
ClCG10G009250 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACTCCGTCTTCTCCGCCACGACGAGCAAGATAGCCATTTGCTGCGTCTCGAAAGCCTTGAATCGGAGACTCTTCGAAATTGTTCGTAGAAGATGCGTTCACGGCGTTGACCGAGCTCGCCGTTTCAGCTGCATTTCCAGTTATCTTGACCTCTACGGAACTACTGGACTTTCTGGTTCATCTTCACCGTCGCTCAGGACTCTTCAGGTTGTTTTGCCTTCACTGCGGCGTCCTTTGCGGTGTGTTTCGAGTTCCTCTGTATCTTTTGCATCTGGTGGCGGAAATGGCGGTCTTGGAGGGAAGAATGGCGGCGGAGGTCGTGGTGGAGATGGTGAACTGGGCGGTGGAGATGGCAATAAGTTTGTTTCTGGTAGTGCTGAGGAGGTTTCTTCACTGTTGCCTAACGTTATCATACTCGATGTTGGAGTACGGATTTTGCATCACTTTTTTGGTTCTTGATTTATCTTATCATTGCACCTGTCGTTCGTCTTTTATCTCTACCGAATTCTGCGATATTTGGATGCACTTTTTTTTCCTGATCCTTCTCCTGTTCCATATTATTGTAATTTATTTTTTTTCTCATAGAAAAAAAATCGTAGGGAATGACATGCGGGGGATGTGCCGCAAGTGTGAAGAGAATTCTAGAGAATCAGGTTATAGTTACTAATTCTCTTTGCTCGGACTTCAATTATGGAAATAATTTTTGTTTTGTTCTGTTATGCTCGGTAATAAACAGAAACCTGAATTAATTGAATGAATTAAATGTAGAAACCATGTTAGTAAAAACCAGTAAGTTTAGAAACCCTCCTCAATTGGTTCAAAGAACTGTTAAACTAAATCGCGGCAAGGTATTGCAAGTGAATGCAGGTTTTTTCTTGATAAATGAACCAATGCTCATGTTATTGTAAAATCACTAAACAGGCACAAGTATCATCTGCTAGTGTGAACCTCACAACAGAGACTGCAGTCATATGGCCAGTACCGGAGGTGAAAGATTCACCTCATAGGGTGAAGCAGCTGGGAGAGACGCTTGCTAATCATCTAACTCGATGTGGTTTTGCATCTAGTCTTCGAGGTCAAAGTTCATCTTTCATAATGGACAACATTATCGTCATTTATGCCTAGTGTTTAATTATTGTTTACATGATCTCTAGTATAATTGTTCGTTAGTTTTTGTGTATGCCTTCCTCCTTTTCTCTGCTTTTGTTGTTCTGTCATCTATACTTAAAATTGTTCATTGCCATTAGTATTTGATCAATTTGTAGAAACCTTTTACATGTGGTAGCTGTAATGCTCACAGTCACCATAAGGCTCTAGGAGCCGGTGGGTCTTTCAATCTCTGGTTTCTTGATGGTATCTTTATGAAGCGAAGTGTTGGGAAAAACCTCACTTGCCACAATTCAAAGTTGATCATTCCATCAATTTCTGCACACCAAATATTTTATTGGACTCATAAAGCTTGACACATATGTTTTACTCCTAGCAAATCAACAAATAGTGAACAACCCACAATATTCACAATATTGCAACTCGTTTCAAGCATTCTTTTATGACGTGGAAGTTCAGACAATGTGAAACCATAGAGCATACTTAGAAATTCAAAAACCCTCAAACTAAAGCTCTGGTACTACTTGTTGGGAAAAACCTCAATACTACCACAAGAATTTACCACATGTTTGCACCACCCAGCCACACATGCCCCCACCCACGTACACACGTGCATAATTTCAGAGTGGAAAAAACTTGAATAAAGGCTGCTTTAGAAGTTGAAGTTTTAACTAGTCTTAGCTTCACTCATCTCAAATGGTAGTGAGTTTGATATATTAGATGTTTGTATTCCTTGGAAGCTCTACTTGTTTACTATAGCTTGATAATACAACTCCTCTTATGTGTCCAGAGTCAGGAAAAGATAACATCTTCATGGTTTTTGAAAGGAAGATGGAAGAAAAGCGCAATCGTTTAAAAGAGAGTGGTTGGTACCTTGTTCCCATGCTTTGGTCCCATTGCCTGACTTTTTTTCCTTTTGTTGTATGGATATTATGTTTACCAATAAATCTCTGACATGCTGCTGTTCTTCATTTATATATAATAACGAACACTGCTCTTTTCTTACACTTTTTCAGGTCGCAATCTTGTTTTGTCGTGGACTTTGTGTGCTGTGTGTCTTCTTGGTCACATTTCTCATTTCTTTGGTGCTAAGGCCTCATGGATCCATACATTTCATACTACTCAATTTCATCTATCATTGTGCTTATTTACATTACTTGGTCCTGGTCGTCAACTGATTATTGATGGTATGAAAAGTCTTGTCAAAGGAGCTCCAAATATGAACACTTTAGTTGGTCTTGGAGCCCTATCATCCTTTACTGTCAGTTCATTGGCTGCCTTAATGCCAAAACTTGTAAGTGACATGTCTATAAATGAAGCCCACATGTTTTTATACAGTCTTATTTATTCATTATATTTTTTGTGGCAGTCAAGCTGTAACCATTTCAATTATCAGTTGGTTTCCTTTTTTATTTTCTATTTTTGTATATTAAGAGAAACTCAATCCTTTTGTTGCCACATTCAAAGACAAAGCTTTGAGTGTTTTGGATAGGAGGGTTTATCCATTATGCCATCCTTCGTAAAATTTAGACTGGATGTAGTTGTTAAATGACAATTTGGGGAGGAATTTAGTAATACGTTTCTTGAATCTGTCCAAGGATGAAAAACATAGACATGAATGTGACATACCCTTGGCATTATGAGAGCTTGTGGGGAGTTGGGTTCAACTGTTTTAATAAAACTTTATCATCCATCTAGTATGTGAATGAGTTAACAGTGTCTGTTGGTTGTTGGGACACTGAAAGCTTAAGTTATTGACCCTTTTTTGAACTTTCTTACTGAAAATTTATGTGTAGGCTCATTAATACTGTTGTTGAATATGATAGTAACAAAATTCACTATAGATGGCAGATTGACTTTTATTTATTTAATTTAATTTAATTATTATTATTATTATTTTATAAAAACTTTTATAAGGTGGTTTCTTATAAAAACATTTTCCAATCTCAATTTATTGTCATTTCTCTTACCAGAATATCTATTTAATGTATTTTCTTCAATCCTCAACATAAAATGCCTGACCTATAATATAATATTTATTTTCTGGACAGGGTTGGAAGGCTTTCTTTGAGGAACCAGTTATGTTAATAGCATTTGTATTGTTAGGAAGGAACCTTGAACAGAGAGCTAAAATTAGAGCTGCGAGTGATATGACAGGACTTCTTAGTATTTTGCCCTCAAAAGCTCGTCTAGTTGTTGATGGTGATACAGAATTGGGTTCAACAGTTGAAATTCCTTGTTCTAGTCTTTCAATTGGAGATGAAGTTATTGTACTTCCTGGGGTTAGTCAAATGAATACGTCTTCAAAAGCTCGTCTAATTGATGTCTTTACTTTATTACAATTACTTTTAACAGATATGTCCTTTCTTTTAGCTTATTATATCCGTGCCAAACTTCATTTGAATAATTTACATAGGATCATTCCTTCTTTAGCTGTTTTGCACTGTTTGAACCTATAATACGGTTAAATGTTTAACAGTTTTACTGTCCACTTTTACGTAATTTTTTCTTGATTTCAGGACCGTATTCCTGCTGATGGAGTTGTGAAATCTGGTAGAAGCATTGTGGATGAGTCTAGTTTCACTGGGGAGCCATTACCTGTTACCAAGCTGCCTGGGGTACATTTCTTTTGTTTTTTTTTTTAAATTTTGGTCAAAGCATTATGATCTCATTTTGATGTTGGTTTTGCATGTTTCTTGGCAAGCAGTAAGTCTACCTTTTGCAAAGTGGTCATATATAGAACAAGATGGTGCCTTTTGCAACTGTCTATATCCTAAATTGCATTTGACCATTATAACATACTTTTTGTTTTCTAAAGTAAAGCACTTCTGAAATCTACTAAGAGTATGTTAGTTTCATTTTATCATAGAGTTTTATTTCCTCCCCTGTGCTAGAGCCAAGTTGCAGCAGGAACTATAAATCTTAATGGAACTCTTACAGTTGAGGTGCATCGACCAGGAGGTGAGACTGCTATGGGAGATATTATTCGTTTGGTAGAAGAGGCTCAAAGCCGGGAAGCTCCTGTTCAACGATTGGCTGACAAGGTTATCTCTGAATTATTTATTTTTATTTATTTATTTTTCTAATTCTATGGTGAAATTGCTTGAAGTAGGTTGACAAGGTTCTCTGAATTTAGGTCTCTCTCTCTTCCCCCCTATTTTCTTATGGATGTCCTTTCTAGGACAAGTTTTGACTCTTTCTTCTCAATGAGATATGCTCTTGGGAGGTTTCTAATGCAAGCCATGGCAAGGGAGGGGAGGAAAGCAAAGCTAGAGAAGAGACGAGAGTAGAGATGTTTAGTGAAGGCATTGGCAGTGGAGTGGAGTGGAGTGGTGGGGAGAGAGCAGGAGTGGGAGTGGAAGAGAGAGAGAGAGAGATCACCATCACCCTGTCACAGCAGTCTCATGTTACCTATTCCTTTGATTTTATTGTGCCAGATTAGTTTCAAGGTGTATTTCTGGAACAACTACTAAGGAGGCCATAGAATGGAACTTTTGGTTTCGAAACTCATATGAGTACAACACGAAGGGAAACCTTCTTCAATATTGATTTCTTTTTTCCAATACAAGTTATAAATTATTTGTTCGTATTGTTTTTTGTTTGACCATTTATTCCTTATGACCACAACAGTTTGAATCAGTAGAATGAGCAACCTCTAAGTATAGATGCATTCTTTTTCATTATCACTTAGAGGTTGTAACAGCACAGTACAGCCTTCTGGGGTTAGGAGTTGTTCTATAGGATTCATCAATGTGTGGCCAAGTTCTTTTTATCATTTATGGTTAAGAAAAACGATGTCTTATCTTTTAAATTCATACTACGCACTTTCTGTGATCTTTCCCGTTGATCTATCACAGGATTTAGTCTTCGGATGGATTTTATCA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MDSVFSATTSKIAICCVSKALNRRLFEIVRRRCVHGVDRARRFSCISSYLDLYGTTGLSGSSSPSLRTLQVVLPSLRRPLRCVSSSSVSFASGGGNGGLGGKNGGGGRGGDGELGGGDGNKFVSGSAEEVSSLLPNVIILDVGGMTCGGCAASVKRILENQAQVSSASVNLTTETAVIWPVPEVKDSPHRVKQLGETLANHLTRCGFASSLRESGKDNIFMVFERKMEEKRNRLKESGRNLVLSWTLCAVCLLGHISHFFGAKASWIHTFHTTQFHLSLCLFTLLGPGRQLIIDGMKSLVKGAPNMNTLVGLGALSSFTVSSLAALMPKLGWKAFFEEPVMLIAFVLLGRNLEQRAKIRAASDMTGLLSILPSKARLVVDGDTELGSTVEIPCSSLSIGDEVIVLPGDRIPADGVVKSGRSIVDESSFTGEPLPVTKLPGSQVAAGTINLNGTLTVEVHRPGGETAMGDIIRLVEEAQSREAPVQRLADKVSNASHGKGGEESKAREETRVEMFSEGIGSGVEWSGGERAGVGVEEREREITITLSQQSHVSGHFTYGVMALSAATFIFWSQFGSRILPAALYHGSSVSLALQLSCSVLVVACPCALGLATPTAMLVGTSLGATKGLLLRGGNILEQFSMVDTVVFDKTGTLTVGKPVVTKVLATSRNERNADSQVNSHGNYSENEILKFAAAVESNTVHPVGKAIVEAARAVNGQSLKVVDGTFVEEPGSGAVATVENRIISVGTLDWVQSSQGQGNCRSVLFGEEVWHAFPGSQRKIVVEAIPCNLREITFLPPSDNFLPTISRYFLHGVVVDHFQEMDDLKAQSVVHVGVDNILAGCIYYEDGIREDASHVVDTLSKQGINTYMLSGDKRSNAEYIASVVGIPKEKICLPHLSISQFPDLLTFLYLLYSGVGFPTPPLVSSQISTSVRHLFSRVLLFCYSFCVDLGGMSILPKGDSIQILEVWNANLEEEFALIREIVDEFNYIAMDTEFPGVVLRPLGAFKNINDYNYRTLKDNVEMLKLIQLGLTFSDENGNLPTCGTDKFCIWQFNFREFNIGNDIFASDSIELLRQCGIDFQKNNEEGINVNGFGFFELINVYFPVVYDIKHLMKFCNSLHGGLNKLAELLEVEMIGVCHQAGSDSLLTACTFRKLRNTFFNGSIQKYAGSKEILCYIVRSGVKPHEKKKFISELQENNNIVAMVGDGINDAAALATADIGIAMGGGVGAASEVSPIVLMGNRLSQLLDALELSRLTMKTVKQNLWWAFGYNIVGIPIAAGILLPITGTILTPSIAGAFMGLSSVGVMANSLLLRLRFSQNRKRSLEDQQPKEK Homology
BLAST of ClCG10G009250 vs. NCBI nr
Match: XP_038876702.1 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1514.6 bits (3920), Expect = 0.0e+00 Identity = 886/1331 (66.57%), Postives = 903/1331 (67.84%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. NCBI nr
Match: KAG6576859.1 (Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1481.1 bits (3833), Expect = 0.0e+00 Identity = 867/1331 (65.14%), Postives = 897/1331 (67.39%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. NCBI nr
Match: XP_022922942.1 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1478.8 bits (3827), Expect = 0.0e+00 Identity = 866/1331 (65.06%), Postives = 896/1331 (67.32%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. NCBI nr
Match: XP_022984847.1 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1473.4 bits (3813), Expect = 0.0e+00 Identity = 863/1331 (64.84%), Postives = 892/1331 (67.02%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. NCBI nr
Match: XP_004137165.1 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN53721.2 hypothetical protein Csa_014412 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1472.6 bits (3811), Expect = 0.0e+00 Identity = 864/1336 (64.67%), Postives = 889/1336 (66.54%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZC9 (Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PAA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 979.2 bits (2530), Expect = 4.7e-284 Identity = 624/1324 (47.13%), Postives = 741/1324 (55.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9DFX7 (Copper-transporting ATPase PAA2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PAA2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 436.0 bits (1120), Expect = 1.5e-120 Identity = 361/1229 (29.37%), Postives = 521/1229 (42.39%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P37385 (Probable copper-transporting ATPase SynA OS=Synechococcus elongatus (strain PCC 7942 / FACHB-805) OX=1140 GN=synA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 325.5 bits (833), Expect = 2.8e-87 Identity = 315/1218 (25.86%), Postives = 461/1218 (37.85%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKZ2 (Probable CCR4-associated factor 1 homolog 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAF1-7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 1.1e-86 Identity = 160/261 (61.30%), Postives = 188/261 (72.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LEU4 (Probable CCR4-associated factor 1 homolog 10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAF1-10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 321.6 bits (823), Expect = 4.1e-86 Identity = 160/255 (62.75%), Postives = 184/255 (72.16%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4S2 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430770 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1478.8 bits (3827), Expect = 0.0e+00 Identity = 866/1331 (65.06%), Postives = 896/1331 (67.32%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J3A7 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483005 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1473.4 bits (3813), Expect = 0.0e+00 Identity = 863/1331 (64.84%), Postives = 892/1331 (67.02%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0N3 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1453.3 bits (3761), Expect = 0.0e+00 Identity = 853/1331 (64.09%), Postives = 882/1331 (66.27%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0M4 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1448.3 bits (3748), Expect = 0.0e+00 Identity = 853/1333 (63.99%), Postives = 882/1333 (66.17%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHL7 (copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011574 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1438.7 bits (3723), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/1328 (63.33%), Postives = 883/1328 (66.49%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. TAIR 10
Match: AT4G33520.2 (P-type ATP-ase 1 ) HSP 1 Score: 979.2 bits (2530), Expect = 3.4e-285 Identity = 624/1324 (47.13%), Postives = 741/1324 (55.97%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. TAIR 10
Match: AT4G33520.3 (P-type ATP-ase 1 ) HSP 1 Score: 976.1 bits (2522), Expect = 2.9e-284 Identity = 623/1324 (47.05%), Postives = 740/1324 (55.89%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. TAIR 10
Match: AT5G21930.1 (P-type ATPase of Arabidopsis 2 ) HSP 1 Score: 436.0 bits (1120), Expect = 1.1e-121 Identity = 361/1229 (29.37%), Postives = 521/1229 (42.39%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. TAIR 10
Match: AT5G21930.2 (P-type ATPase of Arabidopsis 2 ) HSP 1 Score: 436.0 bits (1120), Expect = 1.1e-121 Identity = 361/1229 (29.37%), Postives = 521/1229 (42.39%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G009250 vs. TAIR 10
Match: AT5G21930.3 (P-type ATPase of Arabidopsis 2 ) HSP 1 Score: 411.0 bits (1055), Expect = 3.7e-114 Identity = 356/1229 (28.97%), Postives = 509/1229 (41.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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