ClCG06G017350 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG06G017350
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr06: 30555939 .. 30560196 (-)
RNA-Seq ExpressionClCG06G017350
SyntenyClCG06G017350
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTCAGCTGTCTGCAGTGCAATATCTTCCGCGGTTTACAAGCCCTCTTTCTTCTCAAGCTCTGTTCACGCTTCCGGCTCCGATCCACAACGCTGCTCATGATCCCTCCCATTCCCCTTCTCCTTCTCCATCGTGGCTCGGCAACAGTTCTGGACGGTAGTCGACTGTGGCTGCGTTGGATGGATGGCGGTGATGGATCTGAGTACCAGCGGCGAGCTTACAGTATGTTTCCTTCCTTGTTTTATGAGATTATTTCCTTTTTGAACTTTATTTGAACTCCAGTTTCTTTCTCTAGATTTGGTTTTTCAACTTCCGGTTTGTTTCTAATTTCACGTTTTCGTTTTCGATTATCTCTGTTTTCACTGGTATTGAATCTGAGAGAGAAGTGTTTTATTAATTAAAAAACTCAGTAAATTCAACATACAAACTTGGACTCTCTCAACTGATATAAATACATGAACTGCTAACAATTTGAACAACTACTTAGCAGATATTTGTTACAACTAATAGGTATAACCACTCGGCTGAATTCTGGTGGTACTGTTTGGTTGATTTGTTGATTTGTTGATTTGTTCCTCCTATCCAACTTCTGGAGGTCCCTAGAATTGAAAGGTAGAAAGAATGTTCCAATAGCATTCCTAACACAATATTCCTAGTGGTACTCAAATTTTAAGGTCACAAAAGAAGTATACATGTAATCTTATTCAAAGTAGTTACTTTTGATTCTTTCGGACCTAAATATTTCTAATCCTACACTTTCTTTGTAGGTCCATGAAAACCTGATACACGGGCTTGGTTTTGTTAAAATTTTGTGTGATATTAAAAAGAAAGGCATGCAAGGATCACCAACTTGGAGGCTCAAGAAGATAATAGAAGAAAATTGAGGTAGCACACCTTGATTCAGATAAATGAGATATCAGATGCTTACCTCCAATAAATTCTTCCAACATCAACTGATTATGCTTTTTATTTCTACACCTTGCAAGCAGATGGACATTCTTAAATTAGGCAGAAGCAAATAGTTGATCACATTGAGAACTCCATGGAAGAAAGGTAACACTTTTAAATATAATTGCTACACTTGAAAAATGCACTAAATCAGTGAATATAACAATAAGTATGTTGTGATCAGCACGGAATGATTTGTAAAATAAAACTTTCTTCAGGACATAGTTTAAGAAATCAGCTATTCAACTCAGACGTCTGGCTCTCCAAAATCAATCATTTACTGGAATCTCATGTTATTTACTAATTGTTATAAAAATTTGAGTAAGGAAACTTTGTTTCCTTTTTTTAGAAGAATAAAAATTTTGAGTTCATAGTTTTGGTGGAAAATTAAAATATTAAATACAGTATAGACCGTTATTTTTTGGATTCAAGAATGGAATTTATTGTTTGTGTTTGATATTTTTTTTTCCTTTCAAGAATGTAATTTTTCCTCCGTTTTGCATATTTTTTAAGAATTTTAAAAAACCATTAATTTAATTTTGATGTTTAATTTCGTTTGTGATTCTTCCTTTGCATAGACCGGTAGTTTTTTGAATCAAAGACGACAAGTTCTTTGATTGCCTCAAGGCGAGAGGTGACAAACATGCACATATATATATATATATGCACACGCATTGTAAAAACATCAAAATGTAAAAAACATACAATAACGATCAGGTTCTAATAGTTCCAAAACATATTGCCAGTGGGAATGTTTGCGTTTGTGATCCATTTCTACCATCCTATTATGATAAGAGTACAAAATAAACTTAAAACCACCTCACTGGCCACTGCTAATGTCGAAGAAGCAAAATGCAAATAAGAAAATTTATTGGATTAAATTGATTTAATTATAAAACATAATAAATTACCCTAAACCCAACTTACTATAAATTGTAATAATAAAATTTAATCTTATTATCAATAGAAGTTTTATTTAAGAAAGAAATTGGAAGGGAATGAAGAAAGAATAGAAATAAATAAAAAAACTAACCCACACCGATAGAAAGGAAATGATGACCAATTGGAGAAACCTTACACCCACTCACTGCTTGGAAGCCATTGAAACAATTGGAAAGACTTTGAAGAAAATGCTGAGAATTCACAAACATTAAGGAGAAGCCAAAGAGTTAACCACAAGTCTCTGTGTAGGCTTTTTTTCTCGGGCTTATGGTTGGGCGCTTTGCCTTGTCAACGAAGATTCTCGACCAAGCACTTACCCTAGGTCACCTCGCCTCTCGCCTTAGTCGTGTGCCTAGAGTCACCTTAATAACATTGTTTAGAGCCTGTTTAGTAAGATTGTGTAAAGATTGTTACTTTAATTCTTATTTCAAATGAGATTGAAGTGTTTGGATGACATTTTAAACACATGGAAATTTGTGGTTACAGTTGGGTAAATTTCTATGCATTCTCGACTTGTAGAACACATTTTGGACTAGTTTGGACTCGATTCAGTTTCTATCTTTTTTCCAAGATTGTCGATAATTTTGTTACTCCATTAGTCATTGACCTCTATGGCAAAAAAATCTTCCGAATATTCTAACAATGTAGAGGGATTGATGAAAGATACCTACTTCTCCAACAACTTCAAGACGAGAAATTTCTTTTATAAGGAAAGTTGGGTCTACTAGAGCAACTTGGAGGGTGGGAAAAGGCAAATAATGTGTTTTCTAACTCTAAAGTGAAAGTTGGTGATAATCATTGAATCATGGATGACTACACTCCTCATTCTATTTTTGTACCAACAGGGTATTACATGATTCCTTCATAATTTGTATGAGAAAAGGACATTCTCCGCAACAATATAAACACCATTTTTTCCTAATTAGCGAGCAAATATGATACATATGGAAGTGTATGATCTAGAAAATTGGAAGAACAAGTGGTTGGTTGAGAAAATGAGCTTTGCATTGATAGAGTTAATTTTAAAAATGAATTTTGCATCTGATCGATTTAGTGAAGATGGGATCCAACAACTTCTACATGGATATAATTTGTAACCATCTTAGTTTCAAAAGTTCAACCTTTGATAATAAAAAATTAACTTGAAATCTAGTTGAAGAATAACATTCTAACGATGTGGAACCTACTAATGAATGTTATGTGAAAGTTTTTATTTTGATTTGTATTAAAATTTTCTTCATTTTCTTATATGATTTGCCTTTAAAAAGATTTCAATATAAAAGAAAACTCATTATTATAAAACAAAACGAAGAAATTTTCAATATCAAAATAAAAATACTTTACATACCTGTATTGTTCATTAGCAGGTTCCACATCCTCATTCTTCAATCTCATTTTTTTTTTCATTCATCAAAGGTTGATGGATATTCCCCTGAATCTGAGGTGGAAATAGTTGAACTGAATCAGTATCAAACGCAAAATTGATTCCAAAATTAACCTCATCGATGCAATGTTCATCTTCATTACTGTGGATAATGCCATTTTTTTCTTGTTTCAAAATTCTTTTTCGGAGCATACAAAGTACGAATGAATCATGTACTATCTTATTGTTACACAAAAGTAAGATATGGGTGTACTCATACATGATCCAAGAGTGATTATCATCAACAGTCTTCACCTTTGTAGTTTTCATAATGGAACTGTTTAACACTTCTGATCAAGTCATTGTTGTCGGAAGAAAACACCTTATTTGCTTTGTTCTCACCACTCCAAGTGGCCCTATTAGAACCAACTTTCCTAATAACATGAGATTTCTTCTTCTGGTGGTGAGGAAGGATATGTCTTGGTCACCCATCCCTCCACATTGTTGCCGTATTTGGTAGGTTCTTGGCTATAAAGGTTCTTTGTGAAAAAGATAGAAGCTAGAGAGGTGTGGCCGGTGGGAAGCATGCTTGGATTCAATAATGAAGGTAAAAGACAACACAAACCAAGTACTTGGTTAAATTAATATAATTACAAATTTATTATTTAATCATTTATGTGTATGAATATATATTTTCAACTAAAACTATTTTACGTATAGGGAAAACAAACTGACTTGACTTATTGTCGACTGGTCGTGGTGGCTGTGCAACAATCTCTGGCGATGGGGTTAGTGAACCACCGACAACGAGCTAACGGCTAGGCGAGGGGTGGATGGCAGCGTGAAGAAGAGACTAATAAACAGTGTACAAAGATTCGAATTTGGTGGATAAGTGTTGCTGTGAGTGTGTGAGACTAATAAACTTTGTTCAAAGATTCGAGTTTGGATTTAAGCAAACACAATTATTTTATTTGCTGCCTCCATTAAATTTTAAATTTGGTTCTATT

mRNA sequence

GTCAGCTGTCTGCAGTGCAATATCTTCCGCGGTTTACAAGCCCTCTTTCTTCTCAAGCTCTGTTCACGCTTCCGGCTCCGATCCACAACGCTGCTCATGATCCCTCCCATTCCCCTTCTCCTTCTCCATCGTGGCTCGGCAACAGTTCTGGACGGTAGTCGACTGTGGCTGCGTTGGATGGATGGCGGTGATGGATCTGAGTACCAGCGGCGAGCTTACAGAAGGATATGTCTTGGTCACCCATCCCTCCACATTGTTGCCGTATTTGGTAGGTTCTTGGCTATAAAGGGAAAACAAACTGACTTGACTTATTGTCGACTGGTCGTGGTGGCTGTGCAACAATCTCTGGCGATGGGGTTAGTGAACCACCGACAACGAGCTAACGGCTAGGCGAGGGGTGGATGGCAGCGTGAAGAAGAGACTAATAAACAGTGTACAAAGATTCGAATTTGGTGGATAAGTGTTGCTGTGAGTGTGTGAGACTAATAAACTTTGTTCAAAGATTCGAGTTTGGATTTAAGCAAACACAATTATTTTATTTGCTGCCTCCATTAAATTTTAAATTTGGTTCTATT

Coding sequence (CDS)

ATGATCCCTCCCATTCCCCTTCTCCTTCTCCATCGTGGCTCGGCAACAGTTCTGGACGGTAGTCGACTGTGGCTGCGTTGGATGGATGGCGGTGATGGATCTGAGTACCAGCGGCGAGCTTACAGAAGGATATGTCTTGGTCACCCATCCCTCCACATTGTTGCCGTATTTGGTAGGTTCTTGGCTATAAAGGGAAAACAAACTGACTTGACTTATTGTCGACTGGTCGTGGTGGCTGTGCAACAATCTCTGGCGATGGGGTTAGTGAACCACCGACAACGAGCTAACGGCTAG

Protein sequence

MIPPIPLLLLHRGSATVLDGSRLWLRWMDGGDGSEYQRRAYRRICLGHPSLHIVAVFGRFLAIKGKQTDLTYCRLVVVAVQQSLAMGLVNHRQRANG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG06G017350.1ClCG06G017350.1mRNA