Cla97C11G214970 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCATCAATAAGTAATCGAGAATTGACTGTCGACGACAACGACGATGTAAATGCCGTCCTTCCTCGTTCTTGTTCTATAGCGTTTTGTATATCCGAGTACTTTGATCCTTCTCTTCCATCCCCTTTTCAGGATTTCGACTGGGAAGCAGCCGTCAAGGAAATTGATGTGACCTGCCTATCAGGAATTCACTCTGCTTCATCACATTCACTTCATCCTTCCGACGCCTCTGCAGAAACTCCATCTTCATTTCCATTTTCCAAGGAGAATGAAAAACGCGGGACTTCTCGCCAGTCTACACTTCACAGGTTTATTGTTAATCCCAATGCTAAGCCCCGAAAGATATCACTCGACGTCGAACAACCGGTTGAAGATCCCAGCCTTGTTGAACACTCAGTTGGTCTTGTTGACATCGATGAGGAGGCAGCTAAGACTTGGATATATCCAGGTGAGTCTCTGAATTCCGAACTACTTTTGATTTCTCTTGTTTTGGGATTGTCAATTGTTATCTACGGACTCAATTTCGAGTTAGACTTTAGGCAATTTGCTTGTAGAAAATGTCACCTATGTCCACTCCATTTTGTATCTTCATAAGCTTGAACACCATAGGACTGTCACTAAGTTACTAACTCACTGTAAACCTCTCCAGCAGCAGCATCTTCTTCCTTTAACGATCCAAACTGGTGTTCTTTTAGTTTTGCTAGCATTAGAAACAGGTGGATCTTCATTAATGGATTAAGCATGTTCTCCATTATTTCCTATGTTTTTGTTTATTTATCACTTTCCTTCCGATCAGATTACCTAAAATGGTTTCTTCATGGCTTTATTCCCCGTTCCTACAATTTTCTTCTCCATTATACACATCTCTTCTGTTCTCACTATGATCCTTTGTGAAAGTGGATCATATAATCCGTATACCTCTCACTCCTCACTTATCCCAAATAATTAGAACATGTAGAATACAAAAGAGAACTAATGCCAACTGATTGTTTAGATCAACTACAAGCTTCTTCAGGTGTCATGTGTTTTACTGCAAGAGTTTGGCTTCTATTTTGACATGCAATGAGTCCAACTTACTTCCTCAAACCATATAGTTTTCTGTAGATTTTCTTTTGTTTCAACTCTAAGTTTGTTTCATATGCCAGCATATTCCTCCAATTTTTGGAATTCACTGTTTCGTTATGTAGGCTATAAATTTCATGAAGTCAGTAGATAAGATGATTTTTTTGGTATTATGATAATGTATTTTGCGTGATTGACTGCTTGATGGATTATTTCTATTCTTAGAAGTTGGGTGTTAATAGAATTCTAATCTAATGTGACACAATTAAATTATGTAGTTAATGTTCCTCTTCGGGATTATCAGCTTGCTATTACCAAGACAGCACTATTTTCAAATACGTTGGTAGCTTTGCCTACAGGACTTGGAAAGACTCTCATTGCTGCAGTTGTTATGTATAACTACTTCAGATGGTTTCCTGAGGGTAAGGGAAAACTTTTGCCATCTTATTGATTATTAAAGTTATATTATCTCAATGGTAATGTCCAGTGGCCACTTGAACATAGTTTCAGTAAGGTAGGTTCAATCCAAGGTTTCATGAATTTTTTTTGGTACTCCCACTATTATATCAAAATTTGTAGTGCATTTTTTCTGCTTGAGAGGTTTCTTTTGCCACTAAGTAGTGCTCTTAGAAAACTAACAGAACATCCTTGAAGCTTTTAAATAAGAAGTGTGTCAAAGCTCCAAGCAAAAGGGGGGAGATTTACGTGACAATTTTTGCTACTTTGGTAGAATTTTGGGAGAAAAATAATGCTATTTAGGTTTGAGTTGATTTTAAATAGATTCAAATGAAAATAGTTAGGAAGATATTTGTTTTATGAGTTGGGTATCCTATGTCAGATTATGAGTTAGGTGTCCTATATCACCACTGTTGCTATTTGGTTTCACTTCAAAATCAAGCCAACATGAATAGCTGCATCTTCAGTTCCTATCTAAATATAAAGATTCTTTTTTTGAAAAAAATTATTCAAATGTATTTATTAGTATTGGCAACTAAAGCTTTCCCCAAGATTATCACGAAACAAGCTCAATAAGCAAACAAACATTCCAAATCTTTTGAAATCTTAAAATGCAGTGAAAAGTGTTTGTTGCAAAGACACCCAAATACCACATTCTCCTTGTACTTTTTAAACTCTATGAAACTAATCCTAGTTTTAATATACCAAGACAACTAATCCTAATCCTATTTAGTTAAGGGTTTGACCAAGATAACCCAATTTACCCTAATCGTTACTACATCACTCAGTCAGACCTAAGCGCAACGCACTATGGTACTCATAAAGATATGCAATATAATGCTTGTGGATGAAGTTACCTTCCCTTTGTTTTCATGAAGACGAGTTTTGGAATTTATTGAATACATTTGTGAACTTAAAGGATGTTGACATCTTTTCCTAGTTATTGCTTGCAGGCAAAATAGTATTTACTGCTCCTTCTCGACCACTGGTCTTGCAACAGATAGAAGCATGCCATAATATTGTCGGAATACCACAAGTATGGGGTAAACTTGTTTCTCAATGAAGTGGTTTGATGGATCATTGGTCTTTCTCTAGATATCTCATTATGTTAATTGGAACGATTTCAATGACTTTCTAATCAAATATGTTGCAGGAATGGACCATTGACATGACAGGCCTGATAAATCCGGCAAAAAGAGCATGTTTTTGGAGAAGTAAAAGAGTTTTTTTTGTTACTCCACAAGTGCTAGAGAAGGATATTCAATCAGGTGATTATTCAGATCCTTAACCCTCTCGTATTGCAAGTGGTGACTGACTGGACTAGGAATTGCAATTATGTATAATTACTCTTATTCTCAGCGCAAGGGGAAATTTATGTAGGAGACTATTTCATGCCTGGTTTAAAAGTTCATCTTTAGTCAAAGTTGTATCTGAATGTAATATTGAGATGTTCCAGGTAAAAAAGTTTTAGTTTGTATTCGTTTACGTTGATTGAAAGCCTCTAATAATTGATTTCTTGAGACTATATCTCTTATCTTCAAGAATAAAAGATGAACTATTTCTTAAGGATTTTACAAACTCAATTGATTTAGTTCGTTTGAATCAAGTTTTAAAGGATGAAGGTGTAGAGGTTGAAGATCTAGATCCTAGACTAGCATTTTTGTTACCCTCTCGGCATTCCCCAAATTTTCGGGCATCATCTGAACCCGATTCCAAACCAGTGCCATCTGAAAAGACTTTCGGGTGTCCTTTTCTCGAGGTAGGTGTTGAGCGACACTTATTGAAGAATGAGAAAGAAGTTGGGGAGTTAGCCTCTGGCCAAGAAAAGACCCTCGGTATCCCTTTGAAAGAAGCCCAATCGGTCTTTGCCGCCAAGGATAGAGATTCTTCAGCTGTTACACTTCCCAAGGGATCCAGCCCCATGCTTGTAGCTGTTTCAAACCCTTTCGATTACCCTCCCAATGAATTCTCCCCTTCAGAAGTTAATGTTGCCGGTTCCTTATTCAATGAAAAGGAATTTAATGCTCGATTAAATTGCCCCACGCCTGCAGCAACTATTACAAAGCCTTTCGGCCCCCCAACCTTTGATCTCCCCCTTTCAACTTTTAATGGTGTCGGTCCCCCATTAAATGAAAAAGAATCAAATGATAGCTCTTTCATTATCTCTCCTAGAAAGTCAAGAGTCGGCAGCCCTCTTTTCACAACAGCCCCTCCCTCGTTGGCCCATTAAAAAAACAGCCCTATTTCGTCTTATCCAGCTTAGATTTCTTTCGCTTTGAAGGAAAAAAAGCGTTCCCTTGCTCAAACCTTTCCCCAAACATTTTGTTAGGAAAAAGACTTCTTTTTTCAACTCTTGGTCCTTGATAGTGAATCTAGATTTGCTTGAAAATTGCTGTGTTAAAGTACAAATTCCAGGGATGTTTCCTAAAAATTCAAATTCCTCCCCCTCGGATCAAATATCTTTTTCCCATTAAGACTTCACAATTCTAGGCTCTAAAGTAAATTTGTTAAAGGCCTTCCGGAAAACTTTTCACACAAAAATAGCCATAAAATTAAGCTTCAGAAAAGGATTCAGATGAAGATTCTATAATAAGTGCAAGCAGCAAAGAGTTAGAACATCTCGCTTTGGAGGAGCCCCACGAGGAAGAAGATTTGGATGAAGGGTTTGGCAGTGATTTCCAATAATTATTTCAAGCTGAGGAAGACTCCTTGCTTGGTAAGACTGAAGCTTCCATTTTTACTCCCCTAGATAAGAGTGAAATCCCACAACACCTCCATTCATTCATTGATGCTTGTGGTATTGTTCTTGGTTAATTTCCGTTTGAGGAGTTCGCACATTTTCGAAGCTGTTTTGGTCTAAATCCTCTTGAAAGATCCATTCATGGTTTACAAGTGGCTTGGTCGCATCTTTGGAAGCATGTCTAGTTTGGATGGGTTGGTTCAGTTATTGGAAGGCTGGAGGGTTGTTCGGCTCGGTGGAATTTTACAAATTGGGGTTGCTGCCTAGGGTTTCTACAAGTCCGAAGCTGTCTCGTCTGCTCTCAACAAGTGTATTAGGGCCTTTCCTTCACTACCAATTATTCTGCTCATTTTTTGGCTTTTGATCTGTTGTTCTTTGGTTGATTGTATGTTCTTTTATCCAATGTTTTTGTCCTTCAATTGTGTAATTGTCTCTTTATAGATTCTATGTTGTTTGTTTGTTCTCCTTTTTGTCTCCATTGTACTTTGAGCTAATGACTCTTTTCATTTTATCAATGGAAAAGTCATGTTTCCTTTTAAAAAAAAATTTATTATCTTAATGAAGAGGCTTGTTTCCATTTCAAAAAAAGAAAAGATTGTCTTCCTTTCCTATTTCCTCCAATAGTTTGATTAAACCTTCTTCTATCATAAAACTTGAACTTAGAATTCAGACCATTAGGAATTTTTTGTAGTAATTCTCCCCCTGAATTAGAAGGTTCTATACTTGGCATTGAAGG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ATGGCATCAATAAGTAATCGAGAATTGACTGTCGACGACAACGACGATGTAAATGCCGTCCTTCCTCGTTCTTGTTCTATAGCGTTTTGTATATCCGAGTACTTTGATCCTTCTCTTCCATCCCCTTTTCAGGATTTCGACTGGGAAGCAGCCGTCAAGGAAATTGATGTGACCTGCCTATCAGGAATTCACTCTGCTTCATCACATTCACTTCATCCTTCCGACGCCTCTGCAGAAACTCCATCTTCATTTCCATTTTCCAAGGAGAATGAAAAACGCGGGACTTCTCGCCAGTCTACACTTCACAGGTTTATTGTTAATCCCAATGCTAAGCCCCGAAAGATATCACTCGACGTCGAACAACCGGTTGAAGATCCCAGCCTTGTTGAACACTCAGTTGGTCTTGTTGACATCGATGAGGAGGCAGCTAAGACTTGGATATATCCAGTTAATGTTCCTCTTCGGGATTATCAGCTTGCTATTACCAAGACAGCACTATTTTCAAATACGTTGGTAGCTTTGCCTACAGGACTTGGAAAGACTCTCATTGCTGCAGTTGTTATGTATAACTACTTCAGATGGTTTCCTGAGGGCAAAATAGTATTTACTGCTCCTTCTCGACCACTGGTCTTGCAACAGATAGAAGCATGCCATAATATTGTCGGAATACCACAAGAATGGACCATTGACATGACAGGCCTGATAAATCCGGCAAAAAGAGCATGTTTTTGGAGAAGTAAAAGAGTTTTTTTTGTTACTCCACAAGTGCTAGAGAAGGATATTCAATCAGGCACATGTTTGGTGAAATACCTGGTTTGCTTAGTGATTGATGAAGCCCATCGAGCACTTGGGAATTACTCTTATTGTGTTGCAGTTCGTGAGTTAATGATGGTACCTGTGCCACTAAGAATACTAGCCTTAACTGCCACACCAGGATCAAAGCAGCAGGGTATTCAGCAAATCATTGACAACTTACACATTTCGACCCTTCAATATCGTGATGAAAGTGATCATGATGTCAGTCCATATGTTCATAACAGGAAAATAGAATTGATTCAAGTTGCAATGGGAGAAGATGCTGTTGAGATAAATAATGAGCTCTTGGAAGTTATCCGTCCATTTGTGGCTAAACTTTGTTCAATAGGAATTCTCCAAAACAGAGATTATAGAACGTTGAGCCCATGTGATTTACTGAACTCTAGGGATAAATTTCGTCAAGCGCCCCCACCAGTCCATCCACACATTAAGTATCAAGATGTGGAGGGTTTCTTTGGAGTACTCATTACACTATACCATATACGTAAGTTACTCTCAAGCCATGGAATAAAGCCAGCATCTGAGATGCTAGAAGAGAAGCTCCAGCAAGGGGATATTATGGGTGCACTATCCAAGATTGAAGACATTGTCAGAGCTACTGAGTTTATTGGTCAAAGCTCAGGAAAATCTCTCAAAGGTCAATCACAAAAGGTTCAACAGGCTGTTTTGGAGAAATTTCGTGCTGGCGGTTACAATGTCATTGTTGCCACATGCATTGGAGAAGAAGGGCTTGATATAATGGAAGTTGATCTTGTCATCTGTTTTGATGCGAACATTTCACCAATAAGAATGATTCAGCGGATGGGTAGAACTGGAAGGAAGCATGATGGACGAGTGGATATCCTTGAACATTCAATTATCAATCAATCTCATTTATTGAATTTCGAAGTTGTTATATCTAATGTTATTTTTTGTCAGTTTAGCAAGATATTATGCCTATTTGTTTGTTAA MASISNRELTVDDNDDVNAVLPRSCSIAFCISEYFDPSLPSPFQDFDWEAAVKEIDVTCLSGIHSASSHSLHPSDASAETPSSFPFSKENEKRGTSRQSTLHRFIVNPNAKPRKISLDVEQPVEDPSLVEHSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAVVMYNYFRWFPEGKIVFTAPSRPLVLQQIEACHNIVGIPQEWTIDMTGLINPAKRACFWRSKRVFFVTPQVLEKDIQSGTCLVKYLVCLVIDEAHRALGNYSYCVAVRELMMVPVPLRILALTATPGSKQQGIQQIIDNLHISTLQYRDESDHDVSPYVHNRKIELIQVAMGEDAVEINNELLEVIRPFVAKLCSIGILQNRDYRTLSPCDLLNSRDKFRQAPPPVHPHIKYQDVEGFFGVLITLYHIRKLLSSHGIKPASEMLEEKLQQGDIMGALSKIEDIVRATEFIGQSSGKSLKGQSQKVQQAVLEKFRAGGYNVIVATCIGEEGLDIMEVDLVICFDANISPIRMIQRMGRTGRKHDGRVDILEHSIINQSHLLNFEVVISNVIFCQFSKILCLFVC Homology
BLAST of Cla97C11G214970 vs. NCBI nr
Match: KAG7015875.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 941.8 bits (2433), Expect = 2.8e-270 Identity = 478/555 (86.13%), Postives = 502/555 (90.45%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. NCBI nr
Match: XP_038884538.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 934.1 bits (2413), Expect = 5.9e-268 Identity = 493/623 (79.13%), Postives = 508/623 (81.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. NCBI nr
Match: XP_022993248.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 8.8e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. NCBI nr
Match: XP_022993249.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 8.8e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. NCBI nr
Match: XP_022993247.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 8.8e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I3XHK1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FANCM PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 673.3 bits (1736), Expect = 2.5e-192 Identity = 364/577 (63.08%), Postives = 415/577 (71.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8IYD8 (Fanconi anemia group M protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCM PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 380.9 bits (977), Expect = 2.5e-104 Identity = 214/523 (40.92%), Postives = 282/523 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BGE5 (Fanconi anemia group M protein homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Fancm PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 4.0e-102 Identity = 206/520 (39.62%), Postives = 280/520 (53.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A1D5PRR9 (Fanconi anemia group M protein OS=Gallus gallus OX=9031 GN=FANCM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 360.9 bits (925), Expect = 2.7e-98 Identity = 198/529 (37.43%), Postives = 281/529 (53.12%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7SDF3 (ATP-dependent DNA helicase mph1 OS=Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) OX=367110 GN=mph1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 1.4e-91 Identity = 220/587 (37.48%), Postives = 307/587 (52.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K1N4 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489325 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 4.3e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JS92 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489325 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 4.3e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JZN9 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489325 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 920.2 bits (2377), Expect = 4.3e-264 Identity = 484/623 (77.69%), Postives = 505/623 (81.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTZ2 (Fanconi anemia group M protein isoform X5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 917.1 bits (2369), Expect = 3.6e-263 Identity = 483/619 (78.03%), Postives = 506/619 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUR1 (Fanconi anemia group M protein isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 917.1 bits (2369), Expect = 3.6e-263 Identity = 483/619 (78.03%), Postives = 506/619 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. TAIR 10
Match: AT1G35530.1 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 670.2 bits (1728), Expect = 1.5e-192 Identity = 360/572 (62.94%), Postives = 411/572 (71.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. TAIR 10
Match: AT1G35530.2 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 669.1 bits (1725), Expect = 3.3e-192 Identity = 360/571 (63.05%), Postives = 410/571 (71.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. TAIR 10
Match: AT3G03300.1 (dicer-like 2 ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.0e-09 Identity = 47/154 (30.52%), Postives = 68/154 (44.16%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 56.6 bits (135), Expect = 7.7e-08 Identity = 35/93 (37.63%), Postives = 54/93 (58.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. TAIR 10
Match: AT3G03300.3 (dicer-like 2 ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.0e-09 Identity = 47/154 (30.52%), Postives = 68/154 (44.16%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 56.6 bits (135), Expect = 7.7e-08 Identity = 35/93 (37.63%), Postives = 54/93 (58.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G214970 vs. TAIR 10
Match: AT1G01040.1 (dicer-like 1 ) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 4.5e-08 Identity = 53/198 (26.77%), Postives = 84/198 (42.42%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 48.9 bits (115), Expect = 1.6e-05 Identity = 27/97 (27.84%), Postives = 49/97 (50.52%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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