ClCG01G011920 (gene) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview


Name	ClCG01G011920
Type	gene
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description	Unknown protein
Location	CG_Chr01: 21337366 .. 21345505 (-)
RNA-Seq Expression	ClCG01G011920
Synteny	ClCG01G011920

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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ATGTCTCAGAGAAGTAGACCTCGACAGCAACATGCAAGCAGAACTCAGAATGCTACCTTAAGATCCCCAGAAGAAGGGGAAGGAGAATCAAGGCATCCGGCAATGACGAGTGTAATAGAATCACAGGTACTTCATGATTTTGCTTGGCAGATAGCTGAGAATCTAAGTATTTTTTTTTTAAATCTCGAAAGGTTGTATGGAATAGAAATGCTCAAAGCCTTAGGAGCAAGTACGTTTGAGGGAACAATAGATCCTAAAGAAGCAGAAGGTTAAGTGCCTAGAATGCGAAAAATCCCACATGGGGAAATGTTTGAAAGGACCGGGTAAATGTTACACTTGTGGGCTCGAAGGACATAATCGGATAAGATGCCACATATTCATTGACTTCTGTCAACAGTAGAAGGAAATCATTGAGGGTTTGAGGTCTAGGACAGTGGAATTTCCATGTCCAAATTGCGAGCGTCGCTATAAGGGTGACAAGGAAGGAAGGGGGGACGTCTGCTACATGTATGAGCAGCCCGAGCACTACTGCAAAGATTGTCCTTGCAACCATGGAGGCCTCTACTACTAGGCATGGAAGGGAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAGAAAAGAAGAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGGAAGAATGAATTAAAAATATTTGTTGTTTTGTTGTTGTTTTCTTGAGATGAAAAGGAATGTAAAATCAAAACGTAAATAAATAAAGTACTTTTTCTTTATCTCAGCGGTAAGTCTCTAACCTAAATTTCGAGGATGAAATTTTTCTAAGGTGAATAGGATTGTGACACCCTAACCTTTGACCTAGTTGCTTAAGGAACTTAAAAAAGAGAAGAGCCAACACAGACCTCCAACATTAAGAAATCATCAGGCGAATGATCGCCTTGTGCCATTAAATTTGTTTTTAGAAAACCAAATTATAGAGAACAAACATACAGGATAAACTACTGTATTAGTATGCTTTTAAAGAAGAGTTAGAGATTAGGAGTTTTTCCTACCTTTGAAGACCTTCTTTAATGTGAAATTCTCCTTTTTCCAAGTCACGAACTGGTGAGAATCTCCAACAAAATACAGCAAAAATTCTTCTCCTTTGGAACACCACCACAATGACAACCTTACTATTCTCCAGAAATAATCAAAGAGGAGTTGTGGGCTCTCTTTGTTTGGCAAGGGAAATATTTGAGAGGAAGAAGAGAGAATTGGAGAGGGAGAGTTCTTAGGAAAATACAAACTCTTCTATAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTACGTGTAAAGTGTGAGAGAGAAATGAGAAAATAACTTCCTTAATAACGTGGGAAGTTATTTATTTAATAATAATAATATAATATTAATTAAAATGAAATTTTATTTATTTATATATATTAAATCATAATAATCTTTCGCGATCTATCGCGGTCTATCGCAGATAGATAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATACTTTTGTTTCTTTTGTTATATTTGAAAAGAGCCCTTTAATAAATACAATTAAATAAAATTAATTAATTAATAATTAATTAATTAATTAAATATCTCATATTAAATTTTAATTTGAATTATATTCAAATAACCTTTTCTCACATAACCATAGTTTTAATATGAATCTCATTCATATTAATTTTAACCTATAGTTTTTATATGAATCTCATTCATATAATTAATATTTAAATCTTATTTAAATATTCATCTCTCTTATAATATAAAGTATAAATTTTGAATCTTATTCAAAATAAACTATATATTATAATGTATATATACATTGCGCTAATTGTATTACGTAAAATTAATTCCCTTATTAATTTGAACATTTCAAATTAAACCAAAATATTTTATTCTTATACTAATCCCTCGTGAGCTAGCAAGGGAACCTTATGGACCTATAGTTAGAAGCTCCAATGATATGAGATTAATCAATTAAACTCTTTAATTAGATTAATCAATATTAATTAACTATAGGTTATTCCATTAAAGACTTGCAGCTGCACTCTTCGCACTATAGATATATTTCTGTGTCCACGGAATTTACTAATCAACAGTAAGTCGAGCCTTCACAAATTACTCATAACTACAGTTGGGACAAATTGCCGTTTACCCCTGTAGTTATATCTAACTTCTTAAGTACTACTAATCCCTCTAATGAACAAATTGTTTATAGTCCAACTATAAACTAACCCCTCTCGGGCCAATGAGAGAGTGAGGTCTCATTATTTAAGACCCGGAATCAGTTCTTAAAGGAGTAATTTATCTACTTACCCTGAGCAAGGGAAGGAGTGAATTTTATCTTGTGAAGATATGTTCCCAGCTTCCTAATTAGACAAATCCAAAAATGGTAGGCATATTGAGTCAGCGATTTGGCCACTCCCACCCATACAGATCAAAGAATTTCCCTTATAAACAGGAGTTCATAACCCACTCAGAATTTAGGTCGAGTTACCTATAGTCATCCTATGAAATGTTAGTTTCTACAATTAACAGCGTTACAAACAGAAAATTAAACATTTCGCAGTCCGGTCTTATACAAACTATTTGTATTGGATACCCCCACTCACATGTTTCCACATGAACGATTAGGATCAAAATCGTTTGTAACACTTTACAATTTTTTGTACAAAGTGGGCAGTATCCGTAGTGTTACCAGAATAAGGCACTCAACTTTATTCCTATACTATAGACCTTTTTAGTCATTACTTAAGCATGATCCAAACTTGTATGTCAACCACATACATGTTTAAGCTTACATAAAATAACCATGGAATCTTAGTTTATTGGATTGCGTTAATGCATAAAAGAGATAAAATAACTTCTTATTTTATTTAATAAATAAAATGTATATACAATTTACAAACTATAAGACCCAAGAGATTTAGAACATACCAGTCCCATCTAATTCAAAATGAAAGGAAACAAATTCATTAAAATGAATGACTTGAATAAAAAATAATTGTTCAACCTAAACGAAGATATAAGTTCAAAATAAAGAAAAGACATAAAAGTTTCAAGAATGCAAATATTAAAAATTCTAAGTTCAAACATTCAATGACTTAGAACAAAATTATGAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACTAAGCGAAAGCTTTTAATTAGTCTCATGGCACCGCCATGGATTCTTCTTGTCATATGTTAGTTTCTTTTTTCCTTTTATCTAAAAAAAATATCAAAAGAAATGGTGAGTATTTAAAATACTCAATAAGTAACTCCACTACCGAGGTCAGGTTATGCAATCGCATGCAACTAAATGAATATAACTAGTGGGACCTATTCTAAGGTACTAAAGCTATACATGGATGACCATCTAAGGGAACGATTTAACTCATCCTACTATAGGCGAGATGTTCTCATACATATCATACATATCTAGTGGACTCGTAGGCACACAAATATGTAGGATCGGTATGACAATCCTAGAGGGATGAATAGGGTTTATTAAAACTAATTAAATTTTTTTTTAACTAGGGGTCTTAATTTAGCAAACCAATAAACTTTTTGCTTGCATGTAATTTAAACAATAATTTCATGCAAATAAATTCACCTTGAATTAGATAATAAATTAACACTAATAATTTATAGCACTCTATTTGATTCCAACAATAATATTGGAATGTGCAGAATTTGTTGCCCAATTCTGCTTCCCAAATGATTTTTAATTGTACTCGCCTAAACTACTAGTAATGGCAAGACCAAGGCGAACACAAGGAGCACTAGAATTTCTCAATCAAGGAGTTAATAGTTCACGGTCAACCAAGAGGGATTTTGGGGTTTGATTGCAATAAAATTTAAATACCATAAAATAAACACGATGAACAAAAGGGTTGAGAATTTGTATGAGAAAAGTGTAGTTTGGGTTATAACGAATTTTTCCTATTCAAGTAATTCAATCATCGAGTTTTCATTACCAAAATTTAATAGTTGCTTGCACCTAACCAATTTAATTAGAAAGACTAATTAAATTGTCCTAATCGATAAACTAGTCCAAATTGATAAGATGAAAAGCATGCAAATCAAGCTGTTCTAATTGCATTAAGATCTAGGGAATGTAGGGTGAATATTTAACTAGAAATGTCATGATTAAACATTCTTTTGGTTCAATTCTAAGTTGATTGGATCAATGTTAATCTAATTCAAATTGCAAGCTAACCTAACTTATTGCTTTCTATAGATCAATAAACAATTAAGTGTCACAAATTGCATATTAACTCAAAGCAGTAATCATACCATCCCCAAGCGTCCAATTATATGATTTAAATCTAATTGAGACAGAATTGAATCCAACAATTACGAAACTCTATTCAAAATCTCACAAATACATTAAAATAGGGAAACAATCCTAAAACCCAAGATAGAACATGTTACCATAACCCATAATCGACATATCGATTGATCAGGAGAGTTTTAATGCATAAACAGATCAAAAAGCTCGAGAAAGAAGGAGAAAAAAATCGATCCAAATCGGTTGGTGGCAAACCCCATGACCTAAAAATCAAAAACTAGGTTTTTATAATATAGTTGGAGCACCGCAGCACTGTCGAGAACATACGTGTGACACTCTTGGGCAGCGCCACGAAGCTTGTTGCATTTCGCCAGCGCCTCTTCTCCTGAAAAAACACAACAATGGTGCCTAGGTGACGCCGGTGTATTGTGACCTTAGGGGCAAAATAGTCATTTTGGCCTTCTCTTTTTCAGTTGATGCAATTGAGCTCTTGTTGTTGACAGATCTAAAGTCCAAAAATTTGTTGTGCGTTTATCTTTATTATTAAGCTTACTACTATGCATTTAACATATTATGCGTTTAATATGCTTAATACTATGCGTTTCTACTCTGTCAAGTTTTCCTATTCTTAACCCAAGTATAAGCCAAGAAATAGGTTTACTCAGTGAGTCCGAGGTTGAACACAGAGACTATGCTGATTCTAAAATTCGTTGGATTAATTGAGTTGGAGTGGTAGCCAAAAATA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mRNA sequence

ATGTCTCAGAGAAGTAGACCTCGACAGCAACATGCAAGCAGAACTCAGAATGCTACCTTAAGATCCCCAGAAGAAGGGGAAGGAGAATCAAGGCATCCGGCAATGACGAGTGTAATAGAATCACAGGTACTTCATGATTTTGCTTGGCAGATAGCTGAGAATCTAAATGGTATTAAAGTGGAACCTCTCCCAGTAAGATGTGGTTTAGGGACAAACCAAGTAAAAGCTGGTGGATATGTAATGCCCCGAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTCTCAGAGAAGTAGACCTCGACAGCAACATGCAAGCAGAACTCAGAATGCTACCTTAAGATCCCCAGAAGAAGGGGAAGGAGAATCAAGGCATCCGGCAATGACGAGTGTAATAGAATCACAGGTACTTCATGATTTTGCTTGGCAGATAGCTGAGAATCTAAATGGTATTAAAGTGGAACCTCTCCCAGTAAGATGTGGTTTAGGGACAAACCAAGTAAAAGCTGGTGGATATGTAATGCCCCGAGATTAG

Protein sequence

MSQRSRPRQQHASRTQNATLRSPEEGEGESRHPAMTSVIESQVLHDFAWQIAENLNGIKVEPLPVRCGLGTNQVKAGGYVMPRD

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of ClCG01G011920 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of ClCG01G011920 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of ClCG01G011920 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of ClCG01G011920 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (Charleston Gray) v2.5
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..34
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..23

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
ClCG01G011920.1	ClCG01G011920.1	mRNA