Clc02G00030 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGAAAAAGGAGAAAAAAAGAGAAGAGTTTTGCTTGCAGGAAGTTTATGCATTCACGTCAACACCGACTACTATAAAACTCGTTGCGGTGCCGAAAAGCCAAAATTCGGGAAATTTGTTCCAAAGTATGGCGGCTAACTTCTGGACTTCATCGCACTAGTACTGTCCTAGACTATCTTCACGCTTAACAGATTCTCATAATTTCTACATTTTGTATCATTTTTTTGTTCTTTATTTCTTTGTGCGATTGTAACCTACAGCAAACAACTCCTGGACCAAGAGGAGGTCGATGTGGTGCAATCGCTCGATAAAGATAGGGGCATCACTCTTGAAGACTTCAAGCTCATTAAGATGCATATGGCAAATTGTAATTACCCTTCCTATCTTCTTTTCTTTTTGATTAACACATCTCTGATCTCGTACTGGTTGCGGTGTTTTTTCCCTCGGTTTTCGAAATCGAAGTTAGATGCGCAATAAATTTCTCTTCATTTCAAAGTAGTTTTGTTCTTTGGACTGGCATTATCGGCAAATATCTAGCCCATCCTAAGGCGATACCCATCTCTCTCCAGCCCGTTACTTTCCCCATGTCAAAAGGAGGGGGCCAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAAGAAGGCTTTGGAGGTTGCCACAGAAAAGGAGGCTCTTTGGAGGAAGGTGGCGGCTGCAAAATTCATTGCCCTCGAAGGTGGTTGATGGTCCCTACCCAATAGGAAGAAATCGGAGAAACATTCTCAAACTTAAGGATGTGTTGGCTTCCAGAATTAGCATTTTCATGTATAAAGGCCTTAATACAAAAATTTGGGAAAATTGATCGATGCACATCGATTCTATTTCATTTACTTTCCGTAGGCTTTATGTAATCCTCAATAGCAAGAGTCAAGAACTTTTTTATCAGTATAGTTTGGAACCCTCCTAATGCTACTTGGAATCTTAATTTAAGAAAAAATCTCAATGCTTTGGAGATGCAAGATTGGATTTCCCTTCTGGATTATCTCACAGTCACAGACTTTGCATTCAACCACGTTGATAATAAAGCAAGTGGACATATGTCGGTTTGGGATTTGTCATGAAGCTTCCATAGTTGACCCTAGCTCGTGTAAATGGATTTGGAAGAGTGGATATTGGAAGAAGGCCATTCGCTGAAACATATTGATTGTAGCAAGTCAGATTCTGGTTGAACGGGCAGCTTGTTCTTGGTAGTTTTTGGAATGGACAGTCAAATCTTTGTGTTCTGCGGTCAGCTTGGCTTTGAAGTCATTTTTCTTTTTGGTTATTTTGTTTTGTTTCAGATGTTTAGGGTTACATTGCGTTGCTCTTGCCTAAGCGTTTATTATCTTTTCTCTAGGCATATTTCCTCTATATCATTTACTTTGTAGAAGATACTTTGAAGAATATGAAATTTCAGATGAAAGCTAAATATTTTTGGCTAAAAGATTTCACTTGAATCTTTTTGAACAAGATAGTAAGATACAACACTTTTCATTGAGAGAATGACGATAGACTATTGATCAATGATACAAAACTCTCATAGGAGTGAAATAGACTACCTAGATTTAATATTCTACGAGTTTCTTTGACGTCCAAATCTTGTAGGGTCATGCGGGGTTATCTCGTGAGATTAGTCGAGGTGTGCGTGGGCTAGCCCGGATATCACAGATATCAAAGAAAAAAAAAGATCTTCAGAGGGCTGTAGGAATGCCATCCACTGGATGGAGGATGTGAGGTCTCTGATTATGAAAACTTATTCTAGATTCATTCAAGAACTTGAAGCTTTTTGGTGCAAAGTTATTAAAAGTATTCACGGCTCCAACACTCATTGTTGGCACACTTCTGGAAAGGTTCTTGGATTAGTTTGAGAAGCCATTGGATTTGAATCTATAAAACTTGGCTAAAAGTTGTCACGCTTGTTGCATTCAAGTTGGGAAATGGGAGACATATCCGGTTTTGGCTTGATCCTTAGGTTTCAAAGCTTTCTTTCAAATCACATTTCCACGGTTGTATGGCATTGCATTATTCCCCAATGGTTCGGTCTTTGAACATTGGGATGAGAATATGAGATCTTGGCAATAATTGGCATATTACTTTCAGAAGATTTCTTAACTAAGAGGAATTTTCTGATTTTCAGCATTTACTGAGTTGTTTGGACTCCATACAGCCTTCTTCTTCTCTAAACTCAAGGCGTTGGCTGTTGAATTCTTCTAGAAATTTCACGGTTAACTCATTATCCAAGCATCTAGTGGCAGCCTTCCCTTTAGACAAAGTTATTTATCAGGCTCTTTGGAAATCCAAAAGTCCAAAACAAATTAACATTCTTATTTGGCCTATGCTTTTTGGATCAGTTAAGTGTTCTGCCACCCTTCAACACAAGCTTCAACAACACTATCTTTCTCCCTTGATGTGCTCTTTGTGTTTGGCTCACAGTGAAGACTTGCAACACTTGTTCTTTGAGTGCTGTTTCTCTAAACCAGCCTGAGGAGATTATTCTCATTTTTTCAGCTTCAGTGGAGTTTTGCCAAGTCTTTTCAGGAGAATATTCTTCATATTTTGGTGGCCCTCCTTTGGCTAATAGTTCCCCAGATTTTATGGTCCAATGCAATTAAAGCTCTTCGGTCTGAGGTTTGGTTTGTACAAAATCAGCAGGTTTTTCATGATAAGTCCCTTTCTTGGTCTATTTGATTGGATTCAGCTTGTCATCTTGCCTCCTCATGGTGTTCTCATTCTAAGGCTTTCTCTAATTATTTTATTCAAGACATTTGTTTGAATTTGAATGCTTCCATTTTCTTTGTTTAAATAGTTTGTATCTTTTATTTGGATTTTTATTTTCAATTTCTATTTTATTGTATTTTGAGCATTAGACTCTTTTTGCTATGTCAATGAAAGGTCTCGTTTCCTTTTTTAAAAAAAAATGAAAAGAGGATAAGAAGACTTATTCCAAGAGGGGTAAGAAGGTAAATGGGTAGGAGTAAATCAATTATTTTGGCAGGAGGGAACGCATGTACGAATTTTCTGGTTGTTGGGGGATTTATATGGGGTTTTTGGTGTACGTTGTGTGGTATTGGGATTTTGGTGAGGAAATTGTTGGCTAGTGTGGCCTGTAGAGAACTATCTCTCTCAAAAAGTTGGGTACTTTATCTTCTTTTTTTTTCTTGTTGTTCATTCTAGTTGTGAACTCCGTTATTTTAAGAGTCGTTAAAGCCAAGAGCATTTCTGGTTGTTATTCTTGTTATTATTTCAAGTTAATCACAGGAATTCCATCCTCCGTGTATAGGAAGAGGGTTTTCGTTATGGTAGGTGGGGGTGTGTGGTGTGTTGTGGGACATTTTGGGGGAGAGAAACAATAGGATTTTTCGAGGGACGTTTCTGGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTTTGTATTTTGATGAGCTTTAACACAATCTCATTAGTTGAAATATATTTGATCTCTAGAAATAAATGAGATTCAATTTTGAAGACTGTTTTGTGTATGGTTTTGGCTAATTGATTTCGCAAGTTTTTTCTTCTGAGAGTTGCTAGGTCTTTTCTTGGCGTTTATATTTACATTTGGCTCTTGTAATATTTGGAGATTCTTTTTAAAGAAAGAAACTTTAACAACTAAAATTTCATTGAGGAAAAATGGAAGACAACGAATAGGCCAAATAGGGAAAGAAGGTAACCAAAGAACAGTGCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAGAAAAATAGGCTGCCTACAAAAAGACATCCTAGAAGCAACCAAAAAGAACCTAACCTAACGTGATAGAAAATGGTTCCAGTCCAAAAGAATAAGACTTGTGAACTGAAAGATTTGAGGCGGCTCATCTAAATGCTTCTTCTTGGTGTTCTCTCTCTAAGGCATTTAAGGAATTCTCTATTCAAGACATCAGCATCAACTGGAAGGCTTTTATATTCCCCCAATCTTAATATCTCCACAAATTTGTACTTAGCCTAGGTTTTTGGTGTCTTGTCGGATTTTGGAATTACTTGTTGCTTGTCCTTTTTATTTTTCCTTTGTCCTTGTATTTGTTTCTTGCTATGGAAGTTTTTGGTCTTTTGTATTGGATATGATGAGAGTGCTATGGGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGCCCGGGTGCACTTGCTGATCCATTCTCTCTATTTAATATTTATTTGTATCATTATCTTGTTTGTATCTTTTCATTCACTTAATGAAGAGTTCGTTTCCTTCTTCAGAAAAAAGAATAAGACTTGATGAATTATTATGAAAGTCATTTCGTTTAATCTGGCTAAGGATCAAAATCTCTCCACACTCCTAAGAATTCTATATGTTCTTTTAGTTTAGATTTCTCATGGAATTGTACAAAAAGAAAAACTAGCCCTCCATAAAACCCTTCTTTATCATAAAACTTCAATCACTGTGATGGGCCAAACAAATTTTTTAGGAAGCAAGGTAGTATGGGGATACCTTTGCCCCATATCAGTAAGAATGAGATAACCAATGTGGTACTTAAGTGGCTAGGCTCTCCCACCTCATAGCTAGCTTTTGGGACGTGGTTCTCCAAGGTGTTCATACCTAACAATGGTATTAGAGCTGGATGTTAATGTTTCGGGGAGGAGCACTGGTGGAAGGTTCTGACTGGGGGCTTCGAGTGAAGTATTGTCGTTCTAGCCACGAGGACATCGACTTTCCGAGGTGGGGTATTGTTTGGAACCAAGGTAGTATGAGCAACCTTGTCCTACATCGCGTTAAGAATGGGATGACCAATGTGATACTTGAGTGGCTTGACTCTCCTACCTCAATAGCTGGCTTTGGGATGTGGTTCTCCAAGGTGCTTAAGTACCTAACATACCAAAAACATTAAATGAGCAGTCCCATACAAATGACTTTAGCAACTCCAAAGTAAATGGCCCAACTCCTCAATCCCTTTCCTCATCCCTTTCCTCGAATGTCTTTCTGCGAAGAATGCAC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Match: XP_004147331.1 (cyclin-C1-1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8651997.1 hypothetical protein Csa_016928 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 6.6e-116 Identity = 237/317 (74.76%), Postives = 245/317 (77.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. NCBI nr
Match: XP_038901502.1 (cyclin-C1-1-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 427.6 bits (1098), Expect = 1.5e-115 Identity = 236/317 (74.45%), Postives = 245/317 (77.29%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. NCBI nr
Match: XP_022157727.1 (cyclin-C1-1-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 3.1e-113 Identity = 230/317 (72.56%), Postives = 243/317 (76.66%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. NCBI nr
Match: XP_022970688.1 (cyclin-C1-1-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 1.1e-110 Identity = 227/316 (71.84%), Postives = 240/316 (75.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJK6 (Cyclin-C1-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CYCC1-1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 1.4e-89 Identity = 187/316 (59.18%), Postives = 219/316 (69.30%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJK7 (Cyclin-C1-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CYCC1-2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 328.2 bits (840), Expect = 1.6e-88 Identity = 176/313 (56.23%), Postives = 216/313 (69.01%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93411 (Cyclin-C1-1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0504400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 325.5 bits (833), Expect = 1.0e-87 Identity = 183/323 (56.66%), Postives = 220/323 (68.11%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4KLA0 (Cyclin-C OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=ccnc PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 144.8 bits (364), Expect = 2.5e-33 Identity = 104/325 (32.00%), Postives = 162/325 (49.85%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3ZCK5 (Cyclin-C OS=Bos taurus OX=9913 GN=CCNC PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 144.4 bits (363), Expect = 3.3e-33 Identity = 102/325 (31.38%), Postives = 163/325 (50.15%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DV87 (cyclin-C1-1-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024378 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 1.5e-113 Identity = 230/317 (72.56%), Postives = 243/317 (76.66%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4M9 (cyclin-C1-1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 5.3e-111 Identity = 227/316 (71.84%), Postives = 240/316 (75.95%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G812 (cyclin-C1-1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451709 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 409.1 bits (1050), Expect = 2.6e-110 Identity = 226/316 (71.52%), Postives = 239/316 (75.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDQ3 (cyclin-C1-1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499578 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 408.3 bits (1048), Expect = 4.5e-110 Identity = 232/332 (69.88%), Postives = 241/332 (72.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2I4GJW5 (cyclin-C1-2-like isoform X1 OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC109008524 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 377.9 bits (969), Expect = 6.5e-101 Identity = 211/320 (65.94%), Postives = 234/320 (73.12%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. TAIR 10
Match: AT5G48640.1 (Cyclin family protein ) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 1.0e-90 Identity = 187/316 (59.18%), Postives = 219/316 (69.30%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. TAIR 10
Match: AT5G48630.1 (Cyclin family protein ) HSP 1 Score: 328.2 bits (840), Expect = 1.1e-89 Identity = 176/313 (56.23%), Postives = 216/313 (69.01%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. TAIR 10
Match: AT5G48630.2 (Cyclin family protein ) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 1.2e-83 Identity = 168/304 (55.26%), Postives = 206/304 (67.76%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. TAIR 10
Match: AT5G45190.1 (Cyclin family protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.4e-07 Identity = 61/287 (21.25%), Postives = 108/287 (37.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc02G00030 vs. TAIR 10
Match: AT5G27620.1 (cyclin H;1 ) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 7.1e-07 Identity = 32/92 (34.78%), Postives = 55/92 (59.78%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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