
ClCG10G002960 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGAAGAACAAAGAGCTTGAGTGGGCAAAAGCACAGAAGATTGAAATAGGTGTTGATCTTGTAGCTGCTGCTAAACGTCAGCTTCAGTTCCTCTCTGCAGTCGATAGCGATCAGTTCCTTCATGAAGGCCCTACCCTTGATCGGGCTATTTACAGGTAACAAATCTAGGTCTCGTTTGATAATGTTTTCGTTTCTTATTTTTTATTTTTTGAGAATTAGAAACAAGAATATGTTTGATACCCGTTTTTTGTGTCTGGTTTCTTCAAGGAAAGAAACAGAAATAGAAATAGAAATTTGGTTGATAACTATTACTTGTTTCTACTTTATTTTCTATTTTTTTTCTTAGGGTTTAAATTCAATTTAGTTATATAAATATAAAATTCCATAATAAGCACTAAAATGAAAGAAAAAGAAATAATCAAAGCTCCATCTTCAAGATTAAAAGATAACATGTTACAAGCCTGGATTTTCTCAGACATATGACTGCACCCACATGGGCAGAGGACAAACTTGATTCTCAATCATAACATAAAAATAAAATAAATTATAGAAACAGATGAAAATATAAAAACTTTGTTTCTTTAAAAATGAGAAACGAGAACAAAAACCAGAAAATGAGAACGTTATCAATTGGACCCTCGAAGATAGATTGATTTTCGGACAAAGGTATCCTCAATGGATGAATGTTGAGAAGGGAGAAGTGTTTATATATTTTTCTATTACTACTGTTAAAGTGTAAAAATGATTCTAATTTGTAGGTACAATGCTTATTGGCTTCCATTGCTTGCTAAACATTCTGAATCCCCACTATTTGAAGGACCTTTGGTTGTCCCTTTGGACTGTGAATGGATTTGGCATTGCCACAGATTGAATCCTGTAATCCACACCTTCTCCCACCTTCTCAACTTTTTTATATATTTACATATTCCGTTGCTAGTCTGAGACTTTTGTCATATTCAAAATTATTCACTTAAACACGTTTTTAATCATTCAAAATTAATTACTTAAATATTTAATTTTACACTTTCAAATGCAACTTTCATATCATAAAAGTTGGTTTTTAAATGAGTGTAAAAACATGTTGAAGAATGATTTTCACTATTTTCAAATCTTGGGAGTGATTTTGAAATGGTTAAAAATCAATTTTAACATTTTCGAAATTAACCATTTCAAAATTACTCTAAAACATGATTTTAATAATTCAAAACTAATTTTAGATTTCCTATTTTTTGTTTTGTTTGAGCTCTCATCTAGCTCTCTGTACATCTTACGAATTATCTTGTACTCTTTGCCTTTGAATGAAAGTTTATTACACCCTTTTGTATTTTAACCGACATCAAAGGCCTAATTTCTTCTAGTGTTGGGAGTTTGATGAGGGTGCTAAAAATGTGCCAACTAAGTTGAGATATTCAAGTGTCATCTCCTAATTCCTTTGACGTTTCTTGTTAAAGAAAAAGTAATTTTGATGATATAAAAATTGTATTTAAAAGTATAAAATTAAATTTAAGTGATTAAAGATGTGTTTAAGAGTGATTTTGAATGTGACAAAAGTAATTTCAATAATTTTAAGATCACTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGAGTGGGTAACACAATTTTGTTAATTTCGTTTTTGAAGGTACAATACATATCTGATTGTGAGGAACTTTATGGAAAGATACTTGACAATTCCAATGTTATATCAACTACCATTATTGAAAGTTGCTGTCTTAAAGAAACTGAAAAAGTTTGGAATGAATTATACCCTCAAGAGCCCTTCAGCTTCAATTACTTCAACTTACAAGAGGATGATGTCCCAAAAGATCAGCTCTCACAACTTGAAAAATACACCAAATATGATCTTGTCTCAGCTGTTAAAAGACAGACCCCCTTCTNAAATCGACATTTTTATCAATATTTTTATCAAAAGTTGAGTAAGATTAAGACTTGGATATTTTCGTTGGCATCCACATTTTAAACCCTAATATGCTATGAATTAAGAGGTGTTTGAATTCCTCTGCCAACCTTATTCTTATATCTGAAAAAGGAATCCCTCAGCTATAAATAGATGCTCTTGGCTAACAAAAAAAAACCATCCTCCCACATTGCAACTTTCTCCTTCTTTTACAATTCTAAAATCAGTAGCCATGTCTTCACTCCCACTTCAAATCTCTCATGCTCATGGAATTTCAAGGCAATATATCTTTTCTTTTTAATACATGCATTACTTTAATTTTCGATTCTATCTCATGTTACAAGATGTTTATTGGTAGGGAAACGAAAATAAAACAAAATAAAGTAGTGGTTGGCTATATAATATATAGTTTGATCAAAGAGGTTTTAATTATTTCATGTCACAGGAAAATGGAGAAGAACAAAGAGCTTGAGTGGGCAAAAGCACAGAAGATTGAAATAGGTGTTGATCTTGTAGCTGCTGCTAAACGTCAGCTTCAGTTCCTCTCTGCAGTCGATAGCGATCAGTTCCTTCATGAAGGCCCTACCCTTGATCGGGCTATTTACAGGTAACAAATCTAGGTCTCGTTTGATAATGTTTTCGTTTCTTATTTTTTATTTTTTGAGAATTAGAAACAAGAATATGTTTGATACCCGTTTTTTGTGTCTGGTTTCTTCAAGGAAAGAAACAGAAATAGAAATAGAAATTTGGTTGATAACTATTACTTGTTTCTACTTTATTTTCTATTTTTTTTCTTAGGGTTTAAATTCAATTTAGTTATATAAATATAAAATTCCATAATAAGCACTAAAATGAAAGAAAAAGAAATAATCAAAGCTCCATCTTCAAGATTAAAAGATAACATGTTACAAGCCTGGATTTTCTCAGACATATGACTGCACCCACATGGGCAGAGGACAAACTTGATTCTCAATCATAACATAAAAATAAAATAAATTATAGAAACAGATGAAAATATAAAAACTTTGTTTCTTTAAAAATGAGAAACGAGAACAAAAACCAGAAAATGAGAACGTTATCAATTGGACCCTCGAAGATAGATTGATTTTCGGACAAAGGTATCCTCAATGGATGAATGTTGAGAAGGGAGAAGTGTTTATATATTTTTCTATTACTACTGTTAAAGTGTAAAAATGATTCTAATTTGTAGGTACAATGCTTATTGGCTTCCATTGCTTGCTAAACATTCTGAATCCCCACTATTTGAAGGACCTTTGGTTGTCCCTTTGGACTGTGAATGGATTTGGCATTGCCACAGATTGAATCCTGTAATCCACACCTTCTCCCACCTTCTCAACTTTTTTATATATTTACATATTCCGTTGCTAGTCTGAGACTTTTGTCATATTCAAAATTATTCACTTAAACACGTTTTTAATCATTCAAAATTAATTACTTAAATATTTAATTTTACACTTTCAAATGCAACTTTCATATCATAAAAGTTGGTTTTTAAATGAGTGTAAAAACATGTTGAAGAATGATTTTCACTATTTTCAAATCTTGGGAGTGATTTTGAAATGGTTAAAAATCAATTTTAACATTTTCGAAATTAACCATTTCAAAATTACTCTAAAACATGATTTTAATAATTCAAAACTAATTTTAGATTTCCTATTTTTTGTTTTGTTTGAGCTCTCATCTAGCTCTCTGTACATCTTACGAATTATCTTGTACTCTTTGCCTTTGAATGAAAGTTTATTACACCCTTTTGTATTTTAACCGACATCAAAGGCCTAATTTCTTCTAGTGTTGGGAGTTTGATGAGGGTGCTAAAAATGTGCCAACTAAGTTGAGATATTCAAGTGTCATCTCCTAATTCCTTTGACGTTTCTTGTTAAAGAAAAAGTAATTTTGATGATATAAAAATTGCATTTAAAAGTATAAAATTAAATTTAAGTGATTAAAGATGTGTTTAAGAGTGATTTTGAATGTGACAAAAGTAATTTCAATAATTTTAAGATCACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGAGTGGGTAACACAATTTTGTTAATTTCGTTTTTGAAGGTACAATACATATCTGATTGTGAGGAACTTTATGGAAAGATACTTGACAATTCCAATGTTATATCAACTACCATTATTGAAAGTTGCTGTCTTAAAGAAACTGAAAAAGTTTGGAATGAATTATACCCTCAAGAGCCCTTCAGCTTCAATTACTTCAACTTACAAGAGGATGATGTCCCAAAAGATCAGCTCTCACAACTTGAAAAATACACCAAATATGATCTTGTCTCAGCTGTTAAAAGACAGACCCCCTTCTTCTATCAGGTATGCACTTCAAATCAACTTCGCCTTGTACTTAACAGTTAATTAACATGCAGTCTTCAAGCTTTATTTGGTAGACAACTTAAAAACAAGAGATTTGATGAAAAGAGTTATGTTTCGTATTTTCCTTTATACGTGTTTGGTAGCATAATTCAGAGTTTCAATTCTAATTTAAACGATTATTTGTAATTTGTTTGATCATAAAACATTTATAAACCAAAAAGTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNGATCTTGGGGTTGATAAAACATGTATTTGATGCCAATTAAGATATACCACTTTTTTGCAAGAAAAAAGTTGTAGTTAGTTATTCACTAAATATTAAGTTGAATATAACTATTATTGATTAATTAATTTATGAATAACAAATATTATGTTAAAATTTTTGTAAAATTATTATGTAGGAAAATTATTATAACAGAAAAAATATCAAATTATTTACAAATATAGCAAAAATTTACTTTCTATACTGCAATAGACCCAGATAGACATCTATTCGTATCTATTAAAGTGATAGATGTCTATCTTGGTCTATCATAGTTTACCACAAATAGAAAGTAAAATTTTGTTATATTTGTAATTATTTTTAACAGTTTTTCTATTTTTGAAAACATCCATATTATTTAAGGTTAAAAATCACTTTTAGTACCTAAACTTTCATAGAATTTAGTAAGAATTTAGTCCTTG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BLAST of ClCG10G002960 vs. NCBI nr
Match: XP_038876850.1 (uncharacterized protein LOC120069217 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 558.5 bits (1438), Expect = 1.0e-154 Identity = 349/500 (69.80%), Postives = 374/500 (74.80%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. NCBI nr
Match: TYK19501.1 (glycine-rich domain-containing protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 458.8 bits (1179), Expect = 1.1e-124 Identity = 222/299 (74.25%), Postives = 251/299 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. NCBI nr
Match: XP_008448876.1 (PREDICTED: glycine-rich domain-containing protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 456.8 bits (1174), Expect = 4.2e-124 Identity = 222/302 (73.51%), Postives = 253/302 (83.77%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. NCBI nr
Match: XP_023552041.1 (glycine-rich domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 7.2e-124 Identity = 219/300 (73.00%), Postives = 251/300 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. NCBI nr
Match: XP_023007682.1 (glycine-rich domain-containing protein 1-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 9.4e-124 Identity = 220/300 (73.33%), Postives = 251/300 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZQ47 (Glycine-rich domain-containing protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GRDP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 5.2e-101 Identity = 177/296 (59.80%), Postives = 221/296 (74.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZJ2 (Glycine-rich domain-containing protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GRDP2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 1.9e-98 Identity = 173/296 (58.45%), Postives = 217/296 (73.31%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D7F4 (Glycine-rich domain-containing protein 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold443G001560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 458.8 bits (1179), Expect = 5.4e-125 Identity = 222/299 (74.25%), Postives = 251/299 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BLM1 (glycine-rich domain-containing protein 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490909 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 456.8 bits (1174), Expect = 2.0e-124 Identity = 222/302 (73.51%), Postives = 253/302 (83.77%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L3N7 (glycine-rich domain-containing protein 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500228 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 4.6e-124 Identity = 220/300 (73.33%), Postives = 251/300 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L8C3 (glycine-rich domain-containing protein 1-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500228 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 4.6e-124 Identity = 220/300 (73.33%), Postives = 251/300 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZD5 (glycine-rich domain-containing protein 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500228 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 4.6e-124 Identity = 220/300 (73.33%), Postives = 251/300 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. TAIR 10
Match: AT2G22660.1 (Protein of unknown function (duplicated DUF1399) ) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 3.7e-102 Identity = 177/296 (59.80%), Postives = 221/296 (74.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. TAIR 10
Match: AT2G22660.2 (Protein of unknown function (duplicated DUF1399) ) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 3.7e-102 Identity = 177/296 (59.80%), Postives = 221/296 (74.66%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. TAIR 10
Match: AT4G37900.1 (Protein of unknown function (duplicated DUF1399) ) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 1.3e-99 Identity = 173/296 (58.45%), Postives = 217/296 (73.31%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. TAIR 10
Match: AT1G56230.1 (Protein of unknown function (DUF1399) ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 1.6e-25 Identity = 81/281 (28.83%), Postives = 133/281 (47.33%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG10G002960 vs. TAIR 10
Match: AT1G56230.2 (Protein of unknown function (DUF1399) ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 1.6e-25 Identity = 81/281 (28.83%), Postives = 133/281 (47.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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