ClCG06G001050 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACTATTTGACTTTTAATGGTACTGATATTAGTAGTTGTGCCGTCGCAAATGAGGTCTTCGCCACTGCCCTCGGCGACGGTACTGTCACAATCAAATCTCTTTTCTTTGATAAGTTTTGGTCGCGTGGGTGTGATAATTGGGTTGTGGCTGGGTCTTGTAACTCCAACCACAATGATCCCAACACTTTGTTCTTTCCCACAAAAGTTGGTAATAATGTTGTTGCTTTGCGTAATTTGGGCAACCAATTGTTCTGCAAAAGATTTACCGACGAGGGAGTCATCAACGGTCTTAACGCGGTCATTCCTACCATTACTCCAGAGGCACAACTCCAGGTATATGAGCTTGTTGCCACCAGAGAGATCGAAAATGTCGAATTTCGCCTCTCGGACGGACGGATCTACGATAAGAAAGTTATTACTGTTGCCACCGGTGTTGCTGAAACAAGGTTAAATTCTATTATCATTTTCGTGTGCTTCAACCTTTCAAACATATATGACTATTTTGATCTCTTATAACTTTACTTTTATTTTTTCTTAAAAAAATATAAATTTTTGTTCCTTCAATTTGGATTGTTTTCAAATATAAAAAATAAATAAAATATTCACAAATATAACAAAATTTCACTATCATAATCTATCGCGATTTATCAAGACTGTGAAAATTTTGTTATTATTTATAAATATTTTCAAGTTTTGTTATTTAAAATAATTTTATTTTAAATTTTGAATTTAGTTTTTTCTTTTCATTTGCTCTCTAATATTTAACACTTTTATTTTTCAATTTTTTTTTTGCTAATGCTCATTTCTCGCTTTTGACCTTTACTTTTCAAAAATATTAATTTAAAATAGTTATGACGTGGAAATTCTTAAGAAAATTTAATATTGAGGAAAAATTAATGAGTACTGATATAATTAAATATTAATTTATATCATAGTGAATATTTGGTTAAAAAAAAAATTGAGTGTTAATTTGAATCAGGCTCAAAATTAGAGTAATGTAAAATGTAGCATTTCTAAACTTAGCAACCACGTCAAAATTAAATTCAAAATTCATAAGTAAAAGTTTATAGTTTTTTAAGTCTTAACAACCACGTAAAAATTAAATTCAAAATTCATAAGTAAAAGTTTATAGATTTTTAAGACTTAAAAAGACCAATGTGATTTAGATTAAAGAAAATAATGACAAATATTTTTCCCTTGATTTGAAAATGTATATTCTACATTTATGTAGCTTCATTGCATTTCTACATTTGCATCGACTATTTTCTAAAGCATATATGAATGACTAAAATAGATATTTTAAAAATTAGAGTCCAAAATAAAAGGAATTTACAATAACAAACATCTAAATGAAAAATATTGTACCATCAACCTTAGGTGTAAGATTCCATCTCTCACCCTACATATTGTAAAAAAAAAGAAAAAACTACAAAAATTAGATTTAAGTCTCCATAGACTAATAAATGAATATTTTATGGCAATACATTTGAAATAGAATATTTAAGCTTTGAAAAATATTTAGGTGCATCTTGGGTTGGGTTGCAACCTAGTTATCTAATCAATTGTTGCCACGTGTCAAATTTAGAAAAAAAATATTCTTAAGATTTTTCTTTTACCATGTAATTAAAAGTGATGCATGAAGATAGGTGCAATCTAAATAAAATTGGAGTTCCATCATGATGCAGGTTGCTGCAACCTGCTGTAGTCGATGTGAAACTTGCGTACGATGACAAAAAGGTAAGTGCTTGGAGTTCTACTATTTCAGTGAAGCTAGATGTAGAAACAAGCATCATCAAATCGAGCATTCCCATCATTTTCGACGATAAGCTAGCGATTGGATCGGAATTTTCAGGAGAATACGAATGGGGAGAAGCTAAGAACTTAACGAAGAAGGTGGAGACTGTGCACAAGGTTCTTGTGCAGCCATTGACAAAGGTGAGAGTGAATTTGGTGGCCACACAAGCTTCATACGATGTGCCATTCTCTTACACACAAAATGATACTCTCATCAATGGCCAAAACATTACACTCAACATGGAAGATGGGATTTACAAGGGAATCAATCTTTACAACTTTAAGTTTGAAACCGAATCGTGGAAGTTGTGAATGTTGAGAATATAATGGTTTCATTCAATGTGTTATTGTGTGTTTTATTTGTCTTAATAATGGTGGAGGAGCTTGTTCTTTAAACATGTCAGCCACAGCAAAGGAGTAGTGTGTTATGCTTGTTGGCTTTTCTTTTCTCATTTCAATTTTGTGTTATTTCGAGTGTTAAGAAGCTACTCATAATCTCTTCATGTTTTTGGAGCAACGTACGGTACATTTGATAAGATTCTCATTTCTTATTTTTTGTTTCCAACTTTTCTTAAAAATAGACTTATTTGATAATCAATCTCTTGCTTATTGTTTTAACTTTGAATAATCGTTTCAAAAAATAGAGTAAAATTTGAGAAATGTTAAAGATCTTGTTTGATAACCATTTGGTTTTTGGAGTTTGTGCTTGTTTCCCATCAATATCTTACCATAGTTTTCATTTTTTCTAAATAAAAGAGTTGAATACATAGCTAAATTCCAAAACAAAAACAAGTTTTTAGAAACTAATTATTTTTAGTTTTCAAAACTTGACTTTAATTTTTAAAATATAGGTAGAAAGTAATTAAAAAAAAAAAAAACAAAGAAACTCAGAGATGGGTAGGATGTTTGTAAGCTTAATTTTGAAAAAAAAAACTAAAAACCAAATGGATATCGAGATTTAGTGCTTTATCTAATTTTACTTTCTTTTATTTATAAATAAAAAAATAGGAATATGAAACAATTTTGAGAGTATGAAAATAATTATTAAAAATACATATGAAATCATTATTAAATAAATAATTTTGTTATCTTAATCCTTGTGTCATAGATTGGTAACACTAATTTTAAATGGGTTAAAAGTGAATTTTTTTTTTAGAGAGTTGGTGAGGAAGAAAAAAAGGAAAATTTTTAATTTTTCAACATTTATGTCTATTTTTAGTGTCATCTCAATCTATGTCTTATATTAATTGATATTAAAGAGCAAGAAATGTAAAAAACTAGTTACAACATTAGGTAAATAAATTTAAATTAAAAAAAATAGCCTTTTTTTTTTAAGTAAGCATTTATTAAATTTTAATTTTGAATTAAAAAAACTATCTGTAGATTATTATAAAAATTTGTATAATTTAATTATATGAACCAATATAAACTTATTATTTCAATTATTTTCGTACTTATAATTTAATATATTCATTTAAGATTCTATAGGACTTGAATTTTATCTAATTTTCTTTAATCAAAATTATTTAATAATCATTTAAAATTGATTTTAATAGATTAACTAACAATTTGTCCAAACACAAAAAATATTGAATTACTTTTTCAACAAATTTCATACCTCTAACAAATATTGAATTGACATTTTAAGAAGCCACAGATTCTAATGATGAGTTTATTGAAGTCCTTTGTATTCATTTGGGGAGTTGTAATTTCTTATGGTTTTTATTGAAGGATCCGTTTGGATTGACTTGAAAAAAAAAATCAAAAAACTCATTTTCATTTAATATCTTTTGATAAAATTTGTTTAAAATACACTTCAAAATCTATTTTGAGTGGTTGTTAAACACTTCAATTTTTTTTCAAAACGACTTATTTTTTAAAATTAAACACTTAAAAATATATTCCAAACACACCCGAATAGGAATCACTGATAGACTTCAAAAATTAGGAATGTCGAGCCTCCAACATATTTTAATATATTGAATGGACTGTTTGGACATTTTCTTGGAAGTAAATTTTAGTATATTTGCAATGTTTTACTATACTAAATTTTAGTATATATGCAATTATAGGCCTAAATATAAGAATCAAAACTTAAACTTAAGTGTGGGCCTTAGGTAGCCTTGTTTTAAGAGAAGATATCTCAATCATTGAGGTATAATTATATTATTACTTTTCTTCACAAAAGTACTCATCGTGGCCCTTTGGTAGCCCTGTTTTAAATATTCAATACAACCTTTACCCTCACACCAAACAACCACAATTATTCAATTGGAACCCACCCCCACGTAATTACTACCATTCAATTATTTCATTGTGTGAAGACAACAACAGTAAATGAGGGTTCTGCCAATGTGATGTTAATGATGCTTACATAATTTTACTTTCAACATGACTCTCATTCTTTCCAAAACCTGCAATAATATACCAGAATTTTAATTTTTGGTCAAATTACCCCATAATTATCCCAGTTGTTATATATAATTAATAACTCATATTTGATATCATTTGGTTTTTAGAATTAAGTTTACAACCATTTTTAAGTAAAAGGGTTTAGCTAAATTTCAAAAAGAAAAAAAAATAATAAAATAATAAACTTTTAAAAAGTGTTAGGAAGACAACAATTTTTTTTAAAAAACTAAATCTAAAAGCTGGTATTAAGAAAACACATCAGCTCCTCGTTACATGCCGGTAAACAAAATGGTACATTTAATATGACAATAAATACTACTTGTGATTCCATACCCACCTAGTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTATTTTTTTGTAACTTTAAATCTCCAACATCTAAGGGCTAAGTACATACTAATATATACTATTAAGCTAAGTTCATTTTGGCAACTTTAGTTTTATTCAATTCCTATGAACTAAATTCCTCATTTAATTAATTTTTTCATAAATTGCCAATTGGTCCAAAAACTTAATCATTTATGGACTTGAAATATGTAGAATACTCCACAAGTAGAAACTAATATTAATTGGAGAGAAAATAGCATTGCTTGAATTTGAACACATGACTCTCTGGACCATATGTTCTGATACTATTTGAAATCACTTATTGACATAGAAGTTTAAACTAATGGGTAAAGATGAATTTGATATAATGCCATCTAATATTTTTCAATTTTTCTTAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAATATATATATATATAGTGGAAAAGG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BLAST of ClCG06G001050 vs. NCBI nr
Match: XP_038875952.1 (uncharacterized protein LOC120068303 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 833.6 bits (2152), Expect = 1.3e-237 Identity = 401/468 (85.68%), Postives = 428/468 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. NCBI nr
Match: XP_008460021.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498960 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 828.9 bits (2140), Expect = 3.2e-236 Identity = 401/468 (85.68%), Postives = 426/468 (91.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. NCBI nr
Match: KAA0039925.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold122G002050 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24575.1 uncharacterized protein E5676_scaffold266G001200 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 828.6 bits (2139), Expect = 4.2e-236 Identity = 401/468 (85.68%), Postives = 426/468 (91.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. NCBI nr
Match: XP_004140598.3 (uncharacterized protein LOC101212067 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 819.3 bits (2115), Expect = 2.6e-233 Identity = 395/468 (84.40%), Postives = 426/468 (91.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. NCBI nr
Match: XP_022953531.1 (uncharacterized protein LOC111456051 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 797.7 bits (2059), Expect = 8.0e-227 Identity = 380/460 (82.61%), Postives = 415/460 (90.22%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBK3 (uncharacterized protein LOC103498960 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498960 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 828.9 bits (2140), Expect = 1.6e-236 Identity = 401/468 (85.68%), Postives = 426/468 (91.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TEN6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G001200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 828.6 bits (2139), Expect = 2.0e-236 Identity = 401/468 (85.68%), Postives = 426/468 (91.03%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KBV4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G085110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 817.0 bits (2109), Expect = 6.2e-233 Identity = 394/468 (84.19%), Postives = 425/468 (90.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GN79 (uncharacterized protein LOC111456051 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456051 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 797.7 bits (2059), Expect = 3.9e-227 Identity = 380/460 (82.61%), Postives = 415/460 (90.22%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG06G001050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JX13 (uncharacterized protein LOC111488623 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 790.4 bits (2040), Expect = 6.2e-225 Identity = 376/460 (81.74%), Postives = 415/460 (90.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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