Cla97C01G011960 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTGACACTAACACTTACTCTTCTTTTATTATATTATTATATATATACTACACCCAAAGTTGTAACCAACAATATTCACCACCATTTCTCATATTATTATCCTTCCCTTTTGATCTCTTCCTCTTTCCCCATTTCCATGGAGTTCCAAAGTGTACTTGAATTTCTTCGCAATAAGTCCATCTTCGTCACCGGCGCCACCGGATTTCTCGCAAAAGGTCGTCCGTCCTCCCCTTTCTTGCTTTTTTAAAAATATGAATAAAACCTTAAATTTACTGATACCTATCAATTAAGTTGTCCATGAAAATGCAGTAATGGTGGAGAAGATCTTAAGAGTTCAACCCAATGTGAAGAAGCTTTATCTACTCATACGGGCGGAGGACCAGAAAGTTGCGACCCAACGCCTTAACACCGATGTGATCGGGAAGGAGTTGTTCAAAGTATTGAAGGAAAAATGGGGGGAAAATTTTAGATCTATTATATCGGAGAAGCTCGTGGCGGTGGCCGGAGATATCTCCGACGAACTTTTAGTTCTCAAGGAATACTCCAAATTGAGAGAAGAATTGTATGGCCAAATTGATGTCATAGTAAACTTGGCTGCAACTACCAACTTTGATGAGAGGTGCAAATAAATTGAAACACACCTACTTAATTTAGATTTTAGCATATATGCATGTACCTTTTTGCCTGTTTTGAGACACTTAAACCACATAAATAAGTGTAATAAATGATTTTTCTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCATTTCAGTCATTTTAATCCATATGCTTTTAATATCCAATTTTATCTTAAATTTAGTCCATCAAAATTAGTTTTTACCAAATTTTTTCATGCAAGGAAATACAATATATGAATATGTTTTCAAAATTTATAGTAAAAAATGTTATAGATAACTTAAGAATTTTAAAAAACCAACAATAAATTAGCTATGAGGCTAAATTTAAGATTTATTGAGAGTATAAAGACTTAAATTAGATAATTAAGGACTAAAAGATAAACAAATTACAAATATTAAGACCAAATTAATATTTTATTTATTTTGTTAGATATGACGTTGCTCTTCATGTCAACACTTTGGGAGCTAAGCATGTTATAAACTTTGCTAAAAAATGTGTGAAGTTGAAGGCATTCATCCACGTGTCCACAGGTTTTATTCTCTCCTCTTGAACATCCTTATGAATTTACTATATTTTAATCATGATTTCCTATAAAATTCGTCAATTTGTATCTTTAATTTGAGTTGTTCGTATATATGTTTTAAAATTATTGTCTCTCATATTCATATTCATGTTCTTTAATTATTATTTTTTATATATTCGAGTGAATTTAGTTCAATTAGCATTGACATAATTTTTTATTTTAAATATTAAAGATTCGATCTTTTATCTCTACAATTGTAGTAAAATTTTACGAGATCAAATTATTTGTAAGTATAATATAAATACATAATATTTTATACTAATGATTGATCTGATACGACAATTTTTATTTTTATTTTTTAAAATGACAGTAGTAGAATAGTCATTTTATGGTAGTTATTAGATAAAAACGTAATATATTTAATTAGGTGTTATTGATGTATCAGTAAATACACATCCACAACTAAATATTAATTAATTAATTATTATTATTTTTTTTAAAATTTTAAGATCTAGTTACTTATCCGTACAAAAGTTTTAATAATAGTTTTAACAGTCAAGTTAATTTCATCATTTACTTAAAAAGTTTTAAAGACTCTTTTCAAATATAGCAAAATGAACCAAAATATTTATAAATATAGCAAAATTTTATTGTCTATATGCGATAGACCGCGATAGATCACGATAGACTATTATCTATGTCACGATAGATACAGATAGTAGTCTATCTAAATCTATTGTAGATAGACTGTATTTTACTATTAGTAATTTAATCATTATTTAACTGAAAAGGAAAAGAATGACACAACACAACACGTTGTCAAAAGGAAAAGTACATGTCAGGGCATATTGAGGTTGTAAATTTTAAAAGATGTAGAATTTTTTTAATGTTTTAGTTTAAATTTGTTTAAATTTTCTCTTTTTTTTTTTCTCCTCTCTCTCTCATCTCTTCGTTTTCCTTTTCTCCTATGAGTTTATTAATTTAGGAATCTGTGGACATTTTTGTTTCTTTATTTTTCTTATTATTTGGACGGTTTGCTACGACTTATTTTAACAAAAAGATATATATATAAAATACAAAGCTAAAATTGTAAAAATATCGAAATTCAACCATGAGAGAACCACACCGGAAATAAATGAAAGTGAGCCCTACCAATCAAAATAAATGAACATTGTAAGTTATTTGTTGGTATCATTAATATTTTGACTGCTATATAGTTACGTGTCTTCTTCCAACCAAAATAAATGAACATTGTAAGTTTTATAGAAATAAAATAATATACTTATGAATTTAATAAATTGAATGAGATCAAGTGTATTCGATGTTAATATGAGCATAGTTCAAAACTTGACATAAAACATATACTATCGATATAAAAATAAGAGACTCGATTTCCCACCTCACGTATCAAAAAAGGAAAGTATACCAAACTCAAACTTAGTTAGAGTGGAGAAATAACTTATTTTCTTTGTCCTTATTGATATATTTATGCAAGGTTGATCACGCATATATATAGGATTATTCACGACCTTTTCCTTTACCATTGATAAAAAAGATTGGTGTCGAACCCACTTGGGTTATCCCCGCCTTGTTCATGCATGAATGAGACTTGTCTTTGCTGGGCCTAGGGTTTCTAGCGTCTCTCAATTTCTGTGATTTTGGCCCGTTTCATTTCAAACTTCTTGACTATGTTGGTTCTTTCATTTATGTGTTAGGGAGTGAAATCGAATCACCTTCAAATTCTGCCTAAATTCCTATCTCTCCAATGCCCAATTGGGTCATGGGGTAAATATCAGGCTCGGATTTGATTCGGTTTCTCGGTCGATATAATATTTGAATTTGTTCAATATCGATTATGCTTCTTTAGTCCAAAATTACTCACAACAACAATATCTCCTTATTTATTTTATTTTGAAAGTTTATTTGTTTGGTTAGCTTACGTTTGTGGCGTGAGGGAAGGGCTAATACTTGAAACCCCATATAACATGGGAGACACTCTTAATGGAAAACGTGGCCTACAAATTGAAGACGAGTTGAAGCTTGTGGATCATACAATATCTAACCTTCGAGCTGAGAGAGCTACCCAAAAATCCATCACTTTAACCATCAAAGATTTGGGTATCGAAAGGTTAGTATAAAACACTCTTTTTCTTTACTTCTATGCTTCAATATTATTACCATAAACCTCATAATATTTAATTAATACTTTTTTTTTTCCCTTAAATTTTGGATTTAGTTTTTATTTGGTCTCTAGATAACAGTATTTTATATTTTTAGTACTTAAGTTTTGAGTTTAATTTCAATTTAGTTCATAAGTTTCAAAATGTCATAATTTTACCCTTGAAGTTGAATTTTGTTTCAATTTGGTCCCTAGATTTCAATTTACACTTTTTAACACTTTGATTTTTCCATTAAATACTCACTTTCATTTTTTGGTGTTAATGTCTATTAACTAATTTTAAATTAGTTAAAAGAATTATAATTATGGTTGTTTTCAAATATAGCAAGATGAGTCAAAATATTTAGAAATATAGCAAAATATCATTGTGTATTAGTGATAGACTATGATAGACTCTAATAAACTACTATCATCTATCATTGCCTATTAGTGATAGACACTAATAGATGTCTATCATTGTATATCGTTGTCTATCACTAATAGATAATCACATTTTGTTATATTTGAAAATATTTTCAACAATTTTGTCATTTAAAATAATTAGCCTTATAATTAATTAATTGGCACTATGTTTTCTATCACTATTAAAATTAATTTTAAAATTTAATTTCACAATAATTTTCAATTAATTAATAGATATTAATTGCAACATTGAAAGTTGGGTATTTAATGAAAAATAAAATTCATGACTAAAACTATAAATCTTGAAACTTAGGGACCAAATTAAAACAAAACTCAAAACTTAAGAACTAATTAAAGTGTAACATTTTGAAACCTAGTGACTAAATTGAAATCAAATTCAAAACCCAAGGACTAAAAGAGTAACTTTTTGAAGTTCTAAGGACAAATAAAAATTAGACCCAAAACCTAAGGATTAAAAGTGTAATGAAGAATGATATTTAGGAAAATTATGATAAATATAAAAAAATATCAAACTACTTACAAATATATAAAAATTTAACTATCCATCAGAGATAGAAGTCTATTGCAGTTTATCGCTCAAATGATAGAAGCTAATCACAATTTATTGTTGATAAATAGTGAAATTTTTTTTATGTTTGTAAATAGTTTGACTCATTTTACTATATTTGAAAACGAATCAATTATTTAAATGAATCTTAATTATCAGGGCACAAAAGTATGGATGGACAAACACATACGTATTTACAAAAGCAATGGGAGAAATGTTGATAAACGACCTAAAAGAAGATCTTCCTGTGGTTATCATACGTCCCACCATTGTTTCTAGTACCTACAAAGAGCCATTTCCTGGTTGGGTTGAAGGTGTTAGGTATGTATAAATTTCCAAAATTTCCCTATATATACTCTTAGTCAGAATCGTCTATTTTGTAAAACTAACATTTGGATAAGTTTACATATATTTGATAATCATAATGAGAAGTCTAAATTGATTAGCTTATGAAAACTTAGGAGTTTAATTGACTTAAATTGTAAGTTTCAATGATATTGGTCAAATAAAATCTAGAAAAGAGTTATAAATCGATCACTGATCATGAATCTTTAAGATTTAAATTGATACAATTATTAGATCAAGATTTTAATTGATATAACCTCAAAAAATTAGCGGTATAAATTTGATATTTGTCCTAAATTTTTTTTATTTTAAAATTTTTTTTTAATAAAAAAA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BLAST of Cla97C01G011960 vs. NCBI nr
Match: XP_038893773.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 900.6 bits (2326), Expect = 6.0e-258 Identity = 444/492 (90.24%), Postives = 471/492 (95.73%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. NCBI nr
Match: XP_008462137.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 3.4e-253 Identity = 430/492 (87.40%), Postives = 469/492 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. NCBI nr
Match: XP_004139568.1 (LOW QUALITY PROTEIN: fatty acyl-CoA reductase 3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 882.5 bits (2279), Expect = 1.7e-252 Identity = 434/492 (88.21%), Postives = 465/492 (94.51%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. NCBI nr
Match: XP_008462145.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 5.5e-251 Identity = 427/488 (87.50%), Postives = 465/488 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. NCBI nr
Match: KGN64901.2 (hypothetical protein Csa_022764 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 854.4 bits (2206), Expect = 5.0e-244 Identity = 424/492 (86.18%), Postives = 455/492 (92.48%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93ZB9 (Fatty acyl-CoA reductase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 594.0 bits (1530), Expect = 1.6e-168 Identity = 289/491 (58.86%), Postives = 368/491 (74.95%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XGY7 (Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase OS=Simmondsia chinensis OX=3999 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 593.6 bits (1529), Expect = 2.1e-168 Identity = 291/490 (59.39%), Postives = 371/490 (75.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39152 (Fatty acyl-CoA reductase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 515.0 bits (1325), Expect = 9.4e-145 Identity = 258/488 (52.87%), Postives = 353/488 (72.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXN3 (Probable fatty acyl-CoA reductase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 1.5e-142 Identity = 251/488 (51.43%), Postives = 350/488 (71.72%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WRB0 (Probable fatty acyl-CoA reductase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 6.9e-140 Identity = 255/492 (51.83%), Postives = 349/492 (70.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGS1 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 1.7e-253 Identity = 430/492 (87.40%), Postives = 469/492 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGA9 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 2.7e-251 Identity = 427/488 (87.50%), Postives = 465/488 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJ29 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020507 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 820.8 bits (2119), Expect = 2.9e-234 Identity = 410/495 (82.83%), Postives = 450/495 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5FU12 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_006230 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 708.0 bits (1826), Expect = 2.8e-200 Identity = 343/492 (69.72%), Postives = 402/492 (81.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5WHQ7 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G126900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 3.6e-200 Identity = 340/492 (69.11%), Postives = 403/492 (81.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. TAIR 10
Match: AT4G33790.1 (Jojoba acyl CoA reductase-related male sterility protein ) HSP 1 Score: 594.0 bits (1530), Expect = 1.1e-169 Identity = 289/491 (58.86%), Postives = 368/491 (74.95%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. TAIR 10
Match: AT5G22500.1 (fatty acid reductase 1 ) HSP 1 Score: 515.0 bits (1325), Expect = 6.7e-146 Identity = 258/488 (52.87%), Postives = 353/488 (72.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. TAIR 10
Match: AT3G44540.1 (fatty acid reductase 4 ) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 1.1e-143 Identity = 251/488 (51.43%), Postives = 350/488 (71.72%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. TAIR 10
Match: AT3G44550.1 (fatty acid reductase 5 ) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 4.9e-141 Identity = 255/492 (51.83%), Postives = 349/492 (70.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G011960 vs. TAIR 10
Match: AT3G44560.1 (fatty acid reductase 8 ) HSP 1 Score: 483.0 bits (1242), Expect = 2.8e-136 Identity = 249/498 (50.00%), Postives = 350/498 (70.28%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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