ClCG11G000040 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG11G000040
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr11: 74374 .. 79182 (-)
RNA-Seq ExpressionClCG11G000040
SyntenyClCG11G000040
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCAGTTCCACAGACGCTACTTTCCACGCGTTTATTGGCTGAATAGCGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTAAAGTTTCATGGTTAAATTTGATATAATTTGTTTCGGATTGAATTTTAGTGTTTGAATTTGATTCTATTGCTTGTAGCTCTTCTGTTTTAGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGGTAAGATTTGGGCGGTAACGGTGCTTTGAGACTCTTTTGGACTCAGATGAAATGATTTAGATTAATGTCTAACCCTAGGGAATTCGTGGTTGTAGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAAGGTTTAAGGTCGTGTTTTGGTACGCCCCTCTTGAATACTCTTTTCAACTCAATTCAAACGGCTAAGTATTGCCCTTTTTGTTTAGGACTCTTTTGGGCTTAGGAGCACTGTAGGCAAGTAGAGTTTTACTTGTTGGGTCTGTATGTTGTTTGCTATTTTCCTGTGCTTTATTTGTGCTATTATTCTTTATGATGTAAATACTTGACGGTCTTAAACCTTTAGGTGCTTTGGATGTTTAAGCTTGCAGGAATGTTGTAATGATGTTGTGACGACTAACATGCTGGGGAGTGGTTGTATGACCTTGTGTTATAAGCATGTGCTACTATTGAAAATGTCTGATTAAGCATATGATTTCTGTTGAGGGTACACTATTGTTTCATGTGGTTTTTACATATAGAAGGGTTAGAATCATATTGTAGGACTCATACATTCAAATGATTGTGTGAGAAAGAAGTTTAGGGTAATTCGTGCATTTATAAAGGAAAGTGGGTGCATATCGGTGTGCCTTAGGTAAAAATGGTCATGGGGTGATATGTCGTTGTTGGTGGCATTGATGCCTTGGGTAAAAATGATCAAGGGTCTACGTAGAGGGTCTACAAAGGCAAATATTGGGGCTCTTAAGAAAGAGGTACAATATGTTGCTTATTCATTGAGACATTGGATAAAAATGGTCAAGGGTCAATAGTTGAGCGTCGCAGAGAACGTTGAGGCCCAAGATAAAAATTATAAGGGGTTGCCGCATCTTGAAGGAATCAGTCTCAGAGAGCTTTGGGAGGGCTAATATGAGTGTTGAGTAGTTGAGTTGAGTGAGCTCGTGAAGCTAGCGTAGAGGTTGAGTGTGTGTTACATGGCGTGTTGAGTAAAAATCATCAGCACCTATAAAGTTTGGTTGTGGCTCGGTACATAACGCATATTGAGTAAGTAGCTCACACTTGAGGAGCCACCAAATAGCATACAAGGCAAACATCATGCTATTCACAACAATTTTATTAGATTTTTACATCCATCCTCAAGGTTTTGATTTTCTGTTCAATGTTTGATTTGCCTTATCTTTGAGCTACCAAACAGCGAACCTCACCTATGATTGAGGGTTGAGGGAGTTTTATTCTTATCGTCTATTTTCACAACCTAACTTTATCCTTTTTTAAAAAGAGAACAATAAATTCTGCATATCTGTTGTGCTTCTCACGTCCTTATGCTATAATACTCACATCATGTTTTGAATTATGTAGGTGACTTTGTTAAGTGTCACTAGGAAATGAGGAAAAAACCTATTTTAAATTTCATATGCATGGTCAAGCTAGATAACAATTGATATAGCTGTATATCACAAAATTAAACTATTTCATTCATAATGCAGCAATCATTCAGTCTCTATCCCGCACTGGCTTGAGGAACATAGCCAACTGGTGTAGTTTATAATTTGAACAGAAAAAGGAAAAGGAAATGCTACGAAGACGACTGTGTTACTTACTATCTAGCTCACTTGGCTCTGTGCGTTCTAAACCCCCACCTGCTATTGTAATAAACCAAGCATTATCGTGTCCGTTACTAGAGTTCCAGCAAACCCCTAGCCTTGATCGGAGAGTAGGTTTCCCTCTTTCGGGAAATATCTTTGGTTTTCGAGCTTACAGCCTTTTGAGCTTAAATGATCTGAGAGACAAAGTTCCAAGGAAACAGAAGACACGAAAGGGTCGTGGTATTGGTTCTGGGAAGGGGAAGACGGCTGGGAGAGGTCACAAGGGCCAAAGAGCAAGAGGCTCTGGGAAGCTTGGGTTTGAAGGGGGTCAAACCCCACTTCGTCGTAGGCTTCCTAAAAGAGGCTTTAAAAATCCTTTCAGCCTCACATTTCAGGTATTTGATTTATGTTCTCATCTTATTGCTTTGTTGTTTGTGATCTGTGTTTTAAAAAGCCCACAGCCCACTGAGGCATGCACCTGGCACAACCTTTGTGTGACTGCGTCTCACTTCAAAGTAGCGTGCCTCAAGTTTGATTTCTTACCTTTATTTTTTCTTCTAATTTTGAAGAAATAATTATGTTAATATTCTTACCATCTTGAATAAAAGCTCTACTTTCTTGAGCTTTTTATTATTATTCATCATACTAATTTCCTTCAAACTTTGTTTACATTATCCCTTATTAAAAAAACCTGTGCTTAAGCCCATGGAAGACTATTATGCTGTAGTGCACCTCCAGCATTGTTTATTTATTTTGAAAACTTTTTGCAATGGTTTGATGCAGAATTCTATAAATATAATGCGTCCCATTTTCATCTGGAAGAAAGCAGTCTTTAATATCCATATCTACTAGTAAATTTTTTTCCCTATGCGATGTTATAGGCAATTCATATTGCTTGATCTCTAAAGATTTACCTTCTGCATTTTGCATTACTTAATGCACAGCATATTTGGTATCTTCTGATGTTCAATCTCGAGCAATATTATTTTTGATAGTGTAAAAGACAAATATTTGTTTTGGCAGAATAATTTTTCCTTGAGTATTATGCTATTTCTTTTGTTTGATTCTTTCTTTGGTTTAATGACAGCCGGTTGGTTTGGGAAAGATTGCTAAACTTATTAATGCTGGGAAAATTGATTCCTCTGAATTAATCACTATGAAAACTCTCAAGGTATTATATGACTTCTATCTCAATTAGTATATCAAAAGCCTGAAGTACTTGTTTTTTTGATATTGTGTCATATTATTATGCTTACCAATATGAAAATAGGATACAGGTGCAATTGGAAAACAAATAGAGGATGGAGTAAGATTGATGGGACGTGGTGCCGAACAGATTAAGTGGCCAATTCACCTAGAGGTAAATCTTCAACTAAAAATGTTTTTCTTTTTCCCTTCTGAGGTTGACTTCAATACCTATATGCTCCTTAGTTAAGCTGATGTTCTGTATAGATTATTCATAAATCTGGGGTATTGTCATGCTACTAATTTGAATTGAAGCTAGTGTACTCTTCTCAAAGAAGGGTCTAGTGTTGCAGATATTCTTCCAAGGATTGCATCTTGCTTTCTCTGTAATCTGGTTTGGGATCCAATTGCATTCAGATTACAGATTACCCGAATTTGGTATAACCAAAGGAATATGTTAGGTTTCAATACCCTGCACTCAACATTAAGCAACAAAGAACAGAGCAATATTTACTCTGTTTTACGATATATTTCCAACTAGAAGTTCCCAAGCAACTTGTAACTGAATTCTTTAACTCGCATCCCGAAGTTTCCTTATTACCCCTTCGAGAGATGTATAAAGGATTGGGGGTCTCACAGAATATTCCATGTTTGTGTAGCTTTTCAGACATTCTTATTTGCCTGTGATTGACGTGCTTAGTTTAGGTAGTATTAGCTAAAATACAAAGAGATCGCAAAAAATTTATTTCCAAGTTTTGTCATTCTCAGGTCTTTAACCAAGTGGATCGGGTCCAATAGCCTCTGATTTAGCTAGCAAGAGCTTCTTGCACATGGAACTATTCTTACGAGCCAAATGTTTTTCAAAAGCTTTCAAAATCAATTTTGAGTGGTTGTCAAATACTTTTATTTATTGCAAAATGACTTATTTTTTTAAATTAAACACTTGAAAGAGTATTCTAAACACACCCTAAATGTATGATGTTTTCAGGTGTCGAGGGTCACTGCTAGGGCGAAGGAAGCTGTCGAAGCTGCCGGTGGGACTGTTCGGAGAGTGTATTACAACAAATTAGGCTTTCGGGCGCTTCTCAAGCCTGAGTGGTTTGAAAAGAAAGGCAGAATCCTGCCACGAGCAGCAAGGCCACCGCCAAAGCAGCAAGACAAAGTCGACAGCATTGGCCGCTTGCCTGCTCCAACTAAAACCATTCCTTTTTCAGTTGAAGATGTAGATGGAGGGAGGGCAGCTTCCAATATGTCTACCTAATCATAGCCGTTCGACTTCGAATTAAGGAATTTAAGTTTTGGTTGCCTTTCTTAAATGCATTTTCTGTAGTAACCTGGTCATGATTTTGTCCCTATTAGTGTTTACACATTTCTTAGGATTAATGATGGACGTTGGCCACTTTTCAGCTGAGATTTTAAGGATTCGGGATGGTAATAAAGATCACGTCATGTTATCTATTATCAAGTCCAAGTATGTGTATAACTCTTAGATGTATACTTTTTTTTTTT

mRNA sequence

ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCACGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAAGGTTTAAGGTCGTGTTTTGCAATCATTCAGTCTCTATCCCGCACTGGCTTGAGGAACATAGCCAACTGGTGTAGTTTATAATTTGAACAGAAAAAGGAAAAGGAAATGCTACGAAGACGACTGTGTTACTTACTATCTAGCTCACTTGGCTCTGTGCGTTCTAAACCCCCACCTGCTATTGTAATAAACCAAGCATTATCGTGTCCGTTACTAGAGTTCCAGCAAACCCCTAGCCTTGATCGGAGAGTAGGTTTCCCTCTTTCGGGAAATATCTTTGGTTTTCGAGCTTACAGCCTTTTGAGCTTAAATGATCTGAGAGACAAAGTTCCAAGGAAACAGAAGACACGAAAGGGTCGTGGTATTGGTTCTGGGAAGGGGAAGACGGCTGGGAGAGGTCACAAGGGCCAAAGAGCAAGAGGCTCTGGGAAGCTTGGGTTTGAAGGGGGTCAAACCCCACTTCGTCGTAGGCTTCCTAAAAGAGGCTTTAAAAATCCTTTCAGCCTCACATTTCAGCCGGTTGGTTTGGGAAAGATTGCTAAACTTATTAATGCTGGGAAAATTGATTCCTCTGAATTAATCACTATGAAAACTCTCAAGGATACAGGTGCAATTGGAAAACAAATAGAGGATGGAGTAAGATTGATGGGACGTGGTGCCGAACAGATTAAGTGGCCAATTCACCTAGAGGTGTCGAGGGTCACTGCTAGGGCGAAGGAAGCTGTCGAAGCTGCCGGTGGGACTGTTCGGAGAGTGTATTACAACAAATTAGGCTTTCGGGCGCTTCTCAAGCCTGAGTGGTTTGAAAAGAAAGGCAGAATCCTGCCACGAGCAGCAAGGCCACCGCCAAAGCAGCAAGACAAAGTCGACAGCATTGGCCGCTTGCCTGCTCCAACTAAAACCATTCCTTTTTCAGTTGAAGATGTAGATGGAGGGAGGGCAGCTTCCAATATGTCTACCTAATCATAGCCGTTCGACTTCGAATTAAGGAATTTAAGTTTTGGTTGCCTTTCTTAAATGCATTTTCTGTAGTAACCTGGTCATGATTTTGTCCCTATTAGTGTTTACACATTTCTTAGGATTAATGATGGACGTTGGCCACTTTTCAGCTGAGATTTTAAGGATTCGGGATGGTAATAAAGATCACGTCATGTTATCTATTATCAAGTCCAAGTATGTGTATAACTCTTAGATGTATACTTTTTTTTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGGGTAACCCTGATTTCCCCTTACTCACCCAACTCGCTCCATTTCTTCGTCTTCCTTCCACACGCGGCGTTTGTCGAAGAGCGCAACCCACCACCCATCTTTGGAGAGCCTTGGCGGCACGAGCTCTAGTTCTAGGGTGGCAACGTCCGCTTACAGCAGATCCACACAACCTTGACGGCGTCTCGTTGCACGCCACAGCAGCGACCTCAACGTCCACGACTTTCAGCAGCAACCCACTCCTCAATCGACTTCGATTCAGTTTGCCAGTATTCCCTAGGGGTCACATTTGCGATTTTCAACTCGATCACGTTTCAGCAAAGATTCGAGTCCTATCGGTTCTTACTAGTTTCCAACTCCTCCGAACACCTTTCAGCAAAGACCCGAGCTCTTTTTTGATTCAGACTCATTCGGGGTCTTCATACTAA

Protein sequence

MGNPDFPLLTQLAPFLRLPSTRGVCRRAQPTTHLWRALAARALVLGWQRPLTADPHNLDGVSLHATAATSTSTTFSSNPLLNRLRFSLPVFPRGHICDFQLDHVSAKIRVLSVLTSFQLLRTPFSKDPSSFLIQTHSGSSY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of ClCG11G000040 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG11G000040 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG11G000040 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of ClCG11G000040 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG11G000040.1ClCG11G000040.1mRNA