
ClCG02G023250 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACAAAGAAGATCTTAATTTGTGTGTTTTAATTTTATTATAATGAGGAAGCCTGAGGCCTCGGGTGGCAGTAGTGCAACCACGACCAAAACGACGACAACGATGAAGCTCCGAAAGGGGCTATGGTCGCCTGAAGAAGACGACAAGTTGATGAGCTATATGCTTAACAATGGCCAAGGCTGCTGGAGCGACGTGGCTCGTAATGCCGGTCTTCAACGCTGCGGCAAGAGCTGTCGTCTCCGTTGGATCAATTACTTACGCCCCGATCTCAAACGTGGCGCCTTCTCTCCCCAAGAAGAACACCTTATCATCCATTTGCATTCTCTTCTTGGCAACAGGTCTTTTTTTCTATTCATGTGTATTCACTTCAAAATATAATTAACGGTTTGTAATTATATGGTAAATTAACTATACTATCTACTTTGGGTAATAAAAACTTAAAATGTTGGCAAAGGGGGTTTGATTAAAAGAGTGTAAAAATCAGTTTACATTTGATAGCCATAAATCATGCCCATGCCATATCTCACTATAATATTTATACAGATATTTCAACTTCACAATACACTATACTTTCTTTTATAATTTTATTATAAAAACACTGTGGACTAGTTTAAATGAAAATGACGAAGATTTATAGTGAGTCAACTTCATGTCATTAGGCTTGAAAATAAAAGGCATGAAAATCATATATATATATATATATATATTTTAATTCATAGATCTCTTACTCATTCACGCATACAACATATTAAGTGCCACATTAAACTTTTGTGTTTTTCTCTCCACGGTTTATTATATTTAATCATTGATTTATTGTTAATTAAACATATGACATCTCACCAAATTTAACCACCACTTAAGAATTATAAACGTTACAAAAGATTTTGACATAAACTTGAAATTGTATTCTTAATGGATTTTATTATTGAATATAGACTCGCCTGCATGCACTCCCTCATGCACAAATTTTAATACATGTATATGACTATATGAACGCAGATGGTCTCAAATTGCGGCAAGATTACCAGGAAGAACCGATAACGAAATCAAGAATTTTTGGAACTCGACTATTAAAAAGAGGCTCAAGAATTTGTCCTCTTCCCCGTCGCCCAACACTAGCTCCGCTGGCTCCCCCTCTGCCGACTCGAAACCTAATCTTTTTGGCAACCTCTTATCGGCTCAAGATCAACAACAACCACAAGGGTTAATGGATGACTTCCCCATCTACGCTCCCGATCCCACACCTTCCGTTATTGCCATCGATCCCTTCCCTTTCCTCGCCACCCATGGTGGACCATTCTTCCCTGCCACCACCCCAACCTTCACCACTGGGGTCGAACCGGGCTATTTCCAGGAAGATGAGAGTTTCTTTAGTAATCTCCCTCTTTTGCAAAGTGTTAACGCTACCACCACCACCGTCGCTACCACCGCGGTCGCCATCGCCGAGAGAAGCCTAAAAACCGAAACCGTAGTTAAAGAAGCTAACCATAGTAATTACTTAATTAACAACATCAACTGCCTTGCTAATCATAATAATATTAGCAACAATAATCCAAAGAATGATAACACCATCAATGCTGAGGTTGGAGCAAATTTTCTTCATGAGGAATTTTCAATTGGCGAATGGGACTTGGAGGATTTGATGAAAGATGTTCCTTCTTACCCATGTCTCAATTTTCAAGTCCAATAGTAAATCGAGAAATTATTCGAAGAGGCCACAACAATATGGACGGATAATTTTTATCGAGTCGCTCACATTACATAATTTTTCGAGATGTATATTAACACTTTCACAGGGATATATTTAGGGTTTGGCTAGCTTATTCATATCTATCTTTTCTAGATCTTTATAAGTTTTCATCTTCTTTGCTTTCTGTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTATTATTATTATTGAAAAGCTGTTCATATATAATGTGTAATAAAAAATAAAATAAAAAAAAGTCCAGGGTTGTACTGGGGTATAAAACATTGAAGACCCTTGAAAGGCACTCCATTAAAGGGAGCTATACTTCAAGCTAGAGAAAGAAAGTTAACAATATTATTGTATACATGTAGTTTGTTATTATTTGTAAAACATGCATGTACAGTACAGAAGGATATATGAATATGTCTAGTTGGTGAAATTAATGGAAGTTTGTTATACTTCTCTTTTTCTCAATATTATTGTTGATATTGATCATATATTACATGATAGATTGTGCAGTAGATAAATGAATGAAATTGGGTTTAAAAATTGTAGAATAAAGTTTTTTTTTTACCGTATTATGAACATGATGATCAGGGTGTAAAGGTTATGTCTACTTAGTTGGAATGTTCGAGTGTGTCTTTTGATCTCTCTTTATCTTTTAATTTCTCGTTAAAAAGGTATTTTTTTTAGTAAAATATGTTAAATGGGAATCGAATTTTTGATTTCTTGATCGATAGTACATATGATATTTATGTCAATTGAGTTATGTTTACGAAGAATTCAAGTGTGGTTGAGTTTGGATTGAAAGGAAGGAGTGATGGGTAAAAATGGAGGGGGAAGAGAAAGGTTGTATGATTATTTCTTGGATTAATGGAGTTTAATGATAACTAAGTTGAGAGATGAATATCCATTGCCCACTAAGGGGAAAATTAAACAAGGAGGAGTAGAGTTCTTTTTATCATTTGTTTTTGTTTTTTTTATCTGTAAAACCCTTTTTTGCTTTTTTCGTTAGTGACCATCCCATTTTTTTCATAACTAATTATGTCAATTAGAGATTAGTTAGGCACATGCTTGGTTTCAATTCTAAATCCCATTATGTAACACACTATCTCTCTCTTTCTTTTAATTCGTTTTACCTTAAATAAAAGTAACCACAGATTGGAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATGTATGTATTGTCATTATATATATTCAATTTCATCTTTAGGGTTTCCTAAAGTTCATTTTTTTTAGGGTTTGTGAATATTTTCAACCCAAGTTCTCTTAATGATTAATAATATATATCAAAGTAGAAATTCACTTGAGCTGCCTAGTGGTCTACAAAATATCTAGTTATTTCACCATTATGTGAAGTATTTTCTTGTAATAAAACTCGTATCCTTGTCTATTTTTTCTCGGTTGTAAGTATGTTTCGTCCAACTAAAGTCCTACGTATGTTAAGTAAAGAGAAGATTTATGATGTATAAGTTAGAAAATTATTAGGCCTTTTGGGTGAAACAAAAAACAAATTCATGAAGAATTATACCCAAATTAGATAATATCACACCATTGTGAAGATATTGTTAAAGAAAAAAAAATTGCAAAACTCGACAAGATTTTCATGGTTTAATTTTGAAATAAATAAGGTGAGATAGACATTATTTAACATGTATGAAAATAATAAAATAATAGGATTCTTTTTCCTACGTGTCACACCATCCTTTTTCATTAATTAATTTACTAATATAATCCAAAACTAGTTGTAAAGTAATAGAGTTTGATTTTTTTTTTTCCTTTTCTTTTACATTTCAAAGGTAATTAAAACTTTAGAAACAATAAATTTGAAACCAATAGGAAAAATTAAGAATACATAAGTTCAAAAAGGATTAAACACACTATAAAATAGGGTGACACATAGAGAAGATGTGAGATGATTGCATCTTCCCCAAATTCTCTCATTAAAGCTAGCTTAGAAAATGACCCAATTGAAATATTTTACAAAAATTAGCTCTCATAGGTAGACATAAAAAGTGACCCCTTTTTTCCACTTGAATGAATGATAAAAAGAATGTCCCTTTTTCCCCAATCATTTTCTTTAGGACTTTGAAGGCTAGTCCATGACTAAAATGTGTATCTATGAATTATTTAATTTAGAAAACTAAATATTTGGTTACTTGAAGAACAAACAAAGTACACTTGATCATGTCTTGGATTAGTTGCTAGAGTGATTGTGGGAAGAAAAAAGAAAGCCAATTTGCATTTCAAAATATTATTCTCTATGGGCTTAGGGTTTTTAGTGTTTTTTTTGGAAAAAAAAATCTTAAACACACTAACCAATGCACTAATTACCAATATAGTGCATTTTTCACATGGTAAATAGATTTACATGCACAATAATATACATATGAATTATAATCCAAAGTTTCAAGCTATATGTTTTACCTCGTACTTTTTTGTCCAATGTTTAAATATTTGCATCAACAAGACAAAACATATTTAAAAAGTAGATTAAGTAAAATAAAATAGAAAGTTATTTTTAAATATAGCAAAATATTAGATAGGTAGAGATAGACATCTATGAATGTCTATCACTAATAGACAATGATAAATGATAGTAGTCTATAAATGTCTATCACTAGTAGACGGCAATATTTTGTTATATTTATAAGTATTTTCAATAATTTTGTTAATTTAAACAATTGTCTTAAAAAAATCTACACATTTTTTTTATTTGTTTTCCGCATAGGCCATAATATATGTCATATATGGACTAGTATTTCTTAACAAGCTGGGTGAGACCGAAGACCAATTTGAGACTATGACCTTTTGTTAAAAATAGTTGTAATTTAGTTTGAAATTGTTGTAACCTTGTAATAAATAATTTGGTGATAGTTGTGTCTTTATAAAAATTAAATTATTAAGACATGAACTAAAAAATAGTGCTTGATAAATTTTAATTCTTAACCTAAAAAGGGATATTTTGGTGTGTTTAGTAAATTAATATTAGGTTGTTGTAATTTAGTTATAATCATCAAAGTACACATATTATTTCAATTATTTTTACTTTGATATTTAAAATCAAAGTTTTAATAGATATTTAAATTTATTATAAGATAAAATTTTCAAATGCTTTAAATTAAAAATTAAGTTATTTAATTTAAAATATTTAATCAAAGTTCCACACAGAAAATGTTTTACAAAAATTGAATCAATCTGAATATTATTGACATTAGAGAATATAAGTGATAGGAAAAAAAGAAAAAAAA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BLAST of ClCG02G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_022985757.1 (dicarboxylate transporter 1, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1038.1 bits (2683), Expect = 4.6e-299 Identity = 544/570 (95.44%), Postives = 556/570 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_008449718.1 (PREDICTED: dicarboxylate transporter 1, chloroplastic [Cucumis melo] >TYJ96140.1 dicarboxylate transporter 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 7.9e-299 Identity = 548/573 (95.64%), Postives = 554/573 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_004142115.1 (dicarboxylate transporter 1, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN54177.1 hypothetical protein Csa_018055 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 1.3e-298 Identity = 548/572 (95.80%), Postives = 553/572 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. NCBI nr
Match: KAA0041412.1 (dicarboxylate transporter 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1035.4 bits (2676), Expect = 3.0e-298 Identity = 547/573 (95.46%), Postives = 554/573 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXV3 (Dicarboxylate transporter 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DIT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 860.1 bits (2221), Expect = 2.3e-248 Identity = 460/575 (80.00%), Postives = 497/575 (86.43%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q41364 (Dicarboxylate transporter 1, chloroplastic OS=Spinacia oleracea OX=3562 GN=DIT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 839.0 bits (2166), Expect = 5.4e-242 Identity = 453/578 (78.37%), Postives = 492/578 (85.12%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O34726 (Putative malate transporter YflS OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=yflS PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 2.2e-142 Identity = 247/464 (53.23%), Postives = 342/464 (73.71%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMF7 (Dicarboxylate transporter 2.1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DIT2-1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 464.5 bits (1194), Expect = 2.8e-129 Identity = 260/532 (48.87%), Postives = 354/532 (66.54%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7Z9 (Dicarboxylate transporter 2, chloroplastic OS=Spinacia oleracea OX=3562 GN=DIT2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 1.3e-126 Identity = 270/584 (46.23%), Postives = 366/584 (62.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J5S5 (dicarboxylate transporter 1, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483716 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1038.1 bits (2683), Expect = 2.2e-299 Identity = 544/570 (95.44%), Postives = 556/570 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B8G1 (Dicarboxylate transporter 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold182G001080 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 3.8e-299 Identity = 548/573 (95.64%), Postives = 554/573 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMM8 (dicarboxylate transporter 1, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491513 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 3.8e-299 Identity = 548/573 (95.64%), Postives = 554/573 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L0P5 (2-oxoglutarate/malate translocator OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G291890 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 6.5e-299 Identity = 548/572 (95.80%), Postives = 553/572 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TDA6 (Dicarboxylate transporter 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold206G00590 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1035.4 bits (2676), Expect = 1.5e-298 Identity = 547/573 (95.46%), Postives = 554/573 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G12860.1 (dicarboxylate transporter 1 ) HSP 1 Score: 860.1 bits (2221), Expect = 1.6e-249 Identity = 460/575 (80.00%), Postives = 497/575 (86.43%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G12860.2 (dicarboxylate transporter 1 ) HSP 1 Score: 856.7 bits (2212), Expect = 1.8e-248 Identity = 459/574 (79.97%), Postives = 496/574 (86.41%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G64290.1 (dicarboxylate transport 2.1 ) HSP 1 Score: 464.5 bits (1194), Expect = 2.0e-130 Identity = 260/532 (48.87%), Postives = 354/532 (66.54%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G64280.1 (dicarboxylate transporter 2.2 ) HSP 1 Score: 427.2 bits (1097), Expect = 3.5e-119 Identity = 241/526 (45.82%), Postives = 333/526 (63.31%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G12870.1 (myb domain protein 46 ) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 4.1e-59 Identity = 123/196 (62.76%), Postives = 140/196 (71.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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