
Cla97C06G118980 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGTGGCACCGTCCAGGGGCATCGTATTTCAATCTCCTAAAACCCTACTTTCTCTGTAACCCTTTAACCACTCCCAAACGCACCAATCGATCTTCTTCGATTACAGGCATGGCGACGAAATCCGTAGCCGAATCAGATGTTGGCATACTCAGTTACATTTCTTCTCTCCCTGGCTTTCGCGGCATTCTTAAGCAAAGGTCTCAGCTTCTTTCCCACATGGCATGCCCTTTACTTCAGGGATGCTATGCTTCCCAAACAAATTTCGTACTATCTGCTTGATTGTATTGAAGATAAGGGGCAACTTTTAGAATGTGAAACGAAATGTTGAGAGTAAATTTAAGTTATGGAAAATTGATACTCTTCTTGTGAATCGATAACAGAATCAGAATGAATGATAACAAAGGGTAACTTCGGCGACTAATTATTGTTATGAATTAGTCGAGATAACTGGCACCGTGGAAATGTTCTTATGCTCTAGTTGGCAGAGATTTTCTGTGGCTGTTATCTGTTCGGGGGAGTGTTTTTTCTATCAATGAAATTTCTGATTCCTCAGAAAAAATGGTACAATAGAAATGTGTCCATTGTACAGCACCTGTTGTTTGTTCCCTTTCTATTCTTTGAGTTGGAAATAAACCAATGAGCTTTTAGGTTGCTGTAGGAATGCTATTAGCAAATAGTATCATTCAACCATATCCTCACAAGGTTTGAATGAAGGGACACTTTTTGTTTATTTTTAATTTTTGAAAAAACTTTTTACTCAATGATCCAGTTGTATGATTATTTCTTAAAGCTTTTAGAACCCTATCATTGTACACTTTTGATACAGGTATTCTGACTTCATTGTGAATGAAGTTGACACTGATGGAAATGTTGTTCATTTGACGTCATTGGATGCTCCTCCAGAGGTGTTGAAGTTCAATTTCTCACTGTTTCTATTGCATGCCTTAGATGTTGATTTTTCCCCTTTTGCGTGAACATGTATGATAATTTCAATTCTTTTGAGGTTCAGATTGTTTCGGAAAGCAGACCAACGATAGTCCAGAGTACAAGCGAGAGTTATGCTTCTGAAATTGAATTGTTTAGATCTCTTGCTGGTGATTCTGATGCTGAGATTTTGGAGGCTTTTCTTAAGCAAATCAATTCTGGTGTGGATGACGGCATTTCACCTATTGTATTCTCCCCAGATACAGACAAAACTCATCGAACGGTTAGCTCTAAGACCTTGTTTGTTATTCGCTCATTTATTTTTGAGTTTATCTTGACATTTTTGATTTGAGTAACAACCAGTGCAAGTCATCTTTTTTCTTTATTCTTTTAGCTGATATGTAGATTATTCCTTTAGTTTATGGTAAAAACTGACAATAGTTGGGTAGACATATATTTTTAATGCTGAAGTTTATTTTTTTTGCTCAAAGTGTAACTTCTCATCATTCTGTCAAGTTGAACGAATAAATAAAAGTATATCTTTGTTTATTTTTCATCACCATATGATTTACTGTTTAAATTTGAGGTTTTCAGGCAGTCCACAATTTCTTTAAGAAATTTAAGTTCCTTGTGACCGATACTATTGATGGACCAGATTCTTCATCAAAATGTGTCCGTGTGAGGGTGGATTCAGGGGTGCAGAATAACCGAGGTCGGTTCTCTAAGAAACGAAAAGAAAGGGGTGATAAACCCTTTGATAGTAGAGGTTCGGACAACTGGCCTGAACATGTTGGCAAGTTTCTCAGGTAAAGGATTTTCTACTTTTTAGTAGTTCTGCTTGTTTTGTGGATGCCTAAAGCTTCTTGCCTTCTTATTCATCATTTTACCTTCCCTTTATATAAGGAAATATTTATATTTCTGCTTGCGTCTTAACTTCTAGACCTGAATTGAATAGAGGTACTAAATATGAACTGACTTCCAAAAATTTGTATCTTTCACGATGAAGATTTTGTTACCAGCAAAACAGCTACTTTGTGCCCTTGCTTTATTTTGATGCTTGATGTAAATGCTTAATGGCTTTTTCTAACAAGATCAAATGATCTTTTTGCTACCGGGAAGTTCTTTCTGTAATCCTCAGCTTTAGTGGACATTTCTCTCTCTTTTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGTATATTTTATCTGTTCATTGAATTATTTTTATATCATTTCCTATCCCCCTAAAAAGAGAAGTTGTACCGTCACATTGTGTCAATCCAAAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTACCTTGTAATTTTAATTTTTAATTGTTTTTCATATTATTGAGTGTCATTGATTGGAAAGTTGTCCAAACTAATTTGTTTTAAGAACTGGTCTCTTTCTTTTTGTTCCAAGTAATTATTAACATAGTCTAACAAATTTCCTAATTTATGGTTCTATCTATCTGAATGTTGGATTCTTAATCAACTTTAAGATGTCACTTAAAAACATTTTAGGTTTCATCTTTACAAGGAGAACAAGGATACGCAGGAGGCATTAGGACTTATAGGAAAAATGCTTGGCATCCAGGTTTGCGTACTTGTAGTCTTGGCTTATTTCTCTGTCTAATAGTTGTTTGGCTGATTCTCTACGAGGGACTTTTGATTTTTTTCATTTTTCTATTGACAAATTGGATAAACTGTTCGTGAGCTCCTTGTTCTTCATCACCTTTTGGAGTGGACACTTAATCCTGTGTAATTTTGTTCATTTATACCAGCCCTTGTAATTGTAATCTCCTTGTTCATTTATACCAGCTCTTGACTAACCCTTGTTCCTTGTTCGAACTAGGGGTAATTGGCAATTTGTTTTGGCTTACTGAAATCTTGTTAGTCTGGTCAAAATGTAAAGTTGCGGCCGTACAGTTGCATTTAGATTAAAATATTAGTCATTTGTCCCGTTTTATATCTTTTCCTTTTATCCCTTTTGATCATCATTTCATATTTGAGAAGGTCAATAATAACATAGTGGAACTAAACTAGGTTCCATCTCGCCAAAAAATTGGTGACATTCTCACGATCATTCCCGAGGACAAGTTTTGGTGAATTCAACTCTAAGCTTGGCACTTCTATATACAAACCTAACTTGAGAGGGAGTGTAGATTTGTTTATAGTATAGTTGCATTTAGATAACAATAGTAGTCATTTACCCCTTTTATGTCCTTTCCTTTTATAATTTGTTTCCTTAGTTGGGATTTCCCTGGTATTGAATTCACCCATTATTGTACTAGGAATAAACTTGAATTATGACTAAATAACCACCCTTGTAGATAAGAGGTTGCCACTTGTCAAAAAAGAAACAAAAAATAGTGGAATGTGTTGGTTCTTCTGGTTCATCATTTGTTTTCAATGGAGATAAATGGTTGAACATTTACTTAGTTCAGAAATATACTTTATGCTAGCCTTGGGTATAGTAATTATTGTTCTTCCTCACACTAGTTTTCTTGGGCAGACGAGGTCCTTTGGTTTTGCTGGCACTAAGGATAAGCGCTCCATCTCAACTCAAAGGGTAATTAATTGTTTCTCACCATTTTTCTAGCTTGCTTCTGTATTGTGTTTGCTTTATGAACCACCTACCCCAACCCTCGATTGTTTGCCCTTCCTTCATTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTTGATAAAAATCAAATTTCATTGGCGGATGAAATTTACAAAAGATGGGCAAGATGCCCAAACCAATGGAGTTATAGAAGACTTCTCCAATTGGTCAAAAGAGATGTAAGATCATAAGATTTAAAGAAAGATGTACATTTGCACCAAGTCATAGCAAGGTAGTTAATATGTTCAAAAAGGGTGTCAAAAGAGCTTCCTTTATCATCGAAGAGTCGACTGTTTCTCTCCTTCCATATTAACCATACAAAAGCACAAAAAAATGTGACCACATATTCTGCTTGTGTGAGCTGAAAGGATTGCCAGTGAGAGTATATGTGAGAAGGTTCAATATATCACTAGGATGTGGAGTAGACCATTCAAAGGAGAGGGTGATCTCCTTCCAAAAAAGCTTGGCAAATGAGCAATGAATTAATGGGTGACTCGGGGTCTTGTAAGTGGCGTGGCAAAGGTGGCAGCATTGTGGAGAGAGTGCCATGTGTGGGAGACGTCTCTGTAATTTGTCATTCGTATTGATGGCATTGTGGCTAATTTCCCATAGGAGAAATTTTTGGGTAGAAATCTATCCATTTAGCGTCAAAAGGGAGGGTTTTGGAGCAGCCCCCTCCCCCAAATCAATAGCCAAAGATTTAGTGGAGAAAAACTTTTTTGTCAGGATTCCAAACCCATTTATCTCTTGTGGAGGCCAGCCGAACTCCATCAAGAATGTTCATGAGAGCCATCCAACCTTCAAATTCATCTTCTTTAAAGTTCCTTTTGTATGTGATGGTCCATCCTTGTTGTTCATCCCAACAATTGTTAACGGTGGACAGCTTGTGAGTGGCCAATGTGTAGGAGTAGAGCTGAGGAAAAAGGATTGATAAAGGGGCAGTATTGAGCCAATGATCATGCCAAAAGAGGTGTTGTTTCCATTCCCAACTTTGATAGAAGCTCTCTCCTTGATTAGATTTAAATGAGACAAGATGGATCTCCATGGGCCTTTAATACGCTCTGGGAAAAAAGTATTGGGCTATGAAGAATCAGTACTTGCACTATATTTTGCACCAATAATTTGTCTCCATAATGCACCTTCTTCATGGTAGTATCTTCATATACATTTAGCGAGAAGAGCCCTGTTTTTATCTCCAATGCCTTGTATGCCACATTTTATTTGAGTTTCTACGAGATCCTTTTGGAAAAATTGATTGGTGCTCTCTTTTTGTTAGTTTGGTTGGAGAGGAAAATTCTGAAGCCAGTTTTCTAGCTTTTCCTTGGACTTAGGATCCTTATTTTATTTTATTATTTTTTTTAAAGGAAATGACGGTTATCATTGAAATAATAAAAAGAGACTAATGCTCGAAATACAAGGAAACAAGACAGAAAAACAA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ATGGGGTGGCACCGTCCAGGGGCATCGTATTTCAATCTCCTAAAACCCTACTTTCTCTGTAACCCTTTAACCACTCCCAAACGCACCAATCGATCTTCTTCGATTACAGGCATGGCGACGAAATCCGTAGCCGAATCAGATGTTGGCATACTCAGTTACATTTCTTCTCTCCCTGGCTTTCGCGGCATTCTTAAGCAAAGGTATTCTGACTTCATTGTGAATGAAGTTGACACTGATGGAAATGTTGTTCATTTGACGTCATTGGATGCTCCTCCAGAGATTGTTTCGGAAAGCAGACCAACGATAGTCCAGAGTACAAGCGAGAGTTATGCTTCTGAAATTGAATTGTTTAGATCTCTTGCTGGTGATTCTGATGCTGAGATTTTGGAGGCTTTTCTTAAGCAAATCAATTCTGGTGTGGATGACGGCATTTCACCTATTGTATTCTCCCCAGATACAGACAAAACTCATCGAACGGCAGTCCACAATTTCTTTAAGAAATTTAAGTTCCTTGTGACCGATACTATTGATGGACCAGATTCTTCATCAAAATGTGTCCGTGTGAGGGTGGATTCAGGGGTGCAGAATAACCGAGGTCGGTTCTCTAAGAAACGAAAAGAAAGGGGTGATAAACCCTTTGATAGTAGAGGTTCGGACAACTGGCCTGAACATGTTGGCAAGTTTCTCAGGTTTCATCTTTACAAGGAGAACAAGGATACGCAGGAGGCATTAGGACTTATAGGAAAAATGCTTGGCATCCAGACGAGGTCCTTTGGTTTTGCTGGCACTAAGGATAAGCGCTCCATCTCAACTCAAAGGGTCACTGTATTTAAGCAACAAGCAAGTAGATTAGCTGCTCTTAACGATCGGTTAATTGGAATCAAGTTGGGTAATTTTAGCTATATCCAGCAAGGGCTTCTTCTTGGGCAGCTCCTGGGTAACAGGTTTACCATCACCTTACGAGGAGTTGTAGCTACTAGTGAAGACGCCATCAAAGCATCTGCAGAAGCTTTAGGAATGCATGGTTTTATTAATTACTTTGGCTTACAGGTGCAGTATGTGGTCTTTGACTCTGATTCTGAATTTGTCCAAACGCATCATAGCATCCATTGCTATTGGTTCAATCTTTCTAAATGTTTTGCTAACTATGCCATGTGTACTATTGAATTAAGCGTTTTGGCAGTGGTTCTGTACCAACTCATCTTGTTGGAGCTTCACTTCTCAGAGGAGAGTGGAAGGGCAAGAGAATACTACAAGGGAAGTGATGATATTGATGGAACGCTGAAGCAATTACCTCGATATTTAGTGGCTGAAAGGGCAATACTACAGTGTTTGAAAAAATGTCCTGGGAACTATTTGCAGGCTCTCAAAGCTATACCTAGAACTTTGAGAATGATGTACGTGCACAGTTACCAAAGCTATTTATGGAATCATGCAGCAAGTATGAGAGTGCAAAAATACGGGATTGACAAAGTGGTTGTTGGAGACTTGGTATACTGTAAAGAAAACGATACTGACACAGCTGCGGTTCAAAATTTTGAAGAATATGAAAATGAGGATTGTGGCGATGCTAATTCATATGATTCTTGTCATTTAGAGGAAATGTGTAAGCTAGATCCTCCTACAGAAAGAAATAAGCTAGTGAAGGCTGTAACTGCAGAAGATGTCCTAAGTGGAAACTTTACTATCGATGATGTTGTTCTTCCATTGCCTGGGTCAAGAGTAATCTATCCCACAAATGATATTGCTGAAGTGTATAATGATTTAGCAACTAAGGATTCAATTAGCTTAGTGGAGACTGTTCATAATGTAAAGGAATTTTCGATTACCAATGTGACTGGCAGCTACCGGAGAGTTTTTCAAAGACCAAAGGACTATGAGTGGGAATTGATCTCATATGTTGATCGTAATTTACCCCTGGCTCAGAGCGATTTACATAACCTTTTAAAGTCTCAAAGTGTTGAAATTAGTAAGGAAGAAAAGATAGCCGATAAATCTAAAAATGAAGATCTATTGGATTCCACAGAAGAATCAGGGTGCTGTAAAAAGAATGTTCAACTTGAAGCAGGTGAAAATGAAAATGAAAACGAAAATGAAAGTGGGCAAGGCACTCAGGATCCTCAGATGGCTCTCAAGTTGAGCTTTACTCTCCCCGCGTCTTCTTATGCTACTATGGCAATTAGAGAATTGCTGAAAACATCAACTTCTGTCGCTTTCCACAAAGCTTTAAACTAG MGWHRPGASYFNLLKPYFLCNPLTTPKRTNRSSSITGMATKSVAESDVGILSYISSLPGFRGILKQRYSDFIVNEVDTDGNVVHLTSLDAPPEIVSESRPTIVQSTSESYASEIELFRSLAGDSDAEILEAFLKQINSGVDDGISPIVFSPDTDKTHRTAVHNFFKKFKFLVTDTIDGPDSSSKCVRVRVDSGVQNNRGRFSKKRKERGDKPFDSRGSDNWPEHVGKFLRFHLYKENKDTQEALGLIGKMLGIQTRSFGFAGTKDKRSISTQRVTVFKQQASRLAALNDRLIGIKLGNFSYIQQGLLLGQLLGNRFTITLRGVVATSEDAIKASAEALGMHGFINYFGLQVQYVVFDSDSEFVQTHHSIHCYWFNLSKCFANYAMCTIELSVLAVVLYQLILLELHFSEESGRAREYYKGSDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENDTDTAAVQNFEEYENEDCGDANSYDSCHLEEMCKLDPPTERNKLVKAVTAEDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVIYPTNDIAEVYNDLATKDSISLVETVHNVKEFSITNVTGSYRRVFQRPKDYEWELISYVDRNLPLAQSDLHNLLKSQSVEISKEEKIADKSKNEDLLDSTEESGCCKKNVQLEAGENENENENESGQGTQDPQMALKLSFTLPASSYATMAIRELLKTSTSVAFHKALN Homology
BLAST of Cla97C06G118980 vs. NCBI nr
Match: XP_038878531.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1247.3 bits (3226), Expect = 0.0e+00 Identity = 659/748 (88.10%), Postives = 678/748 (90.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. NCBI nr
Match: XP_038878530.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1233.0 bits (3189), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/741 (87.99%), Postives = 671/741 (90.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. NCBI nr
Match: XP_011660284.1 (LOW QUALITY PROTEIN: pseudouridylate synthase 7 homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1204.9 bits (3116), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/748 (85.29%), Postives = 661/748 (88.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. NCBI nr
Match: XP_008462716.1 (PREDICTED: pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1198.3 bits (3099), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/748 (84.76%), Postives = 657/748 (87.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. NCBI nr
Match: XP_023531231.1 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023531232.1 multisubstrate pseudouridine synthase 7 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1144.8 bits (2960), Expect = 0.0e+00 Identity = 608/748 (81.28%), Postives = 640/748 (85.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96PZ0 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUS7 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 2.7e-71 Identity = 216/724 (29.83%), Postives = 320/724 (44.20%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08DI8 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=PUS7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 4.7e-71 Identity = 218/724 (30.11%), Postives = 321/724 (44.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08647 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUS7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 2.3e-70 Identity = 222/722 (30.75%), Postives = 354/722 (49.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91VU7 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pus7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 6.7e-70 Identity = 213/724 (29.42%), Postives = 314/724 (43.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74343 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=pus7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 4.8e-68 Identity = 224/732 (30.60%), Postives = 348/732 (47.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHJ1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1198.3 bits (3099), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/748 (84.76%), Postives = 657/748 (87.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F560 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440943 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1143.6 bits (2957), Expect = 0.0e+00 Identity = 608/748 (81.28%), Postives = 640/748 (85.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CI40 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1140.2 bits (2948), Expect = 0.0e+00 Identity = 606/711 (85.23%), Postives = 627/711 (88.19%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3D9 (Pseudouridylate synthase 7-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold79G00610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1139.0 bits (2945), Expect = 0.0e+00 Identity = 605/707 (85.57%), Postives = 625/707 (88.40%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KMR0 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 604/748 (80.75%), Postives = 636/748 (85.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G118980 vs. TAIR 10
Match: AT3G04820.1 (Pseudouridine synthase family protein ) HSP 1 Score: 777.3 bits (2006), Expect = 1.1e-224 Identity = 432/737 (58.62%), Postives = 531/737 (72.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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