
ClCG10G003700 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCGTTTCAAGTACTTATGACATCAAATAATGCCTCCTCTTCCAATGATGGTGTTCCTCGTCCATCTGCTAACTTTCATCCAACTGCTTGGGGAGATTTCTTCCTTTCCTATCATTCCCAAACCTCGGTAGACATACACACATATATATGATTTCAAATTTGTGTTTTCTTTGTCTTTTATTTTTGTTGTTTTTGCATGATCATGAAATGTTTTTGTTTCATATTGTTTCATTTGTCAGCCAAATATGTGTTTTCGCTTTGTTTGGAATTGCTCGCAGGTGTGTTTCTAAAAAAACTCAGCTATTTTAATTTTAAATTAAAAAAAATTAGTTATAGTTGTTTGGTCAATTTAATACTAAATTTGTGTAATTTAGTTATGTAAACAAAATATATCATTCGAATTGCAACTAATTTTGTTTAATCTAAATTGTTTTATAAAAGGCTTTTTTTTCTTTTAAATAATTGTTATAAGAAATTGAATCAATTAAAATATGAGGAACACGTGTGAGAAAGTAAATTAATATGGAATGATAAATCTCATATAGGTAAACCGCTAGAAAAGGTATTAGATTCTTAGGAAAGCTTAAAGCATATTAAAAAGTGATTTGGATAGATTAATAAATATTTATTTTACCAAATAACCTAGGCGGTTAAGATTTTTATATAATCGCATTTTATGCTTACAAACACAATTCCAAACAGGAACTTAGTCCCAGATATTTGGATGGTCTAATTTCTCATTTAAATGCCTAAAACTATACTTTGTTAGTTTTTTTTTTTTTTCTTATAATTAAGTTTGTCATTAGCCACACTATTAACACTAGTTATCATTAAAATGATATAGAGAAAAATACTATAGAAAATTGGGTTGTTTACAAATATAGAAAAATTAACCAAAATATTTATAAATATAGAAAAATTTTATCGTCTGTTTGCATTAGACAGCGATAGACTACTATCTGTGTCTATCTGTGTCATGATAAATACAAATAGTAGTCTATCGTAAATAGATTGTGGTATTTTAATATTATTTGTAAATATTTTAAATAGTATTGCCATTTAAAATAATTTCCTTAGAAAATATTAATTTATTGAGAATTTTATTAATTATAACCTTGAACTAATAATTTTATCAATTTAAACCGATATAAATTTATATCCTTTACCATGTTCTATTTAGATAAATATCGTGCGAGAAAGTTATCATTTGTTAGACATAGAAGTATAAGAATATGTTTGAAAACCGTGTGTGTTTCCTGTTCGGGTAGGTTTTCTTTTTAAAAAAGAAAAATTAAAATTTGCTTGAAGTTTTGTTTCGAAAGAAAAAGTTATCAACCTAAAGGGAAAACATATGATGTGTGTTATTTTGTTGGACAAATATTATGAAAAATCAGGAGGAAGAAGAGGAGATGGTCATGATGAAACAAGTTCAAGAACATAAAGAAGAAGTGAGAAGGATGTTTGGAGCTGCTGAAAAGTGTTCAGAAAAATTAAGTTTGATTGATTCAATCCAACGCCTAGGTTTGTCATACCACTTTGAAGATGAGATTAATGAAATTCTTGACCACATCAAAAGTTGTGACACTGTTGACGAAGAAGATGAGAATCTTTACATTATAGCTCTTAGATTTCGATTACTTAGACAACAAGGCTTCTTTGTTTCTTGTGGTAAGTCTCGCTCAAGTGATTTTACCCTCAATTACTTTTTGCTTAATTAATATATATTAGTCTTTGAATTTTCTATATTTAATTTCGTGTCTAATTAATCCTTGATTTATAAGACAATTTATATGGCTCAAAGGGCCAAAAAATTGAAATTTCATGTATACTTCTATTGGCCATTTCTTAGAGTTTACAACACTCAAAAGTTTAGATATCTATTTTAAACTTTTTTTTCAAAGTTTAGAGAACAAACTCATAGTTTAACCTGTTTGTTTAACTTCGAATAGGGATATTCAATAAGTTTACAAATGAAAGGGGAGATTTCAAAGAATCAATTAAAAAGGATGAAGCTGGTTTATTAAGTTTGTATGAGGCATCCCAATTGAGAATGAGAGGAGAAAAGATATTGGATGAAGCATTAGCTTTCACAACTATTCAACTTGAAGCAATTGCTATGGATTCCAACTCTCCATTCTCAGAAGAAGCTAAATATGCATTGAAGCGGCCAATTTATAAAACTATGCCAAGGTTCATGAGTAGGCACTATATCTCTCTCTATAACAACAATCCATCCAACAATAATGCTTTGCTCACTTTTGCAAAGTTGGACTACAATTCTCTCCAAAAACTTCACCGAAAAGAATTGGGTGAACTTTCAAGGTGAAGCTTTTTGATCATTAAAATTCTTAGTTACTATCTTTGAGGGTTATTTTTCTTTGAAAAGACTTATTTCATTTTAGATTTAATTTTAGTTAAACAATTATCTTTTGCAATATATAGGTGGTGGAAGGATATGAAATTGCAAGAGCAATTATCTTTTGCACGAGAGTGCTATGTTTGGAATATATAGTCTTATATTGTGAATCAAATTCATCAATGCATATTATTAGAAACTCTAAGTTTAAAATGTTGTAATATTGACCCTTTTCTTAGTATAATTGTCTTGATCTTTTTTTTTCCTTTTTCGTCAATGCATATTAATAGTCAAAGGATATCCATCACCAAGTCTACGTATAATTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGGTCTACGTAAGGTTTGAGAGTTTTGAGATTGTTGAGATGATACATTAAAATAATTAAATATAAGGTATTTAGAATGGTAGTGCGATTTAATTTGACACTTGAGCATATGATAAATGTTAACTCTGAATATTCTAATAAAATGTCATATTTGAAAATTGAAATTAAAAAAAATTAAAAAATTAAAAAATTATCTTCGTCAACTTAATAACTTGAACTTTGAATAAATTCCAGGTGGGATATTACTGGTATCGAAAAGCTCCCAAATTACATGAAAGTTCTTTATGAAGCCATACTTAAACATTATGGAGAGATTGAACCAAGTTATTTGCAAGGAAATAATACTCCATTTGCATTTGATTATGCAAAAGAAAGGGTGAATTCTATTGTGTATTGTGCTTTCACACACACACACACACATACATATTTCTTGAAAAGAAGATCTTCTCTTCTAAATAATTGATTTTGAAGTTTTGTGTGTACAGATGAAAAGGCAATGCAAAGCTTATTTGATGGAAGCTAAATGGTTCAATGAAGGGTATATTCCAACAATGGAAGAATACATGGAAGTTGGCATCACTTCTGCATCCTATTATGTTTTTGCTTCAATTGCCTTCCTTGCTTTGGGAAATATTGCTTCAAAAGAGGTTTTTGAATGGGCTCAAACTGACCCTATGCTTCTTAAAGCAACTGGAGTAATTGGCAGGCTCCTCAATGACATAGTTTCTCACAAGGTATTTTTCTAAAGTTCTACTTACTTGCAAGTATTTTTCAAGATTTCATTTAAGTTTGAAGTCAAACTATTTCATTTTTAGTTTGAACAAGAGAGAGGTCACGTGGCTTCAGCAATTGAATTAATATGGAGTTTCAGAAGAAGAGGCCATAGCGGAACTAGAAAACCAAATAGAAACAGCATGGAAAGAAGCAATAGAAGACTACACAAAATCTTCAAAGTTTCCAAATGTGATCCTTGACTGTGTCTTAAATGTTGCTCGAATTTCAAACCTCTTTTATAAGGACGAAGATGGTTATGCCTTCGCTGATGGAGAAACCAAACATTTTACTACATTAATGCTTGTGGACCCTGTCCCAATTTAATCAATCTGTGCTTGTTTCATCCTTTTATTCCAAAAGTAATGCATCTGCAGTTGCATGGTAAAAATGTATTTGAGTGTATTTCTTAGAAGAACAATGCTTTTAAGCAGTAAGTTATTATAAAAATGTTCTTAGGTTTTCGGTATTTTAGAGATATTAAGGTTACTATTCAATATATGGATGAAACTTTTCAATTATACTTTTAAATTTTGTTTTTTTATGCTACTCAAGTTCTTACTGTGTGTCTGTTTATATCTAAACATAAGGTTTCATTATCTCAAAAATCAATTGACAATCAGAAGTTTAATGGATGCATCGAACATGTATGCATCGCTTTTGGTCCCGGGAGTATGATGAGCATGTTAAAAATGTGTCAACTTAGTTGAGATAACTAAGTGTCCCTTTTGATCCCTCCTCCATTGGTATCTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAATGTTGACACTCGTGTCAATTATACTATAAGGAGCGAGATGGTTTCACTTTTGTTGATGGAGAAACTAAACATTCTATTACTTTAATGCTAACCGACTCCGTACTAATTTGATCCCATCTATCGTAGTTTAAACCGACTTATCAAGAATATAAATATAAATATAATTATAAGAATGTTTTTTAATTAGCAAAATGTATTATGTCCTTCAGTTTTATTTATTTTAATGAGAAAATAATATAATGTTTAATAATAATAGTTCTTTTTTGGTTAGCTTTGTTACATTATGAACTACTCCGAATATGCATGCATGGAAAATTCAAACTTCTAATTCCCCTAATTAGCCTATTAATTATTATAACAAACCATCACAACTAGCTATTATTATTTAATTTAACTAGGCAGGATAGCGTTTTCATGTCCACCGGACACGAAGCATAAGCACAATGGTGTTGAAAATAACAAGATATTAAAGTGAGGTTATATTAAAGTTCAATTTAATAACAATAAGCATAGCCTATTAATTGTGTTCTGTTTGGGTGATTTTAGAGTTCAATTTATTTACCAAAACTAAAACAAAATCAAATAGGTGAGTTAGTTACATCTAAATAATCCTATTTCTTTTATCTCTTAAGGTCTATCATGGAAGCTATGTAGTCATGGAAAAGCCATAGAAAATACACACATGAACCTAAAAAATTTAAACAATCATCCACGATCACAATTACAAAT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MSFQVLMTSNNASSSNDGVPRPSANFHPTAWGDFFLSYHSQTSEEEEEMVMMKQVQEHKEEVRRMFGAAEKCSEKLSLIDSIQRLGLSYHFEDEINEILDHIKSCDTVDEEDENLYIIALRFRLLRQQGFFVSCGIFNKFTNERGDFKESIKKDEAGLLSLYEASQLRMRGEKILDEALAFTTIQLEAIAMDSNSPFSEEAKYALKRPIYKTMPRFMSRHYISLYNNNPSNNNALLTFAKLDYNSLQKLHRKELGELSRWWKDMKLQEQLSFAREWDITGIEKLPNYMKVLYEAILKHYGEIEPTKWFNEGYIPTMEEYMEVGITSASYYVFASIAFLALGNIASKEVFEWAQTDPMLLKATGVIGRLLNDIVSHKFEQERGHVASAIELIWKEEAIAELENQIETAWKEAIEDYTKSSKFPNVILDCVLNVARISNLFYKDEDGYAFADGETKHFTTLMLVDPVEDDMVKKQFQEVKEEVRSMFAAAEKSSERLRLIDSIQRLGLSYHFKDEINEILEHIQKSSKIDDEEEDLYIIALRFRLLRQHRYYVSCEIFNKFTNERGDFKESITEDAAGLLSLYEASHLRIRGEKILDEALAFTTTHLETIATDSNSPFSEEAKYALKWPIYKAMPRFMSRHYISLYNNNPSNNNALLTFAKLDYNSLQKLYHKELGEFSRWWKDQKLKEQLPFARERVVEIYVWALGVYYEPKYSSARTLLVKVITFISVLDDMYDVYATLDELQLFTNAIERWDVNCIEKLPNYMKGFYETILEVYKEIEQEICKDNNIPFAFHYAKEAMKRQCRAYLMEAKWFNEGYIPRMEEYMEVATISASYHLFASVSFLALGDVASKEVFEWAQTDPMLLKATGVIGRLLNDIVSHKFEQERGHVASAVECYMKEYGVSEEEAIAELENQIEKAWKDVIEDYTKSSKFPNVILDCVLNVARLSDLFYKEEDGYTFVNGQTKHFITLMLKDPLPI Homology
BLAST of ClCG10G003700 vs. NCBI nr
Match: XP_038877743.1 (LOW QUALITY PROTEIN: (-)-germacrene D synthase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 815.1 bits (2104), Expect = 6.6e-232 Identity = 397/526 (75.48%), Postives = 458/526 (87.07%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. NCBI nr
Match: XP_016900585.1 (PREDICTED: (-)-germacrene D synthase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 1.9e-231 Identity = 410/518 (79.15%), Postives = 458/518 (88.42%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. NCBI nr
Match: XP_038903578.1 (LOW QUALITY PROTEIN: (-)-germacrene D synthase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 810.8 bits (2093), Expect = 1.3e-230 Identity = 399/496 (80.44%), Postives = 447/496 (90.12%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. NCBI nr
Match: RYQ94608.1 (hypothetical protein Ahy_B08g089543 isoform C [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 786.6 bits (2030), Expect = 2.5e-223 Identity = 424/1113 (38.10%), Postives = 653/1113 (58.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. NCBI nr
Match: KGN55986.2 (hypothetical protein Csa_011696 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 777.3 bits (2006), Expect = 1.5e-220 Identity = 379/515 (73.59%), Postives = 444/515 (86.21%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Q3H3 ((-)-germacrene D synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0014g04930 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 547.7 bits (1410), Expect = 2.6e-154 Identity = 267/513 (52.05%), Postives = 369/513 (71.93%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9SCB6 (Probable terpene synthase 2 OS=Ricinus communis OX=3988 GN=TPS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 1.7e-145 Identity = 250/511 (48.92%), Postives = 357/511 (69.86%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6M8H4 (Probable sesquiterpene synthase OS=Santalum album OX=35974 GN=SesquiTPS1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 503.4 bits (1295), Expect = 5.6e-141 Identity = 245/519 (47.21%), Postives = 358/519 (68.98%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6M8H7 (Probable sesquiterpene synthase OS=Santalum murrayanum OX=453085 GN=STPS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 503.4 bits (1295), Expect = 5.6e-141 Identity = 244/518 (47.10%), Postives = 360/518 (69.50%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B5A435 (Sesquiterpene synthase OS=Santalum album OX=35974 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 501.5 bits (1290), Expect = 2.1e-140 Identity = 247/519 (47.59%), Postives = 354/519 (68.21%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DXZ8 ((-)-germacrene D synthase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491132 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 9.4e-232 Identity = 410/518 (79.15%), Postives = 458/518 (88.42%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A444XY63 (Uncharacterized protein OS=Arachis hypogaea OX=3818 GN=Ahy_B08g089543 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 786.6 bits (2030), Expect = 1.2e-223 Identity = 424/1113 (38.10%), Postives = 653/1113 (58.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A444XY77 (Uncharacterized protein OS=Arachis hypogaea OX=3818 GN=Ahy_B08g089543 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 3.4e-218 Identity = 413/1103 (37.44%), Postives = 636/1103 (57.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CPK3 ((-)-germacrene D synthase-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013401 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 764.2 bits (1972), Expect = 6.5e-217 Identity = 377/517 (72.92%), Postives = 434/517 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQA8 ((-)-germacrene D synthase-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013331 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 764.2 bits (1972), Expect = 6.5e-217 Identity = 370/512 (72.27%), Postives = 440/512 (85.94%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.2 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 4.0e-102 Identity = 187/513 (36.45%), Postives = 316/513 (61.60%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.1 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 7.6e-101 Identity = 187/515 (36.31%), Postives = 316/515 (61.36%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. TAIR 10
Match: AT1G70080.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 344.0 bits (881), Expect = 4.0e-94 Identity = 189/524 (36.07%), Postives = 307/524 (58.59%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. TAIR 10
Match: AT3G29410.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 6.9e-94 Identity = 196/532 (36.84%), Postives = 310/532 (58.27%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G003700 vs. TAIR 10
Match: AT3G14490.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 342.8 bits (878), Expect = 9.0e-94 Identity = 195/533 (36.59%), Postives = 307/533 (57.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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