Cla97C10G199590 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACAACGAGGTTTTTGAAGCACAGGTATTGGTTGAGAAGTTATCCAAACTCAACAATTCTCAGCAGAGCATTGAGTGTATCCTTTCTCTAATCATTATCTTTTATTTATTTCCTTTTTTGAAAATATTGCATTGCTGATGTAGGACATCTTTTAGATCTTTTATTTTCTTGGTCATCTTTTCTTGTTCTTCGCATTCTTCTCTTTGTCTTCATCAATTGCCCGTTCTATAACACACCTGCCCTTTACAGTTTTTGTTCGGAGATCATTTTCAATATATTTTTGAACCCTATGTTTTTGGTGTTTATAAACATGAATGTCAAAAGAAAAAAAAATGAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAAAGAAAAAGCAAAGTGATGACTTTTGTCATTTACCAATTATGTGTGTACGAATTTGAGTTGTGCTAATCTTGATATTGGAAGTAACTGGATATGTTATGAGGGTGGTGATTATCTATTAATACTTAATTATTTTTTTTTTCTAAAAACTAATATACTTCAATTTATTTTAATCGAGGTATTGGGGTCTCACTCCTTGCTCATGGTCCATCCTCTCTGATCCTTGGTAGGCTTGCCCACCTCAATGTTAGCTTCAAGAAGCAAGGGGCTTTAAGTTGTTTCGACTTGAGGGCTTGAACTCAGGACCTTGGAAAGTGGCTTAGTAGAACCCTAACAAGTCAACATTAATGTTCAGAGTCGGTCCCAACTTACCTTTTAGGATTCTTTATTGCCTCAACACCTGTGGATCAGATTTTAGCATGGGCTCCAAACCTCAAGAAAGCCGGTGATAACACCAACGCTTAGGTCCAATTTACCTTTCACAATTTGTTTTGTCCAAACTCCTCTCGACTATTACGGTTTTGGACCTTTGGTAGGTGTTTACCCAATCAGTCAATCTCCCAGATTCATTAACTGCTTGCAGGAACACATTTCATACACCCAAATTTCAAGAAATGAAGTGTTACTTCTACGTACTAATTGTACTAGCAATAAGGACTAGTAAGTGTAATTCAAGTTTAGATCGGTAATTTAAACTTTATTAGTGTAGGAGCTAAATGAAGTAGACACAATACTTCATTATAGGGATGAGATTTGTCATTACCCCTCCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAGATACATCAATGTACTTAAAAAATAGATTGCACCAATGTAAATAGTAGACAAGTACGAACTTGGATATTTATTAAGGCTCCATCCTATATATTCACTCACTAAACATTAATGAAATTTCGTAGATTGTATTATCCTAGAGAGAGTTGATCGATTCAAATCAGCTTGCCTTAAGGCTTCCTCCAAGTGTTTTTTCCCCAAGCCTTTTGTTGATTTCACGTAACAAGATATATGTCTTAATTGAAATGCATTCATTTATCCTTTGTAATTTCTATTTATGTTTTAGCATTTTGTATTGTTTTTCTCTTTGTTTTTACTTCCTTGTGGAGTTTGTATCTTTTGAGCATTAGTCTTTGTTCATTAGATCAATGAAAAGTTTCGTTTATTGTTCCCATAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAGGAAGATAGTTGATGCTAAAGGGTGCGACTCTAGGCCAAGAAGCCTTACATATTGTCTATAAGATTATTGCAAGAGGCTTGTTTGAACTTATGAAGAAAGTTTTACCTTTACATAAGAGGGTGGAAGTTGCTCAATCCAAAGGCGTTGCAAAAGACTTCACCAATTGGATTAAAGATCAGCAACATTATAAGAGTTAAATAAGAGGCAACAATTTACACCATGTAACAACGAAGAAAATGACATGATAATAAAACAAATCAAAAGACTTTTCTCTTCCAACAAAAAGATTATTTCTCTCAATCCACGTTGACCAAAGGAAAGCTCGAATGATGTTCAGCCATAGATGCCTTTTCTTCCTTTTGAACGGATGCCCCAACAAAATAAAGTATAGGAGGCAAGGTAAGTCTGAAGGAAGAGCCACTGTCCATCAAAGAAGGTTAGGAGTTAAAAGGAGGTGACAATTTACACCATGGTTACTGAGGAAAATAACCCGATTAGAAAAAAATCAAAGCACATTATTTTCCAACAGAAAGACGATGTCTCTCAATCCACGTTGATTAAAGGAAAACTCTTATGATGTGAGCCATTGATACATTTTCTCCCTTTTGAAAGGATGCCACAACAAAATAAAGGATGGAAGGCAAGGTAGGATGGAAGGGAGAGTCACTGTTCACTCAAAGAAGGTTAGGATAGTGCTCCAAAAACGGTTGGCCAAGGGGCAAAATTTATATGGCTTTGTGATTTCCCTCTTTTTTTGTGAAGAACACACCAATGCGGAGAGGGCCATAGAGGGCAGCTGACGTTGCAATAACGCAAGGGTGTTGATGGCTTGGTGAGCAAGCTCTTAGATGAAAAATTTAACCTGCTTAAGGTAGCAATCTGTCCATATGGAGTTGTAGGTAAGAGATATACTAACATCCCTATTGTTGCCTAGGTCTATGAGGAGAGATTTAGTGGAAAAGTTGTCGTTGCTCTCCAATTTCCACGCTCAAATGTCACTTGAATGGGATAGCTGAGTGTTTTGTAGAAGGTGTGGCTTCCCCATTCTTCAGTCTCTTCATCCTTGAGGGTTGCATCTAAGATGAAGGTCCCAAATACTTCTATCATCATCCCTTCGCTGAGGCATTTTGCTTGGTAGAAATGGAGAAGAGTAAGCTGAATCTTGTAGCCAAAGGACCATGGTAAAACCATAAGTCATTCCTAAATGATATATATATTATAATAAGAAACATAACTTTCATTATCAAAGAGAAAGATACAAAAAGAGGGAGAGATGAGATATCCTCGCACAACAACTTACAAAAAAGGAGCCCAACTAGGATACATTTGGGTTAGACTATAATTACAAAAGAATTTAGAAGTAGAGGACCAAGAAGAAGCAAAAAGAGTAACCAAACTAAAATAGTCATAGTTTCTTGATCATGAAAGATTCTAGTGTTTCTTTCAAACCACAACCTCCAAAGGAGGGCGAAGATCCCATTGGACCAAAGGATTTTCACCTAAGCATTTAACTGAGGACCTTCAACTAACTGTAGAAGGGCAACTGAATATTTCTTGGGCCAACACCAGTGCATTTTGAACAAGCTAAACTGTCTCCCCCAACAATTAGCAGCTAAGGGACAAAAGAAAAAAAGGTGCATCAATGACTCCTCACTCTTTTTACAAAGAACACTCCAATTAGGAGTGGGAGCATAATTCGGAAGGATTCTCTGGATTCTACAGTGATGTTGATGCCCCATTTACAATTTTGGAAATCAAATTGGTTATATGCCAAGTCTTGGAACTTTAAGGTTCAAGGTCCCTAAGAGGTAAAGAGGGAATTCATTCCCGGTTTGGTATTTGGCATCAATACACTTCCTCCTTATAGGCTACTGTCTCCACCAAACAAGGCGAGTACCAATTTGTCCATGTTGCCTCTCCAAAGTAAATTTTAGAGGAGCCATAGTGAAGTCTTTGCCGCATCACTTGGCATGGTAAAATCGAGGTAGATTGAAGATTTCAATGTGGGGAATGAAGATCTTCAAATTAATCCTATTCTGATTTCTTCCCATGAGAAAAATGATGTTGAGAATCTAAGTATATTCAACTTATCGAGGAAGCATCCAAATTAAATATCAACGGGCACAAGTCTGAAATTTTGGGTATTAATTGTGACAATAGTTGGGTATCTCACTTAGCAAATCACTTTGAACGTAAGGTGTGCTCATGGCTTGTAACCTACTTGGGTCTCCTTATATACAGTAACTCCTCTTCCCTATCTTTTTGACAACTTATAATGGAAAGGACAGACAAAACTTCAATCTTGGCTTACTCTTGTATCTGCCACCCTAACCAACCTTCCTGCCTACATTTCCCCCTTCTTTTTGCCTTCTAAAGTTGCTGCTCTCCTTGAAAGCTCTTATGAAATTATCTATGGTGTGGGGTGTGGGAATAGGGGCAAGGAGCTCTCACATCTCCTAAAGTGGAACAAGGCAAGAATGACAAAAAATTTCATTGGAGTGGGGCTTGGCGTTATTGATTTGAAGCTTCAGAACAAAGCTCTCTTAAACAAATTGATTTGGAGCTAAAAATATGCGTTATGGAGAGAAGTGTTCAATGCTATATTTGGTACCACCTCTTCCAATTTAAAATTGGGAAACCTTTTTAAGGTATCCCTTAAAAGTCCATGGAAGTCTATCCTTAAGCATTGAGATCTTTTTTAGGAGAACATTGCGATCTTCAAAGCTTTTACCTGTTATGAAAAAAATTGCTATTGGGATGATAATTGGGTAGGAGACAACCCTTTAGTTGTTCTTTATCTAGAATTATGTGCAGTCTCCTTAAAGAAAGAATCTACTCTTGTAGAAAAATCTCTCTGGCAAAAACGAAATTCGTCAAAGAGATAAAAAAGAAAAAAAAGAAAGGGAAGTTTTGTCTTTCTTTCCAAAGAAACCACTCAAAAATGAGAGTTAGATAAAGAAGTTTCACTAAGAACTAGCACTAGACTTCTTCCCCCCTTTCGACTTTTCCTCTCTCCTTTTGTGCTTCTACCCCGGCTTTTCATTCTGAGTGTAGGGATAATGTTAATTAGACATGGAATCTAGGCCTTAGAAGAGGGATTTGGGATTGGGAACTTTAGCATTAAGTGACCTTATTAGAAGGATCGATTCCTTTAGAATGAGAGCTTGAAATTAAATGGAACCTAAACTTGTTTGACTTGTTCTTGTTCTCCAGCAAATCTACTTTCCTCCACATTTTGAAAACACATCATAGAAAGCAGCCCCTTGATCAATTTTTTTGGGAAATTTAAAGCTTCGAAGGGACCATTTGCTATGGACATTGGACTATGACTGAAAACTACAAAGAAAGTTCCCAAATTGGGCCCTCTCCACCTCCATGTGTAGCATATGTTTGGGAGGGAAGAGTCCCTTGACTACCTGTTTCC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Match: XP_038904543.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1011.1 bits (2613), Expect = 3.6e-291 Identity = 544/561 (96.97%), Postives = 548/561 (97.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. NCBI nr
Match: XP_004136608.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B [Cucumis sativus] >XP_031739391.1 regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B [Cucumis sativus] >KAE8651160.1 hypothetical protein Csa_001803 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 988.0 bits (2553), Expect = 3.3e-284 Identity = 526/560 (93.93%), Postives = 538/560 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. NCBI nr
Match: XP_008443180.1 (PREDICTED: regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 984.6 bits (2544), Expect = 3.6e-283 Identity = 527/560 (94.11%), Postives = 536/560 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. NCBI nr
Match: XP_022152017.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Momordica charantia] >XP_022152018.1 regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 920.6 bits (2378), Expect = 6.4e-264 Identity = 505/561 (90.02%), Postives = 521/561 (92.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. NCBI nr
Match: XP_023526660.1 (UPF0400 protein C337.03-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 919.8 bits (2376), Expect = 1.1e-263 Identity = 504/563 (89.52%), Postives = 521/563 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NQG5 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 9.0e-27 Identity = 98/298 (32.89%), Postives = 154/298 (51.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CSU0 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rprd1b PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 122.1 bits (305), Expect = 2.0e-26 Identity = 92/298 (30.87%), Postives = 148/298 (49.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0P5J9 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A OS=Bos taurus OX=9913 GN=RPRD1A PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 107.1 bits (266), Expect = 6.7e-22 Identity = 91/318 (28.62%), Postives = 160/318 (50.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96P16 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPRD1A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 107.1 bits (266), Expect = 6.7e-22 Identity = 91/318 (28.62%), Postives = 160/318 (50.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R8Y3 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A OS=Pongo abelii OX=9601 GN=RPRD1A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 107.1 bits (266), Expect = 6.7e-22 Identity = 91/318 (28.62%), Postives = 160/318 (50.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7H0 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486842 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 984.6 bits (2544), Expect = 1.8e-283 Identity = 527/560 (94.11%), Postives = 536/560 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DF20 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019832 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 920.6 bits (2378), Expect = 3.1e-264 Identity = 505/561 (90.02%), Postives = 521/561 (92.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F335 (UPF0400 protein C337.03-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441698 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 919.8 bits (2376), Expect = 5.3e-264 Identity = 503/563 (89.34%), Postives = 521/563 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGC3 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445436 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 909.1 bits (2348), Expect = 9.4e-261 Identity = 501/561 (89.30%), Postives = 518/561 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2G4 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 907.5 bits (2344), Expect = 2.7e-260 Identity = 503/563 (89.34%), Postives = 520/563 (92.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. TAIR 10
Match: AT5G10060.1 (ENTH/VHS family protein ) HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 1.7e-76 Identity = 215/558 (38.53%), Postives = 303/558 (54.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. TAIR 10
Match: AT3G26990.1 (ENTH/VHS family protein ) HSP 1 Score: 276.6 bits (706), Expect = 4.5e-74 Identity = 218/567 (38.45%), Postives = 306/567 (53.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. TAIR 10
Match: AT5G65180.1 (ENTH/VHS family protein ) HSP 1 Score: 265.8 bits (678), Expect = 8.0e-71 Identity = 180/467 (38.54%), Postives = 271/467 (58.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G199590 vs. TAIR 10
Match: AT5G65180.2 (ENTH/VHS family protein ) HSP 1 Score: 105.9 bits (263), Expect = 1.1e-22 Identity = 101/337 (29.97%), Postives = 166/337 (49.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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