
ClCG10G008350 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTGGATCTAGGTTTTCCATTTTCGGAACCGGTGCTGCTGCTGATAAGGTCGAGAAGTCGGCGAAGAGCGAGTTTTTTCCTGGCCTGAAACTCCGTTCTGATAAAGATGTGTATCGGCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATTGAAATTTGCTCCTCTGTCGCTCAATTGGACTGCCCTCTTTTGATCGAACGACTTAGTTTTGAGATTATTGGGCTCCAGAAGTTGGATGCTCAGTGGTTTAGCACTCAGAAGCCAATCCCTGGATCCAAACAACGGAGAGGTTCCAAGTCCCTTCTATATGATATTGTTCTCAACCGTTTCCTTCTCCTTGTGTAATGTGTGATTGTTATTCGTGGCAATTTGTTATCAGCTTTTATTCTGTTCCCTTTTGTAATGTTGTTTAGTAAACTCTCTATCTGACTGAGAGACATTTCATCCAAAGGCAGTTTTCCTTTTTGGAGAAATGAAAGGAAGTCAGTACTTGTCACTTTGTAGAATTTGCATTGTTCTGCAAAATTTACTCATTCATTTATTGTTTTTTTAAAGATTGCATTGGTTTTCTTAGCTGATGTTGTTCAGTTTCATGTCTTTTGGTCTTGTCAGGTGAACACGTTTTCATGGACTGCTCTGTACATTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCTTCGGGGGCTACAAAGTCATGTAAGCCCATGTGTTTTATGCACAACATTTCTGTATCTCAGTTGTTGATATGCATGTTGTTCACTTGAATATTACTTATTTCATATCTTGCGACTGTTGTTCCCTTAGTTTAATTGATAGAGTCTGGATTTAAAGGAGTTTTTGAGGAGTAAATGAACGTTACCAATATTATTGATTGAAGACTTAATTTTCAAGAAGAGGTTCAGCCTCTTAAATATACAATCAATGAAGAAGAAAATGAAGGAAAATCTAACTTATTAAAGAGTTAGGCAAATAAATAGATTACAATAGCGAATGCAAATAAATGCTAAAGAAAGTTGACCATGAAAGATGATAAGTGCAAAAGTGAGTAATCATTTACAGAGACAAAACATAGATTATGTCTTAACAACCTCTCTCAAACGACATGAGGGAGAGAATCAAAGCTTGAGTTTGTCATGAAGCATCAGAAAATAATGAGGAGGCAATGATTTAGTTAGACAATCAACAAGTTAATCTTGAGAGGGAATGTGCTGGATAACGAGCTTATGGTCTACTTGATTGTGAATGAAGTGAGCATCAATTTCAATCTGCTTGGTGCAAGCATGATAAATTGAATTGCAAGCAAGGGCAACAACGGAAATGTTATCACACCACACCATGTAGTCGAGGGAAAAGAGAGGTGGACACGAAGATCATGAAGAAGAGTTTGAATCCACAACAATTCACAAGCAACATGGGCGAGAGCATGCTACTTTGATTTAGTACTAGAGTGAGGAACGACCATTTTCTTTCTGGAAGTCCATGAAATTAGAGAGGAACCAAGAAAGACACAATAGCCTCCCACCGACTTGTGATCATTAGGAAAAGATGCCTAGTCTACATCAGAAAGCCTAAGAGACATAGGACAAGAGTAGGGTGAAGGGAGAGCCCGAGGTGAAGAGCACTGTAATAACGAAGGACACATAGAGCATGCCAATGAGGAAGAGTGGGTTGATTAAATTGAATCAATTTGTTGACAACAAAAGCAATCTCTGGGTGAGAGTGTTGCAGATGTTGAAGAGATCCAAGAGTACTACAATAGAGCTGAAGATCAACCATCGACTCACCATCATATGAGAGAGTTGTTTACTAGTCACGATATGAGAGGGACGAGCTTAAGATGTTGCAAATTTAATTGAGCGAGCAAGTTTTGGATGTACTTGGTTTGAGAGTGAATAAGGCCATTCTTCGTGAAGTGTGCTTGAATGCCTAAGAAGTAATGTAGGCCACCAATATCTTTAATGGCAAAAACCCTATGTAACTGCAAGGTGAAGGCATCGAGAAGAGCCTAAGAGGAACCTGTTAAGATGATATCATTGACATAAATGAGTATCCTACCTTTCCTCCATTGCTGAAATTTGTGGGTTGCTATTTTGTAAAGCTAAGCATCATACGGGCTAGTTTGTTTTTTGAAGTATTTTGAGGCTTTCCTCTTCAGATTTTGGTGGCCTATTTATGAGGTTTTGCTATGTGTTTACAATTGGGATCAAGATCAAAATATTAAGGAATTTTTACTTGAAGCTATTGTTTCAATAATTGGATTCTTCAAGATCATTTTCATTTTCAAGCTTTTGGTGGCATTTCCTCCCAAGAATTATGTCACTCAATTTCGGATCCTTCAACACTTCATCACGAATAATGTGAACATTCAGAAGGGCAGGGGCGGATAAGTAGGCTAGATGAATAGTAGGAGGGACACATGATAAGGCATCAACAACCTTGTTGTCGGCCCTCGGTTTATATTTAACCTCAAAGTCGTACCCCAACAATTTAGCTATCCATTTCTGATGTTGAGGTTGGATGATTCTTTGTTCCAATAGAAATTTGAGAGCCCTCTGATCAGTTCGGACTACAAACTTTTGCCCTCATAAGTAAGGACGCCAACGCTGCACAGCCAACACAACGACCATCAATTCACGTTCATAAACGGGCAATACGCGCTCCCCCATATACAGAATTTGACTAAATTAAGCAATCAGACGTTTATTTTGAAGTAGGACAACCCCAATACGATGATCAGAAGCGTTTGTTTCAATCTTAAAGGGTTGTGTAAAATCCGGTATGGCCAACATCGGAAGTGTGGTCATGGCTCGCTTCAAAGTATCAAATGCTAATTGAGTCTCCTCTGTCCACTCAAACATGCACTTCTTCAATAATTGACTTAAAGGAGCAACAAAACGTCCACAATTCTGAACAAAACGACGATAGTAACCAGTAAGCCCCAAAAAAACCCCTCACTTCACAAACTGTGATAGGGTTAGGCTACTCGATCGTTGCTCGCAACGTTTCAGGGTTGCTTCAACACCCTTACCAGAAATCAGATGGTCCAACTATTCAACCTTGTCTTGGACGAACTGACACTTCTTATGGTTGACATATAAGTCATTTTCTCTTAATATTGTCAGGACCAAACGCAGATGAACCAAATGGTCCTCCAAACTCTTGCTATACACAAGGATATCATCAAAGAAAACCAAAACAAAGTTTCTTAAATATGTGGCTGGAATACCTCATTCATCAAAGCTTGGAAAGTCGGAGCGTTGGTTAAGCCGAAGGGCATCACGAGAAATTCATAGTGGCCCTCGTGCATTTGAAAAGTTGTCTTCTCAACATCCCCATTGTGCATCAAAATCTGATGATACCCTAATTTTAAATCAATTTTGGAAAACAGAAGAGCCCCATGAAATTCATCAGACAACTCTTCGGCTATTGAAATAGAGAATTTGTTAGGAATGGTCACATTGTTCAAAGCCCTGTAGTCGACACAAAAACGACACCCCTCGTCTTTCTTTTTCACTAATAGAACTGGACTAGAGTAAAGACTCACACTTGGGCGGATAATGCCAAAATTGAGCATCTCCCGAACTAACCTTTCTATCTCACTCTTCTGGTGGCATAACGATAAGACCGCACATTGATCGGTTGAGTATTGGGCTTGAGATGAATATGATGTTTTTTTTTTCTTTGAAAAGGAAACGATCTCATTCATTGATATAATGATAAGAGATAAAATCTCAAAGAACAAAAAGGATTACAAGACCTAGGGCAGGGAAGTGGCTTGAAGTGAATACAATCATAAAAAGAACAATACAACAAGCTTTTGACGATTAAGAGCAAATCCAGTGCAAAAACTACCATCCTCTAAACTAAATGAGAGACATCAAAACAATCCTTTTGAAGAGGAAGAGATCAACACTATGCTGAGGGCAGTAAGGTTAAAATGCTCCAAGCGAGAGGAGGACTGGAACAACTAATCAGAACTGACAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAAGGAAACACTCTCTTTCATTGATATAATGAACTGAGATACAATCTCATAGTATAATAGATGATACTAATGAGAAAAGCCTAGGACCGGATTAGGGAGTGCACTTGGGCATCTCAACTAAGTTGACTCCCCCTTAGCAATCACATCATCTCCACACTAATGTTACACTTGAAAAAATATCAAAAAGATTACAAGGTAAACCAATAGCACAACTCATGAGGTTTCTTGAATACAATGGGGGAAGGACAAAAATACTTTAAGAGAAAAAGAAAACTGTAAGTACTATAAATCTGCTAGAGCTATGGAGTTGGAAATATGAACGCCTTCCAATTTTGACAAAGCACTTGAATAGGAAAGTCTAACTCCTTAGATATTGTGCACCAAGAAGAAGTATTTAGTGAGACCACCTCCTACCTTTTTGACCAGCTTGATTTGATGTCTTGAAATACCCTTCAGTTCCTTTCGAACCAAATTTCCACTAATAAAGCCTTTACTGCGTTCGCCCAAATCAACCTTGGCCCCTTTTTAGGGAGGGACCAATAAGCACCTGTTGAATGTTTTCACAAAAATCGTTACCAAAAACCCAATCCATTTAAAAAATAGTGAAGACTTTCCACCAACAATTTGTGACATAGGAACACCAAAAGAAGATATGCATCAAGTCCTCGCCGTCTGCTTCACATGGGCAAATAGAGGGGGACAAACATTGCGACGGAAGCTCGTGTTGCAATATTGATGAGCAAGTTAAGTGGCCAAACAACAATATCCACTCTAGAATGTTCACTCTTTGTGGACTTTTGGTCTTCCATCATGCATTAAATAGCCTCTTCTCTATAGGCCAAGAAGGAGATAAGTGTGCTGAAAGTGATTGTATTGAAAACTTCCCGGATGAATCCAATGACCAAACCTTTTTATCATAGCTCTCAGAAGGCCTCTTAGCTGAAATCTGTCCCAATAAAGTTTGAAAGTTCGTAATCTCCTCTTCCTATAATAATCTTC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ATGTTTGGATCTAGGTTTTCCATTTTCGGAACCGGTGCTGCTGCTGATAAGGTCGAGAAGTCGGCGAAGAGCGAGTTTTTTCCTGGCCTGAAACTCCGTTCTGATAAAGATGTGTATCGGCCTGGCGATCCGGTTGTTGTTACTATTGAAATTTGCTCCTCTGTCGCTCAATTGGACTGCCCTCTTTTGATCGAACGACTTAGTTTTGAGATTATTGGGCTCCAGAAGTTGGATGCTCAGTGGTTTAGCACTCAGAAGCCAATCCCTGGATCCAAACAACGGAGAGGTGAACACGTTTTCATGGACTGCTCTGTACATTCAATAGTTTCAAATCAGATAATATCTTCGGGGGCTACAAAGTCATATGTGGTTCGATCAATGCTTCCTACCTGCATACCGCCATCTTACAAGGGTGCCACCATTCGTTATATGTATTATGTTAAAAGTACATTACTAGGACGATGGCTATCACAGGAAAATGGTCGATCTCATAAAGAGTCGCTGAGGGATCAAATAGAAATGGAAGCTCGGGTTCCATTACAAGTGTGGGTCACTCAGAAAACCAATGGCATGCTAATGGAAGAAGGTCAAAATGGTCAAAATGATGCCTTTCAAATGGATGTATTTTGGAAAGAGATGGAAGGTGACGCTGATTGGATCAGAGCAAATGATATATATGATGGCATTGATGAAGGCTATGATAGCTCAAGGGATGAGATCTCATCTGTCTCGTCATACAATCCAATGAGAGAACCTTTTCATAGAACCTTTGGAAGTTCACTGTCATTGCAATCATCTGTCGGAAGATCTGGAAGATCTTCGATAAAGGTTGCTCCTTTTATGGAAGGAGATCGATTAAGCTTATCTTCTAATGTTGCACGTCCTCAGGTCTCTGTTGCTGAGGTCCTATATGAACCAACCGATGTTGCATCACCTCAGAAGTCATTTGCAGCTGTCTCTCCCAGCCAGGTGTTGAACTTTGAGAAGAATCAGTCAACAGATGATGATGCTGGAGTAGCATCTTCACCTAGGCCTAAAACTATTGAACCTGTAGCATCGGAAGGCTTTATTCGAGGAAGATCTTACAATATCAGGGTAGATGACCAAGTATTGCTTAGGTTTTGCCCAAAAAATTCTGATTCAACCTATTATTTTAGTGACATGATAGGTGGAACCCTTACCTTTTTCCATGAAGAAGGAGCAAGGAGATGCCTTGAGGTGTCAATAACTTTGGAGACTTCAGAGACTGTGTCACGCCGTTTCATCCATCCTTCTCGGAGGAATTCTCCAACAATTATGAAGGTTCAAAGTGATCATTATGAGGTTGTTGCTGATTTAATTCAGACGAGCTTTCTTTTCTCAATTCCCATGGATGGGCCGATGTCCTTTTCCACTCCACATGTATCTTTGCAGTGGGCACTTCGCTTTGAATTTTTTACCACGCCCAAGAATGTGGATTGGACCAGATATGAGCATCCTCTCTTGATAGAAGGAAGAGAAAAAAGTGAATGGATTCTTCCAATCACTGTGCATGCACCTCCATCTAGTGCTGCAACTGCTCAGAACCGAAATGATAGGCCTTTCTCTTTGGAGCCCTTGTGGATGCACAGCTGA MFGSRFSIFGTGAAADKVEKSAKSEFFPGLKLRSDKDVYRPGDPVVVTIEICSSVAQLDCPLLIERLSFEIIGLQKLDAQWFSTQKPIPGSKQRRGEHVFMDCSVHSIVSNQIISSGATKSYVVRSMLPTCIPPSYKGATIRYMYYVKSTLLGRWLSQENGRSHKESLRDQIEMEARVPLQVWVTQKTNGMLMEEGQNGQNDAFQMDVFWKEMEGDADWIRANDIYDGIDEGYDSSRDEISSVSSYNPMREPFHRTFGSSLSLQSSVGRSGRSSIKVAPFMEGDRLSLSSNVARPQVSVAEVLYEPTDVASPQKSFAAVSPSQVLNFEKNQSTDDDAGVASSPRPKTIEPVASEGFIRGRSYNIRVDDQVLLRFCPKNSDSTYYFSDMIGGTLTFFHEEGARRCLEVSITLETSETVSRRFIHPSRRNSPTIMKVQSDHYEVVADLIQTSFLFSIPMDGPMSFSTPHVSLQWALRFEFFTTPKNVDWTRYEHPLLIEGREKSEWILPITVHAPPSSAATAQNRNDRPFSLEPLWMHS Homology
BLAST of ClCG10G008350 vs. NCBI nr
Match: XP_038904898.1 (uncharacterized protein LOC120091119 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1037.7 bits (2682), Expect = 3.5e-299 Identity = 514/537 (95.72%), Postives = 524/537 (97.58%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. NCBI nr
Match: XP_008455604.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901787.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1006.1 bits (2600), Expect = 1.1e-289 Identity = 504/537 (93.85%), Postives = 516/537 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. NCBI nr
Match: XP_011653362.1 (uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >XP_031739927.1 uncharacterized protein LOC101218523 [Cucumis sativus] >KGN53681.2 hypothetical protein Csa_014549 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1003.8 bits (2594), Expect = 5.5e-289 Identity = 503/538 (93.49%), Postives = 516/538 (95.91%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. NCBI nr
Match: KAG7013397.1 (hypothetical protein SDJN02_23563 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 956.8 bits (2472), Expect = 7.8e-275 Identity = 480/533 (90.06%), Postives = 502/533 (94.18%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. NCBI nr
Match: KAG6574820.1 (hypothetical protein SDJN03_25459, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 953.7 bits (2464), Expect = 6.6e-274 Identity = 479/533 (89.87%), Postives = 501/533 (94.00%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0M0 (uncharacterized protein LOC103495739 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495739 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1006.1 bits (2600), Expect = 5.4e-290 Identity = 504/537 (93.85%), Postives = 516/537 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H364 (uncharacterized protein LOC111460073 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460073 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 4.6e-273 Identity = 476/533 (89.31%), Postives = 501/533 (94.00%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L132 (uncharacterized protein LOC111499409 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 949.5 bits (2453), Expect = 6.0e-273 Identity = 476/533 (89.31%), Postives = 500/533 (93.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KC17 (uncharacterized protein LOC111494236 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494236 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 928.3 bits (2398), Expect = 1.4e-266 Identity = 469/539 (87.01%), Postives = 489/539 (90.72%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKY7 (uncharacterized protein LOC111464493 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464493 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 927.5 bits (2396), Expect = 2.4e-266 Identity = 468/539 (86.83%), Postives = 489/539 (90.72%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G008350 vs. TAIR 10
Match: AT1G50120.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rgp1 (InterPro:IPR014848), Immunoglobulin E-set (InterPro:IPR014756); Has 144 Blast hits to 140 proteins in 61 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 86; Fungi - 10; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 634.8 bits (1636), Expect = 6.3e-182 Identity = 331/545 (60.73%), Postives = 407/545 (74.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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