Clc03G04490 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc03G04490
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr03: 4377674 .. 4380554 (-)
RNA-Seq ExpressionClc03G04490
SyntenyClc03G04490
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCAGTCGCAGTCTCCAGTGGTGGAGCCGTTTCAACTTTCAAGGTGAAATATTTGTCCTTTCTTTTCTCTTTCTAAATTATTCAAATTACTTTCTACATTTTGAATTTAGTTTCGATTATATGACAATACCTTTAAAGTTTATTCAATGATTAGGTTTGTTCATATAATTCAACAATCCGACTAACTCCGACTATTTAACCTAAATCATAAAAATTGAATTTTACTATTTTTTTAAATATTATATAAGCTTCTCAAATTATTTTTAAAATTAAATTGCAACAACCATTCCTAAATTAGTAGTTGTAATACATCCTCAAATATTTAATTGAAAAAAATTGACCCCTAAACTTCTACAAGTATTAAAATTGGACCCTCAAACTTTTAATAATTGTGGAAATTTGACTCACAAATAAAAAAAAAATTAAACTCTCAAACTTATACAAATGTTACAATTTATACAATTATGTAAATTCGAAGTCAAATAAATAAATAAACAAATAAGATTTGAAAAATATTTAAAATCTCGGTCAGTATTAATCTTGCCTAGATTTCTTCAAAAAAACCCAAAACATTCAGATAAAAGATTTAAACTTTTTACTAAATGTGACATATTAGCTAAAATAGACCGACAAAAATTAATTTTATAAAAGTGTGTTAGTTGTAGAAGATGGAAATTTTTGGAGGTTAATTCTATCCATTTTCAATTAGTTTTTTAGGTGTACACAACTGCTCACCCTCTCCTCACACATCCACATCCGGTTGTTTCCGCTAACACTCGCCGGCCGTTCACTTCGGCGATACCTGATCTTCAAAACTTTGAATCTTCACTTCACCACTGCAGAATTTCCACAAACACAACGATTCCTCATCTCTTATGGTGAAAATAATTGCCTGAGATATTGCAATTTTAGGTATGCTTCCAACAAGTTCTCTAAATAAAGTTTTGGTGTATCTCTAAGATTGTTTGTTCCTCTTCCAAATGCCTATTTATAAACCTCATTTTCTTCCGTTTTTACACTCTCAAATCCAATATCTATTTCTCTATTAAAAACTCAAAATTTTCTTGTTTTTCTCTCACACCCGTAAATAAATGTCTTTGGGTTAGATTGGGTTAACCCGAATATAAAGTTAGTCAGATTATAGTTTGGTTTTTAGTTTTGTAAAGAAGATCCACCCAACTCAACCCATATACTCCACTAATTATTTAATACATATAATCATGTCTTTGTTAGTTTACAACTTTAAAAAAAATAAAAGGTAATTAGAAAGGAAGGAGAAAAAAAATTAAAATTTGTTCCACATAAACTCAATTCTATTAAGTTTGTAACTTTAAACATCATAAAGGATATGTGAAGGAGAAAATTATTTTCTTCTTTTACAATACATGGAGATTTGAAAATCAAAACATAGTCTAACTCTATGATTTTTCCTTTTTGAACCAAGGATTCAACAAAAAAGAAAAATACATAACCAACTACTCTCAAAAGAGAATATAAAAAAAATACAAAATAGAATATCCTTTAAAAACTTTCAAAGTCGAAATAATATGAGCAAAAAATACAATTTTTTTTAATGAAGACTCGAATACTGACAAAAGAGATCTTCCTATTGAGATGTTTAACCGCCTCTGATGTCAATTACCATTGACCTAAACTTGCTTAGTTATTTCAGTTTATCTAAGCCCTATGAATTAAATTATATTTATGTGGGCTGAAAAATACATGTGATATTAGAAAGGAATCCATGAAAAATAAATAAATAAAAATATTTGTTTCTTATTTTATTTTTTATTTTTTTGAGAAGCGTGAAATGGCAAATGTATCATCTGCTTAAAAATTCTCCATTTTTGTAGACACTACTAAAAATCTGGCTGCCATAACCCTAACTCCGTGGCCCCGCCTCATTGACAGTGAAGTAGACGGTAAGCGTATCACCCTCCTCCGAAGAGTTTCAACTTTCAGGGTTCCTTCAACACAACTCTACTTTACGGGTAGTTTTTGATTGATTATCTTCAACCTCCATTTCTCATTTTCGTACATGGCTTTTCTTAATTCCTTCGTCGGGCGGTTGTGTGGCTTGGTTTGTTGATATATTTATTTACTTTTAGTTCAAATAAGGCTGAGGATTCGACATCATGGAGGTCATTGATGACGTTCTAATTTGACTTCAAAACTTTTTCTTAAAAAAACTCTGTTTGTGGGTGTTCTGAAACGAGTGAAAAAATCTATGTAAGAGCGATGCAAATTTGCGAGCTCTGAACTGGGAAAACAACAATGAAGTATTCAACTATTTCTCCAGTGATGCTGTACCTCTCCAACTCAGCATTTTTTTTTCCCACTATTTCTCTTGCTTATTCTTAATATGTTCATTTGTGTTCTGTTTGAAGTCAAAGAACATATTCTCCCCCCCTATCCCCCAAACTTTCTGCAATTTAGTGGTGGAATAGGGTATACAGTGATTTATTGGTCAAGGTTTAAACTGTAGACGATTTTGATGATAAATTCCACATTGGAATTGTAATGAAGCCATAAATGAGTCCCGTTATATTGGTATTACCTTTTAGGTTGATATTATGGGATTGCGGTTGATATGTTGTGGGTACAAACGCCAATCCACATCTTTCCTATGTGAATTTTCTTGATATGTCCAAGTCAGCGTAAAGTAGACAAAAGAAAAGTTTTACACTTAATTGTCAAAGTGTGTGTTTGTTTAAATCAGAGTAATTTGTATTTTGTTACTTATGTTATATTTGTTAAATTTCTCCTATTTGTACAAGATGAGAGTCTTGTAATTGGTGTGAGTTTTATGAATAATGTTCTGAACTCCTCATATGGCGCATTAGAGAGAATGTTTCTGACACTAGTGGCTTGACAGGCTGA

mRNA sequence

ATGCAGTCGCAGTCTCCAGTGGTGGAGCCGTTTCAACTTTCAAGGTGTACACAACTGCTCACCCTCTCCTCACACATCCACATCCGGTTGTTTCCGCTAACACTCGCCGGCCATATTGCAATTTTAGACACTACTAAAAATCTGGCTGCCATAACCCTAACTCCGTGGCCCCGCCTCATTGACAGTGAAGTAGACGGTAAGCGTATCACCCTCCTCCGAAGAGTTTCAACTTTCAGGGTTCCTTCAACACAACTCTACTTTACGGGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCAGTCGCAGTCTCCAGTGGTGGAGCCGTTTCAACTTTCAAGGTGTACACAACTGCTCACCCTCTCCTCACACATCCACATCCGGTTGTTTCCGCTAACACTCGCCGGCCATATTGCAATTTTAGACACTACTAAAAATCTGGCTGCCATAACCCTAACTCCGTGGCCCCGCCTCATTGACAGTGAAGTAGACGGTAAGCGTATCACCCTCCTCCGAAGAGTTTCAACTTTCAGGGTTCCTTCAACACAACTCTACTTTACGGGCTGA

Protein sequence

MQSQSPVVEPFQLSRCTQLLTLSSHIHIRLFPLTLAGHIAILDTTKNLAAITLTPWPRLIDSEVDGKRITLLRRVSTFRVPSTQLYFTG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc03G04490.1Clc03G04490.1mRNA