGGGTGTTTACTGTTGAAAAGAAATAGAACCTTCAAAGATGTTGAAACCTCCTTTCCTTTTCTAATTATGGATTGGCCAATTTTTGTCAGAATTGGAAGAGATTTTGTAATTTCCGTTTCACTTTTGTGGTTTTTTAAAAAATTATTTTATTGGAAGGTTCCTTTTGGTTTCTTACATTGCAAAGGGGAAAAAAATGATAATAAAGTTTATGAAGTTTAGTTTCATGATTGGAGAAACAAATGTAGTAAAGTATTGGCACATTGAATGCACTGTAGAAAGTTAGTTTTGGTAGCCATGAAGAACTGATTTTCTTGTATGATAAATAAATGCCGATTGTCGAGTTACAATTTACTTTGTGTCTGTGATAATTCTTCATTCCAAAATCATGATGTAACTCTCGTTCTCTCTTTCTCTCCCTGGAGGTTGGGCTGTTGGGCATGGGCCGGGGACTCCAAAGAGATCTAAATAGAATTGCTGAAAGTGCTGATACATCAACCCCTGAGGGTTTGAGCTATGTTTTAACTGGTAAACAATTGATTTCTTCTTCCTTTCGGAATTAATTACCTCACTTTCTGTTTACTTTCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGTGGTAAACTGTCTTGTTAGTCCTTGCATATGAGAAGGTATTTATAAATATAAAAGACCCTAATAGCCAATGGTTTGGTCTTATGTTTTCTGAAATTGTTTCCATCATTTTTTACCCAAAAGAGTAAAAAATAAATAGTTTCCAGCATTTGCTAGAATGAACCTTCTAAGTTGATATTGTTATTTGTTTCGAAACTGTTTAAAACGTTCTGAGTAGCAGTCACCATGTTCTTTTGTTAAACGGTCAAAGTAACTTATTTTCTATGTAATTTTTGCTTTCATCTTTGGGTTGCAGAAACGATTCTAGCGCTGCTTCGACATCCTGATTATTGCATTTCAGGTTATTCATCTGTAAGTCCCACTATCTCCTTGGAGATTACCTGATCTAGCTGCACAGAGTTAACAAATGCATATTAATTGTTTTTTGAGGTTGCTGGATACAATGGTGATTGACCATAAATGTCCATGAATAAAACAGGTTGAATAAGGCAGGGGGAATGAAA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ATGGTTTCAGCTTCCTTGCTCGAACCGCATCCATTGAAATGGAACACAAAGTTCCCAGTTCATTTCGCCCCCTCTCCTTCTCCATCAACAAGTGGTCGTTATCATCTCTACAGACCCTTTATCTTAACCAGAAATTTGAGAATACAAGATTCTAGCTCTGTCAAATCCGGTGTTAGATGCTTCTTTGCCGTGAAAGGAAAGAGTTCAACGACTTCGAGTTCAAATTCTAGTTCGGTGGAATTGGTTAATGGGGATAAACCCAAAAGCCCAATGGAGGTAATTGGAAATTTGATTACGAATGCCCTCAAGGCGTTGCGGAAGCCTGCAATTGCTGCGGTGTTGTTGGGATTGCTGTTGATGTACGATCCTAATACTGCATTGGCCGCGTCTGGTGGACGAGTTGGAGGAAGTGCGTTTTCGTCCCGCTCCTCCTCGTCTTCGAGGAGTTACTCGACTCCGAGAATGAATTCGGGGTTTTCGTATTCTGCACCGTACAGTTCTCCGTCGGTGTTTGGCGGCGGCGGGATTTACGTTGGACCAGCAGTTGGGGTCGGAGTCGGTGCTGGCTCGAGTTTTTTCTTCATATTGGCGGGTTTTGCGGCGTTTCTTTTGGTCTCGGGATTTCTCTCTGATCGTTCCGATAGTAGTGTTCTTACTGCTTCTGAAAAAACTAGCGTACTTAAACTCCAAGTTGGGCTGTTGGGCATGGGCCGGGGACTCCAAAGAGATCTAAATAGAATTGCTGAAAGTGCTGATACATCAACCCCTGAGGGTTTGAGCTATGTTTTAACTGAAACGATTCTAGCGCTGCTTCGACATCCTGATTATTGCATTTCAGGTTATTCATCTATGGATGTGAAACGTAGTATAGAAGATGGAGAGAAACGTTTCAATAAATTATCAATTGAAGAGCGAGGGAAATTTGATGAGGAAACTCTTGTCAATGTGAATAGCATAAAAAAACAGAGCACAAGCAGCCAGAGGACAAGTGGATTTAGCAATGAGTACATTGTGATAACAATATTGGTGGCTGCTGAGGGAGTTCATAAGCTGCCCACTATCAATGGCAGCAGGGACTTGAAGGAAGCTTTGCAGAAACTTGCATCCATCCCTTCCAGCAAAATATTGGCTGTTGAAGTTTTGTGGACACCACAGAATGAGAACGACACATTGTCTGAACGCGAACTCCTTGAAGATTACCCACTTTTAAGGCCTTTATAA MVSASLLEPHPLKWNTKFPVHFAPSPSPSTSGRYHLYRPFILTRNLRIQDSSSVKSGVRCFFAVKGKSSTTSSSNSSSVELVNGDKPKSPMEVIGNLITNALKALRKPAIAAVLLGLLLMYDPNTALAASGGRVGGSAFSSRSSSSSRSYSTPRMNSGFSYSAPYSSPSVFGGGGIYVGPAVGVGVGAGSSFFFILAGFAAFLLVSGFLSDRSDSSVLTASEKTSVLKLQVGLLGMGRGLQRDLNRIAESADTSTPEGLSYVLTETILALLRHPDYCISGYSSMDVKRSIEDGEKRFNKLSIEERGKFDEETLVNVNSIKKQSTSSQRTSGFSNEYIVITILVAAEGVHKLPTINGSRDLKEALQKLASIPSSKILAVEVLWTPQNENDTLSERELLEDYPLLRPL Homology
BLAST of Clc06G09960 vs. NCBI nr
Match: XP_038879886.1 (uncharacterized protein LOC120071609 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 726.9 bits (1875), Expect = 9.9e-206 Identity = 389/406 (95.81%), Postives = 394/406 (97.04%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. NCBI nr
Match: XP_004142521.1 (uncharacterized protein LOC101210275 [Cucumis sativus] >KAE8653631.1 hypothetical protein Csa_007703 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 696.0 bits (1795), Expect = 1.9e-196 Identity = 372/406 (91.63%), Postives = 388/406 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. NCBI nr
Match: XP_023531004.1 (uncharacterized protein LOC111793389 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 675.6 bits (1742), Expect = 2.6e-190 Identity = 366/406 (90.15%), Postives = 380/406 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. NCBI nr
Match: XP_022933023.1 (uncharacterized protein LOC111439711 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 674.1 bits (1738), Expect = 7.6e-190 Identity = 366/406 (90.15%), Postives = 379/406 (93.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. NCBI nr
Match: KAG7020889.1 (hypothetical protein SDJN02_17577 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 664.1 bits (1712), Expect = 7.9e-187 Identity = 364/408 (89.22%), Postives = 378/408 (92.65%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3H3 (uncharacterized protein LOC111439711 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439711 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 674.1 bits (1738), Expect = 3.7e-190 Identity = 366/406 (90.15%), Postives = 379/406 (93.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HS29 (uncharacterized protein LOC111465613 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465613 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 663.7 bits (1711), Expect = 5.0e-187 Identity = 366/410 (89.27%), Postives = 378/410 (92.20%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJ69 (uncharacterized protein LOC111021018 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021018 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 634.4 bits (1635), Expect = 3.2e-178 Identity = 345/408 (84.56%), Postives = 373/408 (91.42%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2I4DEZ1 (uncharacterized protein LOC108979483 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108979483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 6.1e-145 Identity = 293/411 (71.29%), Postives = 330/411 (80.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N6QVC0 (Uncharacterized protein OS=Carpinus fangiana OX=176857 GN=FH972_006468 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 4.0e-144 Identity = 295/411 (71.78%), Postives = 331/411 (80.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G09960 vs. TAIR 10
Match: AT1G54520.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1517 (InterPro:IPR010903); Has 276 Blast hits to 275 proteins in 83 species: Archae - 0; Bacteria - 108; Metazoa - 6; Fungi - 0; Plants - 113; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 49 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 3.8e-123 Identity = 264/413 (63.92%), Postives = 306/413 (74.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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