
ClCG02G001900 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTTTAAGTAGGCGTGGTTAGCCATTTCTAGTAATAAACATTCAGTACAGAGGAGTGGGAAAGAGAGGCGGCCACCGCTGCTGCAAAAACTCTTCAACCTTCAACTGAGAACGAAGAAGGAAAATAGAGAAAACAGAGCACTTCTGAAAAATGGGATCAAAGTCTCATGAGGATGTTTTTCAACCCTTGCTGCTGCCCACGGCCGAACCGCCGTTGTTGTCAAACAAGCACGAAACTAACGACGAACTGGAAACCATATTATCCGACACTCAGCTTCCTCTCCTCCAACGTTACACTCAAGCTACTTGGATCGAAATGAAACTGATGTTCTACTTAGCAGCTCCGGCGGTTTTCGTTTACATGATTAATTACCTCATGTCTATGTCCACCCAAATCTTCTCCGGCCACCTCGGAAACCTCGAACTCGCCGCTTCCTCTCTCGGCAACAATGGCATTCAAATCTTCGCCTACGGTCTCATGGTATGTCTTTTCTCTGTTTTTCTCTGTTTTCGTTTTTGGGTTATATACCCCATTTAATTATAATTCATAATCATAATTCCTCTCTCTCAAATCTCGTCTTTAATTAATTAACAGTTGGGGATGGGAAGTGCGGTGGAAACTCTATGCGGGCAGGCATACGGTGCAGAGAAGAACGATATGCTTGGGATTTATTTACAGAGATCAGCCATATTATTGACTCTAACAGGGTTTGTGTTAACAGTTGTTTACATATTTTGCAAACCCATCTTGATATTTTTGGGAGAATCCAAGGAAATTGCTTCGGCAGCGGAAATATTCGTGTACGGATTGATTCCTCAAATATTCGCGTACGCAATAAACTTCCCAATCCAGAAGTTTCTTCAGGCACAGAGCATAGTGTTTCCGAGTGCTTACATATCGGCGGGGACGCTGGTGGTTCACGTGGTGCTGAGTTGGGTGGTGGCTTACAAAATGGGGTTGGGGCTATTGGGAGTGGCGTTGGTATTGAGCTTGTCGTGGTGGATAATAGTGGTGGGGCAATTTGTGTATATAGTTAAGAGTGAAAAGTGTAAACAAACATGGAGAGGGTTTAGCGCGAAGGCGTTTTCGGGCTTGCCGGGATTTTTCAAGTTGTCGGTGGCGTCGGCGGTGATGCTGTGTTTAGAGACTTGGTATTTCCAGATTTTGGTGTTGCTTGCTGGATTGCTCGAGAATCCTGAACTTGCTCTCGACTCCCTTTCTATATGGTACCCTTCTCTTCCTTTTCATCCATTAGTCTTTTATTATCTTCTCAATCTCAAAAATAGTCAAATTTAATTAATTTTAATATTTAGACATTATTGTCAAATAGTGAGTGTGAGAGTAAATATTTAAAGAAAATTGGAGATTAAAAGGATATACCTTGAAACCAAAACATTAAATTAGATTAAATTGAAACCAAACTCATTTTAAAACTTAGAGATAAAAATAGAAATTTAAACCCAAAATTAAGAGATTAATAAAGGTATTTTTCCAAAAGAGAAAGTAAAATACAGTTTTGGTATTTTTTACTTTCGATTTCATTTCATTTTAACTCCATAGGTGTAGATGTTTGCTTTCTCAAATTTTGTCATTCCAATATGTGTGTGTATATATATTTTAAAAACTTTATAGAGAGAAGATTCAAACAATTGGTATAATGTTTTCCTCTAATACTATATTTAAATCTAATAATATATTTGCTTAAAATATTCAAAAAATAAAAAATAAAAAAACGCCTTTATGAAGTGGTATTAAATACTAAAAGAATGATTTGAATTGGGAGTATATGAGACTAAACTATAGTATAAAATTTTTAAAATATTAAAACATGAAACATGGAAAGTATTTAAAATGTTATTATTTCCTCGATAAAAGAAATGAGTAGTTGGGAATGGAGTGAAGTGAATGGTGGTTTCCAGGGAAGAAAGCAAATTCGTAGGAAAATGTGAAAGGATCCCCAGCAGCTACGGAAAACAGAAACCACTTTTTTTAAAAATCTCCTCTTTCTCAATTTTCGAAATTGCTTTACAATTTTAGTAACCTTTTTAATTTTGGTCCCTTCAGTCTTAGTCTAATTCCTTTTTAATCTTTTAACCAAATAGAATGAGGTAAAAGATCCCATCTCTAATATGTGAGATTGATAGTACATACTTGATGTGAGTCAAGCATGATTCATTTTTAGTTTTTAAATTTTAAAATATTTCAATTTTATCTTGAAAGTTGAGTTTTGTTTCAATTTGATGTTTAAGTTAGTAGATGCAATTCAATTTAAGTTAGGGATCAAATTGAAACAATAATTAAATCTCTTGATAAAATTGTTACATTTTAAAATCTAAAATCCAAATGTAAATTAGACATAAAAAATTAAATCAAATGTGCTGTTTAAGGATGGCGAAAAGTTTAGAAATAAGTGTAATTTTGAAAATACAAAATTTAAATAATTAAATCTAAACCCAAGTTTCTAATTTATAATTAGGCAAAAAAGATGGTTCAAAAAGTATGGAGGGCCCATCCTAGATTGGATGGTATGCCATTATTGAACGACTTTCATTCACTAACTTCCCTCAACCGGGACGAAATGATCGACTTTTACAATTTGAATTGCTCTATCATTTTTATTCTCATTATTTGGTTTATATATGATTTTAATTTTGTTGTTCATTTCAGTTCTTCTACTTAAAAAAAAGAAGAAGGTACTAAAATGAGTTAGATCCAAATGTGGAAAATTGAAATACTTTAAACATGAACAAGTTTGTTTTTGAGTTGGGTTTTTCCTCTCAATTATTGAGAATACAATATTTGGTAGAAAGCTTTGACTTAAACATGAAAAAGGGGGTCTGATCTTATCACCTATAGAAAAAAAGGGGGGGTTTTGATTAGAAATAATTTTATGATGAAGTCATTTAAAGATATAGTGGTTAGGGATGATGGGATTAAATGGGATGGAGGGTGAAAACGACTCCTCACTTTGCCACTACATATATATTTAATGCATCTTGGTAGATCCAATCTTATTTTTAAAATAATTAATATGGTTGTCATTAATTCTATGTCTTCCTTATTTTTCTTAAAACACCCATTATTTAATTCAATATAGGAAAATGAGTGATTTTTTTTTTTTTTAAATTTAATCTAATTTAACAATATTGTTGTTTGTGGTTTTGCAGTACAACAATATCTGGATGGGTTTTTATGATTTCAGTTGGCTTCAATGCTGCCGCAAGGTGATTTCTGTCAATTACTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTAGCTTAATTTGATGAATATATATTTATGTGTATTTTTATGTTTATTTGTTGTGTTGTGAATCAATTATTGTGAATTGTTGTAAATAGATATATAGTGAGATAGTTTTATAAGTTTCCAAACTGCATACAAGAAATACAAATTTTGTAAAAATTTTGTAAGGTAATTAAATTGTTATTTGTTGTGTTTTGTGTGTGTGTTGCAGTGTGAGAGTGAGTAACGAACTTGGAAGTAGACATCCAAAATCAGCAGCATTTTCTGTAGTAGTGGTGACTATCATTGCATTCGTGATCTCGACATTTTGTGCGGTAATTGTACTCGCGCTTCGCGATGTCATCAGCTACGCCTTTACAGAAGGCCCCATCGTGGCTGCCGCTGTCTCTGATCTTTGCCCACTTCTCGCTCTCACGCTTCTCCTCAACGGAATCCAACCTGTTTTATCTGGTACTTCCATTATAATTAAGATTAATATATATATATATAAGATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATTAATTTCAACCTCCACTTTTTATTTCATATATATATTTATATATTTTTTTTTATTTATCAAGGTGTTGCAGTCGGGTGCGGTTGGCAAGCTTTCGTGGCCTATGTAAATATCGGTTGTTATTATGTCGTCGGAGTTCCCTTGGGGGCTCTCCTTGGTTTCTATTTCAAACTGGGTGCCAAGGTATACTCAATTCATAATTTTTCAAATTTTTGCTTCTTCTAAATAACTCCATAGTATATTATCTTTTGTATATAAATTTAGTGACAAATTAAATTATTATTGTGTAATTTTTGTGTGTAGGGTATATGGCTGGGCATGATTGGTGGAACTTGCATGCAGACAATCATTTTGATTTGGGTCACATTTCGAACAGATTGGAATAAAGAGGTAATTGAAATATAATTTTAGGTGCCAATAAATCTTTTTTTTAATTTGATTTGTGTTATCACAATTATTTTTATTTATTTATATTCTTAGTAGGGTTTAAGAGGAAAAAAGGGAACAATTAATGACAATTGTTTTCCATGGAAAATTGCAGGTCGAAGAATCGATGAAGAGATTAAACAAGTGGGAAGACAAACAGGAAATTACTTTGAAGTGAAGAATTAAATTCCATTGCTCAAATATAGCCTCTCTTTGACAAGAAGAATATATATATAATTTATTAAAGGGTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTACTCTCTTTTCAATTTTGGAGTTTCAATTCCTACCATTTAGAATAAGGATGTGTCGATTGCTTACGTGGAAAATTACCTTTGGTTCTCCATGTTTCTGTCTATGAATTTTTAGGTCAAAATGTATTATTATTTTGTTCTTGTAATTCGACTTTAGTGTGCATATTTTAAAGTAGTGTTTAATTGAAGGAGTACTTGCCATAATGACCAGAAAAATATTCTTGAAGTTACAAATTCATCCATAATTTTTTTAAATTTGCAAATATAGTAAAAAGAAAAAAACATAAACTAAGATCATCGTTTTCATTATTTCAAATTTATCCTTATTCAAATTTATCTTTTTTGATGTATCAACATGTATATTAATAGTATATTGACATCTAATTTGTTAGTCATATAAATTTGTCAAATATAAAGTATATAAGTTATACAATGGATATACTAAATTTATCATTCATATACCATCCCTACTACAAATTTGGNCATATATA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Homology
BLAST of ClCG02G001900 vs. NCBI nr
Match: KAF9672059.1 (hypothetical protein SADUNF_Sadunf11G0001200 [Salix dunnii]) HSP 1 Score: 1721.4 bits (4457), Expect = 0.0e+00 Identity = 953/1646 (57.90%), Postives = 1182/1646 (71.81%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. NCBI nr
Match: KAF9683396.1 (hypothetical protein SADUNF_Sadunf04G0009200 [Salix dunnii]) HSP 1 Score: 1531.2 bits (3963), Expect = 0.0e+00 Identity = 892/1596 (55.89%), Postives = 1096/1596 (68.67%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. NCBI nr
Match: KAG6572298.1 (Protein DETOXIFICATION 40, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1350.9 bits (3495), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/995 (72.86%), Postives = 828/995 (83.22%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. NCBI nr
Match: KAG2306525.1 (hypothetical protein Bca52824_026273 [Brassica carinata]) HSP 1 Score: 1259.2 bits (3257), Expect = 0.0e+00 Identity = 682/1016 (67.13%), Postives = 801/1016 (78.84%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. NCBI nr
Match: BBH00002.1 (MATE efflux family protein, partial [Prunus dulcis]) HSP 1 Score: 1230.7 bits (3183), Expect = 0.0e+00 Identity = 692/1035 (66.86%), Postives = 794/1035 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVD9 (Protein DETOXIFICATION 40 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX40 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 714.1 bits (1842), Expect = 3.3e-204 Identity = 374/513 (72.90%), Postives = 427/513 (83.24%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SAB0 (Protein DETOXIFICATION 36 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX36 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 6.1e-174 Identity = 312/490 (63.67%), Postives = 402/490 (82.04%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80695 (Protein DETOXIFICATION 37 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX37 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 610.5 bits (1573), Expect = 5.2e-173 Identity = 312/513 (60.82%), Postives = 411/513 (80.12%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JKB9 (Protein DETOXIFICATION 38 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX38 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 1.4e-154 Identity = 281/473 (59.41%), Postives = 363/473 (76.74%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q940N9 (Protein DETOXIFICATION 39 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX39 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 548.9 bits (1413), Expect = 1.8e-154 Identity = 282/472 (59.75%), Postives = 360/472 (76.27%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6N2LCL6 (Protein DETOXIFICATION (Fragment) OS=Salix viminalis OX=40686 GN=SVIM_LOCUS150000 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1483.0 bits (3838), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/1527 (56.45%), Postives = 1052/1527 (68.89%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4Y1R795 (Protein DETOXIFICATION (Fragment) OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=Prudu_009885 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1230.7 bits (3183), Expect = 0.0e+00 Identity = 692/1035 (66.86%), Postives = 794/1035 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498JVA8 (Protein DETOXIFICATION OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_011715 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.4 bits (3133), Expect = 0.0e+00 Identity = 759/1572 (48.28%), Postives = 954/1572 (60.69%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498JU22 (Protein DETOXIFICATION OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_011714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1181.4 bits (3055), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/1031 (63.43%), Postives = 784/1031 (76.04%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A067JAE2 (Protein DETOXIFICATION OS=Jatropha curcas OX=180498 GN=JCGZ_21227 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1170.2 bits (3026), Expect = 0.0e+00 Identity = 629/985 (63.86%), Postives = 771/985 (78.27%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. TAIR 10
Match: AT3G21690.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 714.1 bits (1842), Expect = 2.4e-205 Identity = 374/513 (72.90%), Postives = 427/513 (83.24%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. TAIR 10
Match: AT1G11670.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 4.3e-175 Identity = 312/490 (63.67%), Postives = 402/490 (82.04%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. TAIR 10
Match: AT1G61890.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 610.5 bits (1573), Expect = 3.7e-174 Identity = 312/513 (60.82%), Postives = 411/513 (80.12%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. TAIR 10
Match: AT4G21910.2 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 549.7 bits (1415), Expect = 7.7e-156 Identity = 286/472 (60.59%), Postives = 357/472 (75.64%), Query Frame = 0
BLAST of ClCG02G001900 vs. TAIR 10
Match: AT4G21903.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 1.0e-155 Identity = 281/473 (59.41%), Postives = 363/473 (76.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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