ClCG02G010240 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview


Name	ClCG02G010240
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description	Unknown protein
Location	CG_Chr02: 18069801 .. 18075293 (+)
RNA-Seq Expression	ClCG02G010240
Synteny	ClCG02G010240

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCCGCACCCCAACGCTTGGTAACGCAAATCAGCACTTACATGTGCTGAGGGACCATGAGTGAAGGCACTTGAGCAGTGTTTTGGTTGGGAAACCAGTGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCCCATGGTAATATTGACACAGTTAAACTCAGTGTTGAGGGACGAAATGTGAAGGCACTTGAGAGTTTGAAATGCCGAGGGACATAATGTGAAGGCATTTGTCTGTGAAAAGAAATGAGAGTTTGTACTGGAGGTTGAGTGCGTTGAGCTTTGCTCCGTCACAGCTAGGGATGGATAATTGTATTGCAATTGTATGGATGATGGTACTGTTTGTGATCTATAGAATAAGTGACCTAGAAATTCTTGCTATGTGGTTTGTGGTAGTTACTATGGTTTACATTAACTCATGAATGTTAGTAATATTTGAATGAATTCAGTCACTCACTGGGCTTTAGGCTCACTCAATTTGTTTGTTTGACTGTTGTTTTAAGTAGCGAGCGTGTCCGGGACGCCTAGCCTACACAAGATTCTCGTCTGGGCCTACTTTGGAGCAAACCTCTGGGATAGTTGTAAATACGCTGTTTACGTTCATGTTTTATTAATGTACATGTTCCTTGGCAGTGTTGAGAGGATCGATGTGTAGTATAAGTATAGAAAACTTGTCTGATAAGTTGTTATTTTAGTGCATGTCTTAATAGCATAAGTGTTTATATCTTGAGATTAAGCTGGCATATTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATAGCCTTTTAAATAGATAAATAGAGTTTAAATAAGAGAAGCATGCGGTAGTTGATGATAAATTCCATTAATAAATCTTCCTTTGCATTATACTCTTGAATTTTGATGAAGATATTGATTTTACCACTTGTTGAGCCTAAAACGCATATTTTAACGCAGGAATGCAGACGATGCGTTGATGACTTCTTAACGCAGGACAACATGTTAGCAATCGGTTCTTCATGGACGCATGATCTGAACGGAATGCAAACAACCTGACGATGCGTTAACAACAACTCAACGCATAACTACGCGTTAGCAACCTACGACGCGTTGACATCGGGCAAACTATGCATGGACGCATAGACAACCGTTACGGTAAGGCGCTGAGAATCAGATCGGAATCTTGAGAGATTGACGGATGATTGATAGACATGATTTGCGGCTTAAGTGGTGGATCTTAATTGGCCCGAGAATCACGCAATCAGGCGAGATGAACGCAGTGTCAATCTCGCCACCAATCAAGCAGATTTGCCATTAACTGCGATTTCATCATCTATAAAAGGGCAGCTCTGCGAGAGGAGAAAGGTATGAAATCCACGTAAATACTAAATCAATATAATCCCTGTGTTCGACCTCGGACTCACCGAGAAACCTATTCCTTTGCTTATACTTGGGTAGAGGATAGGAAAACTTGACTAGATCACCAACGCATAGTGTAGGACGCATGGCATGTTTAACGCATGACATGTTGAACGCATAATCACATCATTTAGCACCTTGCGTTAGGCTAATTCACACATACAATATTCGCACAACACATATAGTTAAGTCTTAAATATCTGAATATGATTTATGTTATAGTATAGAGGTAGGAAGCATGCAGGTTCACACTCACGCCTAGGGGAAAGGGGTATCTGGGAGGGGGTGTGACAAGATTACTCCACACAGCTAAGGAAAATCGCCGTTGAGGAGCATAGAGCATTGCTCCGCCTCAACTAGGGAAAAAGTATTTTGAAATGAATAAGATTTTGATTATTTATACCAAAGCATATATGTATAATGTAACAATGGTTTTTTATCATGTTATAATATGATTTGAATGGTTATATTTTATCCGAGTTTGACCAGTTTTATAGTTAAAGTCTAATGTTTTCAGAAAACTGTTACTCACTGAACTGTTAGCTCACCCTTTTATATGTTTTCCATTTTCAGGTAGCATGAAAGTTCCCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGTATGTTAATGGTATTACCGACCTAGGATGGATTTATATGAAAGTGAGGTGAATGTGACAGTGGGTTATGTGACAGGGTAGTCGGTAACTGTTGTACTCACACTCCGTCTCGAACTACGGGAGGATAGTTCGGGGTGGGGTGTGACAAACATTGTTAGACCACTATCATTTTTGTTTTTTCCTTTTATAGAAGTTTATTTATTTTGAAACCTTCGGAATATGAACCTTACTTTAAATTGAAAGGACTTTAGTTTCCTTTGAGTTGGAAATAAGTTTAAGTTTATTAGAATGTTAAACTTCACCGTAGTTGAGTTTGTTGGTTTTAAGAGGTTTGTTGAATATGAATAATTTTGTATTTGTGAGTTTTGATCCATTTCTGAAAGCTTGGATGATTCTATTGGAAAGTAGCTGAAGTGAAATGTTATTGGGAGTGTCTCTTTTTGAAACAGGTTAAAGAAAAATTTTGGGTTTCGTTGTGGCAGCTCCATTATGTTGGACATAAGAGATAATAAAATTAGTTATAGGTTAAATGTGGTAATATCCTTAGTTTAGTTTAGAAATTGGGGTCGTCACATAAAAGGGCGTGGGTTAAATAAATAAAAATAAATCAATTAACTAATTAATTTATCTATTAAATATCCAGTATTTAATTGATCATTTAAATCATATTCAAATGTGCATTCCTCTCATAGCCCATAGTCTTGATATGAATCTAATTTATATTATTTATGACCTATAGTTTTAATATAAATCTTATTTATATTGATTTAATATTTGAAATAAATTCAAATAAATTAATTCCCATAAATAATATATAGCTTACATTAATTCTCATAAATAATATATAGTTTTAATTCTAAACCACATCTACCATTGACTATATATTATAATGTATCAATATACATTATACTATATTTTATTATAAATCCTATTTATATTAATTTAAAATTTGAATCAAATTCAAATATATTGATTTTCCCAAATGATATATATTTATTATTATAAATCATATTTTAAGTTGAGAAATTATCTTAAATGGCAAAACTGATGAAAATATTTACAACTAATAGCAAAATACACAGTCTATCGCGATCTATTGCAGTCTGTCACAATAGATAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTGGTTCCTTTTGCTATATTTGAAAATAGCACTTTTAAATTAACTATATATTATAATGTATCATTATACATTATATTTCATATTAATTATATCATATATAATTAATCCATATATTTCTCTTAGCTAATTTGAAGAATTCTAATTATTCTTTCAAACTTTGGTCCTTGTTATTCCATAGTGAGCTAGCAGGGAGACTTAATGAACCAACCTCATTAACTAAATTAACCAACCTTGATTAACTATGGGGCATACCACTAAAAGCCCATAGCTGCAATCTTATGAACTGTAGAATATTTATCTGTCCATTGCTTTAACCATATTTTATAAGTTAATCATTCACAGGTTGTTCGTAACTATAGTTTGGTCAACTTACCGTTTTACCCCTATAATTACATCCTGGACTTTAAGTACCACTGATCCTCTAATGAACAATTCTGTTTATGGTCCAACCATAAGCAAAGTCCCTTTCAGGGCAGTGAGAGGGTGAGGCCTCATTTTTCAAGTCCTGGAGTTAGCACTTAAGAGAACAACCTAATTACTTTCCTCAACATTAGGAAGGAATGATTTCCATCTTGTGAAGTTACATTCCTAGCTCCTCACTCGGTATTATTCTTAAAATAATAGACATATTGAGTCAGCAGTTAAGGCCACTCTCACGCATACAAATCAAAGAATGGCCCTCATGAGTAGGAATTCATAACTTAGTCAGATTGCGATCGAGTTACATGGGTTATCGTTTGAAATATAAATCTTTTCAATTAACGGTGTTACATAGAGAGATCATATTTCGTGGTTTGGTCTCATACAACCTCACTGTATAGTATACTCCCACTTACATGTCATTACATGAACGGTTTGGATCAAACCATCTACAATACTTACAATAATTGTAACATTTACAAAGTGAGTCGTATCCATAGTGTTGTCAGGATAAGGTACGCCAACCATGTGTATATACTATAGACCTTTTAGGTTATAACTTGAACATAATCCATTTGTATGTTAATGACATATTGTTCAAGTTACATTAAATAACCTTGAACCTTAGTTTATTTGATTTTCAATTACACAAATAAATAATACTTATTAGAAACTAAATAATATTTTATTTATTAAATAATTTATTTACAGACTACGAGATTTATGACATAAATCTCAATAGAATTAAAGTAGGCACAAAAATTCATTTGATCTATTGTGGGATTTGACACCCCTGGGTGAGTTAATGAAGTAGCCCAATAAATAATTTGGGCAATCTTTAATAATCGATAATTCAATGATTCATGGTTACATTTAAAAACTATTGTTCTTAAATGAAGGGTTTAATTAAAAATATTATAGACATAAATGAGCTATACTAATTGTAATTAATTTAGGAAACACACCGAAAAGCAAAACTAAAAAATTTCACATAGGTAGGAAAAAAAATTGAAATTTGAATATATAAACGCATCAAATGAATAAAAATGATATGAACTGAAGAGCATATGGATTAAAATTGAACATTCCAAAAAATGGGAACTAAAACGAAACAAAGCTAGAAGTATAGAAACAAAGCTGGAAGTATAGAGATTAGAATGATGTTTTAACCTATTTATTAGTATTATTATTATTATCATTTTGATAATATGTGTGGTGGAAGAATGGAACCTCTAACCTTAACGTTGGTAGTTAAGTTTTATATGTCCGTTAAGTTGTGCTTATTTTGGCTCGTTGAAACATTTTTATCTACTCATTTAATCTATTTTTAATTAATTATATGAAGTCCACCTTTACTTTAGTCTATTGTTTTTTCGCATAAACATATAATTCATAAAAATTGATTAATAAAAGTACTGATTTTTTATACGAAAAGAAAAGTATGTGCTTAAAAGCTTATAAATGGTATTGACTAACAAAAGCATTGGAAAAAAATAAATTGTAAATGATTATAATTAATTAATAACGTGTTAGAAATTTTTTAATTTCGTTTTACAATCATGCGGTGCTTTAACATATAGTTGATTCCAAGAAGTCGTTGTGTTTAGGATTTGGAGCAGACCATCTGATTGGTCCTTTGGGCTTGCAATTGTTGAAGGTTGAGGCAGATGTTGGTGCCCTTGCACTCATTCTATTAGGATCAAAAGTGTTAAACCCATCAGAGCTTGGAGGAAGGGAAATTGATGATTCAGGTACTTCAGCAATAGATTCTCTAAAAATAGGAACTATAGCTTCCAAAGTTTCTAGAGCAGGCACTAAATTGAGCATGACTCTAGAAGTTGCCATGAGTATGGATGGACAAGACATGGCTAGAAAGAAGAAGAACGTGAAGAATAAAGTATTGTATCGAAAATCCATAGAATAG

mRNA sequence

ATGGCCGCACCCCAACGCTTGGCACTTGAGCAGTGTTTTGGTTGGGAAACCAGTGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCCCATGGTAATATTGACACAGTTAAACTCAGTGTTGAGGGACGAAATGTGAAGGCACTTGAGATAGCGAGCGTGTCCGGGACGCCTAGCCTACACAAGATTCTCGTCTGGGCCTACTTTGGAGCAAACCTCTGGGATAGTTGTAAATACGCTGTTTACGTTCATGTTTTATTAATGTACATGTTCCTTGGCAGTGTTGAGAGGATCGATGTCAACCTACGACGCGTTGACATCGGGCAAACTATGCATGGACGCATAGACAACCGTTACGTGGTGGATCTTAATTGGCCCGAGAATCACGCAATCAGGCGAGATGAACGCAGTGTCAATCTCGCCACCAATCAAGCAGATTTGCCATTAACTGCGATTTCATCATCTATAAAAGGGCAGCTCTGCGAGAGGAGAAAGTTCCCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGTATGTTAATGGTATTACCGACCTAGGATGGATTTATATGAAATCGGTAACTGTTGTACTCACACTCCGTCTCGAACTACGGGAGGATAGTTCGGGGTGGGTTGATTCCAAGAAGTCGTTGTGTTTAGGATTTGGAGCAGACCATCTGATTGGTCCTTTGGGCTTGCAATTGTTGAAGGTTGAGGCAGATGTTGGTGCCCTTGCACTCATTCTATTAGGATCAAAAGTGTTAAACCCATCAGAGCTTGGAGGAAGGGAAATTGATGATTCAGGTACTTCAGCAATAGATTCTCTAAAAATAGGAACTATAGCTTCCAAAGTTTCTAGAGCAGGCACTAAATTGAGCATGACTCTAGAAGTTGCCATGAGTATGGATGGACAAGACATGGCTAGAAAGAAGAAGAACGTGAAGAATAAAGTATTGTATCGAAAATCCATAGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCCGCACCCCAACGCTTGGCACTTGAGCAGTGTTTTGGTTGGGAAACCAGTGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCCCATGGTAATATTGACACAGTTAAACTCAGTGTTGAGGGACGAAATGTGAAGGCACTTGAGATAGCGAGCGTGTCCGGGACGCCTAGCCTACACAAGATTCTCGTCTGGGCCTACTTTGGAGCAAACCTCTGGGATAGTTGTAAATACGCTGTTTACGTTCATGTTTTATTAATGTACATGTTCCTTGGCAGTGTTGAGAGGATCGATGTCAACCTACGACGCGTTGACATCGGGCAAACTATGCATGGACGCATAGACAACCGTTACGTGGTGGATCTTAATTGGCCCGAGAATCACGCAATCAGGCGAGATGAACGCAGTGTCAATCTCGCCACCAATCAAGCAGATTTGCCATTAACTGCGATTTCATCATCTATAAAAGGGCAGCTCTGCGAGAGGAGAAAGTTCCCGTTGCCGATCGAAGTCGAGGTTTGTCAAGAGTATGTTAATGGTATTACCGACCTAGGATGGATTTATATGAAATCGGTAACTGTTGTACTCACACTCCGTCTCGAACTACGGGAGGATAGTTCGGGGTGGGTTGATTCCAAGAAGTCGTTGTGTTTAGGATTTGGAGCAGACCATCTGATTGGTCCTTTGGGCTTGCAATTGTTGAAGGTTGAGGCAGATGTTGGTGCCCTTGCACTCATTCTATTAGGATCAAAAGTGTTAAACCCATCAGAGCTTGGAGGAAGGGAAATTGATGATTCAGGTACTTCAGCAATAGATTCTCTAAAAATAGGAACTATAGCTTCCAAAGTTTCTAGAGCAGGCACTAAATTGAGCATGACTCTAGAAGTTGCCATGAGTATGGATGGACAAGACATGGCTAGAAAGAAGAAGAACGTGAAGAATAAAGTATTGTATCGAAAATCCATAGAATAG

Protein sequence

MAAPQRLALEQCFGWETSAEGPRVKAHGNIDTVKLSVEGRNVKALEIASVSGTPSLHKILVWAYFGANLWDSCKYAVYVHVLLMYMFLGSVERIDVNLRRVDIGQTMHGRIDNRYVVDLNWPENHAIRRDERSVNLATNQADLPLTAISSSIKGQLCERRKFPLPIEVEVCQEYVNGITDLGWIYMKSVTVVLTLRLELREDSSGWVDSKKSLCLGFGADHLIGPLGLQLLKVEADVGALALILLGSKVLNPSELGGREIDDSGTSAIDSLKIGTIASKVSRAGTKLSMTLEVAMSMDGQDMARKKKNVKNKVLYRKSIE

Homology

[Close]

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr
Match: KAE8649712.1 (hypothetical protein Csa_012861, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 9.4e-18
Identity = 64/101 (63.37%), Postives = 75/101 (74.26%), Query Frame = 0


Query: 213 LCLGFGADHLIGPLGLQLLKVEADVGALALILLGSKVLNPSELGGREI--DDSGTSAIDS 272
           LCLG GADH IGPLGLQ    +A  GALA I LGSK++N SE+GGREI  DDSGTSAIDS
Sbjct: 2   LCLGLGADHAIGPLGLQ-SNNDAGNGALAPIPLGSKLINSSEVGGREIDDDDSGTSAIDS 61

Query: 273 LKIGTI-ASKVSRAGTKLSMTLEVAMSMDGQDMARKKKNVK 311
           LK+  + +S+V     K SM L VAM +DG+DMA +KKNVK
Sbjct: 62  LKLRMVDSSRVVGGCAKSSMPLVVAMILDGEDMAMRKKNVK 101

[Close]

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr
Match: KAG6581979.1 (OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 3.7e-06
Identity = 46/111 (41.44%), Postives = 61/111 (54.95%), Query Frame = 0


Query: 232 KVEADVGALALILLGSKVLNPSELGGREIDDSGT-------------------------- 291
           +VE  +GALA  LLGS+V  PSE+GG +IDD GT                          
Sbjct: 16  EVEEGIGALAPTLLGSEVAKPSEVGGIQIDDLGTSTDVVGAFVVVNGALEGTKLDPFNKK 75

Query: 292 ----SAIDSLKIGTIASKVSRAGTKLSMTLEVAMSMDGQD-MARKKKNVKN 312
               SA+D+L++G +AS V RA T+ SM LEVA S + +D + RKKKN +N
Sbjct: 76  GWRSSAMDALEVGIVASNVVRACTESSMALEVATSEEEEDTVKRKKKNQEN 126

[Close]

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr
Match: KAE8649705.1 (hypothetical protein Csa_011947, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 3.1e-05
Identity = 37/64 (57.81%), Postives = 48/64 (75.00%), Query Frame = 0


Query: 248 KVLNPSELGGREI--DDSGTSAIDSLKIGTI-ASKVSRAGTKLSMTLEVAMSMDGQDMAR 307
           K++N SE+GGREI  DDSGTSAIDSLK+  + +S+V     K SM L VAM ++G+DMA 
Sbjct: 16  KLINSSEVGGREIDDDDSGTSAIDSLKLRMVDSSRVVGGCAKSSMPLVVAMILNGEDMAM 75

Query: 308 KKKN 309
           +KKN
Sbjct: 76  RKKN 79

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAE8649712.1	9.4e-18	63.37	hypothetical protein Csa_012861, partial [Cucumis sativus]	[more]
KAG6581979.1	3.7e-06	41.44	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1, partial [Cucurbita ar...	[more]
KAE8649705.1	3.1e-05	57.81	hypothetical protein Csa_011947, partial [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of ClCG02G010240 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
ClCG02G010240.1	ClCG02G010240.1	mRNA