Clc04G00880 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAGAAAGGCCATCTGTTCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAGGGAAAAACTTCCATTTTCGCAAGTGTGTTCTGTTTCTGCCTGGCACTCCAATGGAAGAAGACGAAGGTGAACTGCTCCTATGGAAGTCGAGCTCAGCATCTCAATCTATGGTCTCCGTCACCATTGGCAGAGTTATGGTCACCTTACTCGCTGCTCGCCCAAAGAAGCTCCACGACGCCGTTTCCGCTCTCTCACCCCACCACCGGCACAAAGCTTCTTCACTAGGTCCCTCTCTCATTTCACTCGCGGATTGTATTCCTCTTTAATCGTTTCGCTTTCAGTATACACTAACGAATTTTACCGGTTCCACAGATTCTCTTGACCAATCTCTCTGGTTTCTGCACCAGTATGTCAAGGACGCTGTTCAAAACCATGCGTCTTTAGATGAAATCCTCATCCCCATGCTTGAACATGTAATCTCATTCATCTTCGTTTCTACGTTTGCAAATAAAATATGCGAGTCCGTCTGTAAAAATTTCAAGTGTAATCGTGCAGACGTTGAGATTCAAGGATAAGAACTGGCAGCGAGGGGGCCAAGTTATGGTGCTTCTTAACTGGCTGTTCCTTGACGAACTTATTTTCCAAACACTGATAAAAAATCTTGCGGATATTATTGTGAGAAAGGATGATCGCTATGTCGCCCTTGGCTGGTGTATCCTTGTCCGCAGTCTTGTGGAGTTCGAGTCTGTCCCTTGTGAACTTTCATTGAACGGTAGTAGTACCATCCAATGCCAAAATTAGGATATCCCCCATGTGGGTGTACATTAGAATTTCTATTTGTATTCATACACTAAAATGCTGATAATAACGTCCTCTGTTTCTGGTATTGTTTTCATTTTTGTTGTTATTTATTTTGCTTTTTGGATAGGGTTAAGGGAGAGATACAATGATATGCTGAAGGTACTCTGTTCGTGCATTCCACGTCTGACATGTATTTTAAGTAAAAGAAGGTAAATTCCTTCCATACTCTTAGCAAGGCTGTCAGCCCCTGCTTTTCATATTTATTGGTCTATTTTGCTTTTACATTTTTGAATGTCGTAAAAACTGGCTAATGCTGTTATGCGTACAATCTTTGGTCATCAATATGTTGTGATACTAATTTTCAAGATAAATTGCCGCTTTACTTCTCATTGTGGAAGTGTGTCATCTACTTTTGTTTGCATCCGCCTTCTTGGTTTTTACATCTCACAGATGACTTGATTTTGCAGTATTCTACAGGAAGGGTTTGAGTTACCTTCTCGCCTTTCAGTTTGTGCTGCTGATTGTGTTGTATCTCTTACTAGTGCACTGACCACAAAGGCTGAGGTTCAAACGAGGCAGAAAAGATTAAATGTGAGTTCATCATATCAGCAAGTTACTTTCTTTTCAAATGCTGTTGATGACCAGCGAGAGAAACCAATTAGTAGTTCTTCAAAGGACTCAGACTCGGACATGGAATATTTACTCTGGCATCAATTGAAGGATCTCGTGATTTTAGTACAGAGGCTTCTTGCAGTATGTTTCTGTTTGCATGTTATTCTCTTCTTCTGTTTTGCATGGTACAGTTTTAATTTGTTAAATGTTACTTGGAACCTGCGTTGGCATGCTGTTTTATCCCGGTTAGTGATAGCACTTATGCAGCAAAAAACAAAACATTTGGGAAATGATGTATTATTTCCTAATTGTAGATCATTATTACTGAAACAAATTCCTATCTATAAGACCACGTTAATTGCTTTTATAAAGGTCTTGGTACTTTGACTTATTCTATTTTAGTTCCCGTACTTTTTAAGGTCCAAATTTTTTTGTACTTTTGATAGATCTTAGAATTAAGCCCTATTGTTAATCTATTATTAACTTTTCCAAAAAAATGTAATCTTGATTAACCTTCCCTATGTAAGATTTGGAAACATATTCACGTTATATCTTTCATTTATTAGGATTATGATTACTTTACTTGATTGATTAGGATTAGGATTAGTTTCCTTGGTTTATTAGGATGAGGATTAGTTTTTTTGACTAACTAAGATTAGGATTTGTTTGCTATCCAATTCTTTATTAATAGAGGAATCGTTTCTTGTATTGATAACTTTTGATTCATAATAAAGACTTTATTTTTAGTATTGGAGATTTCTTTTCTTTTATCCTTTAGACTACATCAATTTGGTACCAGTGAGAACGTTTGAGCCAATAATGGTTGCCATTAGTAGAAGACCAAGAAGTGACAGATCGCAAGAGGGAGCTTTGTGAGTTGTGCACACTTAATTAGGGGAACCCTTTAAATTCAAGAAGAACAAGAAGAAATATGAAGAATCGTTGAAGAATGGAGTTCTAAGATGCTAAAAGAATGTTCAAGTCTAGAAAATACTCTCTTGGTTATGAAAAGCGACCAAGAAAGTAAAAAAGGGGTAACCAATGTTCTTGGTATCTTGAATAAAATGATATAGAATTTGTTACAATTTTCAAAAAGACGACAAGAATTTGAAAAGGCTAGAATTGCAAATATTGGGAATAACACTCATGAAATTCGAGAACCTAGCTGATACTGTGAAATGGTGCAAGCAATGAAACAAAAATTCTAGAAGATTCGAGACTTGAGTGTGAAGGAGTGTAAGCAAACATGTTGATATTCAGGACTCGAGTGTGAAAGACGTTGTGGGTGGTGAAGAAGAAAAATCAATTGAAAAAGAAATCCGAACTCAAAGTTGTACAACCTATGTATTGACAAAATCTGTGAGCAAGAAACAAGAAGATGGGATGATGGAACCTAAAATCCTATTTGAAGTCCTTGGCAAAGCAGAAGAAGAAGTTGCGATGCCAGGTAGTATTGTTGCTTGCGAAGAGGAAGAAGACGAGAAGGAAGAATATGCAGTCATTTTCGACCTAATGCCATCCAACCCGACTGGTATTTTTTTCTTTGACCTGCAATCTAAACATTCCAACCCAACTCCCTTCATTTTGGCCCCATGACTCGTGCTATTCAACCTAAATTTGGCTGTCTTCATTTTTTTTCCCTTAATCCAACCAATTATCTTATCTCCCTAGTTGAGATGCTCCAGTGCACCTTCTGATCCCAATTTTTGTTCTCATGCGATGTGCCTAATTATCTTACTATGTATTGAAAATTGAACTATTGTAACATGAGCTTTGTCTCATTTCATTTCATCAATGAAAGAGGTTGTTTCCTTTTAAAAAAAATCCAATCAATTATCTCGGTAATGGAAGGCAAATATTTTCCTGGTCAGATCCATGGTGTACTGAAATTCCCCTAAAAGATTGCTTTCCCAAGCTGTTTCGAATTGCTTCAGCTCCAAAAGGCAGTGTCAATGATCATTGGGACCCTGATACTTGTTCTTGGAATCTTTTACTCCGTAGACAGCTTAAAGTTGAGGAAACTTTTGAGGTTCAACAGCTGCTAAGTAGGGGTGAAAGTAGCAGAATTTCTTCATTAAGTGATTCAACAAGTATCAGGGTCCCAATGTGATACTTGTTCTTGGAATCTTTTACTCCGTAGACAGCTTAAAGTTGAGGAAATTTTTGAGGTTCAACAGCTGCTAAGTAGGGGTGAAAGTAGCAGAATTTCTTCACTAAGTGATTCAAGAGTGTGGTCCTTGGATGCTTCAGGAATTTACTCAGTAAAGTCTTTGTCAAAATACCTAAATGCCTCTTCTCCAGTTGACAAGGTATGTCATATTGCTCTTTGGAAAACAAAAAGTCCCAAAAGCGTAAATATTTTGGCATGGATCATGCTGTATGCTCATCTACCTTACAACACAAGCTTCAGAGCAAGTGTTTGTCACCCTCAATTTGCCCTCTATGTTTAGATAACGGTGAAGATATTCAGCACTTGTTTTTTGAATGTTTCTTTTCAAAAAACTGCTGGTGAAAATTATTTAATTGCTTCAATATGAGTTGGGCCTTTGGGAATTCAGCAAAAGAAAATTTTATGCATTTGTTAGTTGGTCCTTCTCTTGCCTCTAAAGCTCAACTTTTATGGGCAAATGCTGTTAAAGCTTTGATTTCTGAGAGTTTGGTTGAAAAGAATCAACATGTTTTTCATGAAAAATACAAAGATTGGTCAGATAGATGGAGTTTAGCCCACCTGCTTGCTTCTTCTTGGAGTTTGCAATCCAAGTTTTTTGAAGATTATTCTATTCAAGATATTTGTCTTAATTGGAATGCTTTCATTTTTTCTATGTAATCAAACATTGTAATCAGTTTGTACTTTTGGTTTTCTTGTATCTCGAATAGTATCTGATCAGGGTGCTAAGGAGGTGTCAACCTAGTTGAGATGCCCGGGCGCACCTCCTGATCCACACTTCTTTAGTCTTTTTGGATTTTTTGTCTCTTTGTATTTGAGCAATTGCACTTTTCATTATATCAATGAAAAGTTCTGTTTCTGTTTACAAACAAACTTCAGATATATGAGAACTTCTTTTGTTAAAGTCAGCAATTTTTTTCCTCGAGGGACACTATTATTTGTGTTCAATTGGCTTGGAAGATGAATTTCTTTTATGTTTTACGACATATTTTGATGTCGAGGATGTAGATTTGTTTTTTTTTTAATATTCATTTTCTTTTTAAAACTTGAGGACATGTTTTTTTTTCTTTTGGAAGGATAGAATGATGTAGTAGGATTAGAGTAAATTAGGGTTTCTTGGTCAAGTTCTTATATTATTTGAATTATGATTAGTGTCCTTGATCGATTAAGATTAAGATTAGTTTGTTTGGTTTATTAGCATTAGAATTAATTTCTTTGATTAATTCAGATTATGGTTAGTTTGCTTTCCAATTCTCTATAGATAGAGGAATTGTCTTCTTGTATTGATAACTTCTAATTCATAATAAAGACTTTGATTTTATTATTGGACATTTCTCTGCTTTTATCCTTTAGGCTAATTCACGTGCCATCATATTGATGCATCTCTTGAGGGGGAGTT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Match: XP_016899564.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486160 isoform X8 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1873.6 bits (4852), Expect = 0.0e+00 Identity = 954/1121 (85.10%), Postives = 1025/1121 (91.44%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUA9 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X8 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1873.6 bits (4852), Expect = 0.0e+00 Identity = 954/1121 (85.10%), Postives = 1025/1121 (91.44%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B593 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X6 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1872.4 bits (4849), Expect = 0.0e+00 Identity = 955/1128 (84.66%), Postives = 1026/1128 (90.96%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUC1 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X7 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1867.8 bits (4837), Expect = 0.0e+00 Identity = 954/1125 (84.80%), Postives = 1025/1125 (91.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUA1 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1863.2 bits (4825), Expect = 0.0e+00 Identity = 954/1137 (83.91%), Postives = 1025/1137 (90.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUB5 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1861.7 bits (4821), Expect = 0.0e+00 Identity = 954/1141 (83.61%), Postives = 1025/1141 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. TAIR 10
Match: AT3G57570.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 1.8e-276 Identity = 516/1096 (47.08%), Postives = 740/1096 (67.52%), Query Frame = 0
BLAST of Clc04G00880 vs. TAIR 10
Match: AT3G57570.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 941.4 bits (2432), Expect = 6.5e-274 Identity = 514/1100 (46.73%), Postives = 739/1100 (67.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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