Cla97C01G001260 (gene) Watermelon (97103) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACGTAGCATTAGAAATTTTCCCGCTAGCGCGGGGATGGACTACATCGCCGGAGTCGAAGAGTTGAAGGCTAATTGCCGGAGTTGAAGAGTTGAAGGCTAATCGCCGGGAATGGCGACGCCGTCATCGTCCTCAGCATCTTCAGTAAGGTCGTGGAGGACGGCGTTTCTGACTCTGAGAGACGAATCGATCTCTTCTTCAACTTCAATTTCCCAACTTCTCTACGACACCATCTTCTCGCACTCCGATTCCTTAATCGCCGCCGCGCGCTACCTTCCTCCACCAGAAGTACGATTTTCTCATTTCTTCTATTTATCTTATTCGAGGCTCTTCAAAAAATGCATAATCATCGCTTTGTTGCTCCTTCTTTGTGTGCATAGGTTTCATCAGATCTGCTGTTTCTCTTAGAAGTGACTACTTCTGCTTCCGACTCCGTCCAAGACATTGTGCTTATCTTCACAGATATCATACATCTGGTGCAATTCATATTTTCGATTTCTATTATTCCTTTTTTCTTCTTTCGGACCAATTTCCTAGGGGTAGAGCCAGAACGATGAAATTGGGAAGTTCTGTTAGTTCAATTTCACGCATCTGTTAAGAATATCGCCAACAATTTAATCATGATCTATTCTGCGTATGAAAATGGGTTGTGTGATGTTTAGAAACTGGAAGAAATTCTTTCTGATTTAAGCCTGGGAAATGAAAATAACCATAGTTATCAGAGAGACCCTAACGATTCAGCCTTCGGGAAGAGTAATTATATATCATTATATTGCAATATTTATTGATATAAAAGTTCATTCCATTATACAGAAGCTTCAGTTGAAAGATCAGGAATCATCAATCAGTACTTTAGATAATGCAATAGGTTAAGCAAATATTATTGGGTTTAAGTGATTTGAAACTTCAATTTTATTGGCGAACGTTCTCAAGAATTGATAGTCTCTACTTGATATATATATATATTTTAATTTTTTATTTATGATGAATAACTACACTTCCATTGAGAAAAAAATTGAAAGAATACATGGGAGTACAAAAAAGGGAAGCCTACAAAAGAGAGGAGGCTACCTAAAAGCCTCCATTCAAGCAAACTATAGCTAAGGAATAATTACAAAACCGCCCACAAAAAAACATGGAATCTAGCAAGGGACTGAACTTGACGGTCTCTACTTGATGTTATGCAAATTCACCATCAAATGCCAAAATGCTGTTTAAGACATCAATTCATACTGTCGGTTTACTTTCATTTTTTGTCATAATAACTATGTATGTGAATGTCGAATATTTAGTGGGAAGATATGTTGACTGACTTCAAACAGGTTGAACATAGCAGAAAACTTCATTGTATATGGAAGATCATTTGCATTTAATATCATTGAGAAAATGTGTAACACACATTGAACATATTTCATAAACATGCATCCTGCTAGATATAATTTCAGGTTTAAATTACTATAATCAAGTACGATGTAGTATTTGTTAAAAAGATATACGTTTCTGTATGACAAGGAATTCAAGTAGTGCATATTTTTATACATAAATGTTTTCCAATGGAGATAACCTTGCTGCCTTAATGTGGTTCTGACCCTGCCTATGCTCTTCTGAATTCTCAGTTTTCTCTAATTATTGATAGTTTTGCACCGAATGCAGATCCACGGTATTTCTTATCAAGTTGCTCTTGAATTTAGTTCTTCCTCTTGGAACCTGCTCCTACAATATTTTGGAGATGTGATCCGAATCCTACTTGGAAAGCTTAATACTCCAGGAAATTATGCTCTAATCAGGCCTGTCTTGGAGTCTTTGGAGTTTGTAAGGTTCGCTTCCCTTTTCTCCTCTGTTAGTTTGAGGAGATACTACTCTTTCTTGCTGCTTTCACTTCTGCACACTGGGTTAGTATTTTGTCATTTGGACCTAGAGTGCTGTTTGCTCAGCTGCGTAAATTTGTTGAATCTGATGAGATCTGTATAGTAATAGCAGGTAGGTTGGTTACTCAAAGTATCCACAGGTTTTCTTTATAGAGAGAGAGTTACTAAATCTGAATAAAGGGAAAAAATAAATTTCATCGTGGTTTTTTGATCATATTTTTGGTGCATATGGAAGGAGACAACGTAATTTTTTTAATGTAGAATGGGAAGCCTTAGCTGCTATTTGGTTGAATCATGAATGTTCACTTCGTTAGTTTCTCTTGGGATTTCTTGTACTAAAGAGGTTAAAAGTTGTTCTTTGGTCATGATTTGATGTTTTGCATCTTGTACCTTGTTTTCCCTTTTATGGAAATGATCAATTGTCTATCTTTTTTTGCAGACACGTTGTCTGTTTACAACAACGCAAGTTTTTACCAGCAGAAGATATTCAGCTCTCAAAGTTCTTGCTTTCTGTGATTGCTGGATCTCAATCAGCAATATTCCCTTCATCAAATTCAATCATTAGACACGGTTGTACTGCCGAAGTTGTGAAAAGTGTACCCAAATGTAATAGTTTATGGGATGTTCAGGCTGTAGCCTTCGATCTACTTAGTCAGGCCATCACAAGTCTAGGGTCATATCTTCCAGTCGATGTTTGGAAGTCAACAATTCAGGTAGAAACAATTCTGTTACATTTGTGGTTTTTCATATATGCATTTGTAGGAAAATTGGGATATATTCAATTTGAATCCTTTGCAAGCAATATATAGGCAATTAGCCAATAAGGAAATAGTGTATTATTATTATTTGGATGAATAATCAAAACTTTCATTGAGAAAATAAAAACGGAAAAAGAATAGAGGGCACACGAAAATGAACCCACAAAAAAGGAGGTAAACTGAAAAAAGGCCTCCAGTCAAGTAAAATAAGACCTAAAGGTACAAAAGGACCTCGTTACTGTGCTCTAGAAAATAACATAGAACTGAATGAGGGACCGAACATCATGCGAAGTTTTCTCAAGCATCCAAAAATTCTACCATTTCTTTGTCTCTGAAGATCCTTCAAAACAACACATCCTGATTCGTCATGTAAATCTCCTTTTCTTGCGAAAGGGCTGATGGGAACTTCTCAATCATTTCTAAAAGAGAGGGTGCGATTAGATTAGCCAAGTGTTCAAAGTTGAATTCTGGAAATATCAAGAGATATTGACTAGTGGAATATGGGCTGTTGGTTATGTTTGTGGGAATGCTTGCTGTCATTAGTTATTGGAACGCTGGACACTTTTGCGATAAATGTAAACTATTTTCAGCTGGCACGGTAACCTTCAACAATGCAGATAACTTGTTGAGCTTGATTCTTTTGTTCATAGGTTATTCGAAAATTGATGGATTTCTGGGCATCTACTAGCTTACTTGTTGAAGACAAGGTGATGTCCAGGTATACAGCTTCAACAATGTTTTAATATTGTACAGTGTTCATTGTTTTTAGAGAGATATGTTGCTTTTGATTTACCAGTGAATTACTGTGCCAGTCATCCTATTGGGTTTAGTATAGTTGCTGTGTTTTGCCTACTGTTTTTCTTTTGATTGTTACTAGTCTCGATGTTTATTTAAGAAGTTTCGGACTATATCTCATATAAGATGGATTATCGAGGCTTAATGAAAATTTCCCTAAGCCATCTTGTGCTTCGGGCTAGAGGAAAGCTTCCTGGTTTAGATGAAGTGAATGAGTTATCTGATCTTAGGCTTGCTGTCCTAATTTATCTCAAGAACTTTCCTCCATTTTTGTGGAGTCTTAGCCAAGGAAGGGGCTATCAGTTTTCTGGTATGAAAAACTGGTAGCAATATTTGGCTCAAGCATATAGACAGCTTTTGTACAAGTCATTAATGGCTGCTGCTTCTAATTAATTGAGGAAAAAAAAAGCGAAATCCAATGAGGGAGTTGTAACCTTTTCACATACAGTCTTGGCTTTGGGAGTAGCCTTGGTTTATGAGAAATTACCATTCAAAACTAACTATCCTAACTAATCCTTACAAGTTACGAATCTATTTTTATTTGGCTTAGGTTTTGGATTAAAGATCAAATGAGGGTATCTTTCAACTGCCATGTGGAGTAAAGTTGAAGAATAAAGCTAAAAGTTTGTGGCTTGTTGCTGTATAAACTTCTTTTAGATATTTGTTTTGAAAGGAACTAAAGAATCTTTGAAGGAAGATCTTTAGATTGGTATGAAAGATGAGATTTTGCAAGGGATGATGCTAGGTGTCTTCTGTTCCTTTCTATTGTTGCCATGTCCAATTCTAGTTGGGTTGGTGTTTGTTCATTTGTTTGTTTTTTCCTTGGTATTTTTTTCTTCTAGATAAGAAACAAATTTCATTGATGTATGAAATTTACAAAAAGAGACCGGAGTCCAAACCAAAGGAGTTGGGTGAGAAACCTCCAATTGGTCAAAAGAGAAGTAAGATTGTATGAACTCAAGAAAGATGTACATTTGCACCAAGTCATAGCATGATAGATAATGAGTTTAAAATAGCAATCAAAGGAGCTTCCCTTATCATGGTGATGATATGGGTAGTTTTGTTTGTAATTCTTGCTGTATTTTTCGAGAGGGGGAGTGTTGATCTTTGGTGGGTGTTTCTTTTTGTACTCTAAGGGAGTCGTATTTTGTTTCCTTGTCATTTTATGATTTCTCATATATCAATTAAAACAGGAAACTAATCACAAGTACATAATGAAGGCCTATGTACTCCCTAAGGCTTACATCATTTACCCAGGCAACAGCCATTTCATTGGCTTTATTAGAAATTATGTGTTTTGCATTCTGTTTTACCAAGAGTTTCAAACTGTATGAAACGAGCATTTGCTTACCCCATTATCCACCATTCCTAGTGAGAAACTGTAATTCCTTATCTTGGCCCATTTTCAAATTAGTGAAACAAGGCTTCATTTCCCCAAACTCCTTTTTGTATTTGGGTGGGGGGTTGGTTGTTTTTTTGGGGTTCTCTCTTGTTTGCTTTGTATCCTAAACTTGGTTTCTTGTAAAAAAAAAGAATAGCCATCCTTTTCATGCGTTGGTGTTTTCTGTTCTGCA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MATPSSSSASSVRSWRTAFLTLRDESISSSTSISQLLYDTIFSHSDSLIAAARYLPPPEVSSDLLFLLEVTTSASDSVQDIVLIFTDIIHLIHGISYQVALEFSSSSWNLLLQYFGDVIRILLGKLNTPGNYALIRPVLESLEFVRVLFAQLRKFVESDEICIVIAGRLVTQSIHRHVVCLQQRKFLPAEDIQLSKFLLSVIAGSQSAIFPSSNSIIRHGCTAEVVKSVPKCNSLWDVQAVAFDLLSQAITSLGSYLPVDVWKSTIQVIRKLMDFWASTSLLVEDKVMSSHLVLRARGKLPGLDEVNELSDLRLAVLIYLKNFPPFLWSLSQGRGYQFSGMKNWYYLSLLRCLHLVIAEPKCSLSDHVSAFVVALRMFFAYGFSNRPLLACSVGNQGKEPSLTSTKSSLEEPKKENHSAYRPPHMRRRENLNKKQANVQNSQSSMTAESLNCDLISSDSDHDSDGPGRDADIIQNGKVRVAAILCIQDLCQADPKAFTSQWTLLLPTRDVLLPRKFDATLMTCLLFDPSLKAQIASAAALVLMLDRTTSISLQIAEYRDPAKCGSFMPLSISLGQILMQLHIGVLYLIQRSTHGRLLTILFKILLHLISSTPYPRMPEELLPNMVKALQATIEEGFPFKSDQTDLLVAAISCLNVALSTSQLSPHVKEMLSKQLSTAQKGNSVLVILLQYSEQLTNPTICIEALQALKAVSHNYPHITFAFWEQVSSVVSNFLHEAAPEVSTGQWRVQSRNSVGIIGEKVITAAVKVLDECLRAISGFKGTEDLLDDNLLDSPFTSDCIRMKKVSSAPSYELKNLDETIDRPEEVCAGMKQWCEVIEKHLPRSLVHTSAMVAWGKQIIYDENDELQENDSKFLQSENVQYQTRSRSSRSLVISFLHKPPRDVAVRAASVTCFAGITSSVFSSLSKEKEDYILSSVVNAAVYDEVPSVRSAACRAIGVISCFPQVSQSAEILDKFIHAVEINTCDSLVSVRVTASWALANICESIRRFFDDFPSRQPTDSIECSHTLTLLIESSLRLANDGDKIKSNAVRALGNLSRLMKFSCLISPCERPRSNSMVANNSEDLLSKGDSKVQPGCPSKNLNDTISFYNLSFLERIVQAFISGITTGNVKVQWNVCHALSNLFLNETLRLQDMDRVSSLFNILLLLLRDSSNFKVRIQAAAALSVPASVYGYGKSFPDVVQGLEHTIENLESNHILAPSFKYKVALEKQLTSTMLHVLSLAASTDNQPLKDFLVKKATFLEEWFKALCSSLGERSNWHGDGEDNSTNNQKREMISKALRSLTEVYTSSNHSAISQRFEDLDKWIH Homology
BLAST of Cla97C01G001260 vs. NCBI nr
Match: XP_038875588.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2074.7 bits (5374), Expect = 0.0e+00 Identity = 1122/1327 (84.55%), Postives = 1145/1327 (86.28%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. NCBI nr
Match: XP_004145966.1 (uncharacterized protein LOC101212003 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49951.1 hypothetical protein Csa_000577 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2038.5 bits (5280), Expect = 0.0e+00 Identity = 1104/1327 (83.20%), Postives = 1137/1327 (85.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. NCBI nr
Match: XP_008437482.1 (PREDICTED: HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2021.1 bits (5235), Expect = 0.0e+00 Identity = 1098/1327 (82.74%), Postives = 1129/1327 (85.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. NCBI nr
Match: KAA0042623.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 1074/1322 (81.24%), Postives = 1105/1322 (83.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. NCBI nr
Match: XP_031741422.1 (uncharacterized protein LOC101212003 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1945.2 bits (5038), Expect = 0.0e+00 Identity = 1064/1324 (80.36%), Postives = 1095/1324 (82.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1EC95 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 1.6e-29 Identity = 196/872 (22.48%), Postives = 363/872 (41.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R5R2 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=HEATR6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 6.0e-29 Identity = 195/869 (22.44%), Postives = 354/869 (40.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AI08 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.0 bits (328), Expect = 1.0e-28 Identity = 198/876 (22.60%), Postives = 361/876 (41.21%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P1G0 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.0 bits (328), Expect = 1.0e-28 Identity = 205/891 (23.01%), Postives = 368/891 (41.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZY56 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=heatr6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 5.6e-27 Identity = 202/894 (22.60%), Postives = 373/894 (41.72%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KQH7 (DUF4042 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G146250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2038.5 bits (5280), Expect = 0.0e+00 Identity = 1104/1327 (83.20%), Postives = 1137/1327 (85.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUR0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2021.1 bits (5235), Expect = 0.0e+00 Identity = 1098/1327 (82.74%), Postives = 1129/1327 (85.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TH89 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold44G001190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 1074/1322 (81.24%), Postives = 1105/1322 (83.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H3P0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1915.6 bits (4961), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1324 (79.00%), Postives = 1086/1324 (82.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAB7 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491546 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1909.4 bits (4945), Expect = 0.0e+00 Identity = 1048/1327 (78.98%), Postives = 1085/1327 (81.76%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 912.1 bits (2356), Expect = 5.0e-265 Identity = 583/1328 (43.90%), Postives = 783/1328 (58.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 251.9 bits (642), Expect = 2.8e-66 Identity = 188/532 (35.34%), Postives = 271/532 (50.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. TAIR 10
Match: ATCG00860.1 (Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core ) HSP 1 Score: 50.1 bits (118), Expect = 1.6e-05 Identity = 25/35 (71.43%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C01G001260 vs. TAIR 10
Match: ATCG01280.1 (Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core ) HSP 1 Score: 50.1 bits (118), Expect = 1.6e-05 Identity = 25/35 (71.43%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (97103) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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