ClCG02G006880 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
|
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAAATTCAGTCAGCAAGTAGAGGTGGCAGGCGTCGGCGTACTTGTGGCAGGAAAATCGTGGACCTAGTCCACGAGTTAGGTACAACTCAGCTCCCCGACAGCAACTGACCAAGCTATTGACGAATCCTAAGAGAAATCAAGTACTGGGTACACGATTTCTCTACCCTATTTTTGATATTTATTTCTAAACCATCCTATTTTTTACATTTGTTTCTAAATTACTTTATTTTTGTCATTATTTTAAAAAAGATGTGTTATTCTTAAAAATAATCCGTCAACTAACGTTCAAGTTAACTGGGGGAAGATAGAAACATTCTTTCAACGTTAAGAAATAAAGTGTCAAATAGACGCTAACCCACGTTTTGCCCAAAATAATAAGTAAGAAGCGGGTGTGGAACATTTCCCGCTACGCATCTGTCAACTAACTTCTTTTCTCGTAAAATCATTACTTTTTAGAAAAACGCGCGCCCCCGACTGTCTCCCCCTTGTTTGGCTGCCGAGAAAGCGAGGGAAAATATTTTCCGTTTCATATTTCAACACCACAGAAAATTGTCACTAATTCATGATTTCTGTGGAGATTTCTATACTTCTTCTTCTTCTTTCTAGCAATCGAAGGGAACCAGTTCGTTCGAACTGCAACAATCGCTACTGCAATGGCGAAAGCTGATACGGCGTGTATCACTCAAGGTAAGAAGCTTACACGATTCGTAGCACACACGAAATCGCTTGGTGTTGAACTGTTCTGTACTGTTTAACTTGTGCAATTTTTCATTCGTCGCCTTTCTTTTCTGTATTTTGTCTACTTGCTTTGCATGAACTTGGAGCGGTTGCTATGATTTTTGATACGAGATACGGAATGTGCCATTTCGGCTGGAGATTCTTACTCATTTTCTGTACTGTTTAACTCATGCAATTTCATTTGTTGCGTTTCTTTTCTGTATTTTCTCTATTTGCTTTACATGAACTTAGAACATTTGCTATGAATTTTGATACGAGATACGGGATGCTGCCATTTCGGCTGGCGATTCTTATTAATTTTCTGTCAATACGTATGGAGCTGCCAATTGAGCGCGGTACTGGCTGTTTCGTTGTAGCTGCAATGGTGGAAGCTGATACGAGGTGTATTTCGAGGTTAGAAATTAACATCACTTCTGAAATCACTATTGATATAACTTACATTGACATGAATGCCGGTTTATTATTTATTTATTTGGTCTTATTATGTTATTTAGAAAAATATCAGGATATGCAGTTAAAAAGTTCCAATATTAATTGGGGCATTGCTAGAATCAAACTTGGAACCTCTAGCACCCTAAATAAGAATCATGCCTTGACCAAATCCCTTCACTATTTGTATGTTTATTAACAAATTCTACAAACTAAATTATATCTATTTTTTTTCCTATTTAACCTTAGCCTTAGGCGCTTATGAAATTACCTTATTGTCAGTTCTCTATGCAGTCTATCTTGCACTGGGCATTAATAATCGAATAACTCACTGGATTGCCTATAAAAATGTAATAAAAAATGAAATCCACGTACAGTAGCTACATTTCTGCAGTTTTTTAAACCTCAAGCTGACTCAAGTTGAATTCTGCAACAACTAGCAGATAGAGAGGGATGATGCTAGTAACAAATAAGGGGGTTGGAGGAAATGTTCAAGTCTAATTTCCTAGTTTTCAGGTTGAATTTCACTTGGTGTTCTTCAACCTTGCAAAATTAAACTTAGCATGCTGTCATTCCCTCATTTTTTAATTTATATTTGTTATTGGGATTTAAAAATTTATATGTCTAACTAGCTATTCTCACTTCCAAGATTGCAACCAAGCATTAGCTTTGCTACCCTTTTTTCCCATCTAGTGAATTCTCTAGCTGCTTTTTCAGAATTACATACAATATAGTAGAAGGGATGCTAACTTCTATCTTATTTCATATCTTCTATAAATTGTTGGTATCTATTTTAAGATGTTAATATATATTTTTTCTGAAACAAAAATTTAAGTTAACTGTGTTGAGATTCAAGCAAGGCTTTTGGAGTTCGAAATAAGATTCATCACTCCAGAATTATTTGACAGGCTGTTTGCTTCTTTTGTTTCATGACCTTTGTTTTGCTAATTGGCTTGTTTTGGCCATTGAGTGGCACTTCGAAATTAACCATATTACAATATGTTAGTTCCACAAGTCTTCCAAGAATAATACACCTGACCTATGGTGGTTTCAGTTGATCGGTAATTTTGTGAAAGAACTCCTATAAAAGGTTTCATTAACTTTTAACTCTGAATCTGCTCACTAAATGAAAAGCCCCTCGTTAATCACTTGTACTCATTCTATGTTTAAGAGTTTAAGTCAGTTCGCCCTGCAGGGTTCTTTTGAGTATGTTTTTACGACTTCATCTGACTGTGGTCTCTGACTTGATGCATTTCCTGCCTTTGACATCTGTTAAAGTTTGTTGAAGATGTAAAGGGTTTGTGTTCTAAATCCCTTTTACTACTGCATTAAAGAGAAATACAAGAAACTATAGGTGGTCACCCTTTTGAAGTGGGTTATGTTCTGTTTTCCTGACTCGGAAAATTTCATTCAAAAGTTGAAGATTACTAGAGGGCGAAGGAGAAAACTCTACACAATCAATGGATTTTCTTTTCTTCTATATTGTCTTGTCACTAGTCTCGAACTTCTCTTGCCAACTCTTGAATGCTTACCAAGCATACAAAATAAAATGCTAAAAGCCTTTATTTATATAGACGTAGAATCATCTTCACACTAAAACTAAAAGTGGGAGCAGTGGCGGATGGATAAAGAGATCTCCTCTCACCTAACTCAGCAAACTACTGAAGTGCCTTTACAAAATTACATCATTGCTACTTAAATCCTTCATTTACTTAGCGTACTACCTCCTACATAGTTAGATGGTAATGGACCCTAGCTACAAAGTTACTCTCTATTCTCTATTAACTAGATTTTCCTCCCTCACCCTCTTCCTAGTGTAATTCAGAGAGATGGGAAGGTGCTCAAACCTATCCATTTAAAATGGTATTCAAACTGTAACTTTCAGAACTCGTACTCTGAACCTATTGCATCTAAAGCAAATATCAGAAAACTGGATCCGCTGCGCACAATTGACCGCTTCATATTCAGTTTTATGGAAGGCTCAAGAGTGTTGAAGTTTCTCTGTTTTACATTTTAACCCGTGGCCCTGTATAAGCTTAATATTGTTATTTTTATCATCCTGCTACTATTTACCTATAGAAATAAATTTCAGGCTTCTTTTGACACGAGAAAATTGCCTCTTCCTGACCAGCAGGAGTTACAACTGAGTCTGAAGTTATAGGTTTGAACTAATTTTCCTCTGTCTAATGTAAATATAAGTTTATTTATTTACCCTTTATTTTATGTGGAATCTTGGGAGTAGGTCTGTTTTTAGGTCACAATCTTAAAATATAATGTTTCAGATTTCATAATGCTAAAATTACTGACCAACAATATTGGTAATAAGTTAATTGCATAAATGGAAAGATCCAATAAATAACTAGTTGAAGTGGGGTATTTCAAGAATTGATCTAGGGACCTCTCGAACCCTAAGCAAGAATCACACAACCAAATGCCCAATGATGATGTAGGGGTAGAAAAGAACTGTAATAATTGTTTTTTCTGTTTTAAATTTCCTTTTGAATTTGTATGAGCAGTTCTCTCGCCCTCTTTCTATCTATACACACGTGCGCACACACATACATCTTGTTGTCTCACAAAAATTGATTGGAGATGGATTGCATCTAATAGTGTTTCTGTCTTAAGTATTTGGGGTTTTCCTTTTTCTATCAAGCTGCAATGCAATAAAAGTATACTTAGTGTGTTTTATTTCATTGTTAGAATTCATTACTGTCAGTATTTTAATTGGATATGATCTGCCAGCTTTCACACGTTGGAAATGGTTATTCAGACCAATTGATTGTTTGCTTGAAGCAAAATGTAAAAATACACAAATGATACCATGATATTTATTCATTTTAGATCATGAAACTGTTCTGTGATGTTATTTTGTCAAACTTTGTTGTACGAAGTAGGATATAGGAAATTGTAGCAAATGGGAGGTGGGGGATCATCCAACTTCTTAACTTTTAAAGAGAGTTGAAAAGTTCACTTTCACCTGAAATTATTAATATTTAGAAAAGTTCACTTTGACCTGAAATTGTAGCAGGCGTCAATGCTGACTTTTACAGTTTTTTTCCTGAAGTCCAAATACAGTGTACTCTCTGGCTGCTTTCTTGAATATATTCTGTAGTAAGTAGGGATGGTGGAAGTTACCAATTTTTCATATCTACCAAACCCATTTGCCGTGCTTTTTTGACACACATGAAAAACCTTCATTTTGGTTTGTCTGTTGAGTCAGTTTTCCTAGTTCTACAGAAGTTCAAAATTTCAAATACTTGATATTAAAATTGGCTTCAATGTTTCAATCCATGCTTTACAACGTTAAACTTGCAACAATGAATTTCACAGTTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTCAACTTTTGATTGATAAAATTAGACTATGGCTTTTTCTTTCATTTCTTAATTTTTATCCTTCCTTTACCTGTATCTATTAGTTTTTTATTTCAATTCTAAACACATGGGACACAAAAATTCTTTTCCTCAAGTTTGAAAAATTAAGAGTGGGGCATTCCGAGAATTGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTTTCTTGTACCCATACTTGTTAGTTGTTGATTAGCATGTTTCTTGGCGTCATATTATTATAGATATTCTTTTAAGTTTCAATTTTCTAAGAAGCCCCTTATTTATGTTCCTTTTGTATCTCAGTCTGACATCCTGGAATTTATTATTCAGAACAACCTCTTGTATGTATGCAAAATGTCAAACTAGACCAGTGGAACTTGTTATACAGATTACTGCTTGTTTGTTTACTTAATAAAGAATGTTGACATAAAGGATATTCATGTGCATATATGAAAAGGTTATTCATTTTAGATCTTGAACTAACTCAAGGTGTAATTCTACTGTAGTTAGTAGTATAGATCACGTACCTTGATGTGCAGATATATTAATAACTAAGAAAAAGAATGTCATAGTCTAGAGTTTAAGGCTACATGTAGTAGAGAGTTTGGACCTCTCTTACCCACGGCAACGATCTAACAATTTAAAAAAAAGTTAATGTAATGGTAAATGCATTTCATTTTAAGTTAGCATGTTTATTTAGGGTCTAGATTTTCTAACTTTGGAGTTGATGTTCTAGTTTTCTGCTTACCCCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTTTCTTGGTTTTACTACATATGGTCCCATACTTTATATTCACTTGCTGCTTTCTTGGGAATTATGGTATGATATTAAAAATATTCCTATGGAAAATGGATATTAGAAATATGTGAGGCCCTCTATTGTCCAAACTTACCGTCGGAGGGGTAATTTGGGTATTCAAACTCTAAACATACCATGGACAATGTAAGGGCCTCAAGCTTGTGGGGGGAGATTTACCTTTCCTGGGAATGGTCTATCTATTTACCATGTTAGGTTACTGTGAGTTATCTTGGCATTTTGTAAACAAGAGTTGTCTTGTAGTGGAGAGGACCAGCTCTCTTGAAAAGCTGGGAAGAAACCTTGTAAACCGTTTCATTTTGTGGTTGAAGGCTTTTATCCCCACGGGGGTTTGTTGCTCCGTGTGTGTTGCTCTATATTGTGTTGATATTGCAGGTTCAGGTATAGAGATACCTAATAAAATATAATTAAGTTTTTGGGTTATTACATCACAGATCAATGGTAAAACTCTGTACATGATGCATTTGATGTATTTAATAACTTCTTCTGTCTTCCTTTCCTCCCAATAGCTTTCGTATGAAGTTTCAATGACCTCTTGGATCCTAAGCGAGAATCAAACCAAACAGTCAATAGCTGTTATTCATTATTGGCACTGAACGGATTAATCTATCTGTTTCTAAAAAGATTACATGGGTTCTTCATCAATTTAATAACTTCTTCTGTCTCCCTTTCCTCCCAATAGCTGTTATTCCTTATTGGCACTGAAACTTCTTTTGGTCAACTAGTGAATACATCAAAGAATTCCTTGCTGTCTACTAGAATGGATGTCTGTTTCGATGGATAGAATATAGTGGAACAATCTAAACCTAAAAAAATGCAACATGGTGGATATATGTTGCATAATAATCCTTTCCTGTCGCACTGTGGATATCTAATGAGGTTTGTTGACTTTAAACAGGTCAGGCTACTTTTGAGTATTAATAATTGTGTCGAATTCAAAATATTCATTATTCAAGATGCTGTTGCTTGGAGCATGAATTCTGGTTTAATTGGTATATACTGTAATGAGTGAGGGTTCTGCTGTTGTTTTTATATTACATGACTTGCTGACTCTAGTCGCCAATATAAGCATAGCTCAATCGAGATAAAACTTGTATTATTGATCTCAAGGTCACCTCACCCTACATACTCTCGAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAACTTGCTGCCTCCAGTCAATACAGTGATTTTCAAAAAGAGAATATTTGAAAAGATTGTGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCAGGACCTCTCGCACCCGAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTTCTTGTCCACCAAGTCTTTTTAGTTGCTAGTTAACATGTTTTGTTTGCCTCAAGGTTTGAAATTTATCCATGTTTTTTCAGCTTTATAACCTATTATTATTGTTCTGTTAATTTCACGTGGTCTATCACAGAATGGTAATTGTTCTTCAAATTATTTGGATGTACTTAAAGTTAATATTGAAATGTCGACATAAAATAATATCCATGTGTGATAATTAATATTTTGTACGTTTGAGATACTGAACAGCGTTTGAGAGCAATCTGGCTCAAATTGTTTTGGTTGAAGCTGCGTTGCCGAATGTCACCAAGGAAAATGTATCCAATTGGAATTCCGTATCTAGATAAGCTGACTGTTCTGAAGCAAGTTCACAGGATTTAACAGGAAAAAACTTGAACTCTTCAAGTTTTAGCCAATTTAGTCATCATCGTTTATTCTGATCATTCCTTTTTACTACATGATAATTCCTAAGCAGCAGCAGGAGTGTAAGTGTTAGATGTATGGAATTGTAGGCATTAGGCACAGTTGAACTGTACAAATATTCAGTAGGAGGTGTCAGCGCTTCTATGTAGAAACCAATTGTAGATCCTAGTTAACTTATCCATGCAATGTTTAAATATGCTATAGTGGTGCATTCTGAGAATTGAACTAACGACCTCTTGCACCTCTTGCATTAGGTAGTACTTCTTGCATTCAGAGCATTATGTAGATATCGAGCATTAACTAGTAACAAAGAATTTATTGGATGACTGAGCAGCAAAATGAGGCCTAGATATTTGAGTTGATCAGGTTGGAGTTGTCGGAGATTGTTGCTAGTTAATGCTCGATATCTTGCCTACTTTTTGCTGCTCGGCCATCCAATGAATTCTTCTGAAGATTGGAATATGACTTCCTGCTCTAATTGAATTGTACCTTTTGTCCTTACGACATAATTTTATTTTTCAGAAATAAAATTGTAGATGGAAGATTGGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGAGACCTCTCGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTTCTTGAAGTCTAATTATTTTCAGCAATATAACACTCTTTTTATATTAACTTTCCTTTTTCCCTGAAGGTCCTAATTTTATCTATTTTCTACTTCAGAATTGGCTTTCTGTAGGAGCATCATTATTATTTTATTCATTCAACTTGCATTTTCAAACACTGAATTTTTTACTACAAACATTTGTATTTTCAGAAGGTTGATCAATAAAGAAAGTGGATTTCAATGAAATCCATGTGAAAGGATTACTATTTTATATCCTTTAGATCTAGACAGCTGCAAAGCTTGATTATTCTCAAATTGTTTATACAGGAGTTGGTGTTTGACTAAGGAGAGGAGAAAAAGCCGTTGAAGTTATTCCCTACTGCAAGTTGTCTGAGAATTTCACCGAACCACACATTCTGAGCACAAGTAAAACAACTTTAGAATGCTAAGATTTGGGTATACATCTTGATTGATTAGAATGCGTTATTGCTTCTCATTGAAGCATATTCAGTTCTTCTACAGTGCTACCTCTGGTCCCATAACTAGAATTATCTTCCTTATGGTTGGGTAGAAAACTATGGAGCCATGATTTACAGTGTCTAAAACAAATTCCATCATCCAAGCTTATAGCAATGTGAAACTAAGATATTTTATTCATATAGTCCGGTTGCTTATAAGATGCATTTCCCTGTTTCTAAAAAAAAAAAAAAGGCCTTTCCCTGCATGGCTGCATCTGTGACAATTGATAGTATAGCCTCTTAGGCAAGAAATATACAATAAGCAAGTGGCTTTCTTGGGAACTGTCTTTTTAGTTGAGTTTTTCCTTTCTACCTGTGTGACCTAGAGGAAAAACAAACAGATAAAATTTAGAATGCCAACGTTCATTTTGTAATTGGTATACTTTGATAGATTGAATGGTCTACATTTCTGGTTTACAAGAGGCAGTGGCTGCCACTGCTTTTTGCAGCACCTTTCTCAGCTTTACTCGGTTTAATTGGTTGAATGGTCTTGCTGCTTGTTGGGAATTCTTTATATTGTAAAATGGGATTTACATCTAAATCTGTGAAAAGTTTTCTAAGTTTTTGTAATTTCCTTCTATTACTGTAAGCTTAAAATTGTTATATACGTATGTAACTTGTGTGCCATTTTCAGCCTTGCTGACGTGGATGTGGAACGGTTGCTTCTACCTCAGAAAACTAATGGTAAAAGGTGTGATTTGCGAATCACTTAGATGCAAATTCAGTCAGCAAGTAGAGGTGGCAGGCGTCGGCGTACTTGTGGCAGGAAAATCGTGGACCTAGTCCACGAGTTAGCAATCGAAGGGAACCAGTTCGTTCGAACTGCAACAATCGCTACTGCAATGGCGAAAGCTGATACGGCGTGTATCACTCAAGAATTCATTACTGTCAGTATTTTAATTGGATATGATCTGCCAGCTTTCACACGTTGGAAATGGTTATTCAGACCAATTGATTGTTTGCTTGAAGCAAAATTGTACTCTCTGGCTGCTTTCTTGAATATATTCTGTAGTAATGGGGCATTCCGAGAATTGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTTTCTTGTACCCATACTTTCTGACATCCTGGAATTTATTATTCAGAACAACCTCTTGTATGGACAATGTAAGGGCCTCAAGCTTGTGGGGGGAGATTTACCTTTCCTGGGAATGGTCTATCTATTTACCATGTTAGGTTACTGTGAGTTATCTTGGCATTTTGTAAACAAGAGTTGTCTTGTAGTGGAGAGGACCAGCTCTCTTGAAAAGCTGGGAAGAAACCTTGTAAACCGTTTCATTTTGTGGTTGAAGGCTTTTATCCCCACGGGGGTTTGTTGCTCCGTGTGTGTTGCTCTATATTGTGTTGATATTGCAGGTTCAGAGGCAGTGGCTGCCACTGCTTTTTGCAGCACCTTTCTCAGCTTTACTCGGTTTAATTGGTTGAATGGTCTTGCTGCTTGTTGGGAATTCTTTATATTCCTTGCTGACGTGGATGTGGAACGGTTGCTTCTACCTCAGAAAACTAATGGTAAAAGGTGTGATTTGCGAATCACTTAG ATGCAAATTCAGTCAGCAAGTAGAGGTGGCAGGCGTCGGCGTACTTGTGGCAGGAAAATCGTGGACCTAGTCCACGAGTTAGCAATCGAAGGGAACCAGTTCGTTCGAACTGCAACAATCGCTACTGCAATGGCGAAAGCTGATACGGCGTGTATCACTCAAGAATTCATTACTGTCAGTATTTTAATTGGATATGATCTGCCAGCTTTCACACGTTGGAAATGGTTATTCAGACCAATTGATTGTTTGCTTGAAGCAAAATTGTACTCTCTGGCTGCTTTCTTGAATATATTCTGTAGTAATGGGGCATTCCGAGAATTGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTTTCTTGTACCCATACTTTCTGACATCCTGGAATTTATTATTCAGAACAACCTCTTGTATGGACAATGTAAGGGCCTCAAGCTTGTGGGGGGAGATTTACCTTTCCTGGGAATGGTCTATCTATTTACCATGTTAGGTTACTGTGAGTTATCTTGGCATTTTGTAAACAAGAGTTGTCTTGTAGTGGAGAGGACCAGCTCTCTTGAAAAGCTGGGAAGAAACCTTGTAAACCGTTTCATTTTGTGGTTGAAGGCTTTTATCCCCACGGGGGTTTGTTGCTCCGTGTGTGTTGCTCTATATTGTGTTGATATTGCAGGTTCAGAGGCAGTGGCTGCCACTGCTTTTTGCAGCACCTTTCTCAGCTTTACTCGGTTTAATTGGTTGAATGGTCTTGCTGCTTGTTGGGAATTCTTTATATTCCTTGCTGACGTGGATGTGGAACGGTTGCTTCTACCTCAGAAAACTAATGGTAAAAGGTGTGATTTGCGAATCACTTAG MQIQSASRGGRRRRTCGRKIVDLVHELAIEGNQFVRTATIATAMAKADTACITQEFITVSILIGYDLPAFTRWKWLFRPIDCLLEAKLYSLAAFLNIFCSNGAFRELNSGPLAPKARIIPLDQMPFLVPILSDILEFIIQNNLLYGQCKGLKLVGGDLPFLGMVYLFTMLGYCELSWHFVNKSCLVVERTSSLEKLGRNLVNRFILWLKAFIPTGVCCSVCVALYCVDIAGSEAVAATAFCSTFLSFTRFNWLNGLAACWEFFIFLADVDVERLLLPQKTNGKRCDLRIT Homology
BLAST of ClCG02G006880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D2S027 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Gossypium mustelinum OX=34275 GN=E1A91_D13G052200v1 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 9.8e-04 Identity = 34/71 (47.89%), Postives = 41/71 (57.75%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
|